Summary

Ein nahtloser Klonierungsansatz für die Konstruktion von Expressionsvektoren für das porzine reproduktive und respiratorische Syndrom

Published: May 17, 2024
doi:

Summary

In dieser Arbeit stellen wir ein Protokoll vor, um den pVAX1-PRRSV-Expressionsvektor durch Einführung geeigneter Restriktionsstellen am 3′-Ende der Inserts zu erhalten. Wir können den Vektor linearisieren und DNA-Fragmente durch homologe Rekombinationstechnologie nacheinander mit dem Vektor verbinden.

Abstract

Die Konstruktion von Genexpressionsvektoren ist ein wichtiger Bestandteil der Laborarbeit in der experimentellen Biologie. Mit technischen Fortschritten wie Gibson Assembly wird die Vektorkonstruktion relativ einfach und effizient. Wenn jedoch das Genom des Porcinen Reproduktiven und Respiratorischen Syndroms Virus (PRRSV) nicht einfach durch eine einzelne Polymerase-Kettenreaktion (PCR) aus cDNA amplifiziert werden kann oder es schwierig ist, einen Genexpressionsvektor in voller Länge durch homologe Rekombination mehrerer Inserts in vitro zu erhalten, kann die derzeitige Gibson-Assemblierungstechnik dieses Ziel nicht erreichen.

Daher zielten wir darauf ab, das PRRSV-Genom in mehrere Fragmente zu zerlegen und geeignete Restriktionsstellen in den reversen Primer einzuführen, um PCR-amplifizierte Fragmente zu erhalten. Nach dem Verbinden des vorherigen DNA-Fragments mit dem Vektor durch homologe Rekombinationstechnologie erhielt der neue Vektor die Spaltstelle des Restriktionsenzyms. So können wir den Vektor linearisieren, indem wir die neu hinzugefügte Enzymspaltstelle verwenden und das nächste DNA-Fragment stromabwärts des stromaufwärts gelegenen DNA-Fragments einführen.

Die eingeführte Spaltstelle des Restriktionsenzyms am 3′-Ende des stromabwärts gelegenen DNA-Fragments wird eliminiert, und eine neue Spaltstelle wird in das 3′-Ende des stromabwärts gelegenen DNA-Fragments eingeführt. Auf diese Weise können wir DNA-Fragmente nacheinander mit dem Vektor verbinden. Diese Methode ist anwendbar, um den PRRSV-Expressionsvektor erfolgreich zu konstruieren, und ist eine effektive Methode zum Assemblieren einer großen Anzahl von Fragmenten in den Expressionsvektor.

Introduction

Als wesentliche Technik zur Konstruktion von DNA-basierten experimentellen Werkzeugen für die Expression in prokaryotischen und eukaryotischen Zellen ist die molekulare Klonierung ein sehr wichtiger Bestandteil der experimentellen Biologie. Die molekulare Klonierung umfasst vier Prozesse: die Gewinnung von Insert-DNA, die Ligation des Inserts in den entsprechenden Vektor, die Umwandlung des rekombinanten Vektors in Escherichia coli (E. coli) und die Identifizierung der positiven Klone1. Bisher wurden mehrere Methoden zur Verbindung von DNA-Molekülen unter Verwendung der Restriktionsenzyme 2,3 und der PCR-vermittelten Rekombination 4,5,6 angewendet. Die homologe Rekombination, bekannt als Seamless Cloning Technology, ist die Gruppe von Klonierungsmethoden, die das sequenzunabhängige und narbenfreie Einfügen eines oder mehrerer DNA-Fragmente in einen Vektor ermöglicht. Diese Technologie umfasst sequenz- und ligationsunabhängige Klonierung (SLIC), Seamless Ligation Cloning Extract (SLiCE), In-Fusion und Gibson Assemblierung. Es verwendet eine Exonuklease, um einen Strang des Inserts abzubauen, und einen Vektor, um kohäsive Enden zu erzeugen, und entweder in vivo-Reparatur oder in vitro-Rekombination, um das Insert durch Bildung von Phosphodiesterbindungen kovalent mit dem Vektor zu verbinden. Die Möglichkeit, einen einzelnen Insert in beliebiger Sequenz ohne Narben mit einem Vektor zu verbinden, ist sehr ansprechend. Darüber hinaus ist die Technologie in der Lage, 5-10 Fragmente in einer vorgegebenen Reihenfolge ohne Sequenzbeschränkungen zu verbinden.

