Nuclei Isolation from Mouse Cardiac Progenitor Cells for Epigenome and Gene Expression Profiling at Single-Cell Resolution

Stephanie Ibrahim; Catherine Robert; Camille Humbert; Clotilde Ferreira; Gwena&#235;lle Collod; Sonia Stefanovic

doi:10.3791/65328

Journal

Biología del desarrollo

Nuclei Isolation from Mouse Cardiac Progenitor Cells at Single-Cell Resolution

May 12, 2023

Epigenom ve Tek Hücre Çözünürlüğünde Gen Ekspresyon Profillemesi için Fare Kardiyak Progenitör Hücrelerinden Çekirdek İzolasyonu

01:46 min

•

1,151 Views

Fare Kardiyak Progenitör Hücre İzolasyonu, Sindirim ve Donma

02:43 min

•

324 Views

Embriyonik Kalp Hücresi Çözülmesi ve Ölü Hücrelerin Uzaklaştırılması

04:22 min

•

333 Views

Kardiyak Progenitör Hücrelerden Çekirdek İzolasyonu

01:45 min

•

170 Views

Stephanie Ibrahim¹, Catherine Robert², Camille Humbert², Clotilde Ferreira¹, Gwenaëlle Collod², Sonia Stefanovic¹

¹Center for Cardiovascular Disease & Nutrition, U1263,Aix-Marseille University, ²Marseille Medical Genetics, U1251,Aix-Marseille University

Summary

Burada, hücre çekirdeği hazırlığını tanımlayan bir protokol sunuyoruz. Kardiyak dokunun mikrodiseksiyonu ve enzimatik ayrışmasından sonra, progenitör hücreler donduruldu, ardından tek çekirdekli RNA dizilimi için kullanılan saf canlı hücrelerin izolasyonu ve yüksek verimli dizileme analizleri ile transpozaz erişilebilir kromatin için tek çekirdekli tahlil yapıldı.