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만성 림프 성 백혈병 환자에서 Methyl-CpG- 결합 도메인 포착 기반 방법을 이용한 포괄적 인 DNA 메틸화 분석
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Comprehensive DNA Methylation Analysis Using a Methyl-CpG-binding Domain Capture-based Method in Chronic Lymphocytic Leukemia Patients
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만성 림프 성 백혈병 환자에서 Methyl-CpG- 결합 도메인 포착 기반 방법을 이용한 포괄적 인 DNA 메틸화 분석

DOI:
10.3791/55773-v

•

13:21 min

•

June 16, 2017

•

,
1Department of Medical Genetics, Institute of Biomedicine,Gothenburg University, 2Department of Clinical Chemistry and Transfusion Medicine, Institute of Biomedicine,Gothenburg University

Kapitel

  • 00:05Titel
  • 00:49Genomic DNA Extraction and Sonication
  • 02:06Bead Preparation Prior to Binding with Methyl-CpG-binding Domain (MBD)-biotin Protein
  • 03:35Binding the MBD-biotin Protein to the Washed Beads
  • 04:59Binding MBD-biotin Beads with Fragmented Genomic DNA
  • 06:22Removing the Unbound DNA and Eluting the Methylated DNA from the Beads
  • 08:10Ethanol Precipitation and the Enrichment of Methylated DNA
  • 10:09Results: Identification of Differentially Methylated CpG Rich Regions in Chronic Lymphocytic Leukemia (CLL) Samples
  • 11:26Conclusion

Summary

Automatische Übersetzung

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이 연구는 만성 림프 구성 백혈병 (CLL) 환자에서 차별적으로 메틸화 된 CpG가 풍부한 부위를 확인하기 위해 최적화 된 메틸 -CpG 결합 도메인 (MBD) 시퀀싱 프로토콜과 계산 파이프 라인을 설명합니다.

Tags

DNA MethylationMethyl-CpG-binding DomainCapture-based MethodChronic Lymphocytic LeukemiaNext-generation SequencingGlobal Methylation ProfilingDifferentially Methylated CpG-rich RegionsCLL-specific Signature GenesDisease PathogenesisPrognosisGenomic DNA ExtractionSonicationMagnetic Streptavidin BeadsMBD-biotin Protein

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