Summary

BrainBeats como um plug-in EEGLAB de código aberto para analisar conjuntamente sinais cardiovasculares e de EEG

Published: April 26, 2024
doi:

Summary

A caixa de ferramentas BrainBeats é um plug-in EEGLAB de código aberto projetado para analisar em conjunto sinais de EEG e cardiovasculares (ECG/PPG). Inclui avaliação de potenciais evocados por batimentos cardíacos (HEP), análise baseada em recursos e extração de artefatos cardíacos de sinais de EEG. O protocolo ajudará a estudar a interação cérebro-coração através de duas lentes (HEP e recursos), aumentando a reprodutibilidade e acessibilidade.

Abstract

A interação entre o cérebro e os sistemas cardiovasculares está atraindo cada vez mais atenção por seu potencial de avançar nossa compreensão da fisiologia humana e melhorar os resultados de saúde. No entanto, a análise multimodal desses sinais é desafiadora devido à falta de diretrizes, processamento de sinais padronizado e ferramentas estatísticas, interfaces gráficas de usuário (GUIs) e automação para processar grandes conjuntos de dados ou aumentar a reprodutibilidade. Existe uma lacuna adicional nos métodos padronizados de extração de recursos de EEG e variabilidade da frequência cardíaca (VFC), prejudicando o diagnóstico clínico ou a robustez dos modelos de aprendizado de máquina (ML). Em resposta a essas limitações, apresentamos a caixa de ferramentas BrainBeats. Implementado como um plug-in EEGLAB de código aberto, o BrainBeats integra três protocolos principais: 1) Potenciais evocados por batimentos cardíacos (HEP) e oscilações (HEO) para avaliar a interação cérebro-coração bloqueada no tempo com precisão de milissegundos; 2) Extração de recursos de EEG e VFC para examinar associações/diferenças entre várias métricas cerebrais e cardíacas ou para construir modelos robustos de ML baseados em recursos; 3) Extração automatizada de artefatos cardíacos de sinais de EEG para remover qualquer contaminação cardiovascular potencial durante a realização de análises de EEG. Fornecemos um tutorial passo a passo para aplicar esses três métodos a um conjunto de dados de código aberto contendo sinais simultâneos de EEG, ECG e PPG de 64 canais. Os usuários podem ajustar facilmente os parâmetros para adaptar suas necessidades exclusivas de pesquisa usando a interface gráfica do usuário (GUI) ou a linha de comando. O BrainBeats deve tornar a pesquisa de interação cérebro-coração mais acessível e reprodutível.

Introduction

Por muito tempo, a abordagem reducionista dominou a investigação científica em fisiologia e cognição humanas. Essa abordagem envolveu a dissecação de processos corporais e mentais complexos em componentes menores e mais gerenciáveis, permitindo que os pesquisadores se concentrassem em sistemas individuais isoladamente. Essa estratégia surgiu devido aos desafios em estudar a natureza intrincada e interconectada do corpo e da mente humanos1. O reducionismo tem sido fundamental para a compreensão de subsistemas individuais isoladamente, como elucidar o papel dos canais iônicos e potenciais de ação para a comunicação neural2 ou cardíaca3 . No entanto, uma lacuna significativa permanece em nossa compreensão de como esses sistemas isolados interagem em uma escala espacial e temporal maior. A estrutura multimodal (integrativa ou ecológica) considera o corpo humano um sistema multidimensional complexo, onde a mente é vista não como um produto do cérebro, mas como uma atividade do ser vivo, uma atividade que integra o cérebro nas funções cotidianas do corpo humano4. As abordagens multimodais e reducionistas não são exclusivas, assim como não podemos estudar um neurônio sem todo o cérebro ou todo o cérebro sem entender as propriedades individuais dos neurônios. Juntos, eles abrem caminho para uma compreensão mais abrangente e sinérgica da saúde humana, patologia, cognição, psicologia e consciência. O presente método visa facilitar a investigação multimodal da interação entre o cérebro e o coração, fornecendo análise conjunta de eletroencefalografia (EEG) e sinais cardiovasculares, ou seja, eletrocardiografia (ECG) e fotopletismografia (PPG). Esta caixa de ferramentas, implementada como um plugin EEGLAB no MATLAB, aborda as limitações metodológicas existentes e é feita de código aberto para facilitar a acessibilidade e reprodutibilidade na área científica. Ele implementa as diretrizes e recomendações mais recentes em seu design e parâmetros padrão para incentivar os usuários a seguir as práticas recomendadas conhecidas. A caixa de ferramentas proposta deve ser um recurso valioso para pesquisadores e médicos interessados em 1) estudar potenciais evocados por batimentos cardíacos, 2) extrair características de sinais de EEG e ECG / PPG ou 3) remover artefatos cardíacos de sinais de EEG.

