דוח זה מספק פרוטוקולים להרכבה, תרבית תאים ובדיקות על פלטפורמת μSiM לבניית מודלים של מחסום דם-מוח.
ה-microSiM (μSiM) היא פלטפורמת תרבית מבוססת קרום למידול מחסום הדם-מוח (BBB). שלא כמו פלטפורמות קונבנציונליות מבוססות ממברנה, μSiM מספק לנסיינים יכולות חדשות, כולל דימות תאים חיים, איתות פרקריני ללא הפרעה בין חדרי ‘דם’ ו’מוח’, והיכולת לדמות ישירות אימונופלואורסצנטיות ללא צורך בחילוץ / הרכבה מחדש של ממברנות. כאן אנו מדגימים את השימוש הבסיסי בפלטפורמה כדי לבסס מודלים של מונוקולטורה (תאי אנדותל) ותרבית משותפת (תאי אנדותל ופריציטים) של BBB באמצעות ממברנות סיליקון-ניטריד ננו-נקבוביות אולטרה-דקות. אנו מדגימים תאימות הן עם תרביות תאים ראשוניות והן עם תרביות תאי גזע פלוריפוטנטיים המושרים על ידי בני אדם (hiPSC). אנו מספקים שיטות לניתוח איכותני של מודלים של BBB באמצעות צביעה אימונופלואורסצנטית ומדגימים את השימוש ב- μSiM להערכה כמותית של תפקוד מחסום בבדיקת חדירות של מולקולה קטנה. השיטות המסופקות אמורות לאפשר למשתמשים לבסס את מודלי המחסום שלהם על הפלטפורמה, ולקדם את השימוש בטכנולוגיית שבבי רקמות לחקר רקמות אנושיות.
רקמות חיות ממודרות על ידי תאים מיוחדים היוצרים ומתחזקים מחסומים ומווסתים אילו תאים ומולקולות מועברים מתא אחד למשנהו. ויסות לא תקין של תפקודי מחסום יכול להיות המקור הן למחלות חריפות והן למחלות כרוניות. מחסום הדם-מוח (BBB) הוא מחסום הרקמה המגביל ביותר בגוף האדם1. תפקוד לקוי של BBB עומד בבסיס מגוון רחב של מחלות של מערכת העצבים המרכזית (CNS), כולל מחלת אלצהיימר2, מחלת פרקינסון3,4, וטרשת נפוצה 5,6. פגיעה ב- BBB קשורה גם לפגיעה קוגניטיבית ארוכת טווח כתוצאה של הפרעות אקוטיות, כגון אלח דם7, COVID-198 והזיה9 לאחר הניתוח. הפיתוח של תרופות בעלות פוטנציאל לטיפול בהפרעות מוחיות היה קשה באופן מתסכל בגלל האתגר של פריצה מכוונת של מחסום הדם-מוח כדי לספק מולקולות ביו-אקטיביות למטרות במוח10. מסיבות אלה, שיטות לחקר תפקוד BBB במבחנה הן בעלות חשיבות עליונה להבנה וטיפול במחלות של מערכת העצבים המרכזית.
השיטות הבסיסיות למדידת תפקוד מחסום במבחנה כוללות הקמת חד-שכבה או תרבית משותפת על קרום חדיר למחצה ומדידת העמידות שמקנים התאים לדיפוזיה של מולקולות קטנות או לזרמים חשמליים קטנים11,12,13,14. בעוד הופעתן של מערכות מיקרופיזיולוגיות (MPS) הניבה שפע של אפשרויות למידול BBB בתלת-ממד15,16, המגוון של גיאומטריות המערכת מקשה על השוואת מדידות חדירות בין MPS או לערכי ספרות מבוססים. קביעת ערכי בסיס מהימנים חשובה במיוחד במחקר BBB שבו, בגלל ויסות המחסום הנרחב על ידי תאי אנדותל כלי דם במוח, ערכי חדירות במבחנה נבדקים היטב12,17,18. מסיבות אלה, מדידות חדירות על פני חד-שכבות שהוקמו על ממברנות דו-ממדיות יישארו מצרך עיקרי במחקרי BBB במשך שנים רבות. זה נכון לגבי מחסומי רקמות אחרים, כולל מחסומי אפיתל, שבהם ערכים מוחלטים של חדירות בסיסית משמשים כדי לאמת ולהשוות מודלים במבחנה 19,20,21.
