Recombinante virus adeno-asociado (rAAVs) vectores son cada vez más valioso para<em> En vivo</em> Los estudios en animales. Se describe cómo rAAVs se pueden producir en el laboratorio y cómo estos vectores se puede titularse para obtener una lectura precisa del número de partículas infecciosas producidas.
En los últimos años recombinantes adeno-asociado vectores virales (AAV) se han convertido cada vez más valioso para los estudios in vivo en animales, y también se está probando en ensayos clínicos humanos. AAV de tipo salvaje es un miembro no patógena de la familia Parvoviridae e inherentemente replicación deficiente. El perfil de transducción amplia, baja respuesta inmune, así como la expresión del transgen fuerte y persistente logra con estos vectores ha hecho una herramienta popular y versátil para la in vitro e in vivo en la entrega de genes. rAAVs puede ser fácil y barato producir en el laboratorio y, en función de su perfil de seguridad favorable, generalmente se les da una clasificación de seguridad bajo. Aquí se describe un método para la producción y titulación de rAAVs quimérico que contiene las proteínas de cápside de ambos AAV1 y AAV2. El uso de estos vectores quiméricos llamado combina los beneficios de ambos serotipos los padres, tales como acciones títulos altos (AAV1) y la purificaciónpor cromatografía de afinidad (AAV2). Estos serotipos AAV son el mejor estudiado de todos los serotipos de AAV, y todos tienen un patrón de infectividad amplio. Los vectores quiméricos descritos aquí deben tener las propiedades infecciosas de AAV1 y AAV2 y por lo tanto se puede esperar para infectar una gran variedad de tejidos, incluyendo las neuronas, músculo esquelético, páncreas, riñón, entre otros. El método descrito aquí utiliza la purificación columna de heparina, un método que cree que dar un título viral más alta y más limpio preparación viral de los métodos de purificación, tales como la centrifugación a través de un gradiente de cloruro de cesio. Además, se describe cómo estos vectores pueden ser rápida y fácilmente titulación para dar una lectura exacta del número de partículas infecciosas producidas.
vectores rAAV son cada vez más valioso para los estudios in vivo en animales. Aquí, hemos descrito un protocolo sencillo y barato para rAAVs producción, lo que puede facilitar la aplicación generalizada de este vector útil al evitar la costosa subcontratación de la producción del virus a las empresas. El protocolo (basado en la referencia 1) describe la producción de quimérico rAAV1 / 2 vectores que contienen proteínas de la cápside de los dos serotipos de los padres en proporciones iguales 4. La purificación de los vectores rAAV uniéndose a las columnas de la heparina se basa en la expresión de proteínas de la cápside AAV2, pero se puede combinar con otros serotipos de AAV1 descritos aquí. Además, AAV6 Se ha informado que se unen a la heparina, aunque con una menor afinidad, y podría ser purificado con columnas de heparina con este procedimiento 5,6. Cabe señalar sin embargo, que otros serotipos se requieren diferentes concentraciones de NaCl de elución de la columna de heparina 5,7.
Embalaje rAAV genomas ha demostrado ser óptimo entre 4,1 y 4,9 kb con una fuerte reducción en la eficiencia de envases de hasta 5,2 kb 8. Este límite de embalaje puede ser considerado como la mayor desventaja del sistema de rAAV, puesto que el tipo específico de células regulación de la expresión del transgen se suele conseguir grandes cis actuando elementos que no pueden tener cabida dentro de las partículas de AAV pequeños. Para superar los lotes de baja titulación, tales como las resultantes del intento de genes paquete que se encuentran cerca del límite de embalaje AAV que se combinan distintos lotes viral concentrada a 250 l en un lote de 500 l, en lugar de añadir PBS como se describe en el paso 6.3. Fiables del tipo de células específicas de transducción se puede lograr mediante la combinación de Cre-driver ratones y cassettes condicional rAAV (ver abajo) para evitar estirar el límite de embalaje.
Es de destacar que mientras que este protocolo pretende proporcionar fácil de seguir las instrucciones en la producción de t de altaiter rAAV, se requiere la presencia de restos de AAV2 proteína de la cápside para la purificación por cromatografía de afinidad con heparina. Otros serotipos de AAV2 debe ser purificado mediante procedimientos alternativos 9. Una de las ventajas de la purificación columna de heparina es que se cree que produce vectores AAV que tienen una mayor tasa de infectividad de los producidos con un gradiente de cloruro de cesio 10. Sin embargo, también existen algunas desventajas de este método. Por ejemplo, otras proteínas que se unen a la heparina también pueden estar presentes en la población viral purificada. Mientras que el tropismo de heparina purificada vectores pueden ser influenciados por el título vector 10, nuestro enfoque para apuntar específicamente a cualquiera de excitación 20 o neuronas inhibitorias (Fig. 2) emplea a Cre-inducida por la activación de la expresión del transgen AAV-mediada y es independiente del título. Una alternativa a la purificación de columna de heparina es el uso de un gradiente de densidad iodixanol, que produce un título viral más alta y más pura que la preparación de la utilización deun gradiente de cloruro de cesio 10. Este método también se puede combinar con la purificación columna de heparina para producir un vector que es mayor que 99% 11. Por lo tanto, la consideración cuidadosa debe ser tomada por los distintos grupos en cuanto a qué método de purificación viral es la mejor para su aplicación posterior en particular.