Als eine von vielen rekombinanten DNA-Techniken ist die Gibson-Assemblierungstechnik, derzeit die effektivste Klonierungsmethode 7,8, eine robuste und elegante Exonuklease-basierte Methode, um ein oder mehrere linearisierte DNA-Fragmente nahtlos zusammenzusetzen. Die Gibson-Assemblierungsreaktion wird unter isothermen Bedingungen unter Verwendung einer Mischung aus drei Enzymen durchgeführt, nämlich 5′-Exonuklease, High-Fidelity-Polymerase und einer thermostabilen DNA-Ligase. Einzelstrangige 3′-Überhänge, die durch die 5′-3′-Exonuklease erzeugt werden, tragen zum Glühen von Fragmenten bei, die an einem Ende Komplementarität aufweisen. Die High-Fidelity-Polymerase füllt effektiv die Lücken in den geglühten Einzelstrangbereichen durch Zugabe von dNTPs, und die thermostabile DNA-Ligase dichtet die Kerben ab, um gemeinsame DNA-Molekülezu bilden 8. Daher ist diese technische Methode für die Konstruktion von Genexpressionsvektoren weit verbreitet.

Das porzine reproduktive und respiratorische Syndrom (PRRS) ist eine Viruserkrankung, die bei Schweinen ab einem Alter von9 Jahren zu Fortpflanzungsstörungen und Atemversagen führt, die durch PRRSV verursacht werden. Das Syndrom manifestiert sich in Form von Fieber, Magersucht, Lungenentzündung, Lethargie, Depression und Atemnot. Darüber hinaus wurden bei einigen Epidemien klinische Symptome, einschließlich roter/blauer Verfärbung der Ohren, beobachtet. Als Mitglied der Familie der Arteriviren wird PRRSV in großem Umfang durch direkten Kontakt und Austausch von Flüssigkeiten, einschließlich Urin, Kolostrum und Speichel, in die schweinefleischproduzierenden Länder übertragen. Aufgrund der Ausbreitung von PRRSV in den Vereinigten Staaten werden die wirtschaftlichen Gesamtverluste der Schweinefleischindustrie auf etwa 664 Millionen US-Dollar pro Jahr geschätzt, basierend auf dem Zuchtmaßstab von 5,8 Millionen Sauen und 110 Millionen Schweinen10,11. Der Bericht des Tier- und Pflanzengesundheitsinspektionsdienstes zeigt, dass 49,8 % der ungeimpften Schweine das Vorhandensein von PRRSV im Serum12 aufweisen und geringe PRRSV-Konzentrationen bei infizierten Schweinen über Speichel, Nasensekret, Urin und Kot ausgeschieden werden13. Es wurden mehrere Strategien implementiert, um die Ausbreitung von PRRSV zu kontrollieren 14,15,16. Neben Eliminierungsverfahren zur Schaffung vollständig virusnegativer Populationen oder zur Verbesserung der Biosicherheit und des Managements ist die Verabreichung von Impfstoffen ein wirksames Mittel zur Kontrolle von PRRS.

