אנו מתארים זרימת עבודה שיטתית כדי לחקור איתות TGF-β ו- EMT הנגרמת על ידי β TGF על ידי לימוד ביטוי החלבון והגנים המעורבים במסלול איתות זה. השיטות כוללות סופג מערבי, בדיקת כתב לוציפראז, qPCR, וכתמי כשל חיסוני.
שינוי פקטורי גדילה-β (TGF-β) הוא גורם רב תכליתי מופרש הממלא תפקיד מפתח בתקשורת בין-תאית. הפרעות של איתות TGF-β יכול להוביל לסרטן השד. TGF-β מעורר את השפעותיו על התפשטות ובידול באמצעות משטח תא ספציפי TGF-β סוג I קולטנים מסוג II (כלומר, TβRI ו TβRII) המכילים תחום פנימי סרין / threonine קינאז. על היווצרות מורכבת הטרומרית הנגרמת על ידי TGF-β, מופעל TβRI מעורר איתות תאי על ידי phosphorylating SMAD2 ו SMAD3. אלה SMADs מופעל טופס קומפלקסים הטרומריים עם SMAD4 כדי לווסת גנים היעד ספציפי, כולל מעכב הפעלת פלסמינוגן 1 (PAI-1, מקודד על ידי הגן SERPINE1). האינדוקציה של מעבר אפיתל-mesenchymal (EMT) מאפשר תאים סרטניים אפיתל באתר הראשי או במהלך קולוניזציה באתרים מרוחקים כדי להשיג פנוטיפ פולשני ולהניע התקדמות הגידול. TGF-β פועל כגרום חזק של פלישה לסרטן השד על ידי נהיגה EMT. כאן, אנו מתארים שיטות שיטתיות לחקור TGF-β איתות ותגובות EMT באמצעות תאים MCF10A-RAS אנושיים קדם-מיניים (M2) ותאי אפיתל NMuMG העכבר כדוגמאות. אנו מתארים שיטות כדי לקבוע TGF-β-induced SMAD2 זרחון על ידי סופג המערבי, SMAD3 / SMAD4 תלוי פעילות שעתוק באמצעות פעילות כתב לוציפראז ו SERPINE1 ביטוי גנים היעד על ידי תגובת שרשרת כמותית בזמן אמת פולימראז (qRT-PCR). בנוסף, מתוארות שיטות לבחון את ה- EMT הנגרמת על ידי TGF-β על ידי מדידת שינויים במורפולוגיה, ביטוי סמן אפיתל ומזנכימלי, כתמי אקטין סיביים וכתם כשל חיסוני של E-cadherin. שני מעכבי קינאז קולטן TGF-β מולקולה קטנה סלקטיבית, GW788388 ו- SB431542, שימשו לחסימת זרחון SMAD2 המושרה β על ידי TGF, גנים ממוקדים ושינויים בביטוי סמן EMT. יתר על כן, אנו מתארים את ההשתנות של השד mesenchymal Py2T תאי גידול אפיתל מורין לתוך adipocytes. שיטות לבחון TGF-β-induced איתות EMT בסרטן השד עשוי לתרום גישות טיפוליות חדשות לסרטן השד.
ציטוקינים שינוי פקטורי גדילה-β (TGF-β) הוא אב טיפוס של קבוצה גדולה של פוליפפטידים רגולטוריים הקשורים מבנית ותפקודית כולל TGF-βs (כלומר, TGF-β1, -β2 ו -β3), חלבונים מורפוגניים עצם (BMPs) ו activins1,2. ציטוקינים אלה ממלאים תפקידים חשובים בהתפתחות העוברית ובתחזוקת הומאוסטזיס רקמות ואיברים3. misregulation של TGF-β יכול להוביל למגוון רחב של מחלות, כולל סרטן4,5. TGF-β ממלא תפקיד מורכב, כפול בהתקדמות סרטן: בתאי אפיתל נורמליים טרום מלמיניים, TGF-β מתנהג כמו מדכא גידול על ידי עיכוב התפשטות וגרימת אפופטוזיס6,7; עם זאת, בשלב המאוחר של התקדמות הגידול, כאשר תגובות ציטוסטטיות נחסמות על ידי הפעלה של אונקוגנים או אובדן של גנים מדכאי גידולים, TGF-β פועלת כמשפרת גידולים על ידי קידום מעבר אפיתל-mesenchymal (EMT) בתאי סרטן, ובכך לאפשר פלישת תאים סרטניים גרורות, הפועל על תאים microenvironment הגידול, וגירוי אנגיוגנזה והתחמקות החיסון8,9,10.
