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Métodos para aumentar a sensibilidade de alta resolução de derretimento Single Nucleotide Polymorphism Genotipagem em Malária
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Methods to Increase the Sensitivity of High Resolution Melting Single Nucleotide Polymorphism Genotyping in Malaria

Métodos para aumentar a sensibilidade de alta resolução de derretimento Single Nucleotide Polymorphism Genotipagem em Malária

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•

10:27 min

•

November 10, 2015

DOI:

10.3791/52839-v

DOI:
10.3791/52839-v

•

10:27 min
November 10, 2015

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3 Views
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1Department of Organismic and Evolutionary Biology,Harvard University, 2Department of Immunology and Infectious Diseases,Harvard T.H. Chan School of Public Health, 3Faculty of Medicine and Pharmacy,Cheikh Anta Diop University, 4School of Nursing and Health Sciences,Simmons College, 5Institute of Infectious Diseases,Broad Institute

Summary

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Enquanto a análise de alta resolução de fusão oferece a capacidade de diferenciar entre polimorfismos de nucleotídeo único em uma população heterogênea, viés amplificação alelo mutante pode aumentar a sua capacidade para detectar alelos presentes em percentagens relativamente baixas dentro de uma amostra. Este protocolo descreve melhorias que melhoram a sensibilidade da análise de fusão de alta resolução.

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MalariaPlasmodiumSingle-nucleotide Polymorphisms (SNPs)Drug ResistancePopulation SurveillanceHigh-resolution Melting (HRM) AnalysisPolygenomic InfectionsPCR AmplificationMinor AlleleGenotyping Sensitivity

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Daniels, R., Hamilton, E. J., Durfee, K., Ndiaye, D., Wirth, D. F., Hartl, D. L., Volkman, S. K. Methods to Increase the Sensitivity of High Resolution Melting Single Nucleotide Polymorphism Genotyping in Malaria. J. Vis. Exp. (105), e52839, doi:10.3791/52839 (2015).

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