JoVE
JoVE
Ressourcen für Lehrende
Forschung
Verhalten
Biochemie
Biologie
Biotechnik
Krebsforschung
Chemie
Entwicklungsbiologie
Ingenieurwesen
Umwelt
Genetik
Immunologie und Infektion
Medizin
Neurowissenschaften
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
JoVE Chrome Extension
Lehre
Biologie
Chemie
Clinical
Ingenieurwesen
Umweltwissenschaften
Pharmacology
Physik
Psychologie
Statistik
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
JoVE Quiz
JoVE Business
Videos Mapped to your Course
Autoren
Bibliothekare
Gymnasien
Über uns
Sign-In
Anmelden
Kontakt
Forschung
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Lehre
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
Gymnasien
DE
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
DE
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
Close
Forschung
Verhalten
Biochemie
Biotechnik
Biologie
Krebsforschung
Chemie
Entwicklungsbiologie
Ingenieurwesen
Umwelt
Genetik
Immunologie und Infektion
Medizin
Neurowissenschaften
Products
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Lehre
Biologie
Chemie
Clinical
Ingenieurwesen
Umweltwissenschaften
Pharmacology
Physik
Psychologie
Statistik
Products
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
JoVE Quiz
JoVE Business
Ihrem Kurs zugeordnete Videos
Teacher Resources
Get in Touch
Instant Trial
Log In
DE
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
Journal
/
Biologie
/
3' enden sekventering bibliotek forberedelse med A-seq2
JoVE Journal
Biologie
This content is Free Access.
JoVE Journal
Biologie
3′ End Sequencing Library Preparation with A-seq2
3' enden sekventering bibliotek forberedelse med A-seq2
DOI:
10.3791/56129-v
•
12:01 min
•
October 10, 2017
•
Georges Martin
,
Ralf Schmidt
,
Andreas J. Gruber
,
Souvik Ghosh
,
Walter Keller
,
Mihaela Zavolan
2
1
Computational and Systems Biology, Biozentrum
,
University of Basel
,
2
Swiss Institute of Bioinformatics, Biozentrum
,
University of Basel
Kapitel
00:05
Titel
00:46
Isolation of mRNA from Cells
03:24
5′ End Phosphorylation, DNase Treatment, and 3′ End Blocking
04:30
Ligation of Reverse 3′ Adapters to 5′ End of RNA Fragments and Reverse Transcription
05:59
Digestion with Uracil DNA Glycosylase Enzyme Mix and Ligation of 5′ Adapters to 5′ Ends of cDNA
07:44
Pilot PCR, Amplification of Libraries, and Size Selection
09:21
Computational Analysis of DNA Sequence Data
10:03
Results: The A-seq2 Method Maps pre-mRNA 3′ End Processing Sites
10:52
Conclusion
Summary
Automatische Übersetzung
English (Original)
العربية (Arabic)
中文 (Chinese)
Nederlands (Dutch)
français (French)
Deutsch (German)
עברית (Hebrew)
italiano (Italian)
日本語 (Japanese)
한국어 (Korean)
português (Portuguese)
русский (Russian)
español (Spanish)
Türkçe (Turkish)
Automatische Übersetzung
Denne protokol beskriver en metode til kortlægning pre-mRNA 3' enden forarbejdning websteder.
Tags
Keywords: 3′ End Sequencing
A-seq2
MRNA Processing
Polyadenylation
Transcript Isoforms
Cell Types
Poly(A) Stretches
Adapter Dimers
Cell Lysis
Oligo D(T)25 Magnetic Beads
Buffer A
Buffer B
Alkaline Hydrolysis
RNA Isolation
Polynucleotide Kinase
Article
Embed
ZUR WIEDERGABELISTE HINZUFÜGEN
Usage Statistics
Verwandte Videos
check_url/de/56129?article_type=v
Chromatin Interaction Analysis with Paired-End Tag Sequencing (ChIA-PET) for Mapping Chromatin Interactions and Understanding Transcription Regulation
check_url/de/56129?article_type=v
Analyse af RNA Processing Reaktioner Brug Cell Free Systems: 3 'End spaltning af præ-mRNA Underlag<em> In vitro</em
check_url/de/56129?article_type=v
Interactome-Seq: En protokol til Domainome bibliotek konstruktion, validering og udvælgelse af Phage Display og næste Generation Sequencing
check_url/de/56129?article_type=v
Vurdering af global DNA-dobbeltstrenget endresektion ved hjælp af BrdU-DNA-mærkning kombineret med billeddannelse af cellecyklusdiskrimination
check_url/de/56129?article_type=v
Anvendelse af passiv hovedbevægelse til at generere definerede accelerationer ved gnaverhovederne på gnavere
check_url/de/56129?article_type=v
Et forbedret kemotaxisassay til hurtig identifikation af rhizobakterielle kemotiltrapitter i rodexsudater
check_url/de/56129?article_type=v
Enkeltcellesuspensionspræparat fra Nile Tilapia-tarm til enkeltcellesekventering
check_url/de/56129?article_type=v
Berigelse af mRNA og bisulfit-mRNA biblioteksforberedelse til næste generations sekventering
check_url/de/56129?article_type=v
CorrelationCalculator og Filigran: Værktøjer til datadrevet netværksanalyse af metabolomicsdata
check_url/de/56129?article_type=v
Fremstilling af en enkeltcellesuspension fra musehalspulsårer til enkeltcellesekventering
Read Article