Dans ce protocole, une méthode de culture in vitro et d’analyse fonctionnelle des cellules souches musculaires est décrite, qui préserve la plupart de leurs interactions avec leur niche endogène.
Le tissu musculaire squelettique adulte abrite une population de cellules souches indispensable à sa capacité de régénération. En cas de lésions musculaires, les cellules souches musculaires quittent leur état de repos et activent le programme myogénique conduisant finalement à la réparation des tissus endommagés en même temps que la reconstitution du pool de cellules souches musculaires. Divers facteurs influencent l’activité des cellules souches musculaires, parmi lesquels les stimuli intrinsèques mais aussi les signaux de l’environnement direct des cellules souches musculaires, la niche des cellules souches. L’isolement et la culture de myofibres simples avec leurs cellules souches musculaires associées préservent la majeure partie de l’interaction de la cellule souche avec sa niche et constituent donc la possibilité la plus proche d’étudier la fonctionnalité des cellules souches musculaires ex vivo. Ici, un protocole pour l’isolement, la culture, la transfection de siRNA et l’immunocoloration des cellules souches musculaires sur leurs myofibres respectifs des muscles EDL(extensor digitorum longus)de souris est fourni. Les conditions expérimentales décrites ici permettent l’étude et la manipulation des cellules souches musculaires ex vivo, y compris l’étude de l’activité myogénique sans le besoin inhérent d’expériences in vivo sur les animaux.
Le muscle squelettique chez l’adulte est un tissu postmitotique principalement composé de myofibres multinucléés, qui sont les cellules effectrices des mouvements volontaires. Il a une capacité remarquable à se régénérer, un processus qui ressemble à la myogenèse embryonnaire et subit des déficiences de l’âge et de la maladie1. Cette capacité de régénération frappante du muscle squelettique dépend des cellules souches musculaires (MuSC), également appelées cellules satellites en raison de leur emplacement entre le sarcolemme et la lame basale des myofibres2,3. Dans des conditions de repos, les MuSC sont quiescents et caractérisés par l’expression du facteur de transcription Pax7 et des marqueurs de quiescence tels que Sprouty14,5,6,7,8. Lors de l’activation, par exemple après une blessure, les MuSC quittent l’état de repos et régulent à la hausse le facteur régulateur myogénique MyoD9. Les MuSC double positifs Pax7/MyoD prolifèrent et se différencient, générant ainsi des cellules précurseurs myogéniques, également souvent appelées myoblastes. Ces myoblastes se différencient ensuite en myocytes allongés, un processus coïncidant avec des changements moléculaires et morphologiques, par exemple la perte de Pax7 et la régulation à la hausse de l’expression de la myogénine10. Les myocytes finissent ensuite par fusionner les uns avec les autres ou avec les myofibres existants, réparant ainsi le tissu endommagé. Il est important de noter qu’une petite fraction de cellules souches musculaires inverse la régulation à la hausse de MyoD et est capable de s’auto-renouveler11. L’état de la différenciation muSC et de la progression myogénique peut être facilement observé par l’étude de marqueurs myogéniques tels que Pax7, MyoD et Myogénine10.
La culture de myofibers simples avec leurs MuSC adjacents est une excellente méthode pour étudier la fonctionnalité MuSC dans un contexte ex vivo puisque les MuSC restent dans leur niche endogène12,13. Le comportement des MuSC est régulé par des signaux intrinsèques ainsi que par des signaux extrinsèques fournis par la niche, un emplacement anatomique spécialisé comprenant des composants de la matrice extracellulaire (ECM) entourant les MuSC et le myofiber lui-même. Par exemple, l’un des régulateurs extrinsèques de la quiescence MuSC est la signalisation Notch. Ici, les signaux de signalisation sont reçus par les MuSC à la fois du myofiber et de l’ECM14,15,16. De plus, la niche MuSC est importante pour contrôler l’axe de division des MuSC régulant ainsi le devenir cellulaire des cellules filles MuSC17,18. Raisonnablement, des paramètres tels que les divisions asymétriques de MuSC, la progression myogénique et l’auto-renouvellement peuvent être évalués de manière unique dans cette configuration expérimentale. Par exemple, un amas multicellulaire peut se former à partir d’un MuSC après une période de culture de 72 heures, ce qui peut être étudié pour l’apparition et le pourcentage de populations myogéniques distinctes telles que les MuSC auto-renouvelés, proliférants et différenciés8,19,20,21. L’état de différenciation des MuSC peut être déterminé par l’étude de l’expression/co-expression de Pax7, MyoD et Myogenin. Après 72 h de culture, les cellules d’un cluster peuvent être discriminées par les paramètres suivants : les cellules Pax7 seules sont des MuSC auto-renouvelées, tandis que les cellules Pax7/MyoD double positives prolifèrent/activent les MuSC et les cellules myogéniques différenciées sont Myogénine positive22. En outre, les nombres de MuSC ou la réintégration dans le cycle cellulaire / activation peuvent être étudiés en plus de la progression myogénique, par exemple, par le biais d’analyses basées sur l’immunofluorescence basées sur les paramètres décrits ci-dessus.
