APTrack是为Open Ephys平台开发的软件插件,可实现实时数据可视化和神经元动作电位的闭环电阈值跟踪。我们已经成功地将其用于人类C纤维伤害感受器和小鼠C纤维和Aδ纤维伤害感受器的显微神经造影。
伤害感受器是一类初级传入神经元,发出潜在有害的有害刺激信号。伤害感受器兴奋性增加发生在急性和慢性疼痛条件下。这会产生异常的持续活动或降低对有害刺激的激活阈值。确定这种兴奋性增加的原因对于基于机制的治疗的开发和验证是必要的。单神经元电阈值跟踪可以量化伤害感受器的兴奋性。因此,我们开发了一个应用程序来允许此类测量并演示其在人类和啮齿动物中的应用。APTrack 使用时态栅格图提供实时数据可视化和动作电位识别。算法通过跨越阈值来检测动作电位,并在电刺激后监测其延迟。然后,该插件使用上下方法调制电刺激幅度,以估计伤害感受器的电阈值。该软件基于Open Ephys系统(V0.54)构建,并使用JUCE框架进行C++编码。它可以在Windows,Linux和Mac操作系统上运行。开源代码可用(https://github.com/ 显微神经学/APTrack)。电生理记录取自在大隐神经中使用挑逗纤维法的小鼠皮肤神经制备中的伤害感受器,以及在腓肠浅神经中使用显微神经造影的健康人类志愿者。伤害感受器根据其对热和机械刺激的反应以及监测传导速度的活动依赖性减慢进行分类。该软件通过时间栅格图简化动作电位识别,从而促进了实验。我们首次展示了体内人类显微神经造影期间以及C纤维和Aδ纤维的离体小鼠电生理记录期间单神经元动作电位的实时闭环电阈值跟踪。我们通过证明人类热敏C纤维伤害感受器的电阈值通过加热感受野来降低,从而建立原理证明。该插件能够对单神经元动作电位进行电阈值跟踪,并允许量化伤害感受器兴奋性的变化。
伤害感受器是周围神经系统中的主要传入神经元,由明显或潜在的组织损伤事件激活,并在急性疼痛中发挥关键的保护作用1。来自动物模型、健康人类志愿者和患者中 C 纤维和 Aδ 纤维伤害感受器的电生理记录显示,在各种疼痛条件下,敏化和异常自发活动2,3,4,5,6,7。了解患者伤害感受器兴奋性这些变化的机制可以使有针对性的治疗干预成为可能8。然而,很少有工具可以直接评估伤害感受器的兴奋性,特别是在患者中9,但这些工具的实用潜力是公认的10,11。
全神经电阈值跟踪可用于检查人类的轴突兴奋性12。然而,由于大的、有髓鞘的外周神经元对感觉复合动作电位的幅度贡献不成比例,全神经电阈值跟踪不允许评估 C 纤维功能11,13。事实上,在之前的一项研究中,患有糖尿病神经病变和化疗诱导的多发性神经病的慢性神经性疼痛队列的全神经电阈值跟踪显示轴突兴奋性没有差异11。
在之前的一项研究中,单神经元水平的电阈值跟踪用于检查离 体 大鼠皮肤神经制剂中逗弄纤维记录期间 C 纤维伤害感受器的兴奋性14。作者证明,钾浓度增加,酸性条件和缓激肽都增加了C纤维伤害感受器的兴奋性,这反映在动作电位产生的电阈值降低。此外,加热热敏伤害感受器的感受野降低了其电阈值,而热不敏感伤害感受器的电阈值增加14。这提供了重要的证据,证明单神经元电阈值跟踪是可能的,并且可以是有用的,但目前没有软件和/或硬件解决方案可用于此类研究,特别是对于人体研究。
在人类中,显微神经造影是直接评估C纤维电生理特性的唯一可用方法15。这种方法已被用于证明慢性疼痛患者的伤害感受器功能障碍2,3,4,5,6,7。显微神经造影可以检测单神经元动作电位;然而,由于信噪比低,研究人员使用标记技术来表征C纤维活性16。在标记技术中,将超阈值电刺激应用于皮肤中的C纤维感受野。这种电刺激产生在恒定延迟下发生的动作电位,该电位由C光纤的传导速度决定。C纤维表现出活动依赖性减慢,因此它们的传导速度降低,因此,它们的传导潜伏期在动作电位放电期间增加17。在基础条件下,C纤维在没有有害刺激的情况下通常不会产生动作电位,因此,它们响应低频电刺激的传导潜伏期是恒定的。引起放电的机械、热或药理学刺激会诱发活动依赖性减慢,从而增加伴随的低频电刺激引起的动作电位的潜伏期。这允许在低信噪比的背景下客观识别对所施加的非电刺激的响应。因此,活性依赖性减慢可用于在功能上表征C纤维16。事实上,C纤维的不同功能类别在涉及改变刺激频率的电刺激范式中表现出独特的活动依赖性减慢模式18,19。C光纤动作电位延迟的这种变化给旨在监测它们的算法带来了挑战。