במטרה להקים כלי חדש ובעל ערך עבור קהילת המחקר BBB, הצגנו22 וקידמנו 23,24,25,26 את מכשיר המיקרוהכולל פלטפורמת silicon membrane (μSiM) לשימוש במידול רקמת מחסום במהלך 5 השנים האחרונות. התכונה המאפשרת של הפלטפורמה היא קרום דק במיוחד (<100 ננומטר) עם מאות מיליוני ננו-נקבוביות 27,28 או תערובת של ננו-נקבוביות ומיקרו-נקבוביות29. שבבי הממברנה העצמאיים מיוצרים על ‘שבב’ סיליקון של 300 מיקרומטר המייצב את המבנים האולטרה-דקים30 ומאפשר לטפל בהם בפינצטה להרכבת מכשירים. בגלל אופיים האולטרה-דק, לממברנות יש חדירות גבוהה בשני סדרי גודל מזו של ממברנות רגילות חרוטות מסילה המשמשות בהתקני תרבית ממברנות מסחריים31,32. בפועל, משמעות הדבר היא שההפרעה של הממברנה לפיזור מולקולות קטנות מהננו-נקבוביות (<60 ננומטר) היא זניחה33. לכן, עבור מחסומים תאיים, רק התאים והמטריצות שהם מפקידים יקבעו את קצב המעבר של מולקולות קטנות מהתאים האפיקליים לתאי הבסיס המופרדים על ידי הממברנה34. עיצוב המכשיר והאופי האולטרה-דק של הממברנות מספקים גם יתרונות רבים למיקרוסקופיה אופטית. אלה כוללים 1) היכולת לעקוב אחר תרביות חיות באמצעות ניגודיות פאזה או הדמיית שדה בהיר, 2) היכולת להכתים ולצלם באופן פלואורסצנטי באתרו ללא צורך לחלץ ולהעביר את הממברנה לזכוכית כיסוי, ו -3) העובדה שהממברנות דקות יותר מ”פרוסות” קונפוקליות, כך שלתרביות משותפות ישירות יש מרווח טבעי יותר בין סוגי תאים מאשר ניתן להשיג עם ממברנות עקובות בעובי 6-10 מיקרומטר.
לאחרונה, קידמנו את הפלטפורמה לפורמט מודולרי כדי להקל על הרכבה מהירה34 והתאמה אישית35,36. מינפנו את הפורמט המודולרי כדי להפיץ רכיבי התקנים בין ההנדסה הביולוגית שלנו לבין מעבדות מחסום המוח המשתפות פעולה. לאחר מכן פיתחנו במשותף פרוטוקולים להרכבת מכשירים, מונוקולטורה ותרבית משותפת, צביעה אימונופלואורסצנטית וחדירות מולקולות קטנות והראינו ששיטות אלה ניתנות לשחזור בין מעבדות. באמצעות פרוטוקולים אלה, הראינו גם כי הפלטפורמה המודולרית תומכת ב-BBB מאומת שפותח באמצעות שיטת תרבית אנדותל מורחבת (EECM) ליצירת תאי אנדותל דמויי כלי דם במוח (BMEC) מתאי גזע פלוריפוטנטיים המושרים על ידי בני אדם (hiPSCs)37. מטרת הדו”ח הנוכחי היא לסקור שיטות אלה בפירוט רב יותר, ובעזרת הסרטון הנלווה, לאפשר אימוץ רחב יותר של הפלטפורמה בקהילת BBB.
בעוד שבבי הממברנה תוכננו ליציבות, הם יכולים להיסדק או להישבר אם מטפלים בהם בצורה לא נכונה במהלך ההרכבה. לכן, קריטי לאחוז את השבב בחריצי פינצטה השבב ולמקם אותו בעדינות בגוף התאורה. בעת טיפול במכשירים באופן כללי, יש לנקוט משנה זהירות שלא להקפיץ או להפיל את המכשירים. במהלך החיבור של שבב הממברנה למתקן A1, השבב חייב להיות מונח שטוח וממורכז על עמוד המתקן A1 כדי למנוע סדקים בקרום במהלך החיבור לרכיב 1. יתר על כן, יש להימנע מכל מגע עם שכבות ה- PSA החשופות לאחר הסרת מסכות המגן. בעת הטיפול ברכיב 2 לאחר הסרת מסכות המגן, רצוי להחזיק אותו לאורך קצה הרכיב ולהשתמש בפינצטה כדי לתפוס את פינת המשולש שהיא נטולת PSA.
