Near-UV-lithografie en tractiekrachtmicroscopie worden gecombineerd om cellulaire krachten op microgepatterde hydrogels te meten. De gerichte licht-geïnduceerde afgifte van enkele cellen maakt een groot aantal metingen op hetzelfde monster mogelijk.
Tractiekrachtmicroscopie (TFM) is de belangrijkste methode die in de mechanobiologie wordt gebruikt om celkrachten te meten. Gewoonlijk wordt dit gebruikt voor cellen die zich hechten aan platte zachte substraten die vervormen onder celtractie (2D-TFM). TFM vertrouwt op het gebruik van lineair elastische materialen, zoals polydimethylsiloxaan (PDMS) of polyacrylamide (PA). Voor 2D-TFM op PA is de moeilijkheid om een hoge doorvoer te bereiken voornamelijk het gevolg van de grote variabiliteit van celvormen en tracties, wat standaardisatie vereist. We presenteren een protocol om snel en efficiënt microgepatterde PA-hydrogels te fabriceren voor 2D-TFM-studies. De micropatronen worden eerst gemaakt door maskerloze fotolithografie met behulp van bijna UV-licht waarbij extracellulaire matrixeiwitten alleen binden aan de microgepatterde gebieden, terwijl de rest van het oppervlak niet-klevend blijft voor cellen. De micropatterning van extracellulaire matrixeiwitten is te wijten aan de aanwezigheid van actieve aldehydegroepen, wat resulteert in kleefgebieden van verschillende vormen om afzonderlijke cellen of groepen cellen te huisvesten. Voor TFM-metingen gebruiken we PA-hydrogels met verschillende elasticiteit door de hoeveelheden acrylamide en bis-acrylamide te variëren en de verplaatsing van ingebedde fluorescerende kralen te volgen om celtractievelden te reconstrueren met geregulariseerde Fourier Transform Traction Cytometry (FTTC).
Om verder te komen tot nauwkeurige registratie van celkrachten, beschrijven we het gebruik van een gecontroleerde dosis patroonlicht om celtractie vrij te maken in gedefinieerde gebieden voor afzonderlijke cellen of groepen cellen. We noemen deze methode lokale UV-verlichting tractiekrachtmicroscopie (LUVI-TFM). Bij enzymatische behandeling worden alle cellen tegelijkertijd van het monster losgemaakt, terwijl met LUVI-TFM tractiekrachten van cellen in verschillende regio’s van het monster in volgorde kunnen worden geregistreerd. We tonen de toepasbaarheid van dit protocol aan (i) om celtractiekrachten te bestuderen als een functie van gecontroleerde adhesie aan het substraat, en (ii) om een groter aantal experimentele waarnemingen van hetzelfde monster te bereiken.
Bij interactie met hun extracellulaire omgeving oefenen aanhangende cellen krachten uit die voornamelijk worden gemedieerd door op integrine gebaseerde focale verklevingen die de extracellulaire matrix (ECM) verbinden met het actinecytoskelet. Focale verklevingen zijn multiproteïneassemblages die zijn gecentreerd rond de binding van integrines aan ECM-eiwitten zoals fibronectine en collageen. Integrineclustering en groei van focale verklevingen is niet alleen cruciaal voor het tot stand brengen van een mechanisch stabiele verbinding, maar ook voor de rekrutering van andere focale adhesie-eiwitten, waaronder die welke de RhoA-route activeren voor de regulatie van cellulaire contractiliteit1. De RhoA-afhankelijke contractiliteit van het actinecytoskelet stelt cellen in staat zich te verspreiden en te migreren op de onderliggende ECM, en ook om de stijfheid ervan te voelen2. De verdeling van tractiekrachten hangt sterk af van het verspreidingsgebied en de vorm van cellen, die beide afhankelijk zijn van matrixeigenschappen en daarom de cytoskeletale organisatie beïnvloeden, waardoor uiteindelijk een gesloten feedbacklus wordt gevormd tussen matrixmechanica en cytoskeletorganisatie3,4.