伤害感受器中的持续活动导致其在低频电刺激期间潜伏期的变异性增加,这再次是由于活动依赖性减慢。这种增加的变异性或抖动是兴奋性的可量化代理度量2。动作电位潜伏期变异的进一步原因包括触发器,其中单个神经元的交替末端分支受到刺激,这导致诱发动作电位具有两个(或更多)相互排斥的基线潜伏期20。最后,外周神经元末端分支的温度变化也以热力学方式引起动作潜伏期变化,变暖增加传导速度,冷却减慢传导速度19。因此,任何寻求对伤害性C纤维进行闭环电阈值跟踪的软件都必须允许电诱发动作电位的延迟变化。
为了实现 C 纤维伤害感受器跨物种电阈值跟踪的目标,我们开发了 APTrack,这是一个用于 Open Ephys 平台21 的开源软件插件,以实现实时、闭环、电阈值跟踪和延迟跟踪。我们提供的概念验证数据表明,在人类显微神经造影期间进行C纤维伤害感受器电阈值跟踪是可能的。此外,我们表明该工具可用于啮齿动物 离体 梳理纤维电生理学,从而使人类和啮齿动物之间的转化研究成为可能。在这里,我们将详细描述研究人员如何实施和使用该工具来帮助他们研究伤害感受器功能和兴奋性。
APTrack是一个用于Open Ephys平台的软件插件。我们选择了这个平台,因为它是开源的、灵活的、实施起来便宜的。不包括恒流刺激器的成本,在撰写本文时,可以以大约 5,000 美元的价格购买开始使用插件所需的所有设备。我们希望这将使研究人员能够更轻松地在周围神经电生理学研究中实施APTrack。此外,研究人员可以自由修改软件以满足他们的实验需求。重要的是,该工具首次允许在人类中对单个C纤维伤害感受器进行电阈值跟踪。
信噪比越高,算法就越能识别动作电位。在我们的大多数记录中,微神经造影期间的信噪比是足够的,但用户必须警惕信号随时间下降的风险。这对于较长的实验方案尤其重要,因为如果跟踪的动作电位的幅度降至检测阈值以下,刺激幅度将被错误地增加;这可以通过实验者监控插件,然后根据需要调整设置来缓解。带通滤波提高了信噪比,但如果较大的瞬变在搜索框时间窗口内到达,它们仍可能被误认为动作电位。通过缩小插件搜索动作电位的时间窗口并优化阈值设置,可以降低将瞬态噪声错误识别为动作电位的风险。但是,仍然存在可能遇到阻碍插件性能的情况。如果较大振幅的动作电位落在算法的搜索框窗口内,则自发活动可能会导致困难,因为它们会被错误地识别为目标动作电位。此外,感兴趣的神经元中的自发活动可能意味着电刺激在其不应期内下降,导致无法产生动作电位。当初级传入神经元表现出触发器时,也会出现使用该软件的困难,从而刺激单个神经元的交替末端分支,从而导致诱发动作电位具有两个(或多个)相互排斥的基线潜伏期20。在记录表现出高信噪比触发器的神经元期间,我们通过增加搜索框宽度来封装神经元表现出的所有潜在传导速度,从而成功地执行了延迟和电阈值跟踪。然而,电阈值可能因被激发的神经元的末端分支而异,这可能部分是由于从电刺激部位到替代伤害感受器末端的距离差异。关于动作电位识别过程的其他工作,例如包括模板匹配是可行的,并且可以集成到该软件中。用于带阻或自适应噪声滤波的GUI插件也可以用于信号链中的APTrack上游。
