Her beskriver vi en protokoll for å få rå giftekstrakt fra sjøemone og oppdage dens hemolytiske og fosfolipaseaktivitet.
Havemone gift sammensetning inkluderer polypeptid og ikke-proteiner molekyler. Cytolytiske komponenter har et høyt bioteknologisk og biomedisinsk potensial for å designe nye molekylære verktøy. Sjøemone gift finner i kjertelceller fra ektoderm og sub-cellulære strukturer kalt nematocysts, som begge er fordelt over hele havets anemone kropp. Denne egenskapen innebærer utfordringer fordi cellene og nematocysten må lyses for å frigjøre giftkomponentene med andre ikke-giftige molekyler. Derfor er giften først avledet fra et råekstrakt (blanding av forskjellige og mangfoldige molekyler og vevsrester). Det neste trinnet er å oppdage polypeptider med spesifikke bioaktiviteter. Her beskriver vi en effektiv strategi for å få sjøemone råolje ekstrakt og bioassay for å identifisere tilstedeværelsen av cytolysiner. Det første trinnet innebærer billige og enkle teknikker (rørt og fryse-tine syklus) for å frigjøre cytolysiner. Vi fikk den høyeste cytolytiske aktiviteten og proteinet (~ 500 mg protein fra 20 g tørrvekt). Deretter ble polypeptidkompleksiteten til ekstraktet analysert av SDS-PAGE gel detekterende proteiner med molekylvekter mellom 10 kDa og 250 kDa. I den hemolytiske analysen brukte vi sauerøde blodlegemer og bestemte HU50 (11,1 ± 0,3 μg/ml). I motsetning ble tilstedeværelsen av fosfolipaser i råekstraktet bestemt ved hjelp av eggeplomme som substrat i et solid medium med agarose. Samlet sett bruker denne studien en effektiv og billig protokoll for å forberede råoljeekstraktet og bruker replikerbare bioassays for å identifisere cytolysiner, molekyler med bioteknologiske og biomedisinske interesser.
Marine dyr er en rik kilde til biologisk aktive forbindelser. I de siste tiårene har sammensetningen av sjøemone gift tiltrukket seg vitenskapelig oppmerksomhet siden den består av et mangfold av polypeptider med hemolytisk, cytotoksisk, enzymatisk (fosfolipase, protease, chitinase) og nevrotoksisk aktivitet og hemmende effekter på proteolytisk aktivitet1. I tillegg er disse polypeptider potensielle kilder for utvikling av molekylære verktøy i bioteknologisk og terapeutisk bruk 2,3.
Det er få rapporter om sjøemongift og dens molekylære komponenter på grunn av kompleksiteten ved å skaffe giftet, til og med isolasjon og karakterisering av giftstoffer. Utvinningsmetodene som brukes i rapportene involverte lysis og tømming av innholdet i celler som er relatert og ikke relatert til giftproduksjonen1.
En spesiell egenskap i alle cnidarians er fraværet av et system for produksjon og frigjøring av giftet sentralisert i en enkelt anatomisk region. I stedet er nematocystene strukturer som holder giften 4,5. Andre typer celler, kalt epidermale kjertelceller, skiller også ut giftstoffer og fordeles også over hele kroppen av sjømoner6.
Den første og mest avgjørende utfordringen med å skaffe giftet er genereringen av et ekstrakt med tilstrekkelig manipulasjon i etterfølgende prosesser, uten inaktivering eller nedbrytning av labile proteiner. Deretter må cellene lyses, og komponentene – i dette tilfellet må polypeptider effektivt og raskt ekstraheres, unngå proteolyse og hydrolyse mens du eliminerer andre cellulære komponenter7.
Ulike metoder brukes for å oppnå rå ekstrakt av en sjøemone; noen innebærer å ofre organismen mens andre tillater det å bli holdt i live. Metoder som innebærer bruk av organismens hele kropp tillater frigjøring av de fleste giftstoffer fragiften 8, sammenlignet med metoder som holder organismer i live, som bare trekker ut noen komponenter i giftet9. Utarbeidelsen av et ekstrakt krever evaluering av tilstedeværelse og styrke av et stoff av interesse gjennom en bestemt bioassay, som inkluderer strategier for å observere de farmakologiske effektene ved in vivo eller in vitro metoder10.
Sjøemone gift inneholder cytolytiske polypeptider, poredannende toksiner (PFTs)11 og fosfolipaser12; Disse molekylene er modeller i studiet av protein-lipid interaksjon, molekylære verktøy i kreftterapi og biosensorer basert på nanopore3. Klassifiseringen av sjøemone PFTer utføres i henhold til deres størrelse eller molekylvekt, fra 5 kDa til 80 kDa. Den 20 kDa PFT, den mest studerte og kjent som actinoporins11, er av spesiell interesse for sitt biomedisinske potensial i utviklingen av molekylære verktøy for mulige applikasjoner som anticancer, antimikrobielle og nanoporebaserte biosensorer. En annen cytolysin, inkludert fosfolipaser, spesielt fosfolipase A2 (PLA2)13, frigjør en fettsyre på grunn og hydrolyserer fosfolipider, destabiliserer cellemembranen. På grunn av denne virkningsmekanismen lover PLA2 å være en viktig modell for studien og anvendelser i inflammatoriske sykdommer. Det kan tjene som modell for studier av lipidadferd i cellemembranen14.
Her beskriver vi en effektiv protokoll for å skaffe råoljeekstraktet fra sjøemone Anthopleura dowii Verrill, 1869, og oppdage hemolysiner og fosfolipaser. Begge er relevante giftstoffer som kan brukes som mal for å designe nye molekylære verktøy.
Den høye etterspørselen etter nye forbindelser med anvendelser innen ulike fagområder og industri har ført til studiet av gift. Gift representerer en rik kilde til molekyler som fungerer som en mal for å generere nye molekylære verktøy. Imidlertid krever kompleksiteten til disse giftene implementering og kombinasjon av ulike metoder for å skaffe og studere dem.
Her viser vi en metode for å skaffe og analysere giftet til sjøemonen Anthopleura dowii, Verrill 1869, som kan bruk…
The authors have nothing to disclose.
Dette arbeidet ble støttet av Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación e Innovación Tecnológica (PAPIIT), med et tilskuddsnummer IT200819. Forfatterne erkjenner til Tom Musselman, Rock Paper Editing, LLC, for å sjekke den engelske grammatikken i dette manuskriptet; og den tekniske hjelpen til Samanta Jiménez (CICESE, Ensenada) og Juan Manuel Barbosa Castillo (Instituto de Fisiología Celular, UNAM). Vi takker også dr. Augusto César Lizarazo Chaparro (CEPIPSA) for å ha skaffet saueblod. Vi takker spesielt Dr José Saniger Blesa, ICAT-UNAM, for fasilitetene i laboratoriet hans for videoopptaket.
15 mL conical centrifuge tube | Corning | 430766 | |
2-Bromophenol blue | Sigma | B75808 | |
2-mercaptoetanol | Sigma-Aldrich | M6250-100ML | |
50 mL conical centrifuge tubes | Corning | 430828 | |
Acetic Acid Glacial | J.T. Baker | 9515-03 | |
Acrylamide | Promega | V3115 | |
Agarose | Promega | V3125 | |
Bisacrylamide | Promega | V3143 | |
Bovine Serum Albumin Fraction V | Sigma | A3059-100G | |
Bradford Protein Assays | Bio-Rad | 5000006 | |
Calcium chloride | Sigma-Aldrich | C3306 | |
Cell culture plates 96 well, V-bottom | Corning | 3894 | |
Centrifuge | Eppendorf | 5804R | |
Centrifuge tubes | Corning | CLS430829 | |
ChemiDoc MP system | Bio-Rad | 1708280 | |
Citric acid | Sigma-Aldrich | 251275 | |
Clear flat.bottom 96-Well Plates | Thermo Scientific | 3855 | |
Coomassie Brilliant Blue G-250 | Bio-Rad | #1610406 | |
Coomassie brilliant blue R-250 | Bio-Rad | 1610400 | |
Dextrose | J.T. Baker | 1916-01 | |
Ductless Enclosure | Labconco | Vertical | https://imagej.nih.gov/ij ImageJ 1.53c |
Gel Doc EZ | Bio Rad. | Gel Documentation System | |
Glycerol | Sigma-Aldrich | G5516-4L | |
Hemocytometer | Marienfeld | 650030 | |
ImageJ (Software) | NIH, USA | Version 1.53c | |
Incubator 211 | Labnet | I5211 DS | |
Methanol | J.T. Baker | 9049-03 | |
Mini-PROTEAN tetra cell | Bio-Rad | 1658000EDU | |
Na2HPO4 | J.T. Baker | 3824-01 | |
NaCl | J.T. Baker | 3624-01 | |
NaH2PO4.H2O | J.T. Baker | 3818-05 | |
Origin software | version 9 | To design the plot with sigmoidal adjustments | |
Petridish | Falcon | 351007 | |
Pipetman kit | Gilson | F167380 | |
Precast mini gel | BioRad | 1658004 | |
Prestained Protein Ladder | Thermo Scientific | 26620 | |
Protease Inhibitor Cocktail | Roche | 11836153001 | |
Protein Assay Dye Reagent Concentrate | Bio-Rad | 5000006 | |
Rhodamine 6G | Sigma-Aldrich | 252433 | |
SDS | Sigma-Aldrich | L4509 | |
Sodium citrate dihydrate | JT Baker | 3646-01 | |
Spectrophotometer | THERMO SCIENTIFIC | G10S UV-VIS | |
Tris Base | Sigma-Aldrich | 77-86-1 | |
Volt Power Supply | Hoefer | PS300B |