PRRSV ist ein behülltes, einzelsträngiges RNA-Virus mit positivem Sinn und einer Länge von etwa 15 Kilobasen (kb). Das PRRSV-Genom besteht aus mindestens 10 offenen Leserahmen (ORFs), einer kurzen 5′-untranslatierten Region (5′ UTR) und einem Poly(A)-Schwanz am 3′-Ende (Abbildung 1A)17. Das Genom eines negativsträngigen RNA-Virus ist nicht infektiös, während das Genom von positivsträngigen RNA-Viren infektiös ist. Es gibt zwei Hauptstrategien für die RNA- und DNA-Transfektion zur Erzeugung von Virusnachkommen18. Die Klonierung des Fragments in voller Länge, das dem RNA-Genom entspricht, ist jedoch entscheidend für die Konstruktion infektiöser Klone. Aufgrund der langen und komplexen Natur des PRRSV-Genoms kann das Genom in voller Länge nicht einfach auf einmal durch PCR gewonnen werden. Obwohl die künstliche Synthese von PRRSV-Genen eine effektive Lösung ist, ist die Synthese langer Fragmente oft teuer. Um den PRRSV-Expressionsvektor in voller Länge zu erhalten, haben wir daher versucht, ihn mit der homologen Rekombinationsmethode19,20 mit mehreren Inserts zu erzeugen. Leider war es uns nicht möglich, den Genexpressionsvektor in voller Länge zu erhalten. Daher fügten wir in dieser Studie dem reversen Primer geeignete Restriktionsstellen hinzu und erhielten den pVAX1-PRRSV-Expressionsvektor erfolgreich durch mehrere Runden homologe Rekombinationsreaktionen. Darüber hinaus kann mit dieser Methode auch eine Deletion oder Mutation von Zielgenen erreicht und eine große Anzahl von DNA-Fragmenten effizient an den Expressionsvektor gebunden werden.

