يوفر المقايسة المغذية microplate طريقة اقتصادية عالية الإنتاجية لقياس استهلاك الأغذية السائلة في Drosophila. يربط جهاز مطبوع ثلاثي الأبعاد لوحة صغيرة من 96 بئرا يتم فيها إيواء الذباب بصحونة صغيرة من 1536 بئرا يستهلك منها الذباب محلول تغذية بصبغة متتبعة. يتم قياس انخفاض حجم الحل الطيفيمقطيا.
يستخدم قياس مداواة الغذاء في دروسوفيلا لدراسة الأسس الوراثية والفسيولوجية للسمات المرتبطة بالاستهلاك، وعواملها البيئية، والآثار السمية والصيدلانية للعديد من المواد. وهناك عدد قليل من الأساليب التي تطبق حاليا قابلة لقياس الإنتاجية العالية. تم تطوير المقايسة المغذية Microplate (MFA) لقياس استهلاك الأغذية السائلة للذباب الفردي باستخدام الامتصاص. في هذا المقايسة، يستهلك الذباب وسط الطعام السائل من آبار مختارة من لوحة صغيرة 1536 بئرا. من خلال دمج صبغة التتبع المخففة في وسط الطعام السائل وتحميل حجم معروف في كل بئر ، تعكس قياسات الامتصاص للبارا المكتسبة قبل وبعد الاستهلاك التغير الناتج في الحجم (أي الحجم المستهلك). لتمكين تحليل الإنتاجية العالية باستخدام هذه الطريقة، تم تصميم مقسم مطبوع ثلاثي الأبعاد يسمح بفرز الذباب بشكل فردي إلى لوحات صغيرة ذات 96 بئرا. هذا الجهاز يوجه بدقة 96- و 1536-جيدا لوحات صغيرة لإعطاء كل ذبابة الوصول إلى ما يصل إلى 4 آبار للاستهلاك، وبالتالي تمكين القياس الكمي تفضيل الغذاء بالإضافة إلى الاستهلاك المنتظم. وعلاوة على ذلك، يحتوي الجهاز على شرائط حاجزة تبدل بين المراكز المفتوحة والمغلقة للسماح بالاحتواء المراقب وإطلاق عمود من العينات في كل مرة. تمكن هذه الطريقة قياسات الإنتاجية العالية لاستهلاك المحاليل المائية من قبل العديد من الذباب في وقت واحد. كما أن لديها القدرة على التكيف مع الحشرات الأخرى وفحص استهلاك المواد الغذائية أو السموم أو المستحضرات الصيدلانية.
Drosophila melanogaster شهدت استخدام واسعة ككائن حي نموذج الوراثية لدراسة الأسس البيولوجية لتناول الطعام والصفات المرتبطة الاستهلاك1. وتشير التقديرات إلى أن 65٪ من الجينات المسببة للأمراض البشرية لديها تجانس وظيفي في الذباب، مع نسبة كبيرة من تلك التي يتم التعبير عنها في الأنسجة المكافئة وظيفيا بين الذباب والبشر2. وعلاوة على ذلك، فإن حجم D. melanogaster، والوقت القصير بين الأجيال، والصيانة البسيطة، وقابلية الالتقاط الجيني تجعل منه نموذجا جذابا للدراسات حول استهلاك المواد الغذائية3و4 والآثار السمية والصيدلانية لمجموعة متنوعة من المواد، بما في ذلك المبيدات الحشرية5والملوثات6والمستحضرات الصيدلانية7وأدوية تعاطي8و9و10.
وفي كثير من الحالات، تتطلب دراسة هذه الصفات تحديدا دقيقا للاستهلاك. طرق لقياس الاستهلاك متنوعة وتشمل CApillary FEeder (CAFE) المقايسة11، وFEeding MAnual (MAFE) المقايسة12، Proboscis تمديد الاستجابة (PER) المقايسة13، تتبع استخراجصبغة 14،15، oligonucleotide تعقب استخراج16، واستخراج النظائر الراديوية5،17. وقد ركزت الجهود الأخيرة على تعزيز الإنتاجية من هذه المقايسات، كما هو الحال في المقايسة اكسبرسو18 أو لوحة القائم على تغذية الحيوان كله FLat (WAFFL) نظام19. وعلى الرغم من فائدتها، يمكن أن تكون هذه المقايسات معقدة أو مكلفة أو كثيفة العمالة، مما يعوق استخدامها في الدراسات عالية الإنتاجية.