Ici, les caractéristiques uniques du protocole d’isolement et de culture du myofiber, par exemple la préservation de l’interaction du MuSC avec sa niche, sont décrites. Les muscles EDLentiers (extenseur digitorum longus)de souris sont soigneusement disséqués, digérés par la collagénase et triés physiquement pour obtenir des myofibres uniques avec leurs MuSC associés pour une culture ultérieure. De plus, le protocole délimite les étapes de transfecter les MuSC avec de l’ARNsi pour des analyses fonctionnelles de gènes candidats et des analyses consécutives basées sur l’immunofluorescence sans avoir besoin d’animaux transgéniques.
Ici, une méthode pour étudier fonctionnellement le rôle d’un gène spécifique dans les MuSC en utilisant une approche in vitro est présentée. Il est important de noter que dans le système décrit ici, les MuSC sont cultivés dans des conditions qui ressemblent autant que possible à la situation in vivo, préservant autant que possible la plupart des interactions des MuSC avec leur niche. Ceci est accompli en cultivant des myofibers isolés avec leurs MuSC adjacents dans des conditions flottantes et une transfection consécutive de siRNA. Les procédures d’isolement des myofibres, de transfection de siRNA et d’étude des populations de MuSC pendant 72 h de culture par des analyses d’immunofluorescence sont décrites. En outre, il a été démontré qu’environ 74% de tous les MuSC ont été transfectés avec un siRNA témoin marqué par fluorescence après 30 h de culture.
Une attention particulière doit être accordée à la dissection minutieuse du muscle EDL, car un étirement, un pincement ou une compression étendus entraîneront une contraction et la mort consécutive des myofibres. En outre, il est important d’étudier les grappes de MuSC d’au moins 20 myofibres différents par réplique et par condition. Ceci est nécessaire car les nombres et les propriétés muSC varient en raison de l’existence de sous-populations MuSC. Lors de l’étude de l’effet d’un siRNA spécifique sur les MuSC à l’aide de la méthode de culture de myofibre flottant, une comparaison de la condition avec le siRNA cible au contrôle non ciblé doit être effectuée au sein de la même souris et du même muscle. Ceci est recommandé pour éviter les différences spécifiques à la souris qui pourraient couvrir ou amplifier les effets du siRNA. L’efficacité de l’élimination peut être déterminée par des analyses d’immunofluorescence avec des anticorps dirigés contre le gène cible à l’aide de myofibers simples avec leurs MuSC adjacents. Si ce n’est pas une option, on peut tester l’efficacité de l’élimination du siRNA dans les myoblastes primaires, suivie d’analyses quantitatives RT-PCR ou immunoblot. L’efficacité du siRNA doit être déterminée avant d’analyser l’effet du siRNA sur les MuSC sur les myofibres simples. L’utilisation d’un pool intelligent composé de 4 siRNA différents contre un seul augmente l’efficacité de l’élimination mais augmente également le risque de ciblage non spécifique. Un siRNA non ciblé doit être utilisé comme témoin. Pour surveiller directement l’efficacité de la transfection, on peut utiliser un siRNA non ciblé marqué par fluorescence comme effectué ici. Le point de temps pour la transfection avec le siRNA est d’environ 4 heures après l’isolement, un point de temps où la lame basale entourant les MuSC est déjà perméable pour le siRNA. Si l’effet d’un siRNA spécifique sur les MuSC après 72 ou 96 h doit être étudié, il est recommandé d’effectuer une deuxième transfection de siRNA après 24 h ou 48 h pour maintenir une efficacité de knockdown élevée.
