В данной работе мы представляем два протокола для количественной оценки поглощения микроглией vGLUT1-положительных синапсов и сырых синаптосом, меченных красным цветом pHRodo, с помощью проточной цитометрии.
Микроглия играет ключевую роль в синаптическом уточнении в мозге. Анализ поглощения синапсов микроглией имеет важное значение для понимания этого процесса; однако доступные в настоящее время методы идентификации поглощения синапсов микроглией, такие как иммуногистохимия (ИГХ) и визуализация, являются трудоемкими и трудоемкими. Для решения этой проблемы в данной работе мы представляем анализы in vitro и in vivo*, которые позволяют быстро и с высокой пропускной способностью количественно оценить поглощение синапсов микроглией с помощью проточной цитометрии.
В рамках подхода in vivo* мы проводили внутриклеточное окрашивание vGLUT1 после выделения свежих клеток из мозга взрослых мышей для количественной оценки поглощения синапсов vGLUT1+ микроглией. В анализе поглощения синаптосом in vitro мы использовали свежевыделенные клетки мозга взрослой мыши для количественной оценки поглощения синаптосом, меченных красным цветом pHrodo, микроглией. Эти протоколы в совокупности обеспечивают эффективный по времени подход к количественной оценке поглощения синапсов микроглией и представляют собой многообещающую альтернативу трудоемким методам, основанным на анализе изображений. Оптимизируя анализ, эти анализы могут способствовать лучшему пониманию роли микроглии в уточнении синапсов в различных моделях заболеваний.
Микроглия — это резидентные иммунные клетки центральной нервной системы (ЦНС)1. Они постоянно сканируют свое микроокружение и обеспечивают наблюдение 1,2. Более того, они часто взаимодействуют с синапсами и опосредуют тонкую настройку синаптическойактивности. Таким образом, они стали ключевым игроком в процессе синаптического совершенствования.
Роль микроглии в утончении синапсов за счет поглощения синапсов была показана различными исследовательскими группами 3,4,5,6,7. Сбои в этом процессе могут способствовать патологии нейроразвития и нейродегенеративных расстройств, таких как шизофрения и болезнь Альцгеймера8. Аберрантное утончение синапсов с помощью микроглии уже было обнаружено в различных мышиных моделях неврологических расстройств 5,9,10. Таким образом, идентификация различных механизмов, лежащих в основе поглощения синапсов микроглией, имеет первостепенное значение для понимания патофизиологии расстройств нервного развития и нейродегенеративных расстройств8.
Нацеливание на микроглиальное поглощение синапсов обладает большим потенциалом как для вмешательства в прогрессирование заболевания, так и для получения информации об основных механизмах нейроразвития и нейродегенеративных расстройств. Чтобы облегчить проведение таких исследований, необходимы быстрые и высокопроизводительные подходы. Современные методологические подходы включают в себя анализы in vivo, ex vivo и in vitro, которые позволяют обнаруживать синаптический материал в микроглии. Как правило, обнаружение поглощения синапсов микроглией в значительной степени опирается на иммуногистохимию (ИГХ) и микроскопические подходы 5,6,11, которые являются трудоемкими и демонстрируют ограничения в анализе большого количества микроглии.
Учитывая эти технические ограничения, изучение альтернативных методологий является императивом. Чтобы решить эту проблему, мы оптимизировали подход, основанный на проточной цитометрии, который позволяет эффективно, непредвзято и высокопроизводительно анализировать поглощение синапсов микроглией. Мы выбрали гиппокамп в качестве основной области интереса из-за его высокой степени синаптического ремоделирования и пластичности12, но протокол может быть адаптирован к различным областям мозга. В то время как проточная цитометрия уже использовалась в предыдущих исследованиях для обнаружения поглощения микроглией синапсов 13,14,15, в настоящем документе мы предлагаем пошаговую методологию с использованием коммерчески доступного в настоящее время флуорофор-конъюгированного антитела vGLUT1. Кроме того, мы предлагаем дополнительный подход in vitro для высокопроизводительного скрининга микроглиального поглощения синаптического материала с использованием грубых синаптосом.
Утончение синапсов посредством взаимодействия микроглии и синапсов является интригующей областью исследований в области нейроиммунологии, предлагающей многообещающее понимание роли микроглии в нейродегенеративных расстройствах и нарушениях развития нервной системы. В 2011 году; Paolicelli et al. представили доказательства присутствия синаптического материала в микроглии, пролив свет на их участие в процессе синаптического поглощения4. В другом интригующем исследовании использовалась покадровая визуализация и модель культуры органотипических срезов мозга ex vivo , и сообщалось, что микроглия участвует в фагоцитарном процессе, известном как трогоцитоз, когда они поглощают пресинаптические структуры, а не всю синаптическуюструктуру. Совсем недавняя публикация с использованием новой трансгенной мышиной модели, которая позволяет измерить фагоцитоз в интактной ткани, показала обрезку по глии Бергмана in vivo при моторном обучении24. Таким образом, имеется достаточно данных, указывающих на участие глиальных клеток в синаптическом поглощении, в том числе микроглии. Тем не менее, степень, в которой эта микроглиальная функция влияет на динамический и селективный процесс синаптического обрезания, требует дополнительных доказательств.
