Ici, nous présentons un protocole à haut débit pour transfecter transitoirement des millions de protoplastes de maïs afin de tester de grandes banques de plasmides dans des cellules mésophylles de maïs.
La transfection des cellules mésophylles du maïs implique souvent la digestion des parois cellulaires végétales pour créer des protoplastes, puis l’insertion d’ADN par électroporation ou polyéthylèneglycol (PEG). Les méthodes précédentes ont été développées pour produire des dizaines de milliers de protoplastes transfectés à la fois. Ici, nous décrivons une méthode simple pour isoler et transfecter des millions de protoplastes mésophylles foliaires dans le maïs (Zea mays L.). Ce processus simplifié supprime certaines étapes courantes de protolasticité, telles que le lavage dans W5. De plus, des étapes telles que la centrifugation, la transfection médiée par PEG et l’incubation ont été modifiées pour fonctionner avec un plus grand nombre de protoplastes. La capacité d’exprimer de grandes bibliothèques de constructions plasmidiques permet des expériences à l’échelle du génome, telles que des tests rapporteurs massivement parallèles dans le maïs.
L’expression transitoire des gènes est un outil puissant en biologie végétale. Cependant, les cellules végétales sont difficiles à transfecter car elles sont entourées d’une paroi cellulaire. Cette barrière à l’entrée de l’ADN n’est pas présente dans d’autres types de cellules couramment étudiés tels que les cellules de mammifères ou d’insectes. Des recherches antérieures ont abordé ce défi en utilisant des protoplastes: des cellules végétales dont les parois cellulaires ont été digérées et enlevées. Contrairement aux tissus foliaires non transformés, les protoplastes végétaux sont faciles à travailler en suspension et se prêtent à des techniques de transfection médiées par électroporation ou polyéthylèneglycol (PEG)1. Les cellules végétales conservent une grande partie de leur fonctionnalité même après l’ablation de la paroi cellulaire. Ainsi, les protoplastes sont utilisés dans une variété de plantes pour étudier la fonction des gènes et des protéines2,3, pour comprendre la transduction du signal4 et pour identifier les cibles possibles pour la sélection végétale5. Les protoplastes sont également un véhicule pratique pour le criblage de constructions d’édition du génome chez diverses espèces cultivées, y compris le blé et la pomme de terre 6,7. En bref, les essais transitoires dans les protoplastes sont indispensables pour la biotechnologie agricole.
Le maïs (Zea mays L.) est la première culture céréalière mondiale en termes de tonnage; En tant que tel, il s’agit d’un axe majeur de la recherche fondamentale et appliquée en phytologie8. Cependant, contrairement aux plantes modèles telles que Nicotiana tabacum9, l’expression transgénique transitoire dans les feuilles de maïs intactes n’est pas systématiquement effectuée. Protoplasting a été utilisé pour obtenir et transfecter des cellules mésophylles de feuilles de maïs10,11. Les méthodes précédentes ont atteint des rendements de transfection allant jusqu’à 75% en utilisant l’électroporation et ont produit des protoplastes transfectés à l’échelle de dizaines de milliers10,15.
Ce protocole détaille comment protoplaster des millions de cellules mésophylles de maïs et les transfecter avec une efficacité comparable aux méthodes précédentes. Les principales étapes sont la culture de plants de maïs étiolés, la récolte du tissu foliaire, la digestion de la paroi cellulaire de la plante et l’administration de l’ADN plasmidique dans les cellules à l’aide de PEG. La principale contribution de ce protocole est la capacité d’étendre la transfection des protoplastes tout en maintenant la viabilité cellulaire requise pour les tests fonctionnels. Cela permet l’utilisation d’expériences à l’échelle du génome, telles que des tests rapporteurs massivement parallèles, qui peuvent tester la fonction de centaines de milliers de régions dans le génome du maïs. Cette méthode a récemment été utilisée pour étudier de grandes bibliothèques d’éléments d’ADN cis-régulateurs, y compris des amplificateurs et des promoteurs12,13,14.