El problema más común asociado con este protocolo es título viral baja. En nuestra experiencia, esto se puede remontar a la eficacia de transfección de baja, o la elución del virus de las columnas de la heparina. Todos los materiales de la transfección debe estar a temperatura ambiente antes de la transfección, y transfections prueba se debe realizar para encontrar las condiciones óptimas en cada laboratorio. Otros métodos de transfección, como lipofectamina, son muy eficientes, pero puede ser muy caro. Además, la concentración y el pH de las soluciones de elución heparina columna es fundamental para la elución completa de los viriones de witho columnas heparinaut daños. Otro punto importante es que las células de envasado deben adherirse bien a la superficie de los platos de cultivo de tejidos. Si las células se separan en algún momento durante el procedimiento se recomienda dar por terminado el experimento y descongelar un nuevo vial de las células.
Espacio-temporales de control de la expresión del transgen en los roedores es fácil de lograr por objetivo anatómica precisa y la etapa de desarrollo del animal. Eficiente AAV-mediada por la transferencia de genes se ha demostrado en el útero 12,13. En el cerebro adulto, el área infectada con partículas rAAV después de la inyección estereotáxica puede ser ajustado de las regiones objetivo muy pequeño, a áreas mucho más grandes no sólo por los cambios en el título viral, sino también mediante la alteración de los parámetros de inyección. Estos incluyen el volumen y la velocidad de las inyecciones y la inclusión de los polioles manitol con la suspensión del virus 14. El manitol también se puede utilizar para mejorar la infección de una variedad de tejidos después de la inyección sistémica rAAV 15 </ Sup>.
La capacidad de envasado de rAAV (aproximadamente 4,7 kb) es probablemente el factor más limitante en términos de los genes que se pueden expresar de estos vectores virales. Sin embargo, estudios recientes han demostrado que esto puede ser parcialmente superada por los genes de la división más grande o casetes de expresión en distintos vectores rAAV y la introducción de una secuencia de transición, iniciando la expresión de genes en los viriones infectan la misma célula 16. Los niveles de expresión de los genes transportados por vectores rAAV también puede ser mucho mejor mediante el uso de auto-vectores gratis rAAV 17. Inyección estereotáxica de vectores rAAV proporciona un método rápido, barato y eficaz para inducir la expresión de genes de una manera específicos de la región. En combinación con dos estrategias de segunda generación de interferencia de ARN 18 rAAVs también se puede utilizar para la región-gen específico de derribar. rAAVs se puede combinar con Cre-ratones transgénicos o de tipo de células específicas para lograr los promotores del circuito y del tipo celularExpresión de genes específicos, lo que permite la manipulación genética con alta resolución espacial 2,19-21, mientras que rAAVs ajuste por ejemplo, con el sistema tet añade el control temporal sobre el virus de la expresión génica mediada 22,23. Estos ejemplos ilustran el enorme potencial combinatorio de estos vectores y predecir un aumento rápido en rAAV estudios basados en los próximos años.
The authors have nothing to disclose.
Name of reagent | Company | Catalogue number | Comments |
Amicon Ultra centrifugal filters | Millipore | UFC810024 | 100,000 MWCO |
Benzonase nuclease | Sigma-Aldrich | E1014 | |
Dulbeco’s modified Eagle medium (DMEM) | Invitrogen | 10567014 | Supplement with 10% FCS and 10 units/ml penicillin/100 μg/ml streptomycin |
Hek293 cells | American type culture collection | CRL-1573 | Use at passage less than 30 |
HEPES buffered saline | Sigma-Aldrich | 51558 | |
HiTrap Heparin cartridge | Sigma-Aldrich | 54836 | |
Iscove’s modified Dulbecco’s medium | Invitrogen | 12440-053 | Supplement with 5% FCS |
Sodium deoxycholate | Sigma-Aldrich | D5670 | Make fresh solution for each batch |
15 cm Tissue culture dishes | Fisher Scientific | 157150 | |
Stbl2 competent cells | Invitrogen | 10268-019 | |
Virkon solution | Fisher Scientific | NC9821357 | Leave to disinfect overnight before discarding to drain |
Table 1. Specific reagents required for protocol