Pesquisa coração-cérebro
A relação entre o coração e o cérebro tem sido historicamente estudada por meio de métodos de neuroimagem, como ressonância magnética funcional (fMRI) e tomografia por emissão de pósitrons (PET). Usando essas ferramentas, os pesquisadores destacaram algumas regiões cerebrais associadas ao controle cardiovascular (por exemplo, manipulação da frequência cardíaca e da pressão arterial5), mostraram a influência da frequência cardíaca no sinal BOLD6 ou identificaram possíveis vias cérebro-corpo que contribuem para a doença cardíaca coronária (ou seja, pressão arterial evocada por estresse7). Embora esses estudos tenham avançado significativamente nossa compreensão da complexa interação entre o sistema nervoso central (SNC) e a função cardiovascular, essas técnicas de neuroimagem são caras, têm disponibilidade limitada e estão confinadas a ambientes laboratoriais controlados, o que restringe sua praticidade para aplicações no mundo real e em larga escala.

Em contraste, EEG e ECG / PPG são ferramentas mais acessíveis e portáteis que oferecem o potencial para estudar as interações cérebro-coração em ambientes e populações mais diversos ou por períodos mais longos, proporcionando novas oportunidades. O ECG mede os sinais elétricos gerados por cada batimento cardíaco quando o coração se contrai e relaxa por meio de eletrodos colocados na pele (geralmente no tórax ou nos braços)8. O PPG mede as alterações do volume sanguíneo nos tecidos microvasculares (ou seja, fluxo sanguíneo e pulsação) usando uma fonte de luz (por exemplo, LED) e um fotodetector (comumente colocado na ponta do dedo, pulso ou testa), dependendo de como o sangue absorve mais luz do que o tecido circundante9. Ambos os métodos fornecem informações valiosas sobre a função cardiovascular, mas servem a propósitos diferentes e oferecem tipos de dados distintos. Assim como o ECG, o EEG registra os campos elétricos gerados pela atividade sincronizada de milhares de neurônios corticais que se propagam pela matriz extracelular, tecidos, crânio e couro cabeludo até atingirem os eletrodos colocados na superfície do couro cabeludo10. Como tal, o uso de EEG e ECG / PPG é uma grande promessa para avançar nossa compreensão dos processos fisiológicos, cognitivos e emocionais subjacentes às interações cérebro-coração e suas implicações para a saúde e o bem-estar humanos. Portanto, capturar a interação coração-cérebro a partir de sinais de EEG, ECG / PPG com a caixa de ferramentas BrainBeats pode ser particularmente útil para as seguintes áreas científicas: diagnóstico clínico e previsão, aprendizado de máquina de big data (ML), automonitoramento do mundo real11 e imagens móveis do cérebro / corpo (MoBI) 12 , 13 .

