Här beskriver vi ett protokoll för att erhålla rågiftextrakt från havsanemon och detektera dess hemolytiska och fosfolipasaktivitet.
Havsanemongiftkomposition innefattar polypeptid- och icke-proteinmolekyler. Cytolytiska komponenter har en hög bioteknisk och biomedicinsk potential för att designa nya molekylära verktyg. Havsanemongift lokaliseras i körtelceller från ektoderm och subcellulära strukturer som kallas nematocyster, som båda är fördelade över hela havsanemonkroppen. Denna egenskap innebär utmaningar eftersom cellerna och nematocysten måste lyseras för att frigöra giftkomponenterna med andra giftfria molekyler. Därför härrör giftet först från ett grovt extrakt (blandning av olika och olika molekyler och vävnadsskräp). Nästa steg är att detektera polypeptider med specifika bioaktiviteter. Här beskriver vi en effektiv strategi för att erhålla havsanemonråextraktet och bioassay för att identifiera närvaron av cytolysiner. Det första steget innebär billiga och enkla tekniker (omrörd och frys-tina cykel) för att frigöra cytolysiner. Vi erhöll den högsta cytolytiska aktiviteten och proteinet (~ 500 mg protein från 20 g torrvikt). Därefter analyserades polypeptidkomplexiteten hos extraktet av SDS-PAGE-gel som detekterade proteiner med molekylvikter mellan 10 kDa och 250 kDa. I den hemolytiska analysen använde vi fårröda blodkroppar och bestämde HU50 (11,1 ± 0,3 μg / ml). Däremot bestämdes närvaron av fosfolipaser i det råa extraktet med användning av äggula som substrat i ett fast medium med agaros. Sammantaget använder denna studie ett effektivt och billigt protokoll för att förbereda det råa extraktet och tillämpar replikerbara bioassays för att identifiera cytolysiner, molekyler med biotekniska och biomedicinska intressen.
Marina djur är en rik källa till biologiskt aktiva föreningar. Under de senaste decennierna har sammansättningen av havsanemongift väckt vetenskaplig uppmärksamhet eftersom den omfattar en mångfald av polypeptider med hemolytisk, cytotoxisk, enzymatisk (fosfolipas, proteas, kitinas) och neurotoxisk aktivitet och hämmande effekter på proteolytisk aktivitet1. Dessutom är dessa polypeptider potentiella källor för utveckling av molekylära verktyg i bioteknisk och terapeutisk användning 2,3.
Det finns få rapporter om havsanemongift och dess molekylära komponenter på grund av komplexiteten att erhålla giftet, till och med isolering och karakterisering av toxiner. Extraktionsmetoderna som användes i rapporterna involverade lys och tömning av innehållet i celler som är relaterade och inte relaterade till giftproduktionen1.
En särskild egenskap hos alla cnidarians är frånvaron av ett system för produktion och frisättning av giftet centraliserat i en enda anatomisk region. Istället är nematocysterna strukturer som håller giftet 4,5. Andra typer av celler, som kallas epidermala körtelceller, utsöndrar också toxiner och fördelas också över hela kroppen av havsanemoner6.
Den första och mest avgörande utmaningen för att erhålla giftet är genereringen av ett extrakt med tillräcklig manipulation i efterföljande processer, utan inaktivering eller nedbrytning av labila proteiner. Därefter måste cellerna lyseras och komponenterna – i detta fall måste polypeptider extraheras effektivt och snabbt, vilket undviker proteolys och hydrolys samtidigt som andra cellulära komponenterelimineras 7.
Olika metoder används för att erhålla det råa extraktet av en havsanemon; vissa innebär att offra organismen medan andra tillåter den att hållas vid liv. Metoder som innebär användning av organismens hela kropp möjliggör frisättning av de flesta toxiner från giftet8, jämfört med metoder som håller organismer vid liv, som extraherar endast vissa komponenter i giftet9. Beredningen av ett extrakt kräver utvärdering av närvaron och styrkan hos ett ämne av intresse genom en specifik bioassay, som inkluderar strategier för att observera de farmakologiska effekterna med in vivo – eller in vitro-metoder 10.
Havsanemongift innehåller cytolytiska polypeptider, porbildande toxiner (PFT)11 och fosfolipaser12; dessa molekyler är modeller i studien av protein-lipidinteraktion, molekylära verktyg i cancerterapi och biosensorer baserade på nanopor3. Klassificeringen av havsanemon PFT utförs enligt deras storlek eller molekylvikt, från 5 kDa till 80 kDa. 20 kDa PFT, den mest studerade och kända som aktinoporiner11, är av särskilt intresse för sin biomedicinska potential i utvecklingen av molekylära verktyg för möjliga tillämpningar som anticancer, antimikrobiella och nanoporbaserade biosensorer. Ett annat cytolysin, inklusive fosfolipaser, specifikt fosfolipas A2 (PLA2)13, frigör en fettsyra på grund av och hydrolyserar fosfolipider, destabiliserar cellmembranet. På grund av denna verkningsmekanism lovar PLA2 att vara en viktig modell för studier och tillämpningar vid inflammatoriska sjukdomar. Det kan fungera som en modell för studier av lipidbeteende i cellmembranet14.