Тем не менее, количественная оценка поглощения синапсов микроглией служит ценным индикатором и дает частичное представление о сложной динамике взаимодействий микроглии и синапсов, особенно об утончении синапсов. В всестороннем обзоре обобщены современные протоколы, используемые для исследования поглощения микроглией синапсов25. Мы хотели бы подчеркнуть, что наши протоколы оптимизированы на основе существующих протоколов, которые уже используются. Методы, представленные в данном исследовании, обеспечивают быстрое и высокопроизводительное количественное поглощение микроглиями синапсов в различных рассеченных областях мозга. В зависимости от области мозга, для обеих методологий возможен анализ не менее 10 000 клеток микроглии максимум за два дня, что делает их ценными для параллельного тестирования нескольких мышиных моделей.
Мы признаем, что количественное определение микроглии vGLUT1+ включает как in vivo , так и кратковременное поглощение ex vivo до стадии фиксации. Поэтому мы предполагаем, что наш анализ представляет собой быстрый и надежный способ количественного определения синаптического материала внутри микроглии в качестве первого шага перед валидацией in vivo с использованием таких подходов, как ИГХ.
Еще одним недостатком анализа проточной цитометрии является ограниченная доступность антител к синаптическим маркерам, в частности к ингибиторным синапсам. Трудно найти коммерчески доступные, непосредственно конъюгированные антитела, которые демонстрируют яркий сигнал к этим маркерам. Учитывая обширное время оптимизации, необходимое для тестирования различных антител, нацеленных на синаптические маркеры, важно поделиться с научным сообществом хорошо оптимизированными процедурами внутриклеточного окрашивания различными антителами, как мы делаем в этом исследовании.
Что касается анализа данных в этом исследовании, мы использовали контроль Isotype в качестве технического отрицательного контроля для учета неспецифических связываний антитела vGLUT1, поскольку они обеспечивают оценку неспецифического связывания антитела в образце при оптимизации анализов на основе проточной цитометрии26. Тем не менее, контрольные изотипы в основном оптимизированы для обнаружения неспецифического фонового сигнала от процедур поверхностного окрашивания и не являются оптимальными для контроля внутриклеточного окрашивания27,28. Следовательно, не следует полагаться на них для проведения различия между негативными и положительными популяциями при выполнении внутриклеточного окрашивания, которое включает в себя этапы фиксации и пермеабилизации, которые могут повлиять на обнаружение антигена, аутофлуоресценцию и яркость флуорофора29. Такие процедуры внутриклеточного окрашивания требуют использования соответствующего биологического внутреннего контроля для определения положительной клеточной популяции, окрашенной по внутриклеточному маркеру29. Таким образом, учитывая, что мы используем протокол внутриклеточного окрашивания, мы применили внутренний биологический негативный контроль (макрофаги селезенки) и определили границу между положительными и негативными популяциями по макрофагам селезенки, выделенным от тех же мышей. Мы выделили положительную популяцию над воротами, в которой отсутствуют положительные события vGLUT1, от макрофагов селезенки, которые служат биологическим негативным контролем (рис. 1).
Оба метода, представленные в этом исследовании, предлагают большой потенциал для первоначального анализа поглощения синапсов микроглией быстрым и высокопроизводительным способом, анализируя более 10 000 клеток из небольших областей мозга, что не достижимо с помощью стандартных методов микроскопии. Таким образом, эти методы имеют значительное преимущество по сравнению с трудоемкими и трудоемкими методами и, кроме того, обеспечивают более полный анализ синаптического поглощения, позволяя анализировать большее количество микроглии. Кроме того, метод in vitro , представленный в этом исследовании, особенно полезен для проверки влияния различных методов лечения на поглощение синапсов микроглией. Это позволяет напрямую количественно оценить эффект лечения на микроглию без искажающих факторов, связанных с другими типами клеток. Кроме того, он служит косвенным подходом к доказательству потенциального влияния микроокружения или других типов клеток на процесс синаптического поглощения. Таким образом, мы приходим к выводу, что эти методы, особенно при параллельном использовании, предлагают интуитивно понятные и выгодные альтернативы для анализа микроглиального поглощения синаптических материалов.