我们认为确定的电阈值是在用户定义的电刺激数量(通常为2-10)的50%时间内引发动作电位所需的电流。电刺激的形态为0.5毫秒和正方波脉冲。这与确定流变碱基不同,流变碱基是神经元兴奋性的常用测量方法。该插件可以调整为确定流变基数。然而,我们采用了更简单的测量方法,因为兴奋性的动态变化,例如假设在加热期间发生的那些变化,比我们的电阈值估计更难量化流变基变化。
该软件可用于人类和啮齿动物实验。这是通过对电刺激系统的灵活支持实现的。该软件可与任何接受模拟命令电压或可与步进电机手动接口的刺激器配合使用。对于显微神经造影,我们将其与带有CE标志的恒流刺激器一起使用,该刺激器设计用于人类研究,其刺激由表盘控制。接受模拟电压命令的刺激器可能会有噪音,因为它们不会断开激励之间的电路,这意味着模拟输入上的任何 50/60 Hz 嗡嗡声或噪声都将传输到录音中。需要额外的 TLL 触发信号来连接电路的刺激器,允许在类似于模拟电压输入的电流下产生激励,非常适合与插件一起使用。这可以防止噪声在刺激之间传递到记录中。
该软件使用简单的上下方法来估计电阈值。几十年来,这一直被用于心理物理学测试25。与上下方法一致,用于调制刺激幅度的电阈值跟踪算法在计算下一个刺激的幅度时仅考虑前一个刺激的幅度和响应。这意味着刺激幅度将在真正的电阈值附近振荡,从而产生50%的放电率,假设阈值稳定。增量或递减的最小大小为0.01 V;这相当于0.01 mA,假设激励器的输入输出比为1 V:1 mA,分辨率足以实现如此小的阶跃变化。该插件将更新目标动作电位电阈值的实时估计值,每次它在用户定义的先前刺激数量 (2-10) 上达到 50% 的发射率时。事后,我们建议使用最近 2-10 次刺激的刺激幅度的滚动平均值来估计电阈值,应该注意的是,只有当放电率相对稳定在 50% 时,此估计才会准确。在电阈值的实时和事后估计中,需要考虑分辨率、可靠性和时间的平衡。使用较小的增量和递减步长将提高电阈值估计的准确性,但会增加最初和扰动后找到新电阈值所需的时间。计算更多先前刺激的电阈值将提供更好的可靠性,但会增加达到准确估计所需的时间。
APTrack 设计用于周围神经记录,专门用于在实验和病理扰动期间跟踪 C 纤维的电阈值,其中动作电位潜伏期可能因潜在的神经元活动而异。该方法不仅可以检查轴突兴奋性,还可以检查健康志愿者和患者的伤害感受器发生器电位。我们预计电生理学的其他领域可能会采用并调整该工具,以用于任何需要对刺激锁定活动进行电阈值跟踪的实验。例如,这可以很容易地适应由APTrack驱动的光脉冲的光遗传学刺激。该插件是开源的,可供研究人员在 GPLv3 许可证下使用。它建立在 Open Ephys 平台上,这是一个适应性强、低成本的开源数据采集系统。该插件为下游插件提供了额外的钩子,以提取动作电位信息并提供额外的用户界面或自适应范式。该插件提供了一个简单的用户界面,用于实时可视化和延迟跟踪动作电位。它还可以回放以前的数据并使用时态栅格图对其进行可视化。此外,它还可以在播放以前的数据期间执行延迟跟踪。虽然还有其他软件包可用于实时延迟跟踪,但它们不是开源的,无法执行电阈值跟踪26,27。与传统方法相比,APTrack 在从电压迹线识别恒定延迟动作电位方面具有优势,因为它使用时间栅格图进行数据可视化。此外,我们在低信噪比实验中使用它的经验表明,时间栅格图可视化方法可以识别可能错过的恒定延迟动作电位。
全神经阈值跟踪是评估轴突兴奋性的广泛使用的方法13。啮齿动物C纤维中的单神经元电阈值跟踪以前已被用于量化伤害感受器兴奋性14,其在人类中的实用性得到认可10,11;然而,直到现在,这是不可能的。我们提供了一种新颖的开源工具,用于直接测量啮齿动物和人类周围神经电生理研究中的单一伤害感受器兴奋性。APTrack首次实现了对人类单神经元动作电位的实时、开源、电阈值跟踪。我们预计它将促进啮齿动物和人类之间伤害感受器的转化研究。
The authors have nothing to disclose.