Protocol

1. Vorbereitung des Templates des PRRSV-Gens Tauen Sie den Virusbestand in 1 ml RNA-Extraktionsreagenz auf (siehe Materialtabelle). 0,2 mL Chloroform zugeben und gründlich mischen. 3 Min. inkubieren. Die Mischung 15 min bei 12.000 × g bei 4 °C zentrifugieren.HINWEIS: Das Gemisch ist in drei Phasen unterteilt, nämlich eine farblose wässrige Phase, eine Interphase und eine rote Phenol-Chloroform-Phase. Pipettieren Sie die farblose wässrige Phase heraus und übertragen Sie sie in ein neues Röhrchen. Die wässrige Phase gründlich mit 0,5 mL Isopropanol mischen und 10 min bei 4 °C inkubieren. 10 min bei 12.000 × g bei 4 °C zentrifugieren.HINWEIS: Am Boden des Röhrchens befindet sich ein weißer RNA-Niederschlag. Verwenden Sie eine Mikropipette, um den Überstand des Röhrchens zu entsorgen. Fügen Sie 1 mL 75%iges Ethanol hinzu, um das Pellet zu resuspendieren und kurz zu wirbeln. 5 min bei 7.500 × g bei 4 °C zentrifugieren. Verwenden Sie eine Mikropipette, um den Überstand des Röhrchens zu entsorgen. Trocknen Sie die RNA 5 Minuten lang, fügen Sie 20-50 μl RNase-freies Wasser hinzu, um die RNA zu resuspendieren, und mischen Sie sie gründlich. Fahren Sie mit der Durchführung der reversen Transkription fort. Richten Sie die Reaktionen ein, um eine reverse Transkription durchzuführen, wie in Tabelle 1 gezeigt.HINWEIS: Um eine erfolgreiche reverse Transkription zu gewährleisten, verwenden Sie hochwertige RNA-Vorlagen. Verwenden Sie die resultierende cDNA für die PCR oder lagern Sie sie bei -20 °C. 2. Design des PCR-Primers Entwerfen der vorderen GrundierungÖffnen Sie die Software und wählen Sie Neue DNA-Datei. Fügen Sie die PRRSV-Gensequenz (GenBank: FJ548852.1) aus NCBI in die Software ein. Klicken Sie auf OK , um die Sequenzdateien zu generieren. Analysieren Sie die Sequenz, und markieren Sie die Fragmentknoten. Entwerfen Sie den vorwärtsspezifischen Sequenzprimer der Fragmente. In den meisten Fällen liegt die bevorzugte Schmelztemperatur (Tm) zwischen 55 °C und 62 °C, und der GC-Gehalt liegt bei 40-60 %. Klicken Sie auf Primer und wählen Sie Add Primer. Fügen Sie die spezifische Sequenz ein und fügen Sie Überlappungssequenzen des Vektors zu den ersten 5′-Nukleotiden des spezifischen Sequenzprimers hinzu. Wählen Sie in der Nähe jedes Knotens 20-40 bp aus, um als Überlappungsbereich zwischen den beiden benachbarten Fragmenten zu dienen. Benennen Sie den vorderen Primer, der die Überhänge und die spezifische Sequenz enthält (siehe Ergänzende Abbildung S1). Klicken Sie auf Primer zur Vorlage hinzufügen. Gestaltung der RückseitengrundierungAnalysieren Sie die Sequenz und markieren Sie die Fragmentverbindungen in der Software. Entwerfen Sie den umgekehrten spezifischen Sequenzprimer der Fragmente. Klicken Sie auf Primer und wählen Sie Add Primer. Fügen Sie die spezifische Sequenz ein und fügen Sie die Restriktionsstelle zum ersten 5′-Nukleotid des spezifischen Sequenzprimers hinzu.HINWEIS: Die hinzugefügten Einschränkungsstellen dürfen im Einfügefragment und im Vektor nicht vorhanden sein, mit Ausnahme der mehreren Klonierungsstellen. Fügen Sie 20-40 bp Überhangsequenzen von Vektoren zum ersten 5′-Nukleotid der Restriktionsstelle hinzu. Benennen Sie den umgekehrten Primer, der die Überhänge und die spezifische Sequenz enthält (siehe Ergänzende Abbildung S1). Klicken Sie auf Primer zur Vorlage hinzufügen. 