Duas abordagens para analisar conjuntamente sinais de EEG e ECG
Existem duas abordagens principais para estudar as interações entre EEG e sinais cardiovasculares:

Os potenciais evocados por batimentos cardíacos (HEP) no domínio do tempo: potenciais relacionados a eventos (ERP) e as oscilações evocadas por batimentos cardíacos (HEO) no domínio da frequência de tempo: perturbações espectrais relacionadas a eventos (ERSP) e coerência entre tentativas (ITC). Essa abordagem examina como o cérebro processa cada batimento cardíaco. Com precisão de milissegundos (ms), esse método requer que ambas as séries temporais estejam perfeitamente sincronizadas e que os batimentos cardíacos sejam marcados nos sinais de EEG. Essa abordagem ganhou interesse nos últimos anos 14,15,16,17,18,19.

Abordagem baseada em recursos: esta abordagem extrai características de EEG e variabilidade da frequência cardíaca (VFC) de sinais contínuos e examina associações entre eles. Isso foi feito independentemente para EEG (muitas vezes denominado EEG quantitativo ou qEEG20), ECG 21,22,23 e PPG 24,25,26. Essa abordagem apresenta aplicações promissoras ao capturar variáveis relacionadas ao estado e às características. Ressalta-se que, tanto para o EEG quanto para os sinais cardiovasculares, quanto maior o registro, mais dominante é a variável traço 27,28,29. Assim, as aplicações dependem dos parâmetros de gravação. As análises baseadas em recursos estão ganhando interesse crescente, fornecendo novas métricas quantitativas para prever o desenvolvimento de transtornos mentais e neurológicos, resposta ao tratamento ou recaída 30,31,32,33,34,35. Essa abordagem é especialmente atraente com conjuntos de dados grandes e do mundo real (por exemplo, clínica, monitoramento remoto), que podem ser obtidos mais facilmente graças às recentes inovações em neurotecnologia vestível11. Uma aplicação menos explorada é a identificação de associações entre características específicas do cérebro e do coração, destacando a dinâmica subjacente do sistema nervoso central. A variabilidade da frequência cardíaca (VFC) pode ser calculada a partir de sinais de ECG e PPG. Ele fornece informações sobre o sistema nervoso autônomo (SNA) medindo as variações nos intervalos de tempo entre os batimentos cardíacos (ou seja, os intervalos normais a normais)27. O aumento da atividade simpática (SNS) (por exemplo, durante o estresse ou exercício) normalmente reduz a VFC, enquanto a atividade parassimpática (PNS) (por exemplo, durante o relaxamento) a aumenta. Uma frequência respiratória mais lenta geralmente aumenta a VFC devido à atividade aprimorada do SNP, especialmente para gravações curtas (<10 min)27. Pontuações mais altas de VFC geralmente sugerem um SNA mais resiliente e adaptável, enquanto uma VFC mais baixa pode indicar estresse, fadiga ou problemas de saúde subjacentes. Registros longos de VFC (ou seja, pelo menos 24 h) fornecem um prognóstico preditivo para várias condições de saúde, incluindo doenças cardiovasculares, estresse, ansiedade e algumas condições neurológicas27. Medidas como pressão arterial, frequência cardíaca ou níveis de colesterol fornecem informações sobre o estado do sistema cardiovascular. Em contraste, a VFC adiciona um aspecto dinâmico, mostrando como o coração responde e se recupera do estresse.

