La lithographie quasi UV et la microscopie à force de traction sont combinées pour mesurer les forces cellulaires sur des hydrogels à micromotifs. La libération ciblée de cellules individuelles induite par la lumière permet un grand nombre de mesures sur le même échantillon.
La microscopie à force de traction (TFM) est la principale méthode utilisée en mécanobiologie pour mesurer les forces cellulaires. Il est couramment utilisé pour les cellules adhérant à des substrats plats et mous qui se déforment sous la traction cellulaire (2D-TFM). TFM repose sur l’utilisation de matériaux élastiques linéaires, tels que le polydiméthylsiloxane (PDMS) ou le polyacrylamide (PA). Pour 2D-TFM sur PA, la difficulté d’atteindre un débit élevé résulte principalement de la grande variabilité des formes de cellules et des tractions, ce qui nécessite une standardisation. Nous présentons un protocole pour fabriquer rapidement et efficacement des hydrogels DE PA à micromotifs pour les études 2D-TFM. Les micromotifs sont d’abord créés par photolithographie sans masque en utilisant une lumière proche des UV où les protéines de la matrice extracellulaire ne se lient qu’aux régions micromotifs, tandis que le reste de la surface reste non adhésif pour les cellules. Le micromodèlement des protéines de la matrice extracellulaire est dû à la présence de groupes aldéhydes actifs, ce qui entraîne des régions adhésives de différentes formes pour accueillir des cellules individuelles ou des groupes de cellules. Pour les mesures TFM, nous utilisons des hydrogels PA d’élasticité différente en faisant varier les quantités d’acrylamide et de bis-acrylamide et en suivant le déplacement des billes fluorescentes incorporées pour reconstruire les champs de traction cellulaire avec la cytométrie de traction à transformée de Fourier régularisée (FTTC).
Pour obtenir un enregistrement précis des forces cellulaires, nous décrivons l’utilisation d’une dose contrôlée de lumière à motifs pour libérer des tractions cellulaires dans des régions définies pour des cellules individuelles ou des groupes de cellules. Nous appelons cette méthode la microscopie à force de traction par éclairage UV local (LUVI-TFM). Avec le traitement enzymatique, toutes les cellules sont détachées de l’échantillon simultanément, alors qu’avec LUVI-TFM, les forces de traction des cellules dans différentes régions de l’échantillon peuvent être enregistrées en séquence. Nous démontrons l’applicabilité de ce protocole (i) pour étudier les forces de traction cellulaire en fonction de l’adhérence contrôlée au substrat, et (ii) pour obtenir un plus grand nombre d’observations expérimentales à partir du même échantillon.
Lorsqu’elles interagissent avec leur environnement extracellulaire, les cellules adhérentes exercent des forces qui sont principalement médiées par des adhérences focales à base d’intégrine reliant la matrice extracellulaire (ECM) au cytosquelette d’actine. Les adhérences focales sont des assemblages multiprotéiques centrés sur la liaison des intégrines aux protéines ECM comme la fibronectine et le collagène. Le regroupement de l’intégrine et la croissance des adhérences focales sont cruciaux non seulement pour l’établissement d’une connexion mécaniquement stable, mais aussi pour le recrutement d’autres protéines d’adhésion focale, y compris celles qui activent la voie RhoA pour la régulation de la contractilité cellulaire1. La contractilité rhoa-dépendante du cytosquelette d’actine permet aux cellules de se propager et de migrer sur l’ECM sous-jacent, ainsi que de détecter sa rigidité2. La distribution des forces de traction dépend fortement de la zone d’étalement et de la forme des cellules, qui reposent toutes deux sur les propriétés de la matrice et ont donc un impact sur l’organisation du cytosquelette, formant finalement une boucle de rétroaction fermée entre la mécanique de la matrice et l’organisation du cytosquelette3,4.
Les techniques de micromodèlement de surface permettent un contrôle défini de la forme des cellules en créant des régions de la taille d’un micron présentant des protéines adhésives ECM; selon la taille de ces régions, des cellules individuelles ou des groupes de cellules qui adhèrent au micromodèle5. Les protéines ECM peuvent être modelées sur des substrats de verre par différentes approches telles que l’impression par microcontact, le photo-motif ou le motif laser6. L’utilisation de la lumière UV (λ = 185 ou 375 nm) combinée à des stratégies antisalissures de surface offre la flexibilité nécessaire pour concevoir différentes formes et tailles et l’immobilisation de plusieurs types de protéines avec une grande précision près des bords de surface7,8. Les régions recouvertes de produits chimiques protéiques tels que le polyéthylène glycol (PEG) sont protégées par un photomasque au chrome ou un système de lithographie sans masque à base de miroir numérique (DMD). Les motifs dans les masques permettent l’exposition à la lumière UV de régions qui seront ensuite modelées avec des protéines ECM. La modelation des surfaces d’hydrogel avec des protéines ECM nécessite une étape de transfert pour éliminer les protéines de la surface du verre et les relier aux motifs. Alternativement, le motif sur des matériaux mous peut être obtenu en recouvrant d’abord le photomasque d’une protéine répulsive, puis en brûlant les régions non masquées à l’aide d’un éclairage UV profond. Étant donné que les UV profonds génèrent de l’ozone et rendent la surface réactive pour la liaison aux protéines, les régions non masquées sont recouvertes de protéines ECM et enfin le gel est polymérisé directement sur les régions non masquées9,10.
Les hydrogels à motifs peuvent être utilisés pour effectuer le TFM, une technique qui mesure les forces cellulaires à l’interface cellule-matériau11. En 2D-TFM, on utilise la surface plane d’un film polymère épais, dans lequel des billes de marqueurs ont été incorporées pour suivre les déformations12,13,14,15. Afin d’extraire des vecteurs de déplacement, il est essentiel de combiner deux images, l’une de l’état déformé et l’autre image de référence sans déformations. Les deux images sont ensuite mappées l’une sur l’autre avec traitement d’image. À haute densité de marqueurs, cela se fait généralement avec la vélocimétrie par image de particules (PIV), qui est une méthode bien établie pour reconstruire l’écoulement hydrodynamique. À faible densité de marqueurs et en 3D-TFM, cela se fait généralement avec la vélocimétrie de suivi des particules (PTV), qui comprend des caractéristiques spécifiques de l’ensemble de données expérimentales. Un exemple d’alternative moins coûteuse en calcul est le flux optique, tel que l’algorithme Kanade-Lucas-Tomasi (KLT)16. Dans le cas des substrats d’hydrogel, les billes fluorescentes sont généralement incorporées à haute densité pendant la polymérisation du matériau, et les images sont enregistrées avant et après la libération des cellules lors du détachement enzymatique. Le détachement enzymatique des cellules adhérentes, par exemple par trypsinisation, conduit à la libération simultanée de tractions cellulaires de toutes les cellules sur les hydrogels, ce qui rend difficile l’obtention d’une analyse détaillée à partir d’un grand nombre de cellules.
Nous présentons ici un protocole pour préparer des hydrogels à micromotifs pour contrôler la forme et la localisation des cellules et une méthode pour mesurer efficacement les forces de traction en séquence en utilisant les UV pour détacher les cellules individuelles du substrat. Pour les mesures de force de traction, nous présentons une technique pour produire des hydrogels PA à double couche, où les billes fluorescentes sont incorporées uniquement dans la couche supérieure, ce qui augmente leur densité et réduit leur étalement vertical. La combinaison de la libération par les UV des forces de traction cellulaires avec le micromotif permet d’obtenir un contrôle spatial sur le détachement cellulaire (par exemple, des cellules individuelles sans affecter l’adhésion d’autres cellules dans la région d’intérêt), à condition qu’il y ait une distance suffisante entre les cellules à motifs. La traction cellulaire est ensuite reconstruite à l’aide de la méthode la plus efficace et la plus fiable pour la 2D-TFM, à savoir la cytométrie de traction à transformée de Fourier (FTTC) avec régularisation17,18.
Dans ce protocole, nous décrivons la préparation d’hydrogels DE PA à micromotifs contenant des billes fluorescentes, qui sont utilisés comme marqueurs fiducaux pour les études TFM. Notre approche est basée sur trois étapes : 1) préparation d’hydrogels PA à double couche ; 2) le micromodèlement des protéines ECM et leur transfert sur la surface de l’hydrogel; 3) utilisation de lumière proche UV à motifs pour TFM. La configuration expérimentale pour analyser les tractions cellulaires vers le substrat nécessite l’utilisation de matériaux élastiques linéaires avec des valeurs de rigidité connues pour calculer les forces liées au déplacement des billes fluorescentes26. Les hydrogels PA sont faciles à préparer, la rigidité peut être facilement réglée et ils sont couramment utilisés pour la détection de rigidité et TFM18,28. Cependant, pour obtenir des temps de polymérisation reproductibles et une polymérisation homogène de l’ensemble de l’hydrogel, il convient de prêter attention aux conditions de stockage et au temps de conservation des réactifs, par exemple, l’APS doit être conservé dans un dessiccateur pour éviter de perdre son activité; TEMED doit être protégé de la lumière directe. L’utilisation de HEA oxydé permet la liaison covalente de protéines matricielles à la surface de l’hydrogel, ce qui pourrait être avantageux pour obtenir la formation d’une couche protéique complète et stable. La solution HEA oxydée doit être préparée fraîche chaque fois que des hydrogels de PA sont fabriqués. L’hydrogel PA à double couche offre trois avantages principaux: 1) il offre un moyen alternatif d’obtenir de manière reproductible une distribution homogène des billes de fiducial près de la surface de l’hydrogel, sans avoir besoin de rendre le gel extrêmement mince (c’est-à-dire <20 μm). Le contrôle de l’épaisseur de l’hydrogel est crucial pour obtenir des mesures précises avec TFM. Lorsque le substrat élastique est trop mince, de fortes cellules adhérentes telles que les fibroblastes peuvent détecter et répondre mécaniquement au substrat de verre rigide sous-jacent29,30. Les hydrogels épais rendent l’acquisition d’images pour la reconstruction de la force plus difficile. De plus, de nombreux microscopes n’auront pas assez d’espace pour les accueillir, compte tenu de l’épaisseur supplémentaire du substrat de verre utilisé pour fixer l’hydrogel, à moins que des lames de microscopie ultramince ne soient utilisées. 2) Dans l’hydrogel PA à double couche, la distribution homogène des billes fiduciales près de la surface de l’hydrogel PA est obtenue sans utiliser de centrifugeuse, mais plutôt avec une simple incubation de quantités précises de solutions d’hydrogel et de perles fluorescentes. Une densité de billes élevée est d’un avantage significatif lors de l’analyse PIV car elle augmente la résolution des forces de traction et le rapport signal/bruit sans avoir besoin de microscopie confocale. 3) Le confinement des billes dans une fine couche proche de l’interface cellule-matériau permet d’imager les forces de traction avec des microscopes à épifluorescence ainsi que des microscopes confocaux. Lors de la préparation de l’hydrogel, l’utilisateur doit s’assurer qu’il adhère fermement au verre inférieur avant de procéder aux étapes suivantes du protocole. Nous recommandons de suivre le temps d’incubation indiqué pour la polymérisation des couches d’hydrogel, car il pourrait être difficile d’enlever le verre sur le dessus de la surface sans endommager la surface de l’hydrogel.
Les techniques les plus connues pour mesurer les propriétés élastiques sont l’AFM, la nanoindentation, les tests de traction et la rhéométrie. Cependant, la nanoindentation induit des contraintes très élevées sur les matériaux qui peuvent affecter la détermination des propriétés élastiques. Les essais de traction et la rhéométrie, quant à eux, sont des techniques de mesure macroscopiques, tandis que les cellules interagissent à l’échelle microscopique31,32. L’AFM permet des mesures à l’échelle microscopique avec des déformations réduites dans des conditions physiologiques. La fiabilité des mesures AFM peut être affectée négativement si des détails expérimentaux sont manquants (par exemple, la force d’indentation et la vitesse) ou si des données insuffisantes sont enregistrées27. Huth et al. décrivent un algorithme pour extraire les modules de Young des données AFM, qui met l’accent sur le maintien des détails de mesure constants27. Cet algorithme offre une détermination précise et fiable des modules de Young et a été utilisé pour nos expériences. De plus, nous avons mesuré de nombreuses courbes sur des échantillons fabriqués à différents jours et obtenu des résultats très similaires (variation des valeurs moyennes d’environ 1-2 kPa). Cela montre que la rigidité de nos gels peut être prédite de manière fiable.
Dans ce protocole, nous utilisons un module de photomotifs pour créer des régions micromotifs sur verre, qui sont ensuite transférées sur les surfaces d’hydrogel. Le micromodèlement montré dans ce protocole est basé sur la lithographie sans masque sans masque DMD (λ = 375 nm)7. Un DMD se compose d’un grand nombre de micromiroirs sur une puce. Un seul pixel correspond à un seul micro-miroir. Le fichier image de motif pixélisé d’un ordinateur est projeté via DMD et mis au point sur la surface à l’aide d’un objectif. Pour le micromodélisme des protéines, la lumière laser focalisée est utilisée pour cliver les brosses en polymère répulsives à l’aide d’un photoinitiateur. Ensuite, les régions exposées sont remplies de protéines ECM. Cette méthode d’ablation sans masque offre une grande flexibilité dans la conception de nouveaux motifs, car elle ne repose pas sur l’utilisation d’un photomasque. La conception et l’application d’un motif sont très faciles car cela ne prend que quelques minutes en utilisant un logiciel gratuit comme Inkscape. Cependant, le nombre de motifs et d’échantillons produits en peu de temps est un inconvénient majeur, car cette méthode ne peut être utilisée que pour modeler un seul substrat à chaque fois. Le module de photomotif utilise une source laser à semi-conducteurs proche des UV qui émet plusieurs milliwatts. Le faisceau laser non blindé est dangereux pour les yeux et la peau. La lumière et le rayonnement réfléchis et diffusés peuvent également être dangereux. La manipulation doit être accompagnée d’une consigne de sécurité de la part des agents laser. L’étape la plus critique du protocole lors de l’utilisation d’un module de photomodélisme est de s’assurer que pendant le micropatterning et l’ablation, le laser est correctement focalisé sur la surface. Une dose d’éclairage constante (intensité multipliée par le temps) de lumière UV pendant la modélisation dépend de la façon dont le laser est focalisé sur la surface. Une faible intensité à la surface due à une mauvaise mise au point peut entraîner l’échec du transfert de l’ECM à la surface de l’hydrogel, ce qui entraîne l’absence de cellules attachées à l’hydrogel.