Oppervlaktemicropatterningtechnieken maken een gedefinieerde controle van de celvorm mogelijk door micron-sized gebieden te creëren die ECM-kleefeiwitten presenteren; volgens de grootte van deze gebieden, enkele cellen of groepen cellen die zich hechten aan de micropattern5. ECM-eiwitten kunnen op verschillende manieren op glazen substraten worden gemodelleerd, zoals microcontactprinten, fotopatronen of laserpatronen6. Het gebruik van UV-licht (λ = 185 of 375 nm) in combinatie met oppervlakte-aangroeistrategieën biedt de flexibiliteit voor het ontwerpen van verschillende vormen en maten en immobilisatie van meerdere eiwittypen met een hoge precisie in de buurt van oppervlakteranden7,8. De regio’s bedekt met eiwitafstotende chemicaliën zoals polyethyleenglycol (PEG) worden beschermd met een chroomfotomasker of een op digitaal spiegelapparaat (DMD) gebaseerd maskerloos lithografiesysteem. De patronen in de maskers maken de blootstelling aan UV-licht mogelijk van regio’s die vervolgens worden gemodelleerd met ECM-eiwitten. Het patroon van hydrogeloppervlakken met ECM-eiwitten vereist een overdrachtsstap om eiwitten van het glasoppervlak te verwijderen en ze te verknopen met de patronen. Als alternatief kunnen patronen op zachte materialen worden bereikt door het fotomasker eerst te coaten met een afstotend eiwit, gevolgd door de ontmaskerde gebieden te verbranden met behulp van diepe UV-verlichting. Omdat diepe UV ozon genereert en het oppervlak reactief maakt voor eiwitbinding, worden de ontmaskerde gebieden bedekt met ECM-eiwitten en ten slotte wordt de gel direct bovenop de ontmaskerde gebieden gepolymeriseerd9,10.
De hydrogels met patroon kunnen worden gebruikt om TFM uit te voeren, een techniek die celkrachten meet op het cel-materiaalinterface11. In 2D-TFM gebruikt men het platte oppervlak van een dikke polymeerfilm, waarin markerkralen zijn ingebed om vervormingen te volgen12,13,14,15. Om verplaatsingsvectoren te extraheren, is het essentieel om twee afbeeldingen te combineren, een van de vervormde toestand en een referentiebeeld zonder vervormingen. De twee afbeeldingen worden vervolgens met beeldverwerking op elkaar in kaart gebracht. Bij hoge markerdichtheid gebeurt dit meestal met Particle Image Velocimetry (PIV), een gevestigde methode om hydrodynamische stroming te reconstrueren. Bij lage markerdichtheid en in 3D-TFM gebeurt dit meestal met Particle Tracking Velocimetry (PTV), die specifieke kenmerken van de experimentele dataset bevat. Een voorbeeld van een rekenkundig goedkoper alternatief is optische flow, zoals het Kanade-Lucas-Tomasi (KLT) algoritme16. In het geval van hydrogelsubstraten worden fluorescerende kralen meestal ingebed met een hoge dichtheid tijdens de materiaalpolymerisatie en worden beelden opgenomen voor en na celafgifte bij enzymatische loslating. Enzymatische loslating van aanhangende cellen, bijvoorbeeld door trypsinisatie, leidt tot gelijktijdige afgifte van cellulaire tracties van alle cellen op de hydrogels, waardoor het moeilijk is om een gedetailleerde analyse van een groot aantal cellen te verkrijgen.
Hier presenteren we een protocol om microgepatterde hydrogels te bereiden om de celvorm en lokalisatie te regelen en een methode om tractiekrachten efficiënt achter elkaar te meten met behulp van UV om individuele cellen van het substraat los te maken. Voor tractiekrachtmetingen presenteren we een techniek om tweelaagse PA-hydrogels te produceren, waarbij fluorescerende kralen alleen in de bovenste laag zijn ingebed, wat hun dichtheid verhoogt en hun verticale verspreiding vermindert. Het combineren van UV-gemedieerde afgifte van cellulaire tractiekrachten met micropatterning maakt het mogelijk om ruimtelijke controle te verkrijgen over celloslating (bijvoorbeeld van afzonderlijke cellen zonder de hechting van andere cellen in het betreffende gebied te beïnvloeden), op voorwaarde dat er voldoende afstand is tussen cellen met patronen. Cellulaire tractie wordt vervolgens gereconstrueerd met behulp van de meest efficiënte en betrouwbare methode voor 2D-TFM, namelijk Fourier Transform Traction Cytometry (FTTC) met regularisatie17,18.