Тем не менее, анализ свежевыделенной микроглии с помощью фагоцитарных анализов на основе FACS ex vivo может иметь некоторые недостатки. Во-первых, крайне важно использовать хорошо оптимизированные протоколы, которые генерируют свежевыделенную микроглию из мозга взрослого человека, избегая при этом активации ex vivo и стрессовой реакции микроглии. Dissing-Olesen et al. использовали транскрипционные и трансляционные ингибиторы для решения этой проблемы, применяя процедуру диссоциации тканей при 37 °C30. Mattei et al., с другой стороны, представили протокол холодной механической диссоциации тканей, чтобы избежать индуцирования ex vivo экспрессии стресс-ассоциированных генов16 , и мы адаптировали этот протокол в первом разделе, чтобы избежать ex vivo активации стресс-ассоциированной микроглии до внутриклеточного окрашивания vGLUT1. Мы использовали протокол ферментативной диссоциации тканей на втором участке перед анализом поглощения синаптосомами in vitro , учитывая более высокий выход микроглии после диссоциации тканей на основе папаина (данные не показаны). Микроглия неизбежно остается при 37 °C в условиях культивирования при инкубации с синаптосомами, а инкубация при 37 °C действительно может вызвать изменения в микроглии, что является общим недостатком всех анализов in vitro и процедур культивирования клеток. Поэтому мы предлагаем использовать оба представленных протокола параллельно, чтобы прийти к более широкому выводу о поглощении синапсов микроглией.
Кроме того, важно тщательно определить стратегию гейтинга для отбора CD11b++/CD45+ микроглии, принимая во внимание присутствие других иммунных клеток в паренхиме мозга, которые также экспрессируют эти маркеры31. Что еще более важно, при выборе маркеров, специально нацеленных на микроглию (например, TMEM119, P2RY12), важно учитывать, что они могут претерпевать изменения в уровнях их экспрессии во время патологических и воспалительных состояний32, и такие изменения следует учитывать до создания панели FACS для количественной оценки поглощения микроглией синапсов. Наконец, важно подчеркнуть, что ни один из рассмотренных ранее методов, включая подходы in vivo , основанные на ИГХ и микроскопии, не может сам по себе охватить активное и избирательное обрезание синапсов микроглией. Эти методы не в состоянии отличить активную обрезку микроглией от пассивного удаления синаптического мусора в паренхиме мозга. Поэтому при оценке и обсуждении данных крайне важно четко различать эти различные понятия.
The authors have nothing to disclose.
Мы благодарим Регину за техническую помощь в выделении микроглии и доктора Кайо Андрета Фигейреду за помощь в получении микроскопических изображений на дополнительном рисунке S1. Мы благодарим механизм СУИМ MDC за их техническую поддержку. В этой рукописи частично представлены репрезентативные цифры, представленные в журнале Brain, Behavior and Immunity Journal в 2024 году. Рисунок 1A, рисунок 2A и дополнительный рисунок S3A были созданы с использованием BioRender.com.
1 mL Dounce Homogenizer | Active Motif | Cat# 40401 | |
5 mL Tubes | Eppendorf | Cat# 0030119452 | |
Anti-CD11b | ThermoFisher Scientific | Cat# 25-0112-82 | |
Anti-CD45 | BD | Cat# 559864 | |
Anti-Ly6C | BD | Cat# 553104 | |
Anti-Ly6G | BD | Cat# 551460 | |
BCA Protein Assay Kit | Pierce | Cat# 23227 | |
C-Tubes | Miltenyi Biotech | Cat# 130-096-334 | |
CD11b MicroBeads | Miltenyi Biotech | Cat# 130-093-634 | |
CD16/CD32 Antibody | Thermo Fisher Scientific | Cat#14-0161-82 | |
Cytofix/Cytoperm Kit | BD | Cat# 554714 | |
Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM) | Gibco | Cat# 41966029 | |
Dulbecco´s Phosphate Buffered Saline (DPBS) | Gibco | Cat# 14190144 | |
Falcon Round-Bottom Polystyrene Test Tubes | Thermo Fisher Scientific | Cat# 08-771-23 | |
fixable viability dye | Thermo Fisher Scientific | Cat# L34969 | |
Hibernate A medium | ThermoFisher | Cat# A1247501 | |
LS-columns | Miltenyi Biotech | Cat# 130-042-401 | |
Papain Dissociation System | Worthington | Cat# LK003150 | |
Percoll | Th.Geyer | Cat# 17-0891-02 | |
Petri dishes | Thermo Fisher Scientific | Cat# 11339283 | |
pHrodoRed | Thermo Fisher Scientific | Cat# P36600 | |
Protease inhibitor | Roche | Cat# 5892970001 | |
Red Blood Cell Lysis Buffer | Sigma | Cat# 11814389001 | |
Steritop E-GP Sterile Filtration System | Merck | Cat# SEGPT0038 | |
SynPer Solution | ThermoFisher | Cat# 87793 | |
vGLUT1 Antibody | Miltenyi Biotech | Cat# 130-120-764 |