Vantagens do BrainBeats sobre os métodos existentes
Embora existam ferramentas, conforme revisado abaixo, para processar sinais cardiovasculares e de EEG independentemente um do outro, eles não podem ser analisados em conjunto. Além disso, a maioria dos meios disponíveis para processar sinais cardiovasculares envolve licenciamento caro, não permite processamento automatizado (especialmente benéfico para grandes conjuntos de dados), possui algoritmos proprietários que impedem a transparência e a reprodutibilidade ou requer habilidades avançadas de programação por não fornecer uma interface gráfica do usuário (GUI)36. Até onde sabemos, quatro caixas de ferramentas MATLAB de código aberto suportam análise HEP/HEO com uma GUI: a caixa de ferramentas ecg-kit37, o pipeline BeMoBIL38, o plug-in HEPLAB EEGLAB39 e a caixa de ferramentas CARE-rCortex40. Embora o HEPLAB, o BeMoBIL e o kit de ecg facilitem a análise HEP detectando batimentos cardíacos e marcando-os nos sinais de EEG, eles não fornecem análise estatística ou estão limitados ao domínio do tempo (ou seja, HEP). O plug-in CARE-rCortex abordou esses problemas suportando ECG e sinais respiratórios, análise no domínio da frequência de tempo, estatísticas e métodos avançados de normalização e correção de linha de base adaptados à análise HEP/HEO. No entanto, utiliza o método de Bonferroni para correção estatística do erro tipo 1 (ou seja, falsos positivos), que é muito conservador e não fisiologicamente sólido para aplicações de EEG, levando a um aumento nos erros do tipo II (ou seja, falsos negativos)41. Além disso, a caixa de ferramentas não oferece acesso à linha de comando para automação. Por fim, estudos recentes não recomendam métodos de correção basal 42,43,44, pois reduzem a relação sinal-ruído (RSR) e são estatisticamente desnecessários e indesejáveis.

Para resolver essas limitações, apresentamos a caixa de ferramentas BrainBeats, atualmente implementada como um plugin EEGLAB de código aberto no ambiente MATLAB. Ele incorpora as seguintes vantagens em relação aos métodos anteriores:

1) Uma GUI fácil de usar e recursos de linha de comando (para programadores que desejam realizar processamento automatizado). 2) Algoritmos, parâmetros e diretrizes validados para o processamento de sinais cardiovasculares, como detecção de picos de R, interpolação de artefatos de RR e cálculo de métricas de VFC (por exemplo, implantação de diretrizes para janelas, reamostragem, normalização, etc.27,45,46). Isso é importante porque Vest et al. demonstraram como diferenças modestas nessas etapas de processamento podem levar a resultados divergentes, contribuindo para a falta de reprodutibilidade e aplicabilidade clínica das métricas de VFC46. 3) Algoritmos validados, parâmetros padrão e diretrizes para processamento de sinais de EEG, incluindo filtragem e janelamento44,47, re-referenciamento48,49, remoção de canais e artefatos anormais 50,51,52, decomposição otimizada de ICA e classificação de componentes independentes 53,54,55,56. Os usuários podem ajustar todos os parâmetros de pré-processamento ou até mesmo pré-processar seus dados de EEG com seu método preferido antes de usar a caixa de ferramentas para atender às suas necessidades (por exemplo, com o plug-in EEGLAB clean_rawdata50,52, o pipeline BeMoBIL38, o pipeline PREP57, etc.). 4) Potenciais evocados por batimentos cardíacos (HEP, ou seja, domínio do tempo) e oscilações (HEO; perturbações espectrais relacionadas a eventos com métodos wavelet ou FFT e coerência entre tentativas estão disponíveis através do software EEGLAB padrão) a partir de sinais de ECG. Estatísticas paramétricas e não paramétricas com correções para erros do tipo 1 estão disponíveis por meio do software padrão da EEGLAB. As estatísticas não paramétricas incluem estatísticas de permutação e correções espaço-temporais para comparações múltiplas (por exemplo, agrupamento espaço-temporal ou aprimoramento de agrupamento livre de limiar) 58 , 59 . Os usuários podem usar o plug-in LIMO-EEG para implementar modelagem linear hierárquica, que leva em conta bem a variância dentro e entre os sujeitos e implementa uma abordagem univariada em massa livre de suposições com controle robusto para erros tipo I e II60,61. As análises estatísticas dos dados HEP/HEO podem ser realizadas nos domínios do canal e do componente independente. 5) Análise HEP/HEO e HRV a partir de sinais PPG (pela primeira vez para HEP/HEO). 6) Suporta a extração conjunta de recursos de EEG e HRV pela primeira vez. 7) A caixa de ferramentas fornece várias visualizações de dados para inspecionar sinais em várias etapas de processamento necessárias e saídas no nível do assunto.