In dit protocol beschrijven we de bereiding van microgepatterde PA-hydrogels met fluorescerende kralen, die worden gebruikt als fiduciale markers voor TFM-studies. Onze aanpak is gebaseerd op drie stappen: 1) bereiding van dubbellaagse PA-hydrogels; 2) micropatterning van ECM-eiwitten en hun overdracht op het hydrogeloppervlak; 3) gebruik van patroon bijna-UV-licht voor TFM. De experimentele opstelling om celtractie naar het substraat te analyseren, vereist het gebruik van lineaire elastische materialen met bekende stijfheidswaarden om de krachten te berekenen die verband houden met verplaatsing van de fluorescerende kralen26. PA-hydrogels zijn gemakkelijk te bereiden, de stijfheid kan gemakkelijk worden afgestemd en ze worden vaak gebruikt voor stijfheidsdetectie en TFM18,28. Om echter reproduceerbare polymerisatietijden en homogene polymerisatie van de gehele hydrogel te verkrijgen, moet aandacht worden besteed aan de opslagomstandigheden en de tijd voor de reagentia, bijvoorbeeld APS moet in een exsiccator worden bewaard om te voorkomen dat het zijn activiteit verliest; TEMED moet worden beschermd tegen direct licht. Het gebruik van geoxideerde HEA maakt de covalente binding van matrixeiwitten op het hydrogeloppervlak mogelijk, wat voordelig kan zijn om de vorming van een volledige en stabiele eiwitlaag te bereiken. De geoxideerde HEA-oplossing moet vers worden bereid telkens wanneer PA-hydrogels worden vervaardigd. De dubbellaagse PA-hydrogel biedt drie belangrijke voordelen: 1) het biedt een alternatieve manier om reproduceerbaar een homogene verdeling van fiduciale kralen in de buurt van het hydrogeloppervlak te krijgen, zonder dat de gel extreem dun hoeft te worden (d.w.z. <20 μm). Controle over de dikte van de hydrogel is cruciaal voor het verkrijgen van nauwkeurige metingen met TFM. Wanneer het elastische substraat te dun is, kunnen sterk hechtende cellen zoals fibroblasten het onderliggende stijve glassubstraat detecteren en mechanisch erop reageren29,30. Dikke hydrogels maken de beeldverwerving voor de krachtreconstructie uitdagender. Bovendien zullen veel microscopen niet voldoende ruimte hebben om ze te huisvesten, gezien de extra dikte van het glazen substraat dat wordt gebruikt om de hydrogel te bevestigen, tenzij ultradunne microscopieglaasjes worden gebruikt. 2) In de tweelaagse PA-hydrogel wordt de homogene verdeling van fiduciale kralen nabij het oppervlak van de PA-hydrogel bereikt zonder een centrifuge te gebruiken, maar eerder met een eenvoudige incubatie van precieze hoeveelheden hydrogeloplossingen en fluorescerende kralen. Een hoge pareldichtheid is van groot voordeel bij het uitvoeren van de PIV-analyse omdat het de resolutie van de trekkrachten en de signaal-ruisverhouding verhoogt zonder de noodzaak van confocale microscopie. 3) Het insluiten van kralen in een dunne laag dicht bij de cel-materiaalinterface maakt beeldvorming van tractiekrachten mogelijk met epifluorescentiemicroscopen en confocale microscopen. Bij het voorbereiden van de hydrogel moet de gebruiker ervoor zorgen dat deze stevig aan het onderste glas hecht voordat hij doorgaat met de volgende stappen van het protocol. We raden aan om de incubatietijd te volgen die is aangegeven voor de polymerisatie van de hydrogellagen, omdat het moeilijk kan zijn om het glas bovenop het oppervlak te verwijderen zonder het hydrogeloppervlak te beschadigen.
