我们提出了一种针对病毒进入前和进入生命周期阶段的抗乙型肝炎病毒(HBV)化合物的协议,使用等温滴定量热法测量与宿主牛磺胆酸钠共转运多肽的结合亲和力(KD)。通过抑制病毒生命周期标志物(cccDNA形成,转录和病毒组装)来确定抗病毒功效。
乙型肝炎病毒(HBV)感染被认为是肝细胞癌的关键危险因素。目前的治疗只能减轻病毒载量,但不能完全缓解。HBV感染的有效肝细胞模型将提供真实的病毒生命周期,这对于筛选治疗剂至关重要。大多数可用的抗HBV药物针对病毒进入后的生命周期阶段,而不是病毒进入之前。该协议详细说明了能够筛选针对病毒进入前和病毒进入后生命周期阶段的治疗剂的感受态肝细胞模型的生成。这包括靶向牛磺胆酸钠共转运多肽(NTCP)结合,cccDNA形成,转录和基于imHC或HepaRG作为宿主细胞的病毒组装。在这里,HBV进入抑制测定使用姜黄素通过NTCP抑制HBV结合和转运功能。使用等温滴定量热法(ITC)评估抑制剂与NTCP的结合亲和力(KD),ITC是一种基于热力学参数的HBV药物筛选通用工具。
乙型肝炎病毒(HBV)感染在世界范围内被认为是一种危及生命的疾病。慢性HBV感染有肝硬化和肝细胞癌的风险1。目前的抗HBV治疗主要集中在使用核苷(酸)类似物(NAs)和干扰素-α(IFN-α)进入病毒后2,3。HBV进入抑制剂Myrcludex B的发现确定了抗HBV药物的新靶点4。与仅靶向病毒复制的抑制剂相比,慢性HBV中进入抑制剂和NAs的组合显着降低了病毒载量5,6。然而,用于筛选HBV进入抑制剂的经典肝细胞模型受到低病毒受体水平(牛磺胆酸钠共转运多肽,NTCP)的限制。hNTCP在肝癌细胞(即HepG2和Huh7)中的过表达可提高HBV感染性7,8。然而,这些细胞系表达低水平的I期和II期药物代谢酶,并表现出遗传不稳定性9。肝细胞模型可以帮助靶向候选抗HBV化合物的不同机制,如病毒前进入,NTCP结合和病毒进入,将加快有效联合方案的鉴定和开发。姜黄素抗HBV活性的研究阐明了抑制病毒进入作为病毒进入后中断的新机制。该协议详细介绍了用于筛选抗HBV进入分子的宿主模型10。
该方法的目标是探索用于抑制病毒进入的候选抗HBV化合物,特别是阻断NTCP结合和转运。由于NTCP表达是HBV进入和感染的关键因素,我们优化了肝细胞成熟方案,以最大限度地提高NTCP水平11。此外,该方案可以将对HBV进入的抑制作用区分为抑制HBV附着与抑制内化。牛磺胆酸(TCA)摄取测定也使用基于ELISA的方法而不是放射性同位素进行修饰,以表示NTCP转运12,13。受体和配体的相互作用通过它们的3D结构14,15得到证实。NTCP功能的抑制可以通过测量TCA摄取活性来评估16。然而,该技术并未提供NTCP与候选抑制剂结合的直接证据。因此,可以使用各种技术来研究结合,例如表面等离子体共振17,ELISA,基于荧光的热移位测定(FTSA)18,FRET19,AlphaScreen和各种其他方法20。在这些技术中,ITC是结合分析的目标标准,因为它几乎可以观察每个反应中的吸热或发射21。使用ITC直接评估NTCP和候选化合物的结合亲和力(KD);这些亲和力值比使用 计算机 预测模型22获得的值更精确。
该协议涵盖了肝细胞成熟,HBV感染和HBV进入抑制剂筛查的技术。简而言之,基于imHC和HepaRG细胞系开发了肝细胞模型。培养的细胞在2周内分化为成熟的肝细胞。使用实时荧光定量PCR、蛋白质印迹和流式细胞术检测NTCP水平的上调11。乙型肝炎病毒粒子(HBVcc)是从HepG2.2.15中产生和收集的。分化的imHC或HepaRG(d-imHC,d-HepaRG)在接种HBV病毒粒子前2小时用抗HBV候选物预防性处理。实验的预期结果是鉴定降低细胞HBV和感染性的药物。使用TCA摄取测定法评估抗NTCP活性。NTCP活性可以被特异性结合NTCP的代理抑制。采用ITC技术研究了可以预测抑制剂及其靶蛋白的交互式结合的可行性,通过生物分子复合物23,24的非共价相互作用确定配体对受体的结合亲和力(KD)。例如,K D ≥ 1 × 103 mM代表弱结合,K D ≥ 1 × 10 6 μM代表中等结合,K D ≤ 1 ×10 9 nM代表强结合。ΔG与结合相互作用直接相关。特别是,负ΔG的反应是用力反应,表明结合是一个自发过程。负ΔH的反应表明结合过程取决于氢键和范德华力。TCA摄取和ITC数据都可用于筛查抗HBV进入剂。这些方案的结果不仅可以为抗HBV筛查提供基础,还可以通过结合亲和力和转运功能评估与NTCP的相互作用。本文描述了宿主细胞的制备和表征、实验设计以及抗HBV条目以及NTCP结合亲和力的评估。
HBV感染通过与肝细胞25上的硫酸乙酰肝素蛋白聚糖(HSPG)的低亲和力结合而引发,然后与NTCP结合,随后通过内吞作用26内化。由于NTCP是HBV进入的关键受体,因此靶向HBV进入可以在临床上转化为减少 新发 感染,母婴传播(MTCT)和肝移植后的复发。阻断病毒进入将是慢性HBV感染的可行替代疗法。
这里总结了上述协议中的一些关键步骤?…
The authors have nothing to disclose.
