이 프로토콜은 서브유닛 백신에서 항원으로 사용할 수 있는 나노디스크에 지지된 막 단백질을 생산하기 위해 상업용 무세포 단백질 발현 키트를 사용하는 것을 설명합니다.
서브유닛 백신은 안전성, 안정성 및 표준 제조 면에서 기존의 비활성화 또는 약독화 전세포 유래 백신에 비해 이점을 제공합니다. 효과적인 단백질 기반 서브유닛 백신을 달성하기 위해 단백질 항원은 종종 천연과 유사한 형태를 채택해야 합니다. 이것은 막 결합 단백질인 병원체 표면 항원에 특히 중요합니다. 무세포 방법은 일반적으로 나노디스크로 알려진 나노지단백질 입자(NLP)의 공동 번역을 통해 올바르게 접힌 기능성 막 단백질을 생산하는 데 성공적으로 사용되었습니다.
이 전략은 지질 결합 환경에서 막 단백질로 구성된 서브유닛 백신을 생산하는 데 사용할 수 있습니다. 그러나 무세포 단백질 생산은 종종 소규모(<1mL)로 제한됩니다. 소규모 생산에서 생산되는 단백질의 양은 일반적으로 생화학 및 생물물리학 연구에 충분합니다. 그러나 동물 모델에서 백신 연구에 충분한 단백질을 얻기 위해 무세포 공정을 확장, 최적화 및 신중하게 테스트해야 합니다. 정제, 보조제 첨가 및 동결건조와 같은 백신 생산과 관련된 다른 공정은 병렬로 최적화되어야 합니다. 이 논문은 막 결합 단백질 서브유닛 백신을 발현, 정제 및 공식화하기 위한 확장된 프로토콜의 개발을 보고합니다.
스케일 업된 cell-free 반응은 제형화된 나노지단백질 입자의 높은 수준의 생산을 위해 다중 플라스미드 발현 벡터, 지질 선택 및 보조제 첨가를 사용할 때 플라스미드 농도 및 비율의 최적화가 필요합니다. 이 방법은 여기에서 클라미디아 주요 외막 단백질(MOMP)의 발현으로 입증되지만 다른 막 단백질 항원에도 널리 적용될 수 있습니다. 항원 유효성은 여기에서 입증된 바와 같이 항체 생산을 측정하기 위한 면역화 연구를 통해 생체 내에서 평가될 수 있다.
단백질의 무세포 발현을 위한 원핵생물 또는 진핵생물 용해물은 관심 있는 단백질을 합성하기 위한 상용 제품으로 쉽게 사용할 수 있습니다(전체 검토는 1 참조). 이러한 발현 시스템은 다양한 규모로 이용 가능하며 대장균, 담배 식물 및 포유류 배양을 포함한 다양한 유기체의 용해물을 활용합니다. 무세포 용해물은 사용 편의성, 강력하고 빠른 단백질 생산 등 기존의 재조합 단백질 생산 방식에 비해 여러 가지 이점을 제공합니다. 이러한 접근법은 주로 수용성 단백질을 생산하는 데 사용되지만, 이 그룹은 막 단백질을 발현하는 데 사용하는 접근법을 개척했습니다.
이 새로운 접근법은 발현을 위해 두 가지 단백질 생성물인 아포지단백질과 관심 있는 막 단백질을 암호화하는 DNA를 포함하여 기존의 무세포 발현 시스템을 약간 수정합니다. 발현된 아포지단백(ApoA1 또는 ApoE4의 유도체)은 cell-free lysate에 첨가된 지질과 상호작용하여 NLP를 자발적으로 조립(~20nm)합니다. 관심 있는 막 단백질과 함께 번역될 때, NLP 및 막 단백질은 가용성 나노입자 복합체를 형성하며, 여기서 막 단백질은 NLP 지질 이중층 내에 매립됩니다. 따라서, 막 단백질은 용해성, 분리된 입자 내에 포함되어 있기 때문에 다운스트림 응용 분야에 더 쉽게 접근할 수 있습니다. 이 접근법은 NLP 이중층2 내에서 기능성 올리고머 단백질 복합체를 생산할 수 있고, 서브유닛 백신의 항원 성분을 생성할 수 있으며, 이는 연속적으로 친유성 보조제와 혼합되어 생체 내 평가에 적합한 공동-국소화된 항원 및 보조제를 특징으로 하는 나노입자 백신을 형성합니다.