Método Detectar picos R do ECG Detectar ondas R de PPG HEP/HEO Características do EEG e da VFC Remova artefatos cardíacos do EEG GUI Linha de comando
kit de ecg X X X X
Bônus X X X
HEPLAB X X X X
CARE-rCortex X X X X
Batidas cerebrais X X X X X X X

TABELA 1: Novidades trazidas pelo BrainBeats em relação a métodos semelhantes pré-existentes.

Informações para ajudar os leitores a decidir se o método é apropriado para eles
Esta caixa de ferramentas é apropriada para qualquer pesquisador ou clínico com dados de EEG e ECG/PPG. O plug-in ainda não suporta a importação de sinais de EEG e ECG/PPG de arquivos separados (embora esse recurso esteja disponível em breve). A caixa de ferramentas é apropriada para qualquer pessoa que pretenda realizar análises HEP/HEO, extrair características de EEG e/ou VFC com métodos padronizados ou simplesmente remover artefatos cardíacos dos sinais de EEG. Consulte a Figura 1 para obter um diagrama de blocos resumindo o fluxo e os métodos gerais do BrainBeats.

Figure 1
FIGURA 1. Diagrama de blocos resumindo a arquitetura e o fluxo geral do BrainBeats. As operações comuns entre os três métodos são marrons. As operações específicas para potenciais evocados por batimentos cardíacos (HEP) e oscilações (HEO) são verdes. As operações específicas para a extração de características de EEG e VFC são azuis. As operações específicas para remover artefatos cardíacos dos sinais de EEG são vermelhas. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Protocol

O consentimento informado foi obtido de cada participante, e o comitê de ética da Universidade Federal dos Urais aprovou o protocolo experimental. 1. Requisitos do BrainBeats Instale o MATLAB e o EEGLAB no computador. O EEGLAB pode ser baixado em https://github.com/sccn/eeglab e descompactado (ou clonado para usuários do Git) em qualquer lugar do computador. Consulte a página do GitHub para obter mais detalhes sobre a instalaçã…

Representative Results

Primeiro, o plug-in BrainBeats foi usado para pré-processar dados de EEG e ECG, identificar e remover artefatos e analisar potenciais evocados por batimentos cardíacos (HEP) e oscilações (HEO). O BrainBeats detectou com sucesso os intervalos RR do sinal de ECG e alguns artefatos RR (Figura 2). O BrainBeats também relatou na janela de comando que 11/305 (3,61%) dos batimentos cardíacos foram sinalizados como artefatos e interpolados. O índice médio de…

Discussion

Etapas críticas no protocolo
As etapas críticas são descritas nas etapas 1.1-1.4. Avisos e mensagens de erro são implementados em vários locais da caixa de ferramentas para ajudar os usuários a entender por que podem encontrar problemas (por exemplo, locais de eletrodos não carregados nos dados de EEG, comprimento do arquivo muito curto para calcular uma medida confiável de VFC de frequência ultrabaixa, qualidade do sinal muito baixa para qualquer análise co…

Offenlegungen

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

O Instituto de Ciências Noéticas apoiou esta pesquisa. Agradecemos aos desenvolvedores dos algoritmos originais de código aberto que foram adaptados para desenvolver alguns dos algoritmos do BrainBeats.

Materials

EEGLAB Swartz Center for Computational Neuroscience (SCCN) Free/Open-source
MATLAB The Mathworks, Inc. Requires a license
Windows PC Lenovo, Inc.

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Cannard, C., Wahbeh, H., Delorme, A. BrainBeats as an Open-Source EEGLAB Plugin to Jointly Analyze EEG and Cardiovascular Signals. J. Vis. Exp. (206), e65829, doi:10.3791/65829 (2024).

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