Här beskriver vi ett effektivt protokoll för att erhålla det råa extraktet från havsanemonen Anthopleura dowii Verrill, 1869, och detektera hemolysiner och fosfolipaser. Båda är relevanta toxiner som kan användas som mall för att designa nya molekylära verktyg.
Den stora efterfrågan på nya föreningar med tillämpningar inom olika områden av vetenskap och industri har lett till studier av gift. Gift representerar en rik källa till molekyler som fungerar som en mall för att generera nya molekylära verktyg. Komplexiteten hos dessa gifter kräver emellertid implementering och kombination av olika metoder för att erhålla och studera dem.
Här visar vi en metod för att erhålla och analysera giftet från havsanemonen Anthopleura dowii, V…
The authors have nothing to disclose.
Detta arbete stöddes av Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación e Innovación Tecnológica (PAPIIT), med bidragsnummer IT200819. Författarna erkänner Tom Musselman, Rock Paper Editing, LLC, för att ha kontrollerat den engelska grammatiken i detta manuskript; och tekniskt bistånd från Samanta Jiménez (CICESE, Ensenada) och Juan Manuel Barbosa Castillo (Instituto de Fisiología Celular, UNAM). Vi tackar också Dr Augusto César Lizarazo Chaparro (CEPIPSA) för att få fårblod. Vi tackar särskilt Dr José Saniger Blesa, ICAT-UNAM, för anläggningarna i hans laboratorium för videoinspelningen.
15 mL conical centrifuge tube | Corning | 430766 | |
2-Bromophenol blue | Sigma | B75808 | |
2-mercaptoetanol | Sigma-Aldrich | M6250-100ML | |
50 mL conical centrifuge tubes | Corning | 430828 | |
Acetic Acid Glacial | J.T. Baker | 9515-03 | |
Acrylamide | Promega | V3115 | |
Agarose | Promega | V3125 | |
Bisacrylamide | Promega | V3143 | |
Bovine Serum Albumin Fraction V | Sigma | A3059-100G | |
Bradford Protein Assays | Bio-Rad | 5000006 | |
Calcium chloride | Sigma-Aldrich | C3306 | |
Cell culture plates 96 well, V-bottom | Corning | 3894 | |
Centrifuge | Eppendorf | 5804R | |
Centrifuge tubes | Corning | CLS430829 | |
ChemiDoc MP system | Bio-Rad | 1708280 | |
Citric acid | Sigma-Aldrich | 251275 | |
Clear flat.bottom 96-Well Plates | Thermo Scientific | 3855 | |
Coomassie Brilliant Blue G-250 | Bio-Rad | #1610406 | |
Coomassie brilliant blue R-250 | Bio-Rad | 1610400 | |
Dextrose | J.T. Baker | 1916-01 | |
Ductless Enclosure | Labconco | Vertical | https://imagej.nih.gov/ij ImageJ 1.53c |
Gel Doc EZ | Bio Rad. | Gel Documentation System | |
Glycerol | Sigma-Aldrich | G5516-4L | |
Hemocytometer | Marienfeld | 650030 | |
ImageJ (Software) | NIH, USA | Version 1.53c | |
Incubator 211 | Labnet | I5211 DS | |
Methanol | J.T. Baker | 9049-03 | |
Mini-PROTEAN tetra cell | Bio-Rad | 1658000EDU | |
Na2HPO4 | J.T. Baker | 3824-01 | |
NaCl | J.T. Baker | 3624-01 | |
NaH2PO4.H2O | J.T. Baker | 3818-05 | |
Origin software | version 9 | To design the plot with sigmoidal adjustments | |
Petridish | Falcon | 351007 | |
Pipetman kit | Gilson | F167380 | |
Precast mini gel | BioRad | 1658004 | |
Prestained Protein Ladder | Thermo Scientific | 26620 | |
Protease Inhibitor Cocktail | Roche | 11836153001 | |
Protein Assay Dye Reagent Concentrate | Bio-Rad | 5000006 | |
Rhodamine 6G | Sigma-Aldrich | 252433 | |
SDS | Sigma-Aldrich | L4509 | |
Sodium citrate dihydrate | JT Baker | 3646-01 | |
Spectrophotometer | THERMO SCIENTIFIC | G10S UV-VIS | |
Tris Base | Sigma-Aldrich | 77-86-1 | |
Volt Power Supply | Hoefer | PS300B |