Mevcut protokol, Arduino ve ilgili donanımı ve otomatik davranışsal eğitim için isteğe bağlı bir komut dosyası da dahil olmak üzere çok yönlü bir Matlab araç kutusunu kullanarak, kemirgen hayvan modelleri için açık kaynaklı 5 seçimli bir seri reaksiyon süresi görev araç kutusunun geliştirilmesini açıklamaktadır. Komut dosyaları özelleştirilebilir ve farklı deneme ve test tasarımlarının uygulanmasını kolaylaştırır.
5 seçimli seri reaksiyon süresi görevi (5-CSRTT), kemirgenlerde görsel uzamsal dikkat ve dürtüselliği incelemek için sıklıkla kullanılan davranışsal bir testtir. Görev, hayvanların ışık kaynaklarıyla donatılmış beş küçük açıklıktan oluşan yatay bir diziye dikkat etmelerini ve sınırlı bir süre içinde, odanın karşı duvarında bulunan yiyecek dergisinde bir yiyecek ödülü almak için ışıklı bir hedef açıklığına burun sokmalarını gerektirir. Görev, yanıt doğruluğu ve tepki süreleri gibi davranışsal kontrol önlemlerini dikkate alır ve seçici dikkat ve dürtüsellik çıkarmaya izin verir. Görev zorluğu, uyaran süresi ve genel olarak görev tasarımı değiştirilerek kontrol edilebilir. Ticari olarak temin edilebilen aparatlar genellikle görev parametrelerini belirtmek için bir deney odasından ve özel bir yazılımdan oluşur, ancak sabit donanım ve yazılım nedeniyle, genel deneysel tasarımdaki ve özel görev gereksinimlerindeki ve ilgili veri çıktısındaki değişiklikler üzerinde birçok sınırlama getirirler. Bu makalede, kullanımı kolay tek kartlı bir mikrodenetleyici ve standart elektroteknik bileşenlere, açık erişimli bir Arduino komut dosyasına ve sırasıyla donanım kontrolü ve davranışsal görev özellikleri için bir Matlab araç kutusuna dayanan tamamen özelleştirilebilir bir alternatif açıklanmaktadır. Araç kutusu, otomatik davranışsal eğitim sağlayan isteğe bağlı bir merdiven prosedürü içerir. Özelleştirilmiş bölmelere kurulabilen eksiksiz donanım kurulumu ve serbestçe uyarlanabilen yazılım, standart dışı görev ve oda tasarımını teşvik eder. Sistemin tasarımı ve donanım kontrolü ve deney düzeni için açık kaynak kodu açıklanmaktadır.
5-CSRTT, kolinerjik sistemin dikkatteki rolünü ve norepinefrin geri alım inhibitörlerinin dürtüsel davranışlar üzerindeki etkisini belirlemek gibi görsel dikkat süreçlerini ve dürtüselliğiincelemek için kemirgenlerde sıklıkla kullanılan davranışsal bir testtir 1,2,3,4,5,6 7 . Standart aparat, tepki doğruluğu, reaksiyon süreleri, dürtüsel ve zorlayıcı davranış, motor yetenek ve motivasyon 1,2,3,4,5 gibi çeşitli kontrol önlemlerinin gözlemlenmesini sağlar. LED donanımlı beş diyafram açıklığından oluşan yatay bir dizi, açıklıklara karşı çıkan oda duvarlarında bir gıda dergisi ve 2,5 ev ışıklarından oluşur. Tipik bir görevde, evin ışığı aydınlatılır ve bir oturumun başlangıcı, serbest bir peletin teslim edildiği yiyecek dergisinin aydınlatmasıyla işaretlenir. Deneme kursu, hayvan pelet1’i almak için dergiyi burun dürttüğünde başlatılır. Bundan sonra, gıda dergisi ışığı söndürülür ve hayvanın dikkatini açıklıklara yönlendirmesi beklenen denemeler arası aralık (ITI) başlar. ITI sona erdiğinde, 1,2,5 diyafram açıklıklarından birinde bir uyaran aydınlatması sunulur. Uyaran, uyaran süresi (StD) olarak bilinen belirli bir uzunluk için verilir. Hayvan, StD bittikten sonra sınırlı bir süre zarfında veya sınırlı tutma (LH) olarak bilinen uyarana yanıt verebilir. Cevap vermek için, hayvanın hedef açıklığı burnuna sokması gerekir ve doğru yapılırsa, gıda dergisi 1,2,5’te bir ödül yayınlanır. Aksi takdirde, herhangi bir yanlış yanıtın yanı sıra uyaran sunumundan önceki herhangi bir yanıt (beklenti veya erken) veya herhangi bir yanıt vermeme (ihmal) zaman aşımına (TO) neden olur ve bu süre zarfında ev ışığı belirli bir süre 1,2,5 (Şekil 1) kapatılır. Genel olarak, ayrımcı uyaran doğruluğu dikkat işlevini ölçerken, erken ve azimli tepkiler (uyaran sunumundan sonra açıklıklarda tekrarlanan tepkiler) sırasıyla 1,4,5,6 dürtüsel davranış ve kompulsivite ölçümleri olarak kabul edilir.
Şekil 1: Tipik bir 5-CSRTT’nin olası deneme dizileri. Deneme Aralığının ardından, uyaran ışığı belirli bir süre için açılır ve ardından Sınırlı Bekletme aralığı sırasında kapatılır. Sıçan ya doğru cevap verebilir ve bir ödül alabilir ya da yanlış cevap verebilir ve bu süre zarfında bir zaman aşımı alabilir. Sıçan zamanında cevap vermezse, ihmali zaman aşımına neden olur. Benzer şekilde, ışık uyaranının sunumundan önce yanıt verirse, erken tepkisi zaman aşımına neden olur. Başka bir deneme, ödülün toplanmasından veya zaman aşımı süresinin sona ermesinden sonra başlar. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
5-CSRTT, esnekliği nedeniyle yaygın olarak kullanılmaktadır: deneme tasarımının parametrelerini değiştirerek, dikkatin farklı alt kategorileri araştırılabilir. Örneğin, hayvanın dikkatini beş farklı açıklığa (görsel uzamsal dikkat) bölmesi beklenirken, alakasız uyaranların (örneğin, işitsel uyaranlar) kullanılması, seçici veya sürekli dikkatin test edilmesini sağlar 1,2,5,6. Bu amaçla, deney düzeneği, dikkat dağıtıcı veya hatta güçlendirici uyaranlar olarak kullanılabilecek hoparlörler dahil edilerek genişletilebilir 1,2,5,6. Ayrıca, dikkat yükü, uyaran sunumunu değiştirerek veya ITI süresi10’u randomize ederek doğrudan modüle edilebilir. 5-CSRTT sadece kemirgenler 3,7’de kullanılmaz, aynı zamanda yakın zamanda insan olmayan primatlar 1,7,8 ve balık 7,9’u test etmek için uyarlanmış ve fizibilitesini daha da sergilemiştir. Tamamen özelleştirilebilir 5-CSRTT araç kutusu, standart kemirgen paradigmasının diğer hayvan modellerine kolayca uyarlanmasını sağlar. Ayrıca, 5-CSRTT araç kutusunun özelleştirme esnekliği, standart dışı görev tasarımlarını kullanan araştırmaları da teşvik eder.
Burada sunulan tamamen özelleştirilebilir 5-CSRTT araç kutusu, entegre bir geliştirme ortamında programlanmış donanım kontrolü için bir Arduino komut dosyası içerir. Ayrıca deney kontrolü için bir Matlab araç kutusundan (sürüm R2019b veya daha genç) oluşur. Aşağıdaki protokol, 5-CSRTT araç kutusunun yaygın olarak kullanılan standart paradigma ile nasıl yapılandırılacağını açıklar ve standart olmayan paradigmalar için isteğe bağlı yapılandırmaları gösterir.
Mevcut protokol, standart, ticari olarak temin edilebilen 5 seçenekli seri reaksiyon süresi görev aparatına düşük maliyetli ve tamamen özelleştirilebilir bir alternatif geliştirmeyi ve test etmeyi amaçlamaktadır. Genellikle, ticari olarak temin edilebilen cihaz türleri, standart araştırma 5-CSRTT’yi çalıştırmak için gereken sınırlı bir dizi özellik sağlar. Bu nedenle, deneme dizisindeki değişiklikler veya hedef uyaran kombinasyonları gibi spesifik deneme tasarımındaki standart dışı değişiklikler genellikle mümkün değildir. Ek olarak, mevcut cihaz türlerinin çoğu, erken ve sebatlı cevapların zamanlaması ve açıklık sayısı gibi deneyin tüm davranışsal verilerine erişim sağlamayabilecek spesifik, kapalı yazılımlarla birlikte gelir. Buna karşılık, burada sunulan araç kutusunun hayati avantajı – düşük maliyetinin yanı sıra – birçok farklı deneme tasarımı ve araştırma paradigmasını uygulama olasılığıdır. Şu anda, araç kutusu, soluk uyaranlara izin vermek ve iki pelet dağıtım sistemi kullanmak ve reaksiyon süresine bağımlılığı ödüllendirmek gibi çoklu uyaran tasarımlarının tanımını desteklemektedir. Ayrıca işitsel geri bildirim için minyatür bir hoparlörün kullanımını da destekler. Bununla birlikte, birincil amaç, deneme sekansının kullanıcının amacına göre kolay modifikasyonlarına izin vermektir; örneğin, karartma görevleri için soluk ışıklı açıklıklar ve ödüllendirici programlar tanıtmak veya son teknoloji ürünü pozitif takviye eğitim yaklaşımlarını entegre etmek11. Ek olarak, oturum boyunca elde edilen tüm ham veriler daha fazla analiz için hazır hale getirilir. Araç kutusu, otomatik davranışsal eğitim için tamamen özelleştirilebilir ve kullanıcının her seviye güncellemesi için kriterleri, eğitim seviyelerinin sayısını ve güncellenecek parametreleri değiştirmesine izin veren bir Merdiven işlevi sağlar. Ayrıca, cihazın kendisi son derece uyarlanabilir ve deneme tasarımındaki ve oda düzenindeki değişiklikler kolayca uygulanabilir, bu da 5-CSRTT paradigmasını ticari olarak temin edilebilen cihaz türlerinin sunduklarından farklı bir araştırma tasarımına ihtiyaç duyan hayvan türlerine uygulamayı mümkün kılar.
Yazılım yapılandırması için protokolün belirli bölümleri, sorunsuz bir iş akışı sağlamak için kritik öneme sahiptir: özellikle deneyin ilk günü için, hem donanım hem de deney kontrol yazılımının hazırlanması (adım 2 ve 3) ve adım 5.3’ün yapılandırılması çok önemlidir. Mikrodenetleyici donanımı, yazılımı ve deney kontrol yazılımı arasındaki seri bağlantı noktası bağlantısının düzgün çalıştığından emin olmak, tam işlevli bir 5-CSRTT araç kutusu oluşturmak için kritik öneme sahiptir. Her deneme gününün başında, donanım ve deneme kontrol komut dosyalarının doğru yapılandırıldığından emin olmak için yukarıda belirtilen üç adımı tekrarlamanız önerilir.
Son olarak, araç kutusunun mevcut sınırlaması, ne yazık ki tam bir açık kaynaklı araç kutusu olarak kullanımından ödün veren özel bir programlama platformuna uygulanmasıdır. Bununla birlikte, prensip olarak, araç kutusu Python gibi diğer programlama dillerine kolayca uyarlanabilmelidir, çünkü bir denemenin seyri değişmeden kalır.
Mevcut alternatif yöntemlerle karşılaştırıldığında, burada tanıtılan 5-CSRTT araç kutusu, standart 5-CSRTT paradigmasının uygulanmasına ve azimli cevaplar için belirlenmiş bir zaman aralığı tanımlamak veya hoparlörler veya yanıp sönen ışıklar gibi dikkat dağıtıcı veya güçlendirici uyaranlar tanıtmak gibi modifikasyonlara izin verir. Kullanımı kolay ve yüksek oranda uyarlanabilir olmasının yanı sıra, aparat düşük maliyetlidir ve kolayca çoğaltılabilir ve kemirgen olmayan hayvan modellerini kullanarak araştırmaları teşvik eder.
The authors have nothing to disclose.
Bu çalışma DFG WE 5469/3-1 tarafından desteklenmektedir.
1200 Ohm Resistor | Already available in the lab | ||
8-bit 10 kΩ digital potentiometer | Microchip | MCP42010-I/P | From Conrad.de: 1083205 |
ARD MEGA2560 KIT Arduino – Mega 2560 R3 Lernset | JOY-IT | ARD-Set01 | From Reichelt.de: ARD MEGA2560 KIT |
ARD SHD MOTOR Arduino Shield – Motor | Adafruit | 1438 | From Reichelt.de: ARD SHD MOTOR |
ARDUINO STACKABLE HEADER KIT – R3 | Sparkfun Electronics | PRT-11417 | From Antratek.de: PRT-11417 |
Chow | Altromin | 1324 N | Altromin chow products |
Euro-Gehäuse | Hammond Electronics | 1591EBK | From Conrad.de: 520691 |
Food pellets | Bio-Serv | F0021 | From Bio-serv.com: Dustless Precision Pellets Rodent |
Fritzing | Interaction Design Lab Potsdam | Fritzing Software download | |
Integrated Development Environment | Arduino | Arduino IDE download (Freely available) | |
IR Break Beam Sensor – 3mm LEDs | Adafruit | 2167 | From Mouser.de: 485-2167 |
Laptop or Computer | |||
LED white round 5mm 2000mcd 20mA | TruComponents | 1573731 | From Conrad.de: 1573731 |
Microswitch | Hartmann | MBB1 01 A 01 C 09 A | From Conrad.com: 707243 |
NeoPixel Stick – 8 WS2812 5050 RGB LEDs | Adafruit | 1426 | From Reichelt.de: DEBO LED NP8 2 |
Passive buzzer Speaker | Conrad Components | 93038c213a | From Conrad.de: 1511468 |
Pellet release disk | Already available in the lab. Similar products depicted below. Keep in mind that some of these products make use of different (and stronger) motors and infrared sensors. The use of the microswitch (row 7) and the Arduino Motor Shield (row 3) need to be adapted to fit these new specifications. We recommend 3d printing the disk to work with the provided materials and software. Carbatec universal base plate Open Science Framework Open Feeder Open Ephys 3d Model Food Pellet Dispenser Campden Instruments 45mg pellet dispenser |
||
Programming platform | Mathworks | R2019b or younger | |
Psychtoolbox Software | V3 | Psychtoolbox-3 download | |
Spur GEAR-MOTOR with DC brush motor | Micromotors | B138F.12.208 | Micromotos Series B138F Technical data |