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Analyse multifaktorieller RNA-Seq-Experimente mit DiCoExpress
1Université Paris-Saclay, CNRS, INRAE, Univ Evry, Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2), Orsay, France, 2Université de Paris, CNRS, INRAE, Institute of Plant Sciences Paris Saclay (IPS2), Orsay, France, 3Université Paris-Saclay, INRAE, CNRS, AgroParisTech, GQE – Le Moulon, Gif-sur-Yvette, France, 4LSTM, Univ Montpellier, INRAE, IRD, CIRAD, Institut Agro, Montpellier, France, 5Universitté Paris-Saclay, AgroParisTech, INRAE, UMR MIA-Paris, Paris, France
Kapitel
- 00:05Introduction
- 01:18DiCoExpress
- 03:21Results: Differential Expression and Coexpression Analysis
- 04:54Conclusion
DiCoExpress ist ein skriptbasiertes Tool, das in R implementiert ist, um eine RNA-Seq-Analyse von der Qualitätskontrolle bis zur Co-Expression durchzuführen. DiCoExpress verarbeitet das komplette und unausgewogene Design mit bis zu 2 biologischen Faktoren. Dieses Video-Tutorial führt den Benutzer durch die verschiedenen Funktionen von DiCoExpress.