이 현재 방법은 이전에 게시된 프로토콜3에서 수정되었습니다. 주요 변형은 cell-free 반응의 스케일 업 및 단백질-NLP 복합체의 후속 정제에 중점을 둡니다. 추가 변형은 텔로덴드리머로 알려진 양친매성 폴리머의 첨가를 포함하며, 이는 무세포 반응에 첨가되기 전에 먼저 지질과 혼합됩니다. 텔로덴드리머와 지질의 존재 하에서 플라스미드의 공동번역은 텔로덴드리머 NLP(tNLP)를 생성한다. 텔로덴드리머의 첨가는 또한 생성된 tNLP 나노입자의 크기 및 단분산성을 조절하는 데 도움이 된다4. 이 프로토콜은 막 결합 서브유닛 항원 단백질인 클라미디아 MOMP 5,6을 생산하기 위한 대규모 백신 연구에 특별히 최적화되어 있습니다. 상기 방법은 tNLP와 관련된 재조합 MOMP를 생성하여 MOMP 올리고머화를 유지하는 고가용성 MOMP-tNLP 복합체를 형성한다. 일반적인 3mL 스케일업 생산은 >1.5mg의 정제된 MOMP를 산출합니다. 무세포 생산 MOMP-tNLP는 생체 내 면역원성 시험을 위한 신속한 보조제 첨가가 가능하다.
클라미디아는 남성과 여성 모두에게 영향을 미치는 가장 흔한 성병입니다. 클라미디아에 대한 백신 연구는 수십 년에 걸쳐 진행되고 있지만, 대량 생산까지 확대할 수 있는 안전하고 효과적인 백신은 여전히 찾기 어렵다13. 클라미디아 MOMP는 보호 백신 항원으로서 주요 후보로 간주됩니다. 그러나 MOMP는 소수성이 높고 잘못 접히기 쉽습니다14,15. 추가 연구에 따르면 MOMP는 면역원성에 필수적인 올리고머 상태에 존재한다11. 여기에 자세히 설명된 것은 tNLP 나노입자 내에 형성된 올리고머 MOMP를 백신으로 생산하는 검증된 무세포 동시 발현 방법으로, 용해물 3mL당 약 1.5mg의 정제된 MOMP를 수율로 제공합니다. 이 완전히 대조된 절차는 산업 생산을 위해 추가로 확장될 수 있어 백신 생성을 위한 유용한 접근 방식으로서의 전망을 높일 수 있습니다.
우리는 이전에 NLP 3,16에 내장된 막 단백질을 생산하기 위해 무세포 발현을 사용하고 텔로덴드리머 안정화 디스크로 발현하는 방법에 대해 발표했습니다. 그러나 이 후자의 기술은 더 큰 이질성과 더 낮은 용해도를 갖는 막-단백질 입자를 생성했습니다. 4 또한, MOMP-텔로덴드리머 입자의 면역원성은 MOMP-tNLP 입자에 비해 불분명하다6.
이 절차는 서브유닛 백신에 사용하기 위한 항원으로서 유망한 후보인 박테리아 막 단백질의 발현을 확장하는 데 적용할 수 있습니다. 이 절차는 가용화된 박테리아 막 단백질을 생성할 뿐만 아니라 전체 나노입자 구조는 콜레스테롤 부분에 접합된 CpG 또는 FSL-1을 포함하되 이에 국한되지 않는 다양한 친유성 백신 보조제를 사용하여 추가 변형이 가능합니다. 박테리아에서 다른 후보 항원의 발현은 가능하지만 최적의 수율을 달성하기 위해 발현 온도, 지질 선택 및 발현 시스템 유형과 같은 매개변수를 탐색해야 할 수 있습니다.