الشكل 1: مكونات المقايسة المغذية Microplate. (A) تقديم 3D من المقايسة المغذية microplate تجميعها. يتم توجيه اللوح الصغير الذي يحتوي على 1536 بئرا من قبل الزوجين المطبوع ثلاثي الأبعاد بحيث يمكن لكل بئر من اللوحة الدقيقة السفلية ذات ال 96 بئرا الوصول إلى أربعة آبار من اللوحة الدقيقة العلوية ذات 1536 بئرا. ويمكن التحكم في الوصول إلى الآبار عن طريق ضبط وضع شرائط الحاجز المشقوقة من خلال الزوجين. (ب) تمثيل رسومي لكل بئر من المقايسة المغذية microplate. يتم الاحتفاظ حلول الاستهلاك في كل بئر باستخدام فيلم الختم التي تم ثقبها للسماح بالوصول عن طريق الذبابة. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 2:نظرة عامة على الإجراءات في المقايسة المغذية Microplate. يظهر الشكل رسم تخطيطي للتدفق يتوافق مع الخطوات 4.1-5.8 من البروتوكول. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
للتغلب على هذه العقبات، المقايسة المغذية Microplate (وزارة الخارجية؛ الشكل 1) تم تطويره. في هذا المقايسة ، يتم إيواء الذباب بشكل فردي في لوحات صغيرة من 96 بئرا. ويقترن كل لوحة صغيرة إلى لوحة صغيرة 1536 جيدا باستخدام مخصص, 3D المطبوعة الجهاز. يوجه الجهاز بدقة الصفيحتين بحيث تطير كل واحدة منها في بئرها من الصفيحة ذات ال 96 بئرا ويمكن الوصول إلى 4 آبار من اللوحة الدقيقة ذات 1536 بئرا. باستخدام لوحة بلا قعر 1536 بئرا وختم الأفلام، يتم الاستغناء عن الحلول في آبار مختارة ومثقبة مع الإبر قطرها 0.25 ملم دقيقة لتوفير الوصول إلى الذباب. ومن الأهمية بمكان أن السماح بالاستهلاك مباشرة من لوحة صغيرة يسمح بإجراء قياسات فورية قائمة على الامتصاص باستخدام قارئ لوحة صغيرة. يتم دمج صبغة التتبع المخفف في وسط الاستهلاك ، ويتم استخدام التغيير في الامتصاص بعد التعرض لتحديد الحجم المستهلك(الشكل 2 والشكل 3). وبما أن السائل في كل بئر يقترب من عمود من السوائل، فإن الاختلافات الحجمية سوف تظهر كاختلافات في ارتفاع العمود. (الشكل 3A) وفقا لقانون بير لامبرت20:
حيث A هو الامتصاص، ε هو معامل امتصاص الضرس للتوهين التحليلي، l هو طول المسار البصري، و c هو تركيز التحليل المخفف. وهكذا، مع معامل امتصاص الضرس المستمر والتركيز، والتغيرات في امتصاص ويرجع ذلك فقط إلى التغيرات في مسار الضوء البصري، أي مستوى السوائل داخل بئر معين. ومن خلال قياس الامتصاص قبل التعرض وبعده، يعكس التغير النسبي في الامتصاص التغير النسبي في الحجم(الشكل 3B).
الشكل 3: القياس الكمي القائم على الامتصاص لحجم البئر. (A)ضوء الحادث من كثافة الإدخال المعروفة (I0) يجتاز كل بئر. تخفيف الضوء في أحجام التعبئة المختلفة تسفر عن كثافة الانتاج المختلفة (I)، مما يدل على وجود علاقة خطية بين الحجم وامتصاص. (ب)القياس التجريبي للامتصاص مقابل الحجم. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
استنادا إلى التغير في الحجم، يمكن حساب كمية أي مركب تم تناوله من تركيزه المعروف في محلول التغذية. الأجزاء اللازمة للمقايسة منخفضة التكلفة ولها درجة عالية من إعادة الاستخدام ، مما يقلل بشكل كبير من التكلفة المتكررة للمقايسة. وهكذا، يوفر هذا الإجراء طريقة إنتاجية عالية التكلفة لقياس الاستهلاك بدقة.