Dans les expériences TFM, après l’imagerie initiale des cellules adhérentes et des marqueurs fiducial, les cellules sont libérées de l’hydrogel PA par traitement à la trypsine pour enregistrer leur état détendu. Un inconvénient de cette étape est la manipulation de l’échantillon au stade de la microscopie. Sans chambre de perfusion, l’ouverture du couvercle du plat, l’aspiration du milieu, le rinçage et le pipetage de la solution de trypsine représentent un défi pour les débutants et les utilisateurs expérimentés. En fait, ces procédures sont une source majeure de la dérive dans les axes xyz , entraînant une perte de position et de concentration. Notre protocole d’éclairage UV local fait du TFM une technique plus accessible pour les débutants. Il convient de noter que nous avons utilisé un module de photomotif sans masque basé sur la microscopie disponible dans le commerce, mais en principe, tout système d’éclairage UV-A pourrait être utilisé, éventuellement en combinaison avec un masque pour protéger les régions des substrats, où les forces de traction cellulaire ne devraient pas être enregistrées. L’exposition de cellules avec une dose importante de lumière visible de faible longueur d’onde (par exemple, la lumière violette qui excite l’émission de DAPI) entraînera une augmentation du stress oxydatif, ce qui peut entraîner une phototoxicité et la mort cellulaire. Par conséquent, cette technique peut être appliquée même dans un microscope à épifluorescence sans module laser UV. Cependant, comme l’intensité est beaucoup plus faible, il sera beaucoup plus facile d’accomplir la TFM avec le traitement enzymatique dans ce cas.
Avec LUVI-TFM, il est possible d’utiliser le même échantillon pour plusieurs mesures en raison du détachement local de cellules individuelles ou de petits groupes de cellules. Cependant, il faut faire attention à la sélection des cellules à détacher, pour éviter d’enregistrer les forces des cellules voisines. Ainsi, pour les mesures à cellule unique en l’absence de micromotifs, les régions surpeuplées doivent être évitées; pour les mesures sur des cellules à micromotifs uniques, les motifs doivent être conçus de telle sorte que la distance entre les structures individuelles soit au moins deux fois supérieure au diamètre de la zone à motifs. Nous recommandons également de ne pas utiliser les cellules de motifs adjacents dans l’ordre, mais plutôt de les échantillonner dans des régions éloignées sur le substrat. Notre mesure est bien réalisée sur un microscope à épifluorescence équipé d’une fonction de contrôle de la mise au point et d’une lentille 40 x air NA = 0,9, où la distance de travail de la lentille est suffisamment longue et le mouvement rapide d’un puits à l’autre est très accordable. Le détachement ciblé des cellules pour les applications TFM est efficace pour mesurer la force cellulaire d’une seule cellule ou d’un groupe entier de petites cellules (par exemple, jusqu’à 300 μm de diamètre). À l’aide de notre configuration, nous avons observé l’arrondi et le détachement des cellules pour le traitement UV des cellules individuelles (Figure 3A), alors que le détachement se produisait rarement pour les grappes de petites cellules. Cela pourrait conduire à une sous-estimation des forces de traction cellulaire. Pour les grappes de cellules plus grandes, le détachement enzymatique est recommandé, car les utilisateurs doivent utiliser un objectif d’air 20x pour imager l’ensemble du cluster et une fonction de contrôle de la mise au point est nécessaire. Comme la profondeur de mise au point de l’objectif d’air 20x est beaucoup plus longue, la manipulation ne sera pas aussi critique que l’objectif de grossissement plus élevé. L’utilisateur doit s’assurer que la mise au point est correctement réglée pour l’ablation des cellules, car la dose d’éclairage dépend de la mise au point laser sur la surface. Bien que nous soyons conscients des limites possibles de l’utilisation de LUVI-TFM dans les collectifs cellulaires en raison des interactions mécaniques possibles avec les cellules voisines non traitées, cet aspect pourrait en fait s’avérer utile pour les études sur la mécanique de l’extrusion cellulaire ciblée, par exemple à partir de monocouches épithéliales.
En conclusion, avec notre approche TFM combinée à la libération induite par la lumière de cellules micromotifs, nous fournissons un protocole robuste et à haut débit pour mesurer les forces d’adhésion cellulaire. La polyvalence de cette méthode pourrait être exploitée davantage en utilisant la microscopie et la configuration d’imagerie visant à améliorer la résolution et la sensibilité.
