Journal
/
Genetik
/
Metaagenomik Verilerin Biyolojik Dizilerini Sınıflandırmak için Derin ÖğrenmeYi Kullanmak için Bilgisayar Uzmanı Olmayanlar için Bir Sanal Makine Platformu
JoVE Journal
Genetik
Author Produced
Zum Anzeigen dieser Inhalte ist ein JoVE-Abonnement erforderlich.  Melden Sie sich an oder starten Sie Ihre kostenlose Testversion.
JoVE Journal Genetik
A Virtual Machine Platform for Non-Computer Professionals for Using Deep Learning to Classify Biological Sequences of Metagenomic Data
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Metaagenomik Verilerin Biyolojik Dizilerini Sınıflandırmak için Derin ÖğrenmeYi Kullanmak için Bilgisayar Uzmanı Olmayanlar için Bir Sanal Makine Platformu

DOI:
10.3791/62250-v

•

09:34 min

•

September 25, 2021

•

,
1Microbiome Medicine Center, Department of Laboratory Medicine, Zhujiang Hospital,Southern Medical University, 2Center for Quantitative Biology,Peking University, 3State Key Laboratory of Organ Failure Research,Southern Medical University

Kapitel

  • 00:07Introduction
  • 01:35The Installation of the Virtual Machine
  • 04:11Create Shared Folders and Prepare the Files for the Training Set and Test Set
  • 06:55Digitize the Biological Sequences Using “One‐Shot” Encoding Form
  • 07:27Train and Test the Artificial Neural Network
  • 08:12Result
  • 08:52Conclusion

Summary

Automatische Übersetzung

Automatische Übersetzung

Bu öğretici, metanemik verilerin 2 sınıflı sıra sınıflandırmasını gerçekleştirmek için derin öğrenme algoritması oluşturmak için basit bir yöntemi açıklar.

Tags

Virtual MachineDeep LearningBiological Sequence ClassificationMetagenomic DataSpecies ClassificationGene Function ClassificationHost ClassificationDeep Learning FrameworkSequence ClassificationVirtualBoxUbuntu

Article

Embed

ZUR WIEDERGABELISTE HINZUFÜGEN

Usage Statistics

Verwandte Videos

Yüksek verim Protoplast İzolasyonu ve Dönüşüm için Robotik Platformu

İrritabl Bağırsak Sendromu içinde miRNA'lar Sirkülasyon tedirginlikler bir Çoklanmış Yüksek verim Gen İfadesi Platformu Kullanma Algılanan

Yemlerin metagenomic Analizi

Bir GFP etiketli TMEM184A kullanarak Heparin Reseptör Kimliğinin Onay için Construct

Cpf1'i Kullanarak C-Brick DNA Standart Montajı İçin Protokoller

Sağlam DNA izolasyon ve yüksek işlem hacmi sıralama kitaplığı inşaat sulak numuneler için

Bir bitiş homoloji-aracılı katılmadan tabanlı strateji kullanarak hedeflenen Integration CRISPR/Cas9-aracılı Vivo içinde

Sıralı veri--dan toplu Maya 2-hibrid perde Bilişim Analizi

Gen düzenleyici dizileri dairesel kromozom Conformation yeni nesil sıralama kullanarak yüksek üretilen iş tanımlaması yakalama (4C-seq)

Fisyon mayası Schizosaccharomyces pombe derin sıralama yoluyla, kendiliğinden bastırıcı ekran

Read Article