تصف الدراسة بروتوكولا جديدا لقياس الاستهلاك في Drosophila:المقايسة المغذية Microplate (MFA). في هذا المقايسة، يستهلك الذباب من الآبار المغلقة من لوحة صغيرة 1536 جيدا من خلال ثقوب الحجم الخاضعة للرقابة (الشكل 1، الشكل 2؛ فيديو التكميلية S.1). وبما أن الأغذية السائلة مصبوغة وتقدم عن طريق الصفائح الدقيقة، يمكن الحصول على قياسات للامتصاص البصري للغذاء باستخدام مطياف مجهري(الشكل 3). وبهذه الطريقة، يتحدد الاستهلاك بمقارنة الامتصاص قبل الاستهلاك وبعده، ثم بتطبيق هذه النسبة على الحجم المعروف الذي تم صرفه قبل الاستهلاك. وقد تم التحقق من ذلك تجريبيا من خلال قياس امتصاص كميات مختلفة من المتوسط المصبوغ(الشكل 3B).
ولتطوير هذا المقايسة، كانت هناك حاجة إلى جهاز يمكن أن يستفيد من القياس الكمي للاستهلاك القائم على الامتصاص. اختبار الذباب في شكل لوحة صغيرة جذابة لأنه يكمل لوحة صغيرة تستخدم لصرف الطعام ويسمح بالمرونة في الاختيار من صيغ لوحة متعددة (على سبيل المثال، 6-، 12-، 48-، أو 96-جيدا الأشكال) عن طريق ضبط هندسة الزوجين. تم اختيار تنسيق 96 لوحة صغيرة بشكل جيد للسماح بثقافة الطيران الفردية.
الجهاز المطبوع ثلاثي الأبعاد(الشكل 1)يوجه بدقة لوحة التغذية 1536 جيدا مع لوحة الثقافة 96 جيدا، مما يعطي كل ذبابة الوصول إلى ما يصل إلى 4 آبار من لوحة التغذية للاستهلاك. وعلاوة على ذلك، لتوفير الوقت الكافي لتوزيع الذباب في لوحة الإسكان والسيطرة على بدء الفحص، ويشمل الجهاز شرائط حاجز تحويل التي تحتوي على الذباب في الآبار الخاصة بهم ومنع الخروقات. يتم توفير الملفات اللازمة لشراء أو تعديل هذه الأجزاء(الملفات التكميلية S.2–S.3)،فضلا عن تعليمات التصنيع اللازمة للقطع ذات الصلة (ملف التكميلية S.4).
يوفر وزارة الخارجية طريقة إنتاجية عالية بسيطة تكمل أساليب أكثر تفصيلا لمراقبة سلوك تغذية Drosophila18و21و22. توفر وزارة الخارجية مزايا متعددة على الطرق الأخرى المستخدمة لقياس كمية تناول الطعام. يتم زيادة الإنتاجية عن طريق تحديد الاستهلاك باستخدام قارئ لوحة. هذا يلغي القياسات اليدوية وينافي إدخال البيانات اليدوية. البيانات قابلة أيضا لاستخراج البرامج ومعالجتها. وبالإضافة إلى ذلك، فإن زيادة الإنتاجية تزيد من العدد الممكن من التكاثر البيولوجي، ولا سيما بالمقارنة مع تصاميم التغذية المجتمعية، مما يزيد إلى حد كبير من القدرة على اكتشاف الاختلافات الصغيرة في الاستهلاك. باستخدام وزارة الخارجية، يمكن لمجرب واحد قياس استهلاك أو تفضيل أكثر من 500 ذبابة لكل تشغيل بين عشية وضحاها من المقايسة. من خلال تداخل عمليات الفحص ، يمكن اختبار أكثر من 2000 ذبابة في فترة 5 أيام. وأخيرا، هناك وفورات في التكاليف على المدى الطويل بسبب إعادة استخدام لوحات صغيرة ومجزرة(ملف التكميلية S.5). وباستخدام وزارة الخارجية، يمكن أن تصل التكلفة المقدرة لكل فحص إلى 14.80 دولارا، مع تكلفة مقدمة للمعدات قدرها 127.60 دولارا. باستخدام المقايسة الكلاسيكية CApillary FEeder (CAFE) ، والتي تتطلب دقة مكلفة microcapillaries ، والتكلفة المقدرة لكل مقايسة لعدد مماثل من التكرارات هو 46.08 دولار. وهكذا، فبينما يوجد استثمار أولي في اقتناء المعدات اللازمة، يمكن أن يؤدي تخفيض التكاليف المتكررة إلى تحقيق وفورات كبيرة، لا سيما في الحالات التي تجرى فيها اختبارات متكررة.