De meest bekende technieken om elastische eigenschappen te meten zijn AFM, nano-dedentatie, trekproeven en rheometrie. Nano-aantasting veroorzaakt echter zeer hoge spanningen op de materialen die de bepaling van elastische eigenschappen kunnen beïnvloeden. Trekproeven en rheometrie daarentegen zijn macroscopische meettechnieken, terwijl cellen interageren op microscopische schaal31,32. AFM maakt metingen op microschaal mogelijk met verminderde spanningen onder fysiologische omstandigheden. De betrouwbaarheid van AFM-metingen kan nadelig worden beïnvloed als experimentele details ontbreken (bijv. inkepingskracht en snelheid) of als er onvoldoende gegevens worden geregistreerd27. Huth et al. beschrijven een algoritme om de moduli van Young uit AFM-gegevens te halen, waarbij de nadruk wordt gelegd op het constant houden van meetgegevens27. Dit algoritme biedt een nauwkeurige en betrouwbare bepaling van Young’s moduli en werd gebruikt voor onze experimenten. Bovendien hebben we veel curven gemeten op monsters die op verschillende dagen zijn vervaardigd en zeer vergelijkbare resultaten behaald (variatie van gemiddelde waarden van ca. 1-2 kPa). Dit toont aan dat de stijfheid van onze gels betrouwbaar kan worden voorspeld.
In dit protocol gebruiken we een fotopatterningmodule om microgepatterde gebieden op glas te creëren, die vervolgens worden overgebracht naar de hydrogeloppervlakken. De micropatterning die in dit protocol wordt getoond, is gebaseerd op DMD (digital micro-mirror device)-gebaseerde maskerloze near-UV-lithografie (λ = 375 nm)7. Een DMD bestaat uit een groot aantal microspiegels op een chip. Een enkele pixel komt overeen met een enkele microspiegel. Het gepixelde patroonafbeeldingsbestand van een computer wordt geprojecteerd via DMD en op het oppervlak gericht met behulp van een objectieve lens. Voor micropatterning van eiwitten wordt het gerichte laserlicht gebruikt om afstotende polymeerborstels te splitsen met behulp van een foto-initiator. Daarna worden de blootgestelde gebieden gevuld met ECM-eiwitten. Deze maskerloze ablatiemethode biedt grote flexibiliteit bij het ontwerpen van nieuwe patronen, omdat deze niet afhankelijk is van het gebruik van een fotomasker. Het ontwerpen en toepassen van een patroon is heel eenvoudig omdat het slechts enkele minuten duurt met behulp van een freeware zoals Inkscape. Het aantal patronen en monsters dat in korte tijd wordt geproduceerd, is echter een groot nadeel, omdat deze methode slechts kan worden gebruikt om elke keer een enkel substraat te modelleren. De fotopatterning module maakt gebruik van een near UV solid-state laserbron die meerdere milliwatts uitzendt. De onbeschermde laserstraal is gevaarlijk voor de ogen en de huid. Gereflecteerd en verstrooid licht en straling kunnen ook gevaarlijk zijn. De hantering moet gepaard gaan met een veiligheidsinstructie van laserofficieren. De meest kritische stap in het protocol bij het gebruik van een fotopatterning module is ervoor te zorgen dat tijdens de micropatterning en de ablatie de laser goed op het oppervlak wordt gericht. Een consistente verlichtingsdosis (intensiteit vermenigvuldigd met tijd) van UV-licht tijdens het patroonvorming is afhankelijk van hoe de laser op het oppervlak wordt gericht. Een zwakke intensiteit op het oppervlak als gevolg van slechte focus kan resulteren in het falen van ECM-overdracht naar het hydrogeloppervlak, waardoor er geen cellen aan de hydrogel vast komen te zitten.