또한 플라스미드 선택과 비율은 이 과정에서 매우 중요합니다. 사용되는 두 플라스미드는 동일한 골격에서 구성되어야 합니다. 삽입물이 대략 동일한 길이인 경우, 비율은 여기에 기재된 바와 같이 첨가된 플라스미드의 질량에 기초할 수 있다. 그러나 몰을 기준으로 비율을 지정하면 특히 반응을 스케일링할 때 더 재현 가능한 결과를 얻을 수 있습니다. 스크린 스케일 반응(< 0.5mL)에서 잘 작동하는 비율은 더 큰 반응에는 적용되지 않을 수 있으며 추가 최적화가 필요할 수 있습니다. 비막 단백질은 여전히 cell-free 키트를 사용하여 발현할 수 있지만 가용성 제품을 생성하기 위해 지질 나노입자(동시 발현)가 필요하지 않을 수 있습니다. 추가로, 이 프로토콜은 CpG 및 FSL-1을 사용한 보조제를 설명하지만, 이 시스템은 다른 친유성 보조제와 함께 제형화하거나 원하는 대로 가용성 보조제와 혼합할 수 있습니다.
cell-free 발현 반응을 설정할 때 오염은 수율에 영향을 미칠 수 있으므로 피하는 것이 중요합니다. 플라스미드 자체를 포함하여 반응에 대한 모든 첨가제는 매우 순수해야 합니다. 또한 발현된 단백질은 내독소 오염이 없는 물질 및 용액과만 접촉해야 합니다. 후보 제형의 내독소 오염은 면역학적 분석의 일관되지 않고 가짜 결과를 초래할 수 있으며 충분한 양으로 유해할 수 있습니다. 여기에 설명되지는 않았지만 SDS-PAGE와 같은 후속 분석 단계에서 많은 오염 물질이 관찰되는 경우 니켈 친화성 크로마토그래피에 따른 추가 정제가 필요할 수 있습니다. 이것은 SEC를 사용하여 달성 할 수 있지만, 조건에 따라 제형별로 제형에 대한 최적화가 필요할 수 있습니다.
The authors have nothing to disclose.
이 작업은 국립 알레르기 및 전염병 연구소(National Institute of Allergy and Infectious Diseases)의 공중 보건 서비스 보조금 R21 AI20925 및 U19 AI144184의 지원을 받았습니다. 이 작업은 DE-AC52-07NA27344 [LLNL-JRNL-822525, LLNL-VIDEO-832788] 계약에 따라 Lawrence Livermore National Laboratory에 의해 미국 에너지부의 후원하에 수행되었습니다.
1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DMPC) as powder | Avanti Polar Lipids | 850345 | |
1.5 mL endotoxin-free centrifuge tubes | Eppendorf | 2600028 | |
1 M Trizma hydrochloride solution | Millipore Sigma | T2194 | |
Acetic acid, glacial, ACS reagent, ≥99.7% | Millipore Sigma | 695092 | |
Bio-Dot apparatus | Bio-Rad | 1706545 | |
Buffer Dam for XCell SureLock | Life Technologies | EI0012 | |
C24 Incubator shaker | New Brunswick Scientific | ||
Cell-Free Expression System: RTS 500 ProteoMaster E. coli HY Kit | BiotechRabbit | BR1400201 | |
cOmplete His-Tag Purification Resin | Roche Molecular Diagnostics | 5893682001 | |
cOmplete, EDTA-free Protease Inhibitor Cocktail | Roche Molecular Diagnostics | 4693132001 | |
CpG-ODN1826 | Biosearch Technologies | T9449 | |
D-(+)-Trehalose dihydrate | Millipore Sigma | 71509 | |
Dialysis tubes D-Tube Dialyzer Maxi | Millipore Sigma | 71508-3 | |
Disposable, polypropylene fritted columns 10 mL capacity | Bio-Rad | 7311550EDU | |
Dulbecco’s Phosphate-buffered Saline (PBS) | Millipore Sigma | D8537 | |
Electrophoresis Power Supply | |||
Endosafe PTS cartridge | Thermo Fisher Scientific | NC9594798 | |
Endosafe-PTS Testing System | Charles River | ||
Gel wash solution: 10% methanol, 7% acetic acid | |||
HCl and NaOH solutions for pH adjustment | |||
HPLC with UV-vis diode array detector | Shimadzu | ||