وكما هو الحال مع جميع المقايسات، فإن وزارة الخارجية لديها بعض القيود. أساسا، فإنه يتطلب الوصول إلى مطياف microplate قادرة على قراءة 1536-جيدا لوحات صغيرة. بالإضافة إلى ذلك، فإن الاعتماد على قياسات الامتصاص للقياس الكمي يجعل الطريقة عرضة للتداخل البصري. يظهر هذا كقيم استهلاك سالبة لمجموعة فرعية صغيرة من العينات التي تم اختبارها. يجب أن تكون المواد الغذائية أو الأدوية أو الأدوية أو السموم ذات الأهمية قابلة للذوبان في الماء أيضا لتكون متوافقة مع المقايسة.
على الرغم من القيود المفروضة عليه، تقدم هذه الطريقة طريقة إنتاجية عالية لقياس سلوكيات الاستهلاك في Drosophila. وعلاوة على ذلك ، يمكن تعديل جهاز الاقتران بسهولة لقبول العديد من أشكال اللوحات ، مما يسمح له لاستيعاب مجموعة متنوعة من أنواع الحشرات.
The authors have nothing to disclose.
وقد دعم هذا العمل بمنحة من المعهد الوطني لتعاطي المخدرات (U01 DA041613) إلى TFCM وRRHA.
0.25 mm Diameter Needers | Rave Scientific | RS-MN-52-001012 | |
0.45 µm Syringe Filters | Olympus Plastics | 25-245 | |
10 mL Disposable Syringe | EXELINT | 26200 | |
Agarose | Fisher Scientific | BP1600 | |
Barrier Strips (Laser Cut) | Ponoko | – | Material: clear PETG, 0.5mm thickness; Supplementary File: |
Centrifuge 5810 R | Eppendorf | 22625501 | |
Centrifuge Rotor A-4-62 with micro-titer plate buckets | Eppendorf | 22638041 | |
FD&C Blue #1 | Spectrum Chemical Mfg Corp | FD110 | |
Film Sealing Paddle | Fisher Scientific | 50-563-280 | |
Flystuff Flypad | Genesee Scientific | #59-114 and #59-119 | CO2 Anesthesia: The Flypads come in two sizes, either of which is appropriate |
Microplate Coupler (3D Printed) | Shapeways | – | Material: Multi Jet Fusion nylon (MJF PA12); Supplementary File: |
Microplate Lids | Greiner Bio-One | 656170 | |
Molecular Devices SpectraMax iD5 | Molecular Devices | – | Any microplate reader with 1536-well resolution will do. |
Needle Probe Holder | Rave Scientific | RS-MN-52-001000 | |
Polyester Sealing Film | Excel Scientific, Inc. | 100-SEAL-PLT | |
Polystyrene 96-well microplates | Greiner Bio-One | 655101 | |
Polystyrene, Bottomless, 15396-well microplates | Greiner Bio-One | 783000 | Made to Order; allow for adequate lead time when purchasing. |
Rubber Bands | |||
Sucrose | Sigma | S7903 | |
Weather Stripping | 1/2" x 1/8" High Density Self Adhesive Neoprene Rubber | ||
Yeast Extract | Fisher Scientific | BP1422 |