Zum Anzeigen dieser Inhalte ist ein JoVE-Abonnement erforderlich. Melden Sie sich an oder starten Sie Ihre kostenlose Testversion.
Multifactoriële RNA-Seq-experimenten analyseren met DiCoExpress
1Université Paris-Saclay, CNRS, INRAE, Univ Evry, Institute of Plant Sciences Paris-Saclay (IPS2), Orsay, France, 2Université de Paris, CNRS, INRAE, Institute of Plant Sciences Paris Saclay (IPS2), Orsay, France, 3Université Paris-Saclay, INRAE, CNRS, AgroParisTech, GQE – Le Moulon, Gif-sur-Yvette, France, 4LSTM, Univ Montpellier, INRAE, IRD, CIRAD, Institut Agro, Montpellier, France, 5Universitté Paris-Saclay, AgroParisTech, INRAE, UMR MIA-Paris, Paris, France
Kapitel
- 00:05Introduction
- 01:18DiCoExpress
- 03:21Results: Differential Expression and Coexpression Analysis
- 04:54Conclusion
DiCoExpress is een script-gebaseerde tool geïmplementeerd in R om een RNA-Seq analyse uit te voeren van kwaliteitscontrole tot co-expressie. DiCoExpress verwerkt een compleet en onevenwichtig ontwerp tot 2 biologische factoren. Deze videozelfstudie leidt de gebruiker door de verschillende functies van DiCoExpress.