HyClone HyPure culture-grade water | VWR | 82007-328 | |
iBlot 2 Dry Blotting System | Life Technologies | ||
iBlot 2 Transfer Stacks, PVDF | Life Technologies | IB24001 | |
Image Studio V2.0 software | Li-COR Biiosciences | ||
Imidazole | Millipore Sigma | I5513 | |
Immun-Blot PVDF Membrane | Bio-Rad | 1620177 | |
LI-COR Odyssey Fc imager | Li-COR Biiosciences | ||
Lyophilizer | Labconco | ||
Methanol (≥99.9%) | Millipore Sigma | 34860 | |
Microcentrifuge | |||
Microwave oven | |||
NanoDrop One/OneC Microvolume UV-Vis Spectrophotometer | Thermo Fisher Scientific | ND-ONE-W | |
NuPAGE 4 to 12%, Bis-Tris, 1.0 mm | Life Technologies | NP0321 | |
NuPAGE LDS Sample Buffer (4x) | Life Technologies | NP0007 | |
NuPAGE MES SDS Running Buffer (20x) | Life Technologies | NP000202 | |
NuPAGE Sample Reducing Agent (10x) | Life Technologies | NP0009 | |
Odyssey Blocking Buffer in TBS containing 0.2% Tween 20 | Li-COR Biosciences | 927-50000 | |
Orbital Shaker | |||
PBS-T (1x PBS, 0.2% Tween 20, pH 7.4) | |||
PEG5K-CA8 Telodendrimer (custom synthesis product) | |||
pIVEX2.4d vector | Roche Molecular Diagnostics | ||
Plasmid Maxi Kit | Qiagen | 12162 | |
Primary antibody: MAb40 (monoclonal antibody to the variable domain 1 (VD1) of C. muridarum MOMP, de la Maza laboratory)4 | |||
Primary antibody: MAbHIS, Penta-His antibody | Qiagen | 34660 | |
Probe sonicator | |||
Qubit 3.0 Fluorometer | Life Technologies | Q33216 | |
Qubit Protein Assay Kit | Life Technologies | Q33212 | |
Rainin Pipette tips: LTS 1000 µL | Rainin | 17002428 | |
Rainin Pipette tips: LTS 20 µL | Rainin | 17002429 | |
Rainin Pipette tips: LTS 200 µL | Rainin | 17002426 | |
Rainin Pipettes | Rainin | ||
Secondary antibody: IRDye 800CW goat (polyclonal) anti-mouse IgG (heavy and light) | Li-COR Biosciences | 926-32210 | |
SeeBlue Plus2 Pre-stained Protein Standard | Life Technologies | LC5925 | |
Sodium chloride NaCl | Millipore Sigma | S7653 | |
Sodium phosphate monobasic NaH2PO4 | Millipore Sigma | S0751 | |
Superdex 200, 5/150 GL column | Cytiva | GE28-9909-45 | |
Synthetic diacylated lipoprotein-TLR2/6 FSL-1 | Invivogen | tlrl-fsl | |
SYPRO Ruby Protein Gel Stain | Life Technologies | S12001 | |
TWEEN 20 | Millipore Sigma | P1379 | |
UV light source | |||
Vacufuge Bench Top Centrifuge | Eppendorf | ||
Vortexer | |||
VWR 15 mL conicals (89039-666) | VWR | ||
VWR 50 mL conicals (89039-656) | VWR | ||
XCell SureLock Mini-Cell (Life Technologies ) | Life Technologies | EI0001 |