TGF-β מופרש כמו מולקולת קודמן לא פעיל המכיל את β TGF-מסוף קרבוקסיה בוגרת ופפטיד הקשורים להשהיה (LAP)11. קומפלקס קטן זה יכול להיות כבול בקובאליות על ידי חלבון סמוי TGF-β מחייב (LTBP)12. שחרורו של בוגר TGF-β יכול להיות מתווך על ידי פעולה של פרוטאזות ספציפיות כי cleave LAP או על ידי משיכה מכנית של LAP בתהליך תלוי integrin13,14. בנוסף ל- LTBP, גליקופרוטאין A חוזר דומיננטי (GARP) מתבטא מאוד על פני השטח של תאי T רגולטוריים (Tregs) וממלא תפקיד דומה לזה של LTBP בוויסות ההפעלה של TGF-β15,16. GARP נקשר ישירות β TGF-β סמויים באמצעות הצמדה דיסולפידית ושיוך לא-קוולנטי. ההפעלה של TGF-β ממתחם GARP / TGF-β דורשת אונטגרינים17. בוגרת TGF-β נקשר TGF-β קולטני סרין / threonine קינאז, כלומר, TGF-β סוג I (TβRI) ו TGF-β סוג II (TβRII) קולטנים18 ליזום איתות. הכריכה של TGF-β ל- TβRII מקדמת את גיוס TβRI והקמת מתחם הטרומרי. לאחר מכן, TβRI הוא phosphorylated על ידי קינאז TβRII על שאריות סרין ותרונין במוטיב קצר גליצין- וסרין עשיר (GS), וכתוצאה מכך הפעלתו19,20. עם ההפעלה, TβRI מופעל מגויסים phosphorylates המצעים שלה: שני SMADs ספציפי לקולטן (R-SMADs) הכוללים SMAD2 ו SMAD3 (איור 1). R-SMADs חולקים מבנה כולל דומה עם שני תחומים שנקראים Mad homology, MH1 ו- MH2, המופרדים באמצעות אזור קישור עשיר בפרולין (איור 2). מוטיב כריכת ה- DNA בתחום MH1 של SMAD3 אינו נשמר בין SMAD2 ל- SMAD3, ו- SMAD2 אינו יכול לאגד ישירות DNA עקב שתי הוספות בתחום MH1 שלו (exon 3 ו- L1). SMAD2 ו-SMAD3 יכולים להיות מופעלים על ידי הזרחון של מוטיב ה-SSXS בטרמיני C שלהם (איור 2). Phosphorylated SMAD2/3 יוצר מתחמים הטרומריים עם מתווך SMAD משותף, SMAD4, אשר טרנסלוקציה לתוך הגרעין כדי לווסת את שעתוק של גנים היעד (איור 1)7,21. מסלול איתות SMAD קנוני זה מוסדר במדויק ומייצר תגובות ספציפיות לתאים ולרקמות כגון ויסות גורל התא וגרורות תאים סרטניים ופלישה22. בנוסף לאיתות TGF-β-SMAD, מסלולי איתות שאינם SMAD יכולים להיות מופעלים ישירות גם על ידי קולטנים כדי לווסת תגובות סלולריות במורד הזרם23.
במהלך התקדמות הגידול, ההפעלה של TGF-β-induced SMAD-induced מסלולים עצמאיים SMAD נדרשים אינדוקציה של EMT. EMT הוא תהליך הפיך שבו תאים סרטניים dedifferentiate מפנוטיפ אפיתל, אשר קשורה לאובדן של מגעים תא-תא וירידה קוטביות אפית-בסיסית, כדי פנוטיפ mesenchymal עם תנועתיות משופרת ויכולת הפלישה24. EMT מאופיין בביטוי מוגבר של חלבוני סמן mesenchymal, כולל N-cadherin, vimentin, Zeb2 ו חילזון1/2, ואת הסרת הפיקוח בו זמנית של סמני אפיתל, כגון E-cadherin ו β-catenin (איור 3)25. עם זאת, המעבר מאפיתל למצב mesenchymal הוא לעתים קרובות לא שלם, ותאים לקבל מאפיינים אפיתל מעורב mesenchymal (E/M). מאמר שפורסם לאחרונה על ידי האגודה הבינלאומית EMT הציע לתאר את התהליך של תאים שעברו מצבי ביניים E / M phenotypic כמו פלסטיות אפיתל-mesenchymal (EMP)26. פלסטיות זו מתייחסת EMT חלקית, מצב E / M היברידית, מצב EMT metastable, רצף EMT ספקטרום EMT26. במהלך EMT, תאים סרטניים להשיג תכונות תא גזע סרטני (CSC) ולהיות עמידים יותר אפופטוזיס הנגרמת על ידי ניתוק27. בעוד EMT אחראי על רכישת פנוטיפ פולשני בתאים סרטניים ראשוניים ומניע התקדמות סרטן, לעומת זאת, מעבר mesenchymal-אפיתל (MET) הוכח לשחק תפקיד חשוב בצמחייה של תאים סרטניים שהופצו באתרים גרורתיים רחוקים28,29. מחקר שנערך לאחרונה הראה כי תאים סרטניים השד נגזר EMT ניתן transdifferentiated לתוך adipocytes, אשר עשוי להציע הזדמנות לעכב גרורות להתגבר על עמידות לטיפול בתאי הגידול וסרטן התדרדר30. בשל התפקיד החשוב של TGