Bu makale, erişkin Drosophila’ya Penetrasyon Travmatik Beyin Hasarı (PTBI) uygulamak ve ortaya çıkan nörogenezleri incelemek için ayrıntılı protokoller sunmaktadır.
Hastalığa veya yaralanmaya yanıt olarak nörogenezin altında kalan moleküler ve hücresel mekanizmalar iyi anlaşılmamıştır. Bununla birlikte, bu mekanizmaları anlamak nöral rejeneratif tedaviler geliştirmek için çok önemlidir. Drosophila melanogaster sinirsel gelişim çalışmaları için önde gelen bir modeldir, ancak tarihsel olarak yetişkin beyin yenilenmesini araştırmak için kullanılmamıştır. Bunun nedeni öncelikle yetişkin beyninin çok düşük mitotik aktivite sergilemesidir. Bununla birlikte, travmatik beyin hasarının (PTBI) yetişkin Drosophila merkezi beynine nüfuz etmesi, yeni nöronların ve yeni gliaların neslini tetikler. Drosophila’da bulunan güçlü genetik araçlar, burada açıklanan basit ama titiz yaralanma protokolü ile birleştiğinde yetişkin Drosophila beynini nöral rejenerasyon araştırmaları için sağlam bir model haline getirilmektedir. Burada (1) erişkin merkezi beyinde delici yaralanmalar ve (2) diseksiyon, immünohistokimya ve yaralanma sonrası görüntüleme için ayrıntılı talimatlar verilmiştir. Bu protokoller oldukça tekrarlanabilir sonuçlar verir ve nöral rejenerasyon altta kalan mekanizmaların parçalanmaları için ek çalışmaları kolaylaştıracaktır.
Beyin ve sinir sistemindeki hasar, dünya çapında önemli bir ölüm ve sakatlık nedenidir. Her yıl yaklaşık 1,5 milyon Amerikalı travmatik beyin hasarı (TBI) yaşarken, sadece Amerika Birleşik Devletleri’nde yaklaşık 6 milyon kişi Parkinson ve Alzheimer Hastalığı2 gibi nörodejeneratif hastalıklardan muzdariptir. Hem hastalık hem de beyindeki yaralanma, duyusal, bilişsel ve motor kusurlara yol açan nöral dejenerasyona neden olabilir3. İnsan beyninin onarımı için terapötik stratejiler geliştirmek, beynin karmaşık fizyolojisi nedeniyle zor olmuştur. Drosophila melanogaster gibi model organizmalar, nörodejenerasyon ve potansiyel terapötik hedeflerin altında kalan temel mekanizmaları tanımlamak için basit bir sistem sağlar4.
Meyve sineği Drosophila melanogaster, bir yüzyıldan fazla bir süredir genetik, gelişim biyolojisi ve sinirbilim alanlarını ilerleten güçlü bir model organizma olmuştur5,6. Drosophila beyni sadece ~90.000 nöron7’den oluşur, ortalama insan beyninden bir milyon kat daha az8, ancak birçok benzerlikleri vardır. Hem insan hem de sinek beyinleri GABA, glutamat, asetilkolin ve biyojenik aminler dopamin ve serotonin9 nörotransmitterlerini kullanır. Drosophila ve insan nöronları da ortak sinaptik mimari ve benzer sinirsel hücre tipleri ile benzer şekilde çalışır10. Drosophila’nın daha küçük beyin büyüklüğü ve drosophila ve memeliler arasındaki moleküler, hücresel ve fizyolojik mekanizmaların korunması ile birlikte gelişmiş genetik tekniklerinin mevcudiyeti, Drosophila araştırmacılarının memeli modellerinde pratik olmayan veya cevaplaması zor sorular sormasına izin verir.
Drosophila’daki yetişkin nörogenez anlayışımız, hem homeostaz sırasında hem de yaralanmayı takiben sınırlı kalmaktadır. Normal gelişim sırasında nörogenez hakkında daha fazla şey bilinmektedir. Örneğin, nöronlar ve glia, nöroblastlar10,11 adı verilen öncül hücrelerden gelişim sırasında oluşturulur. Merkezi beyinde en az üç farklı nöroblast türü ayırt edilmiştir. Hem Tip I hem de Tip II soy nöroblastları puparium oluşumundan sonra hücre döngüsünden ~20-30 saat sonra çıkar12. Buna karşılık, mantar vücut nöroblastları hücre bölünmesini son haline getirmek için son ve bunu Puparium oluşumundan sonra Reaper bağımlı apoptoz ~ 85-90 saat yoluyla yapar13. Eklozyondan sonra, yetişkin Drosophila beyninin ağırlıklı olarak glia14 olmak üzere birkaç bölünen hücresi (~1 hücre / beyin) vardır. Yetişkin optik loblar nörogenez15 yeteneğine sahip yavaşça bisiklete binen nöroblastlara sahipken, yetişkin merkezi beynin bilinen bir nöroblastları yoktur. Sinir progenitörlerinin kıtlığı ve sınırlı hücre çoğalması, yetişkin memeli beynindeki duruma şiddetle benzemektedir ve Drosophila’daki yetişkin nörogenez mekanizmalarının insanlara potansiyel ilgisinin altını çizmektedir.
Yaralanmadan sonra yetişkin Drosophila optik loblarında düşük düzeyde erişkin nörogenezinin keşfi15 , yetişkin Drosophila merkezi beyninin de yetişkin nörogenez yeteneğine sahip olabileceği hipotezine yol açtı16. Bu protokol, yetişkin Drosophila’da , yetişkin merkezi beyindeki nörogenezleri araştırmak için kullanılabilecek titiz, tekrarlanabilir bir merkezi beyin hasarı modeli oluşturmayı açıklar. İnsan ve Drosophila beyin mimarisi ve işlevi arasındaki benzerlikler göz önüne alındığında, bu keşifler yaralı ve hastalıklı insan beyinlerinde terapötik nörogenez için kritik hedeflerin belirlenmesine yol açabilir.
Yetişkin Drosophila beynine nüfuz eden yaralanmalar daha önce 15,17,18 olarak tanımlanmış olsa da, bu yaralanmalar merkezi beyne değil optik loblara odaklanmıştır. Ayrıca, yaralanmaların nasıl gerçekleştirilmesi için ayrıntılı talimatlar şimdiye kadar eksiktir. Bu protokol, PTBI’den sonra yetişkin nörogenez için istatistiksel olarak anlamlı kanıtlar üreten yetişkin Drosophila merkezi beynine nüfuz eden bir yaralanma modelini açıklar.
Bu PTBI protokolünün tekrarlanabilirliği, kısmen yaralanma hedef bölgesi olarak mantar gövdesinden kaynaklanmaktadır. Mantar gövdesi, büyük ve son derece stereotiplenmiş dizilerde karmaşık dendrit ve akson çardaklara sahip ~ 2200 nörondan oluşan büyüktür18. Mantar vücut nöronlarının hücre gövdeleri beynin yüzeyine yakındır ve yeşil floresan protein (GFP) ifadesi kullanılarak baş kütikülden görselleştirilebilir (Şekil 1C). Mantar vücut öncülleri gelişim sırasında apoptoz uygulanan son nöral kök hücrelerdir13,12,19. Bu nedenle, birçok mantar vücut nöronları eklosyon zamanında oldukça gençtir. Bu, mantar vücudunun diğer beyin bölgelerine göre daha fazla mitotik potansiyele sahip olabileceği hipotezine yol açtı16. Ek olarak, mantar gövdesi öğrenme ve hafıza için kritik öneme sahiptir18. Bu, PTBI tarafından tetiklenen nörogenezin fonksiyonel iyileşmeye yol açıp açmadığını sormanızı sağlar.
Sonuçların tekrarlanabilirliğine katkıda bulunan diğer faktörler arasında tutarlı genotiplerden oluşan aşılmış sineklerin kullanılması, her seferinde aynı yönde haçların gerçekleştirilmesi, yetiştirme ve yaşlanma sıcaklıklarının hassas bir şekilde kontrol edilmesi ve erkek ve dişilerin ayrı ayrı analiz edilmesi sayılabilir. F1 sineklerinin bir çıkınttan kullanılması, spontan mutasyonlar için homozigous beyinlerin analiz etme olasılığını azaltır. Standart çapraz y[1] w[1]; UAS-mCD8-GFP;; OK107-GAL4 yetişkin dişilerden y[1] w[1] yetişkin erkek sinek sinekleri, genotip y[1] w[1]’nin F1 soyuyla sonuçlanır; UAS-mCD8-GFP/+;; OK107-GAL4/+. OK107-GAL4 , mantar gövdesinin tüm içsel nöronlarında ifade edilir ve mantar gövdelerinin ve projeksiyonlarının görselleştirilmesine izin veren membran bağlı muhabir UAS-mCD8-GFP’nin ekspresyonunu yönlendirir. Perma-ikiz haçlar için, soy izleme sistemini kapalı tutmak için haçlar her zaman 17 ° C’de kalmalıdır. Bu, gelişim sırasında hiçbir bölünen hücrenin etiketlenmemesini ve sadece yetişkin kaynaklı nöronların ve gliaların etiketli olmasını sağlar. Bu amaçla, sinek odası 17 ° C’de de korunabilir. Perma-twin sisteminin ilk açıklaması15 18 ° C’de önerilen yetiştirme sinekleri olsa da, bu önemli arka plan etiketlemesine yol açabilir.
Tutarlılık için, PTBI’yi gerçekleştirirken kontrolün YARALANMAMıŞ sinekleri CO2 pedinde tutması da önerilir. Bu, her iki sinek kümesinin de aynı anestezik maruziyete sahip olmasını sağlar. Ek olarak, tekrarlanabilirliğin kafaya tamamen nüfuz etmesi arzu edilir. Bununla birlikte, pimin ucunu pedle bükmemeye dikkat edilmeli ve gelecekteki yaralanmalar için kullanılamaz hale getirilmelidir. Yetenekli uygulayıcılar için PTBI sineklerine istenmeyen çok az zarar vardır. Bununla birlikte, yaralanma sırasında sineği stabilize etmek için toraksa çok fazla basmak ölümcül olabilir. İstenmeyen yaralanmanın boyutunu değerlendirmenin bir yolu, PTBI’nin yaralanma sonrası 24 saat uçtuğu mortaliteyi ölçmektir. Tek taraflı yaralı sinekler için, bu yeni başlayanlar için% 50 veya daha yüksek olabilir. Bu nedenle, gözlemlenen sonuçların PTBI’den kaynaklandığından ve istenmeyen yaralanmalardan kaynaklanmayacağından emin olmak için, yeni başlayanlara birkaç hafta boyunca günlük ~ 20 sinek üzerinde PTBI uygulama yapmaları ve 24 saat mortalite sürekli olarak% 10 < kadar ortaya çıkan beyinleri analiz etmemeleri önerilir.
Merkezi beyin PTBI tarafından uyarılan çoğalma miktarını ölçmek için, hem anti-fosfohistone H3 (PH3) immünostaining hem de 5-etirenil-2′-deoksiyridin (EdU) kuruluşu kullanılabilir. Anti-PH3, metafazdan önce ve metafat boyunca hücreleri etiketler ve algılamayı aktif olarak bölünen hücrelerin yalnızca bir kısmıyla sınırlar. Bu nedenle, anti-PH3 boyama çoğalma sadece kısmi bir bakış sağlar. EdU, yeni sentezlenen DNA’ya dahil edilebilen bir timin analogudur. Yaralanmadan önce ve sonra sinekleri besleyerek, yaralanmadan sonra bölünen veya bölünen hücrelerin daha eksiksiz bir resmini elde etmek mümkündür. Bölünen herhangi bir hücrenin kalıcı olarak işaretlenmiş olması, hem yavaşça çevrim yapan hücrelerin tanımlanması hem de ilk çoğalma sonrasında hücrelerin hayatta kalmasının test etmesi için yararlıdır. Belirsiz nedenlerden dolayı, ancak belki de kan-beyin bariyerinin sınırlı geçirgenliği nedeniyle, EdU etiketlemesi verimsizdir ve yetişkin beyninde hücre çoğalmasını az bildirir. Bu, PTBI sonrası 24 saat boyunca hem kontrol hem de deneysel beyinlerdeki benzer sayıda PH3+ ve EdU+ hücresi ile ve perma-ikiz klonlarındaki yeni hücrelerin sadece bir alt kümesinin EdU16’yı içerdiğini gözlemleyerek kanıtlanır. Maksimum etiketleme için, sinekleri EdU ile önceden beslemek önemlidir, çünkü yaralı sinekler PTBI sonrası birkaç saat boyunca beslenmeye devam etmez. Beslenme, EdU çözeltisine gıda boyası eklenerek ve karın kütikülden bağırsaktaki boya miktarı izlenerek değerlendirildi16.
4. adımda beyin diseksiyon protokolü sağlamış olsak da alternatif tekniklerin kullanılabileceği belirtilmelidir. Bunlardan bazıları daha önce yayınlanan protokollerde mevcuttur20,21,22. Drosophila melanogaster, sinir sisteminin bağırsakları ve bileşenleri de dahil olmak üzere birden fazla dokunun alttaki yenilenmesinin altında kalan mekanizmaları incelemek için kullanılabilecek güçlü genetik ve moleküler araçlara sahip düşük maliyetli bir model sunar. Beyin hasarına verilen tepkiyi incelemek için kullanılabilecek yeni ve tekrarlanabilir bir yaralanma modeli burada özetlenmiştir. Bu protokoller kullanılarak elde edilen veriler, yetişkin Drosophila merkezi beyninin proliferatif yeteneği koruduğu ve yaralanmaya yanıt olarak yeni nöronlar ürettiği fikrini desteklemektadır. Bu gözlemler hem yetişkin nörogenezinin kapsamının hem de alttaki moleküler mekanizmalarının daha fazla araştırılmasını garanti eder. Bu sistemde nöral rejenerasyonda yer alan bileşenler belirlendikten sonra, yetişkin Drosophila nörogenez bilgimizi insanlara dönüştürebiliriz.
The authors have nothing to disclose.
Stacey Rimkus ve Becky Katzenberger’e teknik yardım için ve Eduardo Moreno’ya perma-twin hisselerini paylaştıkları için minnettarız. Barry Ganetzky ve David Wassarman’a şüphesiz bilimi geliştiren canlı tartışmalar için ve Kent Mok, Cayla Guerra ve Bailey Spiegelberg’e laboratuvara katkılarından dolayı teşekkür ederiz. FasII antikorları Corey Goodman tarafından geliştirilmiş ve NIH NICHD tarafından oluşturulan ve Iowa Üniversitesi, Biyoloji Bölümü, Iowa City, IA 52242’de sürdürülen Gelişimsel Çalışmalar Hybridoma Bankası’ndan elde edilmiştir. Bu çalışmada kullanılan Drosophila suşlarının çoğu Bloomington Drosophila Stock Center’dan (BDSC; NIH P40OD018537). Bu çalışma NIH T32 GM007133 (KLC) tarafından desteklendi; NIH NS090190 (GBF); NIH NS102698 (GBF); Wisconsin Üniversitesi Lisansüstü Okulu (GBF); ve UW-Madison Bilim ve MühendislikTe Kadın Liderlik Enstitüsü (WISELI) (GBF).