该研究项目由玛希隆大学和泰国科学研究与创新(TSRI)分别授予A. Wongkajornsilp和K. Sa-ngiamsuntorn。这项工作由国家高等教育科学研究和创新政策委员会办公室通过竞争力项目管理单位(批准号C10F630093)提供财政支持。A. Wongkajornsilp是玛希隆大学医学院Siriraj医院Chalermprakiat赠款的获得者。作者要感谢Sawinee Seemakan小姐(玛希隆大学理学院药物发现优秀中心)对ITC技术的帮助。
Cell lines | |||
HepaRG Cells, Cryopreserved | Thermo Fisher Scientific | HPRGC10 | |
Hep-G2/2.2.15 Human Hepatoblastoma Cell Line | Merck | SCC249 | |
Reagents | |||
4% Paraformadehyde Phosphate Buffer Solution | FUJIFLIM Wako chemical | 163-20145 | |
BD Perm/Wash buffer | BD Biosciences | 554723 | Perm/Wash buffer |
Cyclosporin A | abcam | 59865-13-3 | |
EDTA | Invitrogen | 15575-038 | 8 mM |
G 418 disulfate salt | Merck | 108321-42-2 | |
Halt Protease Inhibitor Cocktail EDTA-free (100x) | Thermo Scientific | 78425 | |
HEPES | Merck | 7365-45-9 | |
illustraTM RNAspin Mini RNA isolation kits | GE Healthcare | 25-0500-71 | |
illustra RNAspin Mini RNA Isolation Kit | GE Healthcare | 25-0500-71 | |
ImProm-II Reverse Transcription System | Promega | A3800 | |
KAPA SYBR FAST qPCR Kit | Kapa Biosystems | KK4600 | |
Lenti-X Concentrator | Takara bio | PT4421-2 | concentrator |
Luminata crescendo Western HRP substrate | Merck | WBLUR0100 | |
Master Mix (2x) Universal | Kapa Biosystems | KK4600 | |
Nucleospin DNA extraction kit | macherey-nagel | 1806/003 | |
Phosphate buffered saline | Merck | P3813 | |
Polyethylene glycol 8000 | Merck | 25322-68-3 | |
ProLong Gold Antifade Mountant | Thermo scientific | P36930 | |
Recombinant NTCP | Cloud-Clone | RPE421Hu02 | |
RIPA Lysis Buffer (10x) | Merck | 20-188 | |
TCA | Sigma | 345909-26-4 | |
TCA Elisa kit | Mybiosource | MB2033685 | |
Triton X-100 | Merck | 9036-19-5 | |
Trypsin-EDTA | Gibco | 25200072 | Dilute to 0.125% |
Antibodies | |||
Anti-NTCP1 antibody | Abcam | ab131084 | 1:100 dilution |
Anti-GAPDH antibody | Thermo Fisher Scientific | AM4300 | 1:200,000 dilution |
HRP-conjugated goat anti-rabbit antibody | Abcam | ab205718 | 1:10,000 dilution |
HRP goat anti-mouse secondary antibody | Abcam | ab97023 | 1:10,000 dilution |
Goat anti-Rabbit IgG Secondary Antibody, Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A-11008 | 1:500 dilution |
Reagent composition | |||
1° Antibody dilution buffer | |||
1x TBST | |||
3% BSA | Sigma | A7906-100G | Working concentration: 3% |
Sodium azide | Sigma | 199931 | Working concentration: 0.05% |
Hepatocyte Growth Medium | |||
DME/F12 | Gibco | 12400-024 | |
10% FBS | Sigma Aldrich | F7524 | |
1% Pen/Strep | HyClon | SV30010 | |
1% GlutaMAX | Gibco | 35050-061 | |
Hepatic maturation medium | |||
Williams’ E medium | Sigma Aldrich | W4125-1L | |
10% FBS | Sigma Aldrich | F7524 | |
1% Pen/Strep | HyClon | SV30010 | |
1% GlutaMAX | Gibco | 35050-061 | |
5 µg/mL Insulin | Sigma Aldrich | 91077C-100MG | |
50 µM hydrocotisone | Sigma Aldrich | H0888-1g | |
2% DMSO | PanReac AppliChem | A3672-250ml | |
IF Blocking solution | |||
