Summary

Microscopia Eletrônica de Transmissão In Situ Induzida pela Luz para Observação da Interação Matéria-Líquido Mole

Published: July 26, 2022
doi:

Summary

O presente protocolo descreve modificações do microscópio eletrônico de transmissão (MET) com um sistema de iluminação de luz, a fabricação de células líquidas e observações in situ de TEM de interações induzidas pela luz entre células bacterianas e um fotossensibilizador. Os métodos de preparação da amostra, os danos causados pelo feixe de elétrons e as imagens também são discutidos.

Abstract

O protocolo atual descreve as modificações da configuração do microscópio eletrônico de transmissão (MET) para observações induzidas pela luz in situ . Uma fibra óptica de vidro inserida na coluna de elétrons acima do polo da lente objetiva e um laser, uma fonte de luz ajustável, foram usados para fabricar o dispositivo. Depois que o iluminador foi calibrado usando um sistema de medição externo, ele permite ajustar a intensidade da iluminação às necessidades do processo observado. Este sistema de iluminação foi utilizado para visualizar fenômenos de terapia fotodinâmica antimicrobiana, que atualmente são objeto de intensa pesquisa. A amostra foi preparada detectando uma suspensão de bactérias em um substrato de carbono, grafeno ou nitreto de silício, borrando o excesso de solução, detectando a solução fotossensibilizadora, borrando o excesso de líquido novamente e, em seguida, montando a célula líquida com um segundo substrato ou filme de grafeno. O processo do experimento de imagem em si inclui a escolha do local certo para a observação com o uso de baixa ampliação e uma dose mínima de elétrons e, em seguida, a ativação cíclica da fonte de luz para capturar imagens subsequentes em intervalos especificados com a quantidade mínima de elétrons necessária. A dose de elétrons de cada exposição e o tempo e a intensidade da iluminação usada precisam ser cuidadosamente registrados devido à complexidade dos fenômenos observados, pois, ao mesmo tempo, o processo é impulsionado pela luz e pelo elétron. Depois que o experimento real é realizado, observações de controle adicionais devem ser feitas, nas quais as mesmas doses de elétrons são usadas, mas sem influência adicional da luz e doses menores de elétrons são usadas para doses mais altas de luz. Isso torna possível distinguir os efeitos microestruturais induzidos pela luz daqueles causados por elétrons nos campos da vida e da ciência dos materiais.

Introduction

Fenômenos induzidos pela luz em alta resolução são interessantes em muitos campos, como nanoengenharia 1,2,3, catálise 4,5 e biofotônica6. Alguns desenhos originais que permitem tais experimentos podem ser encontrados na literatura, incluindo modificações dos suportes amostrais 1,4,7,8,9 e da fibra óptica acoplada ao microscópio 10,11.

A combinação de iluminação de luz, um ambiente líquido e microscopia eletrônica de transmissão (MET) oferece uma grande oportunidade para estudos detalhados e dinâmicos de processos fotoinduzidos. No entanto, a condição de alto vácuo dentro do microscópio é bastante desfavorável para muitos líquidos, especialmente soluções de água. O encapsulamento líquido, que o protege do meio ambiente, pode ser alcançado usando algumas técnicas baseadas principalmente em substratos de grafeno 12, nitreto de silício13 ou carbono14. Além das pesquisas em ciência dos materiais2, as chamadas células líquidas oferecem possibilidades para a realização de observações microscópicas não convencionais em espécimes biológicos próximos às suas condições nativas15. Tais observações são extremamente exigentes, especialmente para microrganismos vivos, como células bacterianas. O feixe de elétrons como radiação ionizante causa danos irreversíveis aos corpos de prova hidratados, de modo que a dose de elétrons deve ser especificada16. Isso é necessário para minimizar os efeitos desfavoráveis, controlar os danos e evitar artefatos confusos. A dose máxima ideal de elétrons que permite observações de células vivas ainda é um tópico questionável16, mas a dose de 30 e/nm2 parece ser o valor limiar, pelo menos para as bactérias17.