In TFM-experimenten, na de eerste beeldvorming van adherente cellen en de fiduciale markers, worden cellen vrijgegeven uit de PA-hydrogel door trypsinebehandeling om hun ontspannen toestand vast te leggen. Een nadeel bij het uitvoeren van deze stap is het verwerken van het monster in de microscopiefase. Zonder een perfusiekamer vormen het openen van het deksel van de schaal, het aanzuigen van het medium, het spoelen en pipetteren van trypsine-oplossing een uitdaging voor beginners en ervaren gebruikers. In feite zijn deze procedures een belangrijke bron van de drift in xyz-assen , wat resulteert in verlies van positie en focus. Ons lokale UV-verlichtingsprotocol maakt TFM een meer toegankelijke techniek voor beginners. Opgemerkt moet worden dat we een in de handel verkrijgbare op microscopie gebaseerde maskerloze fotopatterningmodule hebben gebruikt, maar in principe kan elk UV-A-verlichtingssysteem worden gebruikt, uiteindelijk in combinatie met een masker om delen van de substraten te beschermen, waar celtractiekrachten niet mogen worden geregistreerd. Het blootstellen van cellen met een aanzienlijke dosis zichtbaar licht met een lage golflengte (bijvoorbeeld het violette licht dat DAPI-emissie prikkelt) zal leiden tot toenemende oxidatieve stress, wat kan leiden tot fototoxiciteit en celdood. Daarom kan deze techniek zelfs in een epifluorescentiemicroscoop zonder UV-lasermodule worden toegepast. Omdat de intensiteit echter veel zwakker is, zal het in dit geval veel gemakkelijker zijn om TFM te bereiken met de enzymatische behandeling.
Met LUVI-TFM is het mogelijk om hetzelfde monster voor meerdere metingen te gebruiken vanwege de lokale loslating van afzonderlijke cellen of kleine groepen cellen. Er moet echter aandacht worden besteed aan de selectie van cellen om los te maken, om te voorkomen dat krachten van naburige cellen worden geregistreerd. Voor eencellige metingen in afwezigheid van micropatronen moeten dus drukke gebieden worden vermeden; voor metingen aan afzonderlijke cellen met micropatronen moeten de patronen zodanig zijn ontworpen dat de afstand tussen afzonderlijke structuren ten minste tweemaal de diameter van het patroongebied bedraagt. We raden ook aan om geen cellen uit aangrenzende patronen achter elkaar te gebruiken, maar ze eerder te bemonsteren uit verre gebieden op het substraat. Onze meting wordt goed uitgevoerd op een epifluorescentiemicroscoop uitgerust met een focus control functie en een 40 x lucht NA = 0,9 lens, waarbij de werkafstand van de lens voldoende lang is en de snelle beweging van de ene put naar de andere zeer afstembaar is. Het gericht loskoppelen van cellen voor TFM-toepassingen is effectief voor het meten van de cellulaire kracht van een enkele cel of van een hele kleine celcluster (bijvoorbeeld tot 300 μm in diameter). Met behulp van onze opstelling observeerden we celafronding en ontkoppeling voor UV-behandeling van afzonderlijke cellen (figuur 3A), terwijl loslating zelden voorkwam voor kleine celclusters. Dit kan leiden tot een onderschatting van de celtractiekrachten. Voor grotere celclusters wordt enzymatische ontkoppeling aanbevolen, omdat de gebruikers een 20x luchtdoel moeten gebruiken om het hele cluster in beeld te brengen en een focuscontrolefunctie nodig is. Omdat de scherptediepte van de 20x luchtlens veel langer is, zal de handling niet zo kritisch zijn als het hogere vergrotingsobjectief. De gebruiker moet ervoor zorgen dat de focus correct is ingesteld voor de ablatie van cellen, omdat de verlichtingsdosis afhankelijk is van de laserfocus op het oppervlak. Hoewel we ons bewust zijn van de mogelijke beperkingen bij het gebruik van LUVI-TFM in celcollectieven vanwege mogelijke mechanische interacties met naburige onbehandelde cellen, zou dit aspect eigenlijk nuttig kunnen blijken te zijn voor studies naar de mechanica van gerichte celextrusie, bijvoorbeeld van epitheliale monolagen.