Comme indiqué précédemment, la qualité du matériel végétal utilisé pour la protoplastivité est essentielle pour obtenir des protoplastes de haute qualité16,17,18. Il est crucial de sélectionner des feuilles saines et sans tache. Ce travail a utilisé le cultivar de maïs de recherche populaire B73. Nous n’avons pas testé d’autres cultivars. Les plants de maïs utilisés pour ce protocole ont été cultivés dans l’obscurité parce que les feuilles étiolées produisent des protoplastes avec une plus grande viabilité 16 h après la transfection par rapport aux protoplastes à partir de feuilles vertes. Pour les applications qui ne nécessitent pas d’incubation de nuit, il serait possible d’utiliser du matériel foliaire vert ou vert.
Une étape critique consiste à couper correctement le matériau foliaire en fines tranches avant la digestion enzymatique. Ce processus augmente la surface d’exposition des cellules mésophylles à la solution enzymatique, ce qui augmente le nombre de protoplastes récupérés. Les extrémités distales des feuilles sont jetées et les tranches minces (≤1 mm) sont coupées avec de nouvelles lames de rasoir, qui sont immédiatement éteintes lorsqu’elles commencent à ternir. Pour une quantité donnée de tissu, des tranches plus minces donnent plus de protoplastes à condition que la bonne technique soit utilisée pour minimiser l’écrasement des feuilles.
Il est également important de laver correctement les protoplastes, car ils sont assez délicats après avoir subi l’ablation de la paroi cellulaire. Après la digestion, toutes les solutions sont conservées sur la glace et les protoplastes sombres sont protégés de la lumière. L’osmolarité et le pH sont tamponnés en effectuant les lavages en solution MMG. Pour isoler les protoplastes des débris cellulaires moins denses, la centrifugation a lieu à 100 x g. Les protoplastes centrifugés à 200 x g présentent une viabilité similaire après l’isolement, mais une viabilité plus faible le lendemain, et ils se transforment environ la moitié aussi. Nous recommandons de vérifier la viabilité des protoplastes en les colorant avec du diacétate de fluorescéine (FDA) immédiatement après l’isolement; La viabilité normale varie entre 70% et 90%. Les protoplastes dont la viabilité est inférieure à 40 % après isolement produisent peu de transformants.
L’enrobage et le lavage sont plus faciles lorsque vous travaillez avec de nombreux protoplastes car une pastille clairement visible est obtenue après la transfection. Pour cette raison, la transfection est réalisée avec 1 million de protoplastes ou plus. Lors de la mise à l’échelle du protocole, un récipient de taille appropriée doit être choisi pour les étapes d’incubation (tube à centrifuger de 1,5 mL, 15 mL ou 50 mL), et le volume de solution utilisé pour les étapes de lavage doit être mis à l’échelle en conséquence. Dans tous les cas, il est avantageux de centrifuger dans ≤10 mL d’aliquotes pour s’assurer que les protoplastes ne restent pas dans le surnageant. Une innovation de ce protocole est la suppression de l’étape d’incubation et de lavage de 1 h dans la solution W5 qui est répertoriée dans d’autres protocoles14,19, ce qui s’est avéré inutile entre nos mains.
Comme on l’a vu dans d’autres études, la quantité et la qualité de l’ADN sont toutes deux essentielles à la réussite de la transfection19. Pour les plasmides de l’ordre de 4 à 6 kb, 15 μg d’ADN sont utilisés pour 1 million de protoplastes. Des préparations d’ADN de mauvaise qualité peuvent entraîner une viabilité réduite après la transfection, nous vous recommandons donc d’utiliser un kit d’extraction d’ADN commercial lors de l’isolement des plasmides des bactéries. L’incubation des protoplastes pendant la nuit se fait à température ambiante dans l’obscurité pour permettre la transcription du plasmide ou de la bibliothèque plasmidique tout en minimisant le stress. Après une incubation de nuit, environ la moitié du nombre de protoplastes transfectés à l’origine est récupérée. Les protoplastes sont dilués à une concentration de 500 à 1 000 cellules/μL pour une incubation de nuit. Les protoplastes laissés à incuber pendant la nuit à des concentrations supérieures à 1 000 cellules/μL ont des taux de récupération et une viabilité plus faibles. À des concentrations plus élevées, les débris de protoplastes endommagés et morts peuvent contribuer à la mort des protoplastes voisins. Le lavage des protoplastes après une incubation nocturne sert à la fois à éliminer ces débris et à éliminer l’excès de plasmide.
De tels protocoles ont la limitation que toutes les espèces végétales ou tous les types de tissus ne se prêtent pas au protoplasting. De plus, des différences d’expression génique peuvent être induites par le processus de protolasticité.
