في الخلايا حقيقية النواة، تحتاج نسخ mRNA الوليدة للخضوع للعديد من التعديلات اللاحقة للنسخ للوصول إلى سيتوبلازم الخلية وترجمتها إلى بروتينات وظيفية. لفترة طويلة، كان النسخ ومعالجة ما قبل RNA المرسال يعتبران حدثين مستقلين يحدثان بالتتابع في الخلية. ومع ذلك، فقد ثبت الآن أن النسخ ومعالجة ما قبل RNA المرسال هما عمليتان متزامنتان يتم تنظيمهما بدقة داخل الخلية.
يمكن أن تتحكم بنية الكروماتين، وخاصة وضع النوكليوسوم وتعديلات الهيستون على الجين، بشكل عميق في معدل نشاط بوليميريز الحمض النووي الريبي ومعالجة ما قبل RNA المرسال في موقع النسخ. تساعد تعديلات هيستون المحددة على النيوكليوسومات الخاصة بـ إيكسون في تجنيد عوامل الربط لمواقع لصق وتلعب دوراً نشطاً في اختيار إيكسون أثناء الربط. على سبيل المثال، يؤدي نزع الأسيتيل الهيستون إلى بنية كروماتين ضيقة. يؤدي هذا إلى إبطاء نشاط بوليميراز الحمض النووي الريبي، مما يمنح وقتاً كافياً لتجنيد عوامل التضفير حتى في مواقع لصق ضعيفة، مما يؤدي إلى تضمين إكسونات بديلة في RNA المرسال الناضج. على العكس من ذلك، ينتج عن أستلة الهيستون بنية كروماتين أكثر انفتاحاً تسمح بنشاط بوليميريز RNA أسرع وتوظيف عوامل الربط فقط في مواقع لصق قوية، مما يؤدي إلى استبعاد الإيكسونات البديلة. لذلك، تلعب بنية الكروماتين دوراً مهماً في التضفير التأسيسي وكذلك البديل لـ pre-mRNA وينظم أنماط التعبير الجيني في الخلية.
مثال آخر على تنظيم تضفير الحمض النووي الريبي (RNA) بواسطة بنية الكروماتين هو تريميثلات H3 هيستون ليسين 36 على النيوكليوسومات، مما يساعد على تجنيد عوامل التضفير إلى موقع الربط. يمكن أن تؤدي الطفرات في عملية مثيلة هيستون H3 إلى تعطيل عملية الربط وتؤدي إلى احتباس الإنترون في الرنا المرسال الناضج.
بشكل عام، يؤدي تنظيم معالجة ما قبل RNA المرسال، وخاصة التضفير، إلى إنشاء مجموعة متنوعة من نسخ RNA المرسال وبالتالي، تنوع هائل للبروتين من مجموعة محدودة من الجينات.
