In de thymus, onvolwassen CD4 +8 + thymocyten uiten willekeurig herschikte T-cel-receptor α-en b-keten genen ondergaan positieve en negatieve selectie gebeurtenissen op basis van hun vermogen om self-peptide/major histocompatibility complex (MHC) moleculen uitgedrukt door de thymus te herkennen stromale cellen. In vivo analyse van de rol van de thymus stromale cellen tijdens intrathymic selectie wordt bemoeilijkt door de cellulaire complexiteit van de thymus micro-omgeving in de steady-state voor volwassenen thymus, en door het ontbreken van passende richten op strategieën om de genexpressie in het bijzonder thymus stromale compartimenten te manipuleren. We hebben aangetoond dat de thymus micro-omgeving kan gemakkelijk worden gemanipuleerd in vitro door het gebruik van reaggregate thymus orgaan culturen, die de voorbereiding van de drie-dimensionale thymus lobben van toegezegd stromale en lymfoïde cellen mogelijk te maken. Hoewel de andere in-vitro-systemen ondersteunen een aantal aspecten van de T-cel ontwikkeling, reaggregate thymus orgelcultuur blijft de enige in vitro systeem in staat om een ​​efficiënte ondersteuning van MHC klasse I en II-gemedieerde thymocyt selectie van evenementen, en kunnen dus gebruikt worden als een effectief instrument om te studeren de cellulaire en moleculaire regulatie van positieve en negatieve selectie in de thymus.