Alguns dos assuntos de interesse para tais estudos microscópicos são processos durante a terapia fotodinâmica antimicrobiana (TAPA)18. Em suma, a terapia prossegue da seguinte forma. As células bacterianas são cercadas pelo líquido fotossensível chamado fotossensibilizador. Quando a iluminação da luz é dada em um comprimento de onda específico, as espécies citotóxicas reativas de oxigênio (ROS) são geradas a partir da transferência de energia ou carga das moléculas fotossensibilizadoras excitadas para o oxigênio naturalmente presente na solução. Patógenos expostos a ERO são rapidamente inativados com altíssima eficiência, sem efeitos colaterais19. A resposta à terapia varia para micróbios distintos – por exemplo, o impacto do mesmo fotossensibilizador pode ser bastante diferente para bactérias Gram-positivas e Gram-negativas20. Em geral, estabeleceu-se que o principal alvo das ERO são as estruturas externas das células, onde o dano resulta em distúrbios funcionais da membrana celular e, consequentemente, leva à morte de bactérias21,22. No entanto, danos aos ácidos nucleicos e proteínas também podem ser considerados uma causa de inativação18, por isso ainda não se sabe quais estruturas celulares são os principais alvos durante esse processo19. Uma compreensão mais profunda dos processos prejudiciais poderia ajudar a melhorar esta terapia definitiva. Em comparação com os métodos de microscopia de luz utilizados na pesquisa de APDT23, as técnicas de MET dão mais possibilidades de olhar para o mecanismo de APDT com maior resolução e ampliação24. O ETEM já foi utilizado com sucesso para observação celular durante a terapia em curso, o que nos permitiu estudar os danos bacterianos Gram-positivos e descrever detalhadamente as alterações ocorridas dentro da parede celular 6,25.

O protocolo atual apresenta uma configuração experimental adequada para imagens de alta resolução de inativação de bactérias induzidas por luz usando TEM, que requer um sistema adequado de iluminação de luz, o encapsulamento de células com um líquido e um rigoroso controle de dose de elétrons. A bactéria utilizada para a observação foi Staphylococcus aureus, e uma solução de azul de metileno foi utilizada como fotossensibilizador. A configuração especial de iluminação de luz compreende um laser semicondutor ajustável conectado diretamente à coluna do microscópio usando a fibra de luz. Este projeto fornece irradiação uniforme em toda a amostra devido à colocação quase paralela da fibra óptica ao eixo do microscópio. A luz monocromática de alta intensidade gerada pelo laser pode então ser usada para estudar vários efeitos fotoquímicos. A luz utilizada no experimento apresentou comprimento de onda igual a 660 nm, pois, na região visível, o azul de metileno apresenta picos de absorção de 613 nm e 664 nm26. O protocolo para encapsulamento de líquidos é baseado em substratos de carbono, o que torna o procedimento rápido e descomplicado. Finalmente, um método para observação de TEM in situ de baixa dose de células em líquido é apresentado. As dificuldades em relação à preparação da amostra, os efeitos da dose de elétrons sobre a amostra sensível e a interpretação razoável da imagem são discutidos.

Protocol

1. Modificação do microscópio eletrônico de transmissão Modifique o microscópio eletrônico de transmissão conectando a fibra óptica (consulte Tabela de materiais) à coluna do microscópio na parte superior da lente objetiva. Permita alguns centímetros de espaço entre a lente objetiva e a lente condensadora, além de um slot livre para acessórios.NOTA: Um suporte de amostra dedicado4 ou um suporte para observações catodoluminescentes em…

Representative Results

A configuração experimental foi projetada para observar os processos induzidos pela luz que ocorrem em um líquido com alta resolução. A análise competitiva das imagens permitiu distinguir os danos causados pelo feixe de elétrons das mudanças relacionadas à reação fotoquímica. O efeito do feixe de elétrons sobre a amostra sensível (neste caso, as células encapsuladas com líquido) foi visível em toda a área irradiada à medida que os elétrons penetravam através dela uniformemente. Naturalmente, o efeito…

Discussion

A instalação e o comissionamento do iluminador exigem conhecimento básico de serviço e podem danificar o microscópio. A maneira mais simples de introduzir a luz no microscópio é conectar a fibra óptica a partir do topo da lente objetiva, onde geralmente há espaço para as bobinas de deflexão TEM e detectores adicionais. Mais espaço livre também pode ser esperado de dispositivos de entrada superior mais antigos, onde o mesmo local abriga a trava de vácuo da amostra e o mecanismo de instalação da amostra. Es…

Offenlegungen

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

A pesquisa foi apoiada pela bolsa Miniatura (2019/03/X/NZ3/02100, Centro Nacional de Ciências, Polônia).