#11 disposable scalpels | Santa Cruz Biotechnology | sc-395923 | used for separating Drosophila heads from trunks prior to brain dissection |
150 mm diameter black Sylgard dishes | Dow | 1696157 | made in the laboratory with reagents from Dow; used for brain dissection |
18 mm coverslips | any | for mounting brains on microscope slides | |
4',6-Diamidino-2-Phenylindole, Dihydrochloride (DAPI) | ThermoFisher | D1306 | for immunohistochemistry |
70% Ethanol | made from 95% ethanol sourced variously | ||
anti-mouse Cy5 | Jackson ImmunoResearch | 715-175-151 | for immunohistochemistry |
anti-rabbit 568 | ThermoFisher | A11036 | for immunohistochemistry |
bovine serum albumin (BSA) | SIgma Aldrich | A7030 | for immunohistochemisty |
Clear nail polish | any | for sealing coverslips | |
Click-It EdU labeling kit | InVitrogen | C10640 | to detect newly synthesized DNA |
CO2 bubbler | Genesee Scientific | 59-181 | for anesthesia |
CO2 pad | Genesee Scientific | 59-114 | for anesthesia |
CO2 regulator and supply | any | for anesthesia | |
Confocal microscope | any | for imaging fixed, stained and mounted brains | |
cotton plugs | Genesee Scientific | 51-101 | for EdU labeling |
Drosophila vials | Genesee Scientific | 32-109 | for EdU labeling |
Fix buffer (Pipes, EGTA, Magnesium; PEM) | components sourced from various companies | for fixing adult brains; 100 mM piperazine-N,N’-bis(2-ethanesulfonic acid) [PIPES], 1 mM EGTA, 1 mM MgSO4, pH 7.0 | |
Formaldehyde | Sigma Aldrich | 252549 | for fixing adult brains, added to PEM |
Grade 3 round Whatman filters, 23 mm round | Tisch Scientific | 1003-323 | for EdU labeling |
Microfuge tubes | any | for fixing and staining reactions and for storing Minutien pins | |
Microscope slides | any | for mounting brains | |
Minutien pins | Fine Science Tools | 26002-10 | for brain injury; 12.5 μm diameter tip and 100 μm diameter rod |
mouse anti-Fasiclin II | Developmental Studies Hybridoma Bank | 1D4-s | for immunohistochemistry |
NIGHTSEA stereo microscope fluorescence adaptor | Electron Microscopy Sciences | SFA-GR | fluorescence setup for dissecting microscope |
P20, P200 and P1000 pipettors and tips | any | for measuring solutions | |
phosphate buffered saliine (PBS) | components sourced from various companies | for dissecting brains and making immunohistochemistry blocking and washing solutions; 100 mM of K2HPO4, 140 mM of NaCl, pH 7.0 | |
phosphate buffered saline with 0.1% Triton X-100 (PT) | components sourced from various companies | for washing dissected brains | |
phosphate buffered saline with 0.1% Triton X-100 + 2% bovine serum albumin (PBT) | components sourced from various companies | blocking solution for immunohistochemistry and for diluting antibodies | |
rabbit anti-PH3 | Santa Cruz Biotechnology, Inc | sc-8656-R | for immunohistochemistry |
Reinforcement labels | Avery | 5721 | to maintain space between the microscope slide and the coverslip |
Size 0 paintbrushes | any | to manipulate and stabilize adult Drosophila during injury | |
Triton X-100 | Sigma Aldrich | 93443 | |
Two pair of #5 watchmakers forceps | Fine Science Tools | 11255-20 | used to hold the Minutien pins and for brain dissections |
Vectashield | Vector Laboratories | H-1000 | mounting medium for microscope slides |