בעוד פרוטוקולים של תרביות תאים תוארו עבור מודלים אפשריים של BBB, מודל התרבית המשותפת BMEC/pericyte של BBB המתואר כאן עשוי להיות מספיק או לא מספיק בהתאם להקשר הפיזיולוגי ולשאלות המעניינות. לדוגמה, סחר בתאי מערכת החיסון מתרחש בעיקר בוורידים הפוסט-נימיים של המוח41,42. באזורים אלה, מרחב פריווסקולרי מפריד בין מחסום BMEC/פריציטים לבין גבולות הגליה שנוצרו על ידי אסטרוציטים. לפיכך, בוורידים פוסט-נימיים, היחידה הנוירו-וסקולרית (NVU) מורכבת משני מחסומים מופרדים פיזית בסדרה, וכפות רגליים אסטרוציטיות אינן נוגעות ישירות במחסום הדם BMEC/פריציטים, המיוצג היטב על ידי המודל הנוכחי. אם המטרה היא מודל NVU שלוקח בחשבון את ההשפעה של גורמים המופרשים על ידי אסטרוציטים על מחסום הדם, ניתן להוסיף תא אסטרוציטים למכשיר המאפשר חילופי גורמים מסיסים דרך החלל הפריווסקולרי. דוגמה זו הודגמה בעבר34 וניתן להרחיב אותה כך שתכלול תאים אחרים כגון מיקרוגליה ונוירונים בתא “מוח” תלת-ממדי. הארכיטקטורה המודולרית של הפלטפורמה מאפשרת להשתמש באסטרטגיות הרכבה פשוטות כדי להשיג תצורות מחדש אלה, כך שהפלטפורמה תהיה פשוטה או מורכבת ככל שיידרש כדי לענות על ההשערות העומדות על הפרק. כל מערך תרבית תאים; עם זאת, חייב להיות מותאם עבור קווי תאים חדשים ותרבויות מרובות. לדוגמה, בשל התכונות של ממברנות סיליקון-ניטריד, ייתכן שיהיה צורך להתאים את פתרונות הציפוי בהשוואה ללוחות תרבית רקמות. הכללת פיברונקטין מסייעת בדרך כלל בהתקשרות תאים ובהישרדותם. יתר על כן, משתמשים יכלו לגדל תאי אנדותל ופריציטים בכיוונים מנוגדים. במקרה זה, ייתכן שיהיה צורך לשנות, למשל, את האופן שבו מדידות החדירות נעשות ומפורשות. עם זאת, מתן צעדים לסוג זה של תרבות הוא מעבר להיקף של מאמר זה.
אתגר נוסף שניתן להיתקל בו במהלך תרבית תאים הוא אידוי מהיר של מדיה, שכן המכשירים יכולים להיות רגישים יותר לשינויים בסביבה בהשוואה לצלחות וצלוחיות סטנדרטיות של תרביות רקמה. אם רואים אידוי עודף או מאטים את גדילת התא, יש למדוד את כל הפרמטרים הקריטיים של האינקובטור כדי להבטיח הגדרות מדויקות. ניתן להוסיף יותר מים לפקק הרקמה או לצלוחית פטרי קטנה הממוקמת בתוך תא תרבית התא, או להחליף מדיה בתדירות גבוהה יותר. יתר על כן, בועות יכולות להיכנס לערוץ התחתון ולהיתקע בתעלה עבור מכשירי תעלות. אמנם ניתן להסיר אותם, אך הכי קל להימנע מהוספת בועות מלכתחילה. כדי לעשות זאת, חשוב לבדוק כי אין בועות בקצה פיפטה או אוויר בקצה פיפטה קצה פיפטה לפני pipeting מדיה לתוך החדר התחתון. יתר על כן, אידוי מדיה בערוץ יכול להוביל לפער בין משטח המדיה לבין ראש הנמל. נפח קטן של מדיה יכול להיות מפוצץ לתוך יציאה אחת עד שהמדיה מגיעה לפני השטח של היציאה הנגדית, ולאחר מכן ניתן להחליף את המדיה באותה יציאה נגדית. בעוד hECSR ו E6 + 10% FBS מדיה לא צריך להיות מחומם באמבט המים, מדיה אחרת ניתן לחמם מראש כדי להפחית היווצרות בועות. אם בועה אכן נכנסת לתא התחתון, ניתן להסיר אותה על ידי הזרמה מהירה של 100 μL דרך התעלה. עם זאת, שיטה זו עלולה להוביל לזיהום בין תאים או מדיה שנשפכים על פני השטח של המכשיר. זה עלול גם לשבש את שכבות התא. לחלופין, ניתן להסיר תחילה את המדיה מהערוץ ולאחר מכן להציג אותה מחדש בנפח של 50 μL. עם זאת, הסרת המדיה תחילה עלולה לגרום להיווצרות בועות נוספות בערוץ. אם בועה אינה נמצאת ישירות מתחת לאזור הממברנה, ניתן להשאיר אותה בתעלה ללא השפעה על תרבית תאים.
התקשרות וגדילה של פריציט, כפי שמודגם באיור 2, יכולות להיות מאתגרות. שימוש בצפיפות זריעה אופטימלית חיוני ליצירת שכבה עם יחס מתאים פיזיולוגית בין תאי פריציט לאנדותל. יתר על כן, כמו pericytes רגישים גזירה, כל חילופי התקשורת בערוץ צריך להיעשות לאט מאוד כדי להגן על התאים. עבור תרבית BPLC, חיבור משופר יכול להיות מושג על ידי ציפוי התא התחתון עם 800 מיקרוגרם / מ”ל קולגן סוג IV או 100 מיקרוגרם / מ”ל פיברונקטין .
אימונוציטוכימיה במכשירים המתוארים כאן מאפשרת ניתוח איכותני של בריאות התא ותפקודו. שיטות להכתמה בצלחות תרבית רקמה או פלטפורמות אחרות צריכות להיות ניתנות לתרגום ישיר לפלטפורמה. עבור תרבית תאים רק בתא העליון, לאחר קיבוע, PBS ניתן להוסיף לתוך החדר התחתון ולהשאיר לשלבים הנותרים, עם חסימה וצביעה נעשה בתא העליון בלבד. זה ממזער את הסיכונים של שבירת הממברנות או מקבל בועות לתוך החדר התחתון. לצביעת תרבית משותפת, אנו ממליצים להשתמש בשני התאים בכל השלבים. חשוב לציין כי צמיגות הקיבוע וה- PBS שונה מזו של המדיה. לכן, זה יכול להיות קל יותר להוסיף בועות לתוך החדר התחתון, ויש לנקוט משנה זהירות כדי לבדוק את קצות פיפטה עבור אוויר בקצה הקצה לפני pipeting לתוך החדר התחתון.
הפרוטוקול המתואר עבור בדיקת חדירות המולקולות הקטנות מאפשר הערכה פונקציונלית וכמותית של תפקוד המחסום של תאי האנדותל בתרבית במכשיר μSiM. בעיה אחת שעשויה להיתקל במהלך בדיקה זו היא משיכת בועות אוויר לתוך פיפטה במהלך איסוף הדגימה מהערוץ התחתון בשלב פרוטוקול 4.1.7.4. כדי להימנע מבעיה זו, חשוב לוודא שהקצה אטום ליציאה לפני תחילת איסוף הדגימה ואין לשאוב את הדגימה מהר מדי. אם פעולה זו אינה פותרת את הבעיה, גודל הקצוות שבהם נעשה שימוש עשוי להיות קטן מדי או גדול מדי מכדי להתאים ליציאות; השתמש בעצות המפורטות בטבלת החומרים. אם ערכי חדירות גבוהים באופן בלתי צפוי נמדדים למרות חד-שכבה קונפלואנטית בריאה למראה, יש לבדוק את שלמות החד-שכבה לאיתור הפרעה במהלך איסוף הדגימה. אנו ממליצים תמיד לבדוק את החד-שכבה מתחת למיקרוסקופ מיד לאחר איסוף הדגימה. אם השכבה החד-שכבתית עדיין נראית שלמה ובריאה, ניתן לתקן את הדגימה ולהעריך סמנים ביולוגיים של תפקוד המחסום, למשל, באמצעות אימונוסטיין של חלבוני הצומת. לעומת זאת, אם נמדדים ערכי חדירות נמוכים באופן בלתי צפוי, חשוב לוודא כי 50 μL של מדיה נדגמים מהערוץ התחתון ללא בועות אוויר. אם התווך יוצא מפתח הדגימה מיד עם מיקום קצה המאגר, יש לאסוף מדיה זו לפני התאמת הפיפטה לפתח הדגימה מכיוון שרוב המולקולה הקטנה הפלואורסצנטית תהיה נוכחת בנפח הראשוני של 10 μL שנדגם מהתעלה התחתונה. ציור עיגולים סביב היציאות באמצעות עט הידרופובי או הנחת סרט הידרופובי עם חור סביב היציאה מונע התפשטות של מדיה שאובה פסיבית. אם הבועות נמשכות במהלך הדגימה או אם הדגימה המלאה של 50 μL אינה מוסרת, אין להשתמש בדגימה. לחלופין, ניתן לקבוע את הנפח המדויק ולהשתמש בו בחישוב החדירות; עם זאת, זה צריך להיעשות רק אם נפח הוסר הוא ≥40 μL, אשר מתאים ~ 98-99% התאוששות צבע34.
The authors have nothing to disclose.
J.L.M., B.E., T.R.G., M.C.M., P.K., M.T., K.C. ו-L.W. מומנו על ידי מענק R33 HL154249 של ה-NIH. J.L.M. מומן על ידי R44 GM137651. M.M. מומן על ידי פרס תוכנית שמידט מכון דל מונטה למדעי המוח, אוניברסיטת רוצ’סטר. M.T. מומן על ידי RF1 AG079138. K.C. מומן על ידי הקרן הבינלאומית למחקר אתי.
Antibodies | |||
CD31 Polyclonal antibody | Thermo Fisher Scientific | PA5-32321 | |
Claudin-5 mouse IgG antibody, 4C3C2 | Thermo Fisher Scientific | 35-2500 | |
Goat α-Mouse IgG Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A11001 | |
Goat α-Rabbit IgG Alexa Fluor 568 | Thermo Fisher Scientific | A11011 | |
Hoechst 33342 | Life Technologies | H3570 | |
NG2, mouse IgG2a, 9.2.27 | Millipore | MAB2029 | |
Occludin mouse IgG antibody, OC-3F10 | Thermo Fisher Scientific | 33-1500 | |
PDGFRβ, rabbit IgG antibody, 28E1 | Cell Signaling Technology | 3169 | |
VE-cadherin mouse IgG2B Clone # 123413 | R&D Systems | MAB9381 | |
ZO-1 rabbit IgG antibody, polyclonal | Thermo Fisher Scientific | 40-2200 | |
Chemicals, peptides, and recombinant proteins | |||
100% Methanol | VWR | 101443-718 | Can be substituted with similar products |
16% Paraformaldehyde | Thermo Fisher Scientific | 28908 | Can be substituted with similar products |
Accutase | Thermo Fisher Scientific | A1110501 | |
Acetic acid | Sigma-Aldrich | 695092 | |
B27 supplement | Thermo Fischer Scientific | 17504044 | |
bFGF | R&D Systems | 233-FB-025 | |
Collagen IV from human placenta | Sigma-Aldrich | C5533 | |
Collagen, Type I solution from rat tail | Sigma-Aldrich | C3867-1VL | Can be substituted with similar products |
DMEM/Ham’s F12 | Thermo Fisher Scientific | 11320033 | |
EGM-2 Endothelial Cell Growth Medium-2 BulletKit | Lonza | CC-3162 | |
Essential 6 medium | Thermo Fisher Scientific | A1516401 | |
Fetal bovine serum (FBS) | Peak Serum | PS-FB1 | |
Fibronectin from bovine plasma | Sigma-Aldrich | F1141 | |
Fibronectin human protein, plasma | ThermoFisher Scientific | 33016015 | Can be substituted with similar products |
hESFM | Thermo Fisher Scientific | 11111044 | |
Lucifer Yellow CH dilithium salt | Sigma-Aldrich | 861502 | |
Normal goat serum | Thermo Fisher Scientific | 500627 | Can be substituted with similar products |
PBS without calcium, magnesium | Cytiva | SH30256.01 | Can be substituted with similar products |
Pericyte Medium | ScienCell | 1201 | Use complete kit (includes supplements) |
Poly-L-Lysine, 10 mg/mL | ScienCell | 0413 | |
Triton X-100 | JT Baker | X198-05 | Can be substituted with similar products |
UltraPure DNase/RNase-Free Distilled Water | Invitrogen™ | 10977015 | Can be substituted with similar products |
Experimental models: Cell lines | |||
Blood-brain barrier hCMEC/D3 cell line | Sigma-Aldrich | SCC066 | |
Human brain vascular pericytes | ScienCell | 1200 | |
iPS(IMR90)-4 human induced pluripotent stem cells | WiCell | RRID:CVCL_C437 | |
Glassware and Plasticware | |||
150 mm TC-treated Cell Culture Dish with 20 mm Grid | Falcon | 353025 | |
Clamps | VWR | MFLX06832-10 | |
Corning tissue culture plates (6-well) | Corning | 3506 | |
Flat 96-well non-binding microplates | Greiner Bio-One | 655900 | |
Microscope Slide Device Holder | SiMPore | USIM-SB | Dimensions compatible with micropscope slide holders |
Nunc 15 mL Conical Sterile Polypropylene Centrifuge Tubes | Thermo Fischer Scientific | 339651 | |
Nunc 50 mL Conical Sterile Polypropylene Centrifuge Tubes | Thermo Fischer Scientific | 339653 | Tube caps can be filled with water for cell culture |
P20-200 pipette tips | VWR | 76322-516 | Alternate brands may not seal as effectively into ports |
Transwell filters (12 well, 12 mm, 0.4 μm pore size, PC) | CoStar | 3401 | |
Instruments | |||
10X Objective (For Andor) | Nikon Instruments Inc. | MRD00105 | Air; WD: 4 mm; NA 0.45 |
10X Objective (For Nikon) | Nikon Instruments Inc. | MRP40102 | Air; WD: 6.2 mm; NA 0.25 |
40X Objective (LWD) (For Andor) | Nikon Instruments Inc. | MRD77410 | Water immersion; WD: 590-610 mm; NA 1.15 |
Andor Spinning Disc Confocal microscope | Oxford Instruments, Andor | ||
Nikon Eclipse Ts2 Phase Contrast Microscope | Nikon Instruments Inc. | Can be substituted with similar products | |
TECAN Infinite M200 | TECAN | Can be substituted with similar products | |
Andere | |||
Advanced PAP Pen | Millipore Sigma | Z672548 | 2 mm tip is recommended |
Assembly kit with fixtures | SiMPore | USIM-JIGSET | Including fixure A1, A2, B1, and B2 |
Camera Adapter for Microscopes | AmScope | CA-CAN-SLR Canon SLR / D-SLR | Φ23.2 – Φ30 adapter fits Nikon Eclipse Ts2 |
Canon EOS Rebel SL3 DSLR Camera | Canon | EOS 250D, BH #CAEDRSL3B, MFR #3453C001 | Can be substituted with similar products |
Cell strainer, 40 µm | Millipore Sigma (Corning) | CLS431750 | |
Component 1 | SiMPore | USIM-C1 | |
Component 2 | SiMPore | USIM-C2 | |
Membrane chips | SiMPore | NPSN100-1L | Other chips formats are available |
SMD handling tweezer double angle | Techni-Tool | 758TW003 | "Chip Tweezers" |
Stainless steel precision type GG tweezer | Techni-Tool | 758TW534 | "Straight Tweezers" |
Software | |||
Fiji | ImageJ | For image processing | |
Fusion | Oxford Instruments, Andor | Instructions for version 2.3.0.44 | |
i-control | TECAN | Instructions for version 2.0 | |
Imaris | Oxford Instruments | For image processing. Instructions for version 9.9.0 |