Materials

Carbon film on 200 mesh copper grid Agar Scientific AGS160 The standard TEM grids for observations and liquid cell preparation
Crossover Tweezers Dumont N5 The tweezers are neecesarry for liquid cell preparation
Photodiode Power Sensor ThorLabs S130C The sensor used for light intensity measurement
Polyimide-Coated Multimode Fiber Thorlabs FG400UEP Must be built into the microscope using the on-site built adapter, according to the 10.1016/j.ultramic.2021.113388
Transmission Electron Microscope Hitachi H-800 Can be replaced with any side-entry microscope, available for modification
Tuneable Diode Laser CNI MRL-III-660D The light wavelength must be chosen basing on photosensitizer's absorption spectrum

Referenzen

  1. Vadai, M., Angell, D. K., Hayee, F., Sytwu, K., Dionne, J. A. In-situ observation of plasmon-controlled photocatalytic dehydrogenation of individual palladium nanoparticles. Nature Communications. 9 (1), 1-8 (2018).
  2. Weng, B., et al. Visualizing light-induced dynamic structural transformations of Au clusters-based photocatalyst via in situ TEM. Nano Research. 12 (1), 1-5 (2021).
  3. Cao, K., et al. In situ TEM investigation on ultrafast reversible lithiation and delithiation cycling of Sn@C yolk-shell nanoparticles as anodes for lithium ion batteries. Nano Energy. 40, 187-194 (2017).
  4. Cavalca, F., et al. In situ transmission electron microscopy of light-induced photocatalytic reactions. Nanotechnology. 23 (7), 075705 (2012).
  5. Tung, C. -. W., et al. Light-induced activation of adaptive junction for efficient solar-driven oxygen evolution: In situ unraveling the interfacial metal-silicon junction. Advanced Energy Materials. 9 (31), 1901308 (2019).
  6. Żak, A. M., Kaczmarczyk, O., Piksa, M., Matczyszyn, K. Light-induced in situ transmission electron microscopy: Novel approach for antimicrobial photodynamic therapy imaging. Photodiagnosis and Photodynamic Therapy. 35, 102463 (2021).
  7. Shindo, D., et al. Development of a multifunctional TEM specimen holder equipped with a piezodriving probe and a laser irradiation port. Journal of Electron Microscopy. 58 (4), 245-249 (2009).
  8. Zhang, C., et al. Photosensing performance of branched CdS/ZnO heterostructures as revealed by in situ TEM and photodetector tests. Nanoscale. 6 (14), 8084-8090 (2014).
  9. Zhang, C., et al. Statistically analyzed photoresponse of elastically bent CdS nanowires probed by light-compatible in situ high-resolution TEM. Nano Letters. 16 (10), 6008-6013 (2016).
  10. Yoshida, K., Yamasaki, J., Tanaka, N. In situ high-resolution transmission electron microscopy observation of photodecomposition process of poly-hydrocarbons on catalytic TiO2 films. Applied Physics Letters. 84 (14), 2542-2544 (2004).
  11. Yoshida, K., Nozaki, T., Hirayama, T., Tanaka, N. In situ high-resolution transmission electron microscopy of photocatalytic reactions by excited electrons in ionic liquid. Journal of Electron Microscopy. 56 (5), 177-180 (2007).
  12. Textor, M., De Jonge, N. Strategies for preparing graphene liquid cells for transmission electron microscopy. Nano Letters. 18 (6), 3313-3321 (2018).
  13. Ring, E. A., De Jonge, N. Microfluidic system for transmission electron microscopy. Microscopy and Microanalysis. 16 (5), 622-629 (2010).
  14. Inayoshi, Y., Minoda, H. A carbon sandwich environmental cell for wet specimens. Journal of Electron Microscopy. 62 (6), 623-628 (2013).
  15. Koo, K., Dae, K. S., Hahn, Y. K., Yuk, J. M. Live cell electron microscopy using graphene veils. Nano Letters. 20 (6), 4708-4713 (2020).
  16. De Jonge, N., Peckys, D. B. Live cell electron microscopy is probably impossible. ACS Nano. 10 (10), 9061-9063 (2016).
  17. Kennedy, E., Nelson, E. M., Damiano, J., Timp, G. Gene expression in electron-beam-irradiated bacteria in reply to "live cell electron microscopy is probably impossible.&#34. ACS Nano. 11 (1), 3-7 (2017).