3. PCR zur Amplifikation von Fragmenten Richten Sie sechs einzelne PCR-Reaktionen ein (Tabelle 2): Für Fragment 1 verwenden Sie die Primer P1 und P2 (siehe Ergänzende Abbildung S2); für Fragment 2 sind die Primer P3 und P4 zu verwenden (siehe Ergänzende Abbildung S2); für Fragment 3 sind die Primer P5 und P6 zu verwenden (siehe Ergänzende Abbildung S2); für Fragment 4 sind die Primer P7 und P8 zu verwenden (siehe Ergänzende Abbildung S2); für Fragment 5 die Primer P9 und P10 verwenden; und verwenden Sie die Primer P11 und P12, um Fragment 6 zu amplifizieren (siehe Ergänzende Abbildung S2).HINWEIS: Tauen Sie jede Komponente vor der Verwendung auf, mischen Sie sie und zentrifugieren Sie sie kurz. Führen Sie die PCR mit dem dreistufigen Protokoll in Tabelle 2 durch. 1 μl 6x DNA-Ladepuffer zu 5 μl PCR-Produkt geben, mischen und den Inhalt kurz zentrifugieren. Analysieren Sie die Proben mit 1 % Agarose-Gelelektrophorese. 4. Aufreinigung der PCR-Fragmente HINWEIS: Die Aufreinigung der PCR-Produkte aus einem Gel mit einem Gel-Extraktionskit (siehe Materialtabelle) ist wichtig für die Vektorkonstruktion. 9 μl 6x DNA-Ladepuffer zu 45 μl PCR-Produkten geben, mischen und den Inhalt kurz zentrifugieren. Führen Sie eine 1%ige Agarose-Gel/Goldview-Elektrophorese durch, um die DNA-Fragmente zu trennen.HINWEIS: Verwenden Sie TAE-Laufpuffer nicht wieder, da sein pH-Wert die Rückgewinnung von DNA-Fragmenten beeinflusst. Verwenden Sie nach ausreichender Trennung der Banden ein scharfes Skalpell, um die DNA-Banden vorsichtig zu entfernen.HINWEIS: Minimieren Sie die Größe der Gelscheibe, indem Sie überschüssige Agarose abschneiden. Wiegen Sie die Gelscheibe in einem sauberen 1,5-ml-Mikrozentrifugenröhrchen, geben Sie ein gleiches Volumen an Bindungspuffer in die Gelscheibe (z. B. 0,3 mL auf eine 0,3-g-Scheibe) und inkubieren Sie sie 7 Minuten lang bei 60 °C. Setzen Sie eine Minisäule in ein 2-ml-Entnahmeröhrchen ein. 700 μl DNA/Agarose-Lösung aus Schritt 4.4 in die Mini-Säule geben. Bei 10.000 × g 1 min bei Raumtemperatur zentrifugieren. Entsorgen Sie das Filtrat und verwenden Sie das Auffangröhrchen wieder. 300 μl Bindungspuffer zugeben und bei 13.000 × g 1 min bei Raumtemperatur zentrifugieren. Entsorgen Sie das Filtrat und verwenden Sie das Auffangröhrchen wieder. 700 μl Waschpuffer zugeben und bei 13.000 × g 1 min bei Raumtemperatur zentrifugieren. Entsorgen Sie das Filtrat und verwenden Sie das Auffangröhrchen wieder. Drehen Sie die leere Mini-Säule 2 Minuten lang mit maximaler Geschwindigkeit, um die Säulenmatrix zu trocknen. Legen Sie die Minisäule in ein sauberes 1,5-ml-Mikrozentrifugenröhrchen. Geben Sie 20 μl deionisiertes Wasser direkt in die Mitte der Säulenmembran und lassen Sie es 2 Minuten bei Raumtemperatur stehen. Bei 13.000 × g Geschwindigkeit 1 min zentrifugieren. Lagern Sie die DNA bei -20 °C. 5. Vorbereitung eines linearisierten Vektors HINWEIS: Nach der Vorbereitung des Plasmids können die ausgewählten Enzyme zum Schneiden verwendet werden. Ein langer Verdau oder Dual-Enzym-Verdau ist entscheidend, um die Verdauung der gesamten DNA zu gewährleisten. Dadurch wird die Anzahl der falsch positiven Klone in nachfolgenden Experimenten reduziert. pVAX1-Linearisierung Das Reaktionsgemisch wird bei Raumtemperatur in der angegebenen Reihenfolge hergestellt (Tabelle 3).HINWEIS: Das Volumen Wasser sollte hinzugefügt werden, um das angegebene Gesamtreaktionsvolumen beizubehalten. Hier wurde 1 μg des Plasmids mit Enzymen im Reaktionsgemisch verdaut. Abhängig von der Plasmidkonzentration kann das Volumen des Plasmids im Reaktionsgemisch eingestellt werden. Vorsichtig mischen; dann nach unten drehen. Bei 37 °C in einem Heizblock oder Wasserthermostat 60 min inkubieren. Führen Sie eine Gelaufreinigung durch, die der Aufreinigung der PCR-Fragmente in