Le test de culture de myofiber présente divers avantages par rapport à l’étude des MuSC avec des méthodes de culture cellulaire conventionnelles. Les MuSC restent attachés aux myofibers pendant tout le processus d’isolement, préservant ainsi l’interaction cruciale du MuSC avec sa niche19,23,24,25. L’interaction préservée des MuSC avec le myofiber est une condition préalable à l’étude des effets dépendants de niche sur la fonctionnalité MuSC, qui ne peuvent pas être récapitulés dans les cultures de myoblastes 2D conventionnelles. Par exemple, pendant le vieillissement, les MuSC présentent une capacité myogénique altérée entraînant une efficacité réduite pour régénérer le tissu musculaire après des dommages20,26. Cette dépréciation est au moins partiellement attribuable aux changements dans le créneau MuSC, en particulier aux changements dans la composition del’ECM27,28. Le protocole de culture myofiber permet l’étude et l’interférence avec ces changements de niche aberrants.
Contrairement à la méthode décrite ici, la purification des MuSC par immunomarquage et tri de techniques telles que FACS (fluorescence activated cell sorting) ou MACS (magnetic cell sorting) implique le retrait des MuSC de leur niche. Fait intéressant, les cultures 2D de MuSC isolés de muscles âgés perdent leurs signaux extrinsèques et se comportent de manière similaire aux MuSC isolés de jeunes muscles, ne récapitulant ainsi pas la situation in vivo de manière appropriée29. De plus, la dissociation complète du tissu musculaire et le marquage des MuSC avec des marqueurs de surface entraînent des changements transcriptomiques et l’activation des cellules30,31,32. Un autre avantage du système de culture myofiber est la possibilité d’interférer avec la fonctionnalité MuSC à différents niveaux. La manipulation des MuSC sur les myofibers cultivés peut être réalisée efficacement par l’élimination des gènes médiée par le siRNA, comme décrit ici en détail. De même, l’application de composés chimiques ou l’administration de protéines recombinantes est très efficace pour interférer avec les voies des cellules souches20,28. De plus, les vecteurs d’expression rétro- ou lentiviraux permettent l’introduction de gènes exogènes, c’est-à-dire de mutants actifs constitutifs33. En outre, l’influence des facteurs extrinsèques sur la fonctionnalité MuSC peut être explorée dans le système décrit ici, par exemple, les conditions de culture peuvent être complétées par un surnageant provenant de différentes sources physiologiques ou pathologiques pour modéliser différents états comme la cachexie cancéreuse34,35.
Une limitation de la méthode décrite ici est le fait que le système de culture de myofibre unique ne peut pas récapituler complètement l’impact de tous les facteurs systémiques ou de l’influence d’autres types de cellules sur les MuSC. En outre, le temps pendant lequel les myoibères peuvent être maintenus viables en culture est limité et, par conséquent, l’étude des processus liés au MuSC se concentre sur les événements précoces tels que l’activation et l’engagement myogénique. En outre, l’étude de l’interaction MuSC avec d’autres cellules de niche telles que les cellules immunitaires ou les cellules progénitrices fibro-adipogènes n’est pas possible. Pour étudier les effets systémiques sur la fonctionnalité MuSC, on peut soit effectuer des expériences de lésions musculaires suivies d’une analyse de la régénération musculaire in vivo, soit effectuer des expériences de transplantation36,37.
Pris ensemble, le protocole d’isolement et de culture des myofibres offre une excellente opportunité pour des études génétiques ou mécanistes sur des MuSC adultes sans l’exigence de modèles murins transgéniques et peut potentiellement réduire l’expérimentation animale.
The authors have nothing to disclose.
Nous remercions Christine Poser et Christina Picker pour leur excellente assistance technique et leur lecture critique du manuscrit. Ce travail a été soutenu par une subvention de la Deutsche Forschungsgemeinschaft à JvM (MA-3975/2-1), à la fondation Carl Zeiss et à la Deutsche Krebshilfe (DKH-JvM-861005).
Alexa Fluor 488 goat anti-rabbit IgG 2b | ThermoScientific | A-21141 | use 1:1000 for IF |
Alexa Fluor 546 goat anti-mouse IgG1 | ThermoScientific | A-21123 | use 1:1000 for IF |
chicken embryo extract | Seralab | CE-650-J | chicken embryo extract containing growth factors etc. |
collagenase type 1 | Sigma | C0130 | |
DMEM (Dulbecco’s modified Eagle’s medium with 4.5 g/l glucose and sodium pyruvate) | GibCo | 41966029 | cell culture medium |
fetal bovine serum | Gibco | 10270-106 | fetal bovine serum |
horse serum | Gibco | 26050-088 | |
Lipofectamine RNAiMax | ThermoScientific | 13778150 | transfection reagent |
MyoD antibody clone G-1 | Santa Cruz | sc-377460 | dilute 1:200 for IF |
Pax7 antibody | DSHB | PAX7 | use undiluted |
siGLO Red Transfection Indicator | horizon discovery | D-001630-02-05 | non targeting siRNA |