  18. Alves, E., et al. An insight on bacterial cellular targets of photodynamic inactivation. Future Medicinal Chemistry. 6 (2), 141-164 (2014).
  19. Cieplik, F., et al. Antimicrobial photodynamic therapy-What we know and what we don’t. Critical Reviews in Microbiology. 44 (5), 571-589 (2018).
  20. Huang, L., et al. Type I and Type II mechanisms of antimicrobial photodynamic therapy: An in vitro study on gram-negative and gram-positive bacteria. Lasers in Surgery and Medicine. 44 (6), 490-499 (2012).
  21. Caminos, D. A., Spesia, M. B., Pons, P., Durantini, E. N. Mechanisms of Escherichia coli photodynamic inactivation by an amphiphilic tricationic porphyrin and 5,10,15,20-tetra(4-N,N,N-trimethylammoniumphenyl) porphyrin. Photochemical and Photobiological Sciences. 7 (9), 1071-1078 (2008).
  22. Chu, J. C. H., Chin, M. L., Wong, C. T. T., Hui, M., Lo, P. C., Ng, D. K. P. One-pot synthesis of a cyclic antimicrobial peptide-conjugated phthalocyanine for synergistic chemo-photodynamic killing of multidrug-resistant bacteria. Advanced Therapeutics. 4 (3), 1-10 (2021).
  23. Rogers, S., Honma, K., Mang, T. S. Confocal fluorescence imaging to evaluate the effect of antimicrobial photodynamic therapy depth on P. gingivalis and T. denticola biofilms. Photodiagnosis and Photodynamic Therapy. 23, 18-24 (2018).
  24. Maldonado-Carmona, N., et al. Porphyrin-loaded lignin nanoparticles against bacteria: A photodynamic antimicrobial chemotherapy application. Frontiers in Microbiology. 11, 606185 (2020).
  25. Żak, A. M., Kaczmarczyk, O., Piksa, M., Grzęda, J., Matczyszyn, K. Fiber-optic sample illuminator design for the observation of light induced phenomena with transmission electron microscopy in situ: Antimicrobial photodynamic therapy. Ultramicroscopy. 230, 113388 (2021).
  26. Dinh, V. P., et al. Insight into the adsorption mechanisms of methylene blue and chromium(III) from aqueous solution onto pomelo fruit peel. RSC Advances. 9 (44), 25847-25860 (2019).
  27. Żak, A. Guide to controlling the electron dose to improve low-dose imaging of sensitive samples. Micron. 145, 103058 (2021).
  28. Drulyte, I., et al. Approaches to altering particle distributions in cryo-electron microscopy sample preparation. Acta Crystallographica Section D. 74 (6), 560-571 (2018).
  29. Scarff, C. A., Fuller, M. J. G., Thompson, R. F., Iadaza, M. G. Variations on negative stain electron microscopy methods: Tools for tackling challenging systems. Journal of Visualized Experiments. (132), (2018).
  30. Booth, D. S., Avila-Sakar, A., Cheng, Y. Visualizing proteins and macromolecular complexes by negative stain EM: From grid preparation to image acquisition. Journal of Visualized Experiments. (58), (2011).
  31. Rames, M., Yu, Y., Ren, G. Optimized negative staining: A high-throughput protocol for examining small and asymmetric protein structure by electron microscopy. Journal of Visualized Experiments. (90), e51087 (2014).
  32. Miller, B. K., Crozier, P. A. System for in situ UV-visible illumination of environmental transmission electron microscopy samples. Microscopy and Microanalysis. 19 (2), 461-469 (2013).
  33. Yuk, J. M., et al. High-resolution EM of colloidal nanocrystal growth using graphene liquid cells. Science. 336 (6077), 61-64 (2012).
  34. Schneider, N. M., et al. Electron-Water interactions and implications for liquid cell electron microscopy. Journal of Physical Chemistry C. 118 (38), 22373-22382 (2014).
check_url/de/63742?article_type=t

Play Video

Diesen Artikel zitieren
Żak, A., Kaczmarczyk, O. Light-Induced In Situ Transmission Electron Microscopy for Observation of the Liquid-Soft Matter Interaction. J. Vis. Exp. (185), e63742, doi:10.3791/63742 (2022).

View Video