1x PBS | Gibco | 21300-058 | |
3% BSA | Sigma | A7906-100G | Working concentration: 3% |
0.2% Triton X-100 | Sigma | T8787 | Working concentration: 0.2% |
RIPA Lysis Buffer Solution | Merck | 20-188 | Final concentration: 1X |
Protease Inhibitor Cocktail | Thermo Scientific | 78425 | Final concentration: 1X |
Na3VO4 | Final concentration: 1 mM | ||
PMSF | Final concentration: 1 mM | ||
NaF | Final concentration: 10 mM | ||
Western blot reagent | |||
10x Tris-buffered saline (TBS) | Bio-Rad | 170-6435 | Final concentration: 1X |
Tween 20 | Merck | 9005-64-5 | |
1x TBST | 0.1% Tween 20 | ||
1x PBS | Gibco | 21300-058 | |
Pierce BCA Protein Assay Kit | Thermo Fisher Scientific | A53225 | |
Polyacrylamide gel | Bio-Rad | 161-0183 | |
Ammonium Persulfate (APS) | Bio-Rad | 161-0700 | Final concentration: 0.05% |
TEMED | Bio-Rad | 161-0800 | Stacker gel: 0.1%, Resolver gel: 0.05% |
2x Laemmli Sample Buffer | Bio-Rad | 161-0737 | Final concentration: 1X |
Precision Plus Protein Dual Color Standards | Bio-Rad | 161-0374 | |
WB Blocking solution/ 2° Antibody dilution buffer | |||
1x TBST | |||
5% Skim milk (nonfat dry milk) | Bio-Rad | 170-6404 | Working concentration: 5% |
1x Running buffer 1 L | |||
10x Tris-buffered saline (TBS) | Bio-Rad | 170-6435 | Final concentration: 1X |
Glycine | Sigma | G8898 | 14.4 g |
SDS | Merck | 7910 | Working concentration: 0.1% |
Blot transfer buffer 500 mL | |||
10x Tris-buffered saline (TBS) | Bio-Rad | 170-6435 | Final concentration: 1X |
Glycine | Sigma | G8898 | 7.2 g |
Methanol | Merck | 106009 | 100 mL |
Mild stripping solution 1 L | Adjust pH to 2.2 | ||
Glycine | Sigma | G8898 | 15 g |
SDS | Merck | 7910 | 1 g |
Tween 20 | Merck | 9005-64-5 | 10 mL |
Equipments | |||
15 mL centrifuge tube | Corning | 430052 | |
50 mL centrifuge tube | Corning | 430291 | |
Airstream Class II | Esco | 2010621 | Biological safety cabinet |
CelCulture CO2 Incubator | Esco | 2170002 | Humidified tissue culture incubator |
CFX96 Touch Real-Time PCR Detector | Bio-Rad | 1855196 | |
FACSVerse Flow Cytometer | BD Biosciences | 651154 | |
Graduated pipettes (10 mL) | Jet Biofil | GSP010010 | |
Graduated pipettes (5 mL) | Jet Biofil | GSP010005 | |
MicroCal PEAQ-ITC | Malvern | Isothermal titration calorimeters | |
Mini PROTEAN Tetra Cell | Bio-Rad | 1658004 | Electrophoresis chamber |
Mini Trans-blot absorbent filter paper | Bio-Rad | 1703932 | |
Omega Lum G Imaging System | Aplegen | 8418-10-0005 | |
Pipette controller | Eppendorf | 4430000.018 | Easypet 3 |
PowerPac HC | Bio-Rad | 1645052 | Power supply |
PVDF membrane | Merck | IPVH00010 | |
T-75 A91:D106flask | Corning | 431464U | |
Trans-Blot SD Semi-Dry Transfer Cell | Bio-Rad | 1703940 | Semi-dry transfer cell |
Ultrasonic processor (Vibra-Cell VCX 130) | Sonics & Materials | ||
Versati Tabletop Refrigerated Centrifuge | Esco | T1000R | Centrifuge with swinging bucket rotar |