Abschnitt 4 mit dem Gelextraktionskit ähnelt (siehe Materialtabelle). pVAX1-F1 LinearisierungHINWEIS: pVAX1-F1 ist der Vektor, der aus der ersten Runde der Rekombination von pVAX1 (NdeI und HindIII) und Fragment 1 erhalten wurde. pVAX1-F2 ist der Vektor, der aus der Rekombination von pVAX1-F1 (NdeI) und Fragment 2 erhalten wird. pVAX1-F3 ist der Vektor, der aus der Rekombination von pVAX1-F2 (NdeI) und Fragment 3 erhalten wird. pVAX1-F4 ist der Vektor, der aus der Rekombination von pVAX1-F3 (NdeI) und Fragment 4 erhalten wird. pVAX1-F5 ist der Vektor, der aus der Rekombination von pVAX1-F4 (EcoRV und NtoI) und Fragment 5 erhalten wurde.Für jeden Vektor wird das Reaktionsgemisch separat bei Raumtemperatur in der angegebenen Reihenfolge hergestellt (Tabelle 3). Vorsichtig mischen; dann nach unten drehen. Bei 37 °C in einem Heizblock oder Wasserthermostat 60 min inkubieren. Führen Sie eine Gelaufreinigung durch, die der Aufreinigung der PCR-Fragmente in Abschnitt 4 mit dem Gelextraktionskit ähnelt (siehe Materialtabelle). 6. Subklonierung auf einen neuen Vektor HINWEIS: Eine gute Klonierungseffizienz kann erreicht werden, wenn 50-200 ng Vektor und Inserts verwendet werden. Richten Sie die nahtlose Klonierungs- und Assemblierungsreaktion von ExonArt ein (Tabelle 4). Das Gesamtreaktionsvolumen wird mit sterilisiertem deionisiertem H2O auf 10 μl eingestellt und gemischt. Inkubieren Sie die Reaktion in einem Thermocycler für 15-60 min bei 50 °C. Lagern Sie die Proben auf Eis.HINWEIS: Eine Verlängerung der Inkubation auf bis zu 60 Minuten kann die Montageeffizienz verbessern. Tauen Sie DH5α chemisch kompetente Zellen auf Eis auf. 10 μl des Assemblierungsprodukts werden in die zuständigen Zellen gegeben; Mischen Sie dann vorsichtig, indem Sie auf und ab pipettieren. Die Mischung für 30 min auf Eis legen. Hitzeschock bei 45 °C für 45 s und die Schläuche für 3 min auf Eis übertragen. Geben Sie 900 μl SOC-Medium in das Röhrchen. Schütteln Sie das Röhrchen bei 225 U/min für 1 h in einem 37 °C Schüttelinkubator. Die Umwandlungsreaktion bei 6.000 × g für 2 min zentrifugieren. Den Überstand verwerfen und die Zellen in 100 μl frischem SOC-Medium resuspendieren. Verteilen Sie die transformierte Zellsuspension auf einer separaten LB-Platte mit 50 μg/ml Kanamycin. Alle Platten über Nacht bei 37 °C inkubieren. Wählen Sie einzelne isolierte Kolonien aus jeder Versuchsplatte aus. 7. Analyse der Transformatoren Entnehmen Sie acht Kolonien in 20 μl LB-Medium mit 50 μg/ml Kanamycin. Richten Sie die Kolonie-PCR-Reaktion ein und führen Sie die PCR durch (Tabelle 5).HINWEIS: Für die Kolonie-PCR-Reaktion für Fragment 1 sind die Primer P1 und P2 zu verwenden (siehe Ergänzende Datei 1); für Fragment 2 sind die Primer P3 und P4 zu verwenden (siehe Zusatzdatei 1); für Fragment 3 sind die Primer P5 und P6 zu verwenden (siehe Zusatzdatei 1); für Fragment 4 sind die Primer P7 und P8 zu verwenden (siehe Ergänzende Abbildung S2); für Fragment 5 die Primer P9 und P10 verwenden; und verwenden Sie die Primer P11 und P12, um Fragment 6 zu detektieren (siehe Ergänzende Abbildung S2). Geben Sie 1 μl 6x DNA-Ladepuffer zu 5 μl des PCR-Produkts, mischen Sie und zentrifugieren Sie den Inhalt kurz. Analysieren Sie die Ergebnisse mit 1% Agarose-Gelelektrophorese. Wählen Sie eine positive Kolonie in 5 mL LB-Medium mit 50 μg/mL Kanamycin aus und züchten Sie über Nacht bei 37 °C. Beziehen Sie das Plasmid mit einem Plasmid-DNA-Mini-Kit (siehe Materialtabelle) gemäß den Anweisungen des Herstellers. Visualisieren Sie die Ergebnisse mit einer Elektrophorese von 1 % Agarose-Gel.