The authors have nothing to disclose.
Nous remercions Mme Rebecca Alvarado pour le soutien apporté à la production vidéo du protocole et M. Stephen Casale pour les critiques constructives sur le manuscrit. Nous remercions les collègues du Département de biophysique cellulaire de l’Institut Max Planck de recherche médicale pour leurs discussions utiles. Le soutien financier de la Max-Planck-Gesellschaft à E.A.C.-A. et la Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG SFB1129, Projektnummer 240245660, P15 à E.A.C.-A. et P4 à U.S.S.; DFG EXC 2082/1-390761711 à U.S.S.) est également grandement reconnu. J.B. remercie la Fondation Carl Zeiss pour son soutien financier. E.A.C.-A., C.S. et U.S.S. reconnaissent le financement par le biais de l’école Max Planck Matter to Life soutenu par le ministère fédéral allemand de l’Éducation et de la Recherche (BMBF). C.S. est soutenu par le Conseil Européen de la Recherche (Consolidator Grant PHOTOMECH, n°101001797).
3-(Trimethoxysilyl)propyl methacrylate | #440159 | Sigma Aldrich | |
Acetic acid | #33209 | Honeywell | |
Acrylamide 40 % | #1610140 | Bio-Rad | CAUTION : toxic, work under a fume hood |
AFM cantilever | #CP-CONT-BSG-A-G | NanoAndMore | 5 μm spherical tip |
AFM system | #NanoWizard3 | JPK | Coupled to optical microscope equipped with 40x air objective and GFP filter |
Ammonium persulfate | #A3678 | Sigma | |
Bis-acrylamide 2 % | #1610142 | Bio-Rad | CAUTION : toxic, work under a fume hood |
Camera sCMOS | #C11440-42U30 | Hamamatsu | |
Camera sCMOS | #ANDORZYLA4.2 | Oxford Instrument | |
CellRox | #C10422 | Thermo Fisher | |
Custom incubator chamber | EMBLEM | ||
Dental glue | #1300 100 | Picodent | |
DMEM | #41965 | Thermo Fisher | |
Epifluorescence microscope | #Eclipse Ti2E | Nikon | |
Epifluorescence microscope | #Axiovert200 | Zeiss | |
Ethanol | #9065.3 | Carl Roth | |
FBS South America | #S181T | Thermo Fisher | |
Fibrinogen | #F13191 | Invitrogen | Alexa488 conjugate |
Fibronectin | #F1141 | Sigma | |
Fluorescent beads 200 nm | #F8805 | Invitrogen | Carboxylated (365/415) |
Fluorescent beads 200 nm | #F8848 | Invitrogen | Carboxylated (505/515) |
Fluorescent beads 200 nm | #F8810 | Invitrogen | Carboxylated (580/605) |
Fluorescent beads 200 nm | #F8807 | Invitrogen | Carboxylated (660/680) |
Glass coverslip 15 mm round | #41001115 | Assistent | |
Glass coverslip 24 mm round | #41001124 | Assistent | |
Microscope Objective | #MRH08230 | Nikon | 20x air NA 0.45 |
Mouse Embryonic Fibroblasts | #CRL-2991 | ATCC | |
mPEG-SVA | #MPEG-SVA-5000 | Laysan Bio | |
N-Hydroxyethyl acrylamide | #697931 | Aldrich | |
Plasma cleaner | #100-E | TePla | |
PLPP gel | #PLPPgel | Alveole | |
Poly-L-lysine | #P4823 | Sigma Aldrich | |
Poly(L-lysine)-graft-poly(ethylene glycol) | #PLL(20-g[3.5]-PEG(2) | SuSoS | |
Sodium(meta) periodate | #S1878 | Sigma Aldrich | |
TEMED | #17919 | Thermo Scientific | |
UV Pattening module | #PRIMO | Alveole | |
UVO cleaner | #342-220 | Jelight |