我们要感谢我们的资助者的支持:医学科学院(J.P.D.,A.E.P.),VS关节炎(J.P.D.,A.E.P.),Jean Golding Institute Seedcorn Grant(J.P.D.,A.E.P.,G.W.,A.C.S.,M.M.P.)和生物技术和生物科学研究委员会与礼来公司(G.W.T.N.)的合作培训伙伴关系博士生奖学金。我们要感谢所有为APTrack开发做出贡献的人。我们还要感谢参与微神经造影实验的志愿者以及我们的患者和公众参与和参与合作者的宝贵贡献。
12V DC Power Supply | NA | NA | To power uStepper S-lite. Required for dial-controlled stimulators. |
36 Pin Electrode Adapter Board | Intan Technology | C3410 | APTrack Dependency. For connecting electrode input to headstage. $255 USD as of March 2021. |
APTrack Plugin | NA | NA | https://github.com/Microneurography/APTrack |
Bipolar Ag/AgCl Recording Electrode | Custom | NA | Recording electrode for the skin-nerve preparation. Or equivalent. |
Bipolar Concentric Stimulating Electrode | World Precision Instruments | SNE-100 | For electrical stimulation in the mouse skin-nerve preparation. Or equivalent. |
Bipolar Transcutaneous Stimulating Electrode | Custom | NA | For transcutaneous electrical stimulation while searching for single-neuron action potentials during microneurography. |
BNC T Splitter (1+) | NA | NA | APTrack Dependency. Any standard BNC T splitter. |
BNC to BNC cables (3+) | NA | NA | APTrack Dependency. Any standard BNC cables. |
C6H11NaO7 | Merck | S2054 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
CaCl2 | Merck | C5670 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
Digitimer DS4 Constant Current Stimulator | Digitimer | DS4 | Constant current stiulator for animal research. £1,695 GBP as of September 2022. |
Digitimer DS7 Constant Current Stimulator | Digitimer | DS7A | Constant current stiulator for human research. £3,400 GBP as of September 2022. |
Electroaccupuncture Classic Plus Stimulating Electrodes | Harmony Medical | NA | For fixed position intradermal electrical stimulation of the dorsal aspect of the foot during human microneurography. |
Glucose | Fisher Scientific | G/0450/60 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
HDMI Cable | NA | NA | APTrack Dependency. Any standard passive HMDI cable. To connect OE I/O Board to OE Acquisition Board. |
KCl | Merck | P9541 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
MgSO4 | Acros Organics | 213115000 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
Mineral Oil | Merck | 330779 | Electrical insulation for nerve recordings in th skin-nerve preparation. Or equivalent. |
NaCl | Merck | S9888 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
NaHCO3 | Merck | S6014 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
NaHCO3 | Merck | S0751 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
Open Ephys Acquisition Board | Open Ephys | NA | APTrack Dependency. Includes USB cable to connect to computer and mains socket power supply. €2,955 EUR as of September 2022. |
Open Ephys Graphical User Interface | Open Ephys | NA | https://github.com/open-ephys/plugin-GUI |
Open Ephys I/O Board | Open Ephys | NA | APTrack Dependency. For ADC voltage inputs via BNC cables. €12.5 EUR without connectors, €85 EUR with connectors as of September 2022. |
PulsePal V2 | Sanworks | 1102 | APTrack Dependency. Open-source DAC and train generator. $725 USD pre-assembled as of September 2022. Approx. $275 USD for self-assembly. |
RHD 6ft SPI Cable | Intan Technology | C3206 | APTrack Dependency. For connecting headstage to OE Acquisition Board. $295 USD as of March 2021 |
RHD2216 16ch Bipolar Headstage | Intan Technology | C3313 | APTrack Dependency. For data acquisition and digitization. $725 USD as of March 2021. Or equivalent RHD2000 series headstage. |
Sucrose | Fisher Scientific | S/8560/60 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
TCS-II Thermal Stimulator | QST.Lab | NA | For thermal stimualtion of nociceptor receptive fields during human microneurography. |
Tungsten Microelectrode Pair (Active + Reference) | FHC | 30085 | For microneurography recordings. 35mm. |
Ultrasound Scanner iQ+ | Butterfly Network | NA | For ultrasound-guided electrode insertion during microneurography. |
USB 3.0 5kV RMS Isolation | Inota Technology | 7055-D | For isolating human microneuroography participant from computer. €459 EUR as of September 2022. |
USB-A to micro USB-B cable (2) | NA | NA | APTrack Dependency. To connect computer to PulsePal and to uStepper S-lite if using stepper-stimulator interfacing. |
uStepper S-lite + NEMA17 motor | uStepper | NA | To interface with stimulators via a control dial. €50 EUR as of September 2022. |
Von Frey Filaments | Ugo Basile | 37450-275 | For mechanical stimulation of receptive fields during sensory phenotyping of nociceptors. |