Representative Results

In dieser Arbeit stellen wir ein in vitro Rekombinationssystem vor, um überlappende DNA-Moleküle mit Hilfe des Reverse-Primers über kontinuierlich eingeführte Restriktionsstellen zu assemblieren und zu reparieren (Abbildung 1B). Dieses System ist ein einfaches und effizientes Verfahren, das die Präparation des linearen Vektors und der Insert-Fragmente umfasst, die durch PCR eingeführte Überhänge enthalten, wobei Primer geeignete 5′-Verlängerungssequenzen und Restriktionsste…

Discussion

Die Gibson-Assemblierungstechnik ist eine auf In-vitro-Rekombination basierende molekulare Klonierungsmethode zur Assemblierung von DNA-Fragmenten8. Diese Methode ermöglicht den Zusammenbau mehrerer DNA-Fragmente zu einem zirkulären Plasmid in einer isothermen Reaktion mit einem einzigen Röhrchen. Eines der Hindernisse für die Gibson-Assemblierungstechnik ist jedoch die Gewinnung langer Fragmente aus cDNA. Die langen Fragmente sind aus vielen Gründen schwer genau zu vervielfältigen….

Offenlegungen

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Diese Arbeit wurde durch die finanzielle Unterstützung der Promotionsanbahnungsmittel unterstützt, die von der China West Normal University (Nr. 20E059) zur Verfügung gestellt wurden.

Materials

1 kb plus DNA Ladder Tiangen Biochemical Technology (Beijing) Co., Ltd MD113-02
2x Universal Green PCR Master Mix Rong Wei Gene Biotechnology Co., Ltd A303-1
Agarose Sangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd. 9012-36-6
Benchtop Microcentrifuge Thermo Fisher Scientific  Co., Ltd FRESCO17
Clean Bench Sujing Antai Air Technology  Co., Ltd VD-650-U
DNA Electrophoresis Equipment Cleaver Scientific  Co., Ltd 170905117
DNA Loading Buffer (6x) Biosharp Biotechnology Co., Ltd BL532A
E. Z. N. A. Gel Extraction kit Omega Bio-Tek Co., Ltd D2500-01
E.Z.N.A. Plasmid DNA Mini Kit I Omega Bio-Tek Co., Ltd D6943-01
Electro-heating Standing-temperature Cultivator Shanghai Hengyi Scientific Instrument Co., Ltd DHP-9082
ExonArt Seamless Cloning and Assembly kit Rong Wei Gene Biotechnology Co., Ltd A101-02
ExonScript RT SuperMix with dsDNase Rong Wei Gene Biotechnology Co., Ltd A502-1
FastDigest Eco321 (EcoRV) Thermo Fisher Scientific  Co., Ltd FD0303
FastDigest HindIII Thermo Fisher Scientific  Co., Ltd FD0504
FastDigest NheI Thermo Fisher Scientific  Co., Ltd FD0974
FastDigest NotI Thermo Fisher Scientific  Co., Ltd FD0596
Gel Doc XR Bio-Rad Laboratories Co., Ltd 721BR07925
Goldview Nucleic Acid Gel Stain Shanghai Yubo Biotechnology Co., Ltd YB10201ES03
Ice Maker Machine Shanghai Bilang Instrument Manufacturing Co., Ltd FMB100
Invitrogen Platinum SuperFi II DNA Polymerase Thermo Fisher Scientific  Co., Ltd 12361010
LB Agar Plate (Kanamycin) Sangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd. B530113-0010
LB sterile liquid medium (Kanamycin) Sangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd. B540113-0001
Micropipettors Thermo Fisher Scientific  Co., Ltd
Microwave Oven Panasonic Electric (China) Co., Ltd NN-GM333W
Orbital Shakers Shanghai Zhicheng Analytical Instrument Manufacturing Co., Ltd ZHWY-2102C
PRRSV virus Sichuan Agricultural University
SnapGene GSL Biotech, LLC v5.1 To design primers
T100 PCR Gradient Thermal Cycler Bio-Rad Laboratories  Co., Ltd T100 Thermal Cycler
TAE buffer Sangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd. B040123-0010
TRIzol Reagent Thermo Fisher Scientific  Co., Ltd 15596026 RNA extraction reagent

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Diesen Artikel zitieren
Yang, M., Cui, L., Liu, X. A Seamless Cloning Approach for Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Expression Vector Construction. J. Vis. Exp. (207), e66320, doi:10.3791/66320 (2024).

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