Kortom, met onze TFM-aanpak in combinatie met licht geïnduceerde afgifte van microgepatterde cellen, bieden we een robuust en high-throughput protocol om celadhesiekrachten te meten. De veelzijdigheid van deze methode kan verder worden benut met behulp van microscopie en beeldvormingsopstelling gericht op het verbeteren van resolutie en gevoeligheid.
The authors have nothing to disclose.
We danken mevrouw Rebecca Alvarado voor de steun in de videoproductie van het protocol en de heer Stephen Casale voor de opbouwende kritiek op het manuscript. We danken de collega’s van de afdeling Cellulaire Biofysica, Max Planck Instituut voor Medisch Onderzoek voor de nuttige discussies. De financiële steun van de Max-Planck-Gesellschaft aan E.A.C.-A. en de Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG SFB1129, Projektnummer 240245660, P15 tot E.A.C.-A. en P4 tot U.S.S.; DFG EXC 2082/1-390761711 naar de VS) wordt ook zeer erkend. J.B. bedankt de Carl Zeiss Foundation voor de financiële steun. E.A.C.-A., C.S. en U.S.S. erkennen financiering via de Max Planck School Matter to Life ondersteund door het Duitse federale ministerie van Onderwijs en Onderzoek (BMBF). C.S. wordt ondersteund door de European Research Council (Consolidator Grant PHOTOMECH, no.101001797).
3-(Trimethoxysilyl)propyl methacrylate | #440159 | Sigma Aldrich | |
Acetic acid | #33209 | Honeywell | |
Acrylamide 40 % | #1610140 | Bio-Rad | CAUTION : toxic, work under a fume hood |
AFM cantilever | #CP-CONT-BSG-A-G | NanoAndMore | 5 μm spherical tip |
AFM system | #NanoWizard3 | JPK | Coupled to optical microscope equipped with 40x air objective and GFP filter |
Ammonium persulfate | #A3678 | Sigma | |
Bis-acrylamide 2 % | #1610142 | Bio-Rad | CAUTION : toxic, work under a fume hood |
Camera sCMOS | #C11440-42U30 | Hamamatsu | |
Camera sCMOS | #ANDORZYLA4.2 | Oxford Instrument | |
CellRox | #C10422 | Thermo Fisher | |
Custom incubator chamber | EMBLEM | ||
Dental glue | #1300 100 | Picodent | |
DMEM | #41965 | Thermo Fisher | |
Epifluorescence microscope | #Eclipse Ti2E | Nikon | |
Epifluorescence microscope | #Axiovert200 | Zeiss | |
Ethanol | #9065.3 | Carl Roth | |
FBS South America | #S181T | Thermo Fisher | |
Fibrinogen | #F13191 | Invitrogen | Alexa488 conjugate |
Fibronectin | #F1141 | Sigma | |
Fluorescent beads 200 nm | #F8805 | Invitrogen | Carboxylated (365/415) |
Fluorescent beads 200 nm | #F8848 | Invitrogen | Carboxylated (505/515) |
Fluorescent beads 200 nm | #F8810 | Invitrogen | Carboxylated (580/605) |
Fluorescent beads 200 nm | #F8807 | Invitrogen | Carboxylated (660/680) |
Glass coverslip 15 mm round | #41001115 | Assistent | |
Glass coverslip 24 mm round | #41001124 | Assistent | |
Microscope Objective | #MRH08230 | Nikon | 20x air NA 0.45 |
Mouse Embryonic Fibroblasts | #CRL-2991 | ATCC | |
mPEG-SVA | #MPEG-SVA-5000 | Laysan Bio | |
N-Hydroxyethyl acrylamide | #697931 | Aldrich | |
Plasma cleaner | #100-E | TePla | |
PLPP gel | #PLPPgel | Alveole | |
Poly-L-lysine | #P4823 | Sigma Aldrich | |
Poly(L-lysine)-graft-poly(ethylene glycol) | #PLL(20-g[3.5]-PEG(2) | SuSoS | |
Sodium(meta) periodate | #S1878 | Sigma Aldrich | |
TEMED | #17919 | Thermo Scientific | |
UV Pattening module | #PRIMO | Alveole | |
UVO cleaner | #342-220 | Jelight |