En résumé, nous avons détaillé un protocole simple et évolutif pour isoler et transfecter des millions de protoplastes viables de la culture agricole de base Z. mays. Cette méthode peut transfecter beaucoup plus de protoplastes en utilisant le PEG, avec une efficacité de transformation presque aussi élevée que les méthodes basées sur l’électroporation15. Le plus grand nombre net de transformants permet de tester des centaines ou des milliers de constructions dans des expériences à grande échelle telles que des tests rapporteurs massivement parallèles12,13. Les futures expériences à l’échelle du génome sur le maïs permettront aux scientifiques de mieux comprendre l’expression et la régulation des gènes du maïs.
The authors have nothing to disclose.
Ce travail a été soutenu par le National Human Genome Research Institute Interdisciplinary Training in Genomic Sciences (T32 training grant no. HG000035 to J.T.) et le National Institute of Health (NIGMS 1R35GM139532 to C.Q.) et par la National Science Foundation (RESEARCH-PGR IOS-1748843 et PlantSynBio 2240888 to CQ). Nous remercions Andrea Gallovatti de l’Université Rutgers pour le don des semences de maïs.
1.5 mL graduated microcentrifuge tubes | VWR | 490004-444 | |
15 mL Falcon conical centrifuge tube | Corning | 05-527-90 | |
250 mL Pyrex glass beaker | Fisher | 50-121-5005 | |
40 um nylon mesh cell strainer | Fisher | 22363547 | |
50 mL Falcon tube | Corning | 14-432-22 | |
72 cell propagation tray | T.O. Plastics | 725607C | |
Aluminum foil | VWR | 89107-732 | |
Bell jar | Bel-Art | F42022-0000 | |
Benchtop centrifuge | Eppendorf | 5424-R | |
Beta-mercaptoethanol | Sigma-Aldrich | M6250-250ML | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Store at room temperature. |
Bovine serum albumin | Sigma-Aldrich | A2153 | |
Calcium chloride dihydrate (CaCl2*2H2O) | PhytoTech Labs | C135 | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Store at room temperature. |
Cellulase Onozuka R-10 | Duchefa Biochemie | C8001.0010 | |
D-Mannitol | PhytoTech Labs | M562 | |
Dissecting scope | Reichert | Microstar IV | |
Fluorescein Diacetate (FDA) | Thermofischer Scientific | F1303 | Dissolve in acetone at 0.5% weight/volume to make a 1000X stock solution. Protect from light and store at -20 °C. |
Fluorescence Illumination Systems | Prior | Lumen200 | |
Fluorescence microscope | Leica | MDG36 | |
High-capacity centrifuge | Eppendorf | 5810 R | |
Macerozyme | Duchefa Biochemie | M8002.0005 | |
Magnesium chloride (MgCl2) | Sigma-Aldrich | M292-1KG | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Store at room temperature. |
Maize seeds | B73 | USDA-ARS | https://npgsweb.ars-grin.gov/gringlobal/accessiondetail?accid=PI+550473 |
Medium binder clip | Uline | S-24649 | |
MES | Sigma-Aldrich | M5287-250G | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Adjust pH to 5.7 using KOH. Protect from light and store at room temperature. |
Micropipette 20-200 uL | Gilson | F123601G | |
Nanodrop microvolume spectrophotometer | Thermofischer Scientific | ND-1000 | |
NEB 5-alpha competent E. coli | New England BioLabs | C2987H | |
Neubauer hemocytometer | Daigger Scientific | EF16034F | |
No. 9 Single-edge razor blade | Excel | 20009 | |
Orbital shaker | VWR | 89032-104 | |
Poly(ethylene) glycol 4,000 | Sigma-Aldrich | 81240-1KG | |
Potassium chloride (KCl) | Sigma-Aldrich | P9541-1KG | Dissolve in ultrapure H2O to make a 1M stock solution. Store at room temperature. |
Professional Grade Vermiculite | NK Lawn & Garden | G208 | |
Round-bottom glass centrifuge tube 30 mL | Kimble Chase | 45500-30 | |
Rubber adapter for Corex centrifuge tubes | Corning | CLS8445AO | |
Sphagnum peat moss | Premier Horticulture | 0128P | |
TRIzol Reagent | Thermofischer Scientific | 15596018 | |
Tygon vacuum tubing | VWR | 76336-844 | |
Vacuum gauge | Wika | 4269978 |