Journal
/
Umwelt
/
En Aquatic Mikrobiel Metaproteomics Workflow: Fra celler til Tryptic Peptider Egnet til Tandem-massespektrometri-baseret analyse
JoVE Journal
Umwelt
Zum Anzeigen dieser Inhalte ist ein JoVE-Abonnement erforderlich.  Melden Sie sich an oder starten Sie Ihre kostenlose Testversion.
JoVE Journal Umwelt
An Aquatic Microbial Metaproteomics Workflow: From Cells to Tryptic Peptides Suitable for Tandem Mass Spectrometry-based Analysis

En Aquatic Mikrobiel Metaproteomics Workflow: Fra celler til Tryptic Peptider Egnet til Tandem-massespektrometri-baseret analyse

DOI:
10.3791/52827-v

•

08:09 min

•

September 15, 2015

•

,
1Department of Biology,Concordia University

Kapitel

  • 00:05Titel
  • 01:06Perform Cell Lysis in Catridge Filter Unit with Cells Preserved in RNA Stabilization Solution
  • 04:07Protein Precipitation and Peptide Extraction
  • 05:25DNA Precipitation
  • 06:49Results: Taxonomic and Functional Analysis of Arctic Ocean Microbial Communities
  • 07:50Conclusion

Summary

Automatische Übersetzung

Automatische Übersetzung

This protocol is for the extraction and concentration of protein and DNA from microbial biomass collected from seawater, followed by the generation of tryptic peptides suitable for tandem mass spectrometry-based proteomic analysis.

Tags

Aquatic Microbial MetaproteomicsMetaproteomicsMetagenomicsMetatranscriptomicsMarine Microbial CellsSterivex FilterRNA StabilizationPeptide DigestionTandem Mass SpectrometryDatabase Search

Article

Embed

ZUR WIEDERGABELISTE HINZUFÜGEN

Usage Statistics

Verwandte Videos

Karakterisering og anvendelse af passive samplere for Overvågning af pesticider i vand

Alternativ metode til at fjerne Otolither fra Sturgeon

Ekstraktion og analyse af Mikrobiel Phospholipid fedtsyrer i Jordbunden

En Flow-through Exposure system til evaluering suspenderet sediment Virkninger på vandlevende

Grundforskning i Plasma medicin - en overførselshastighed tilgang fra væsker til celler

Karakterisering af akvatiske biofilm med flowcytometri

Isolering og analyse af mikrobielle samfund i jord, rhizosfære og rødder i flerårig græs eksperimenter

Forsøgsplan for behandlingen af adfærdsmæssige reaktion profiler i larve fisk: ansøgning til Neuro-stimulerende koffein

Sammensætning og Distribution analyse af Bioaerosols Under forskellige miljøforhold

Identifikation af pr- og stofferne kemisk arter med en kombineret målrettet og ikke-målrettet-Screening høj opløsning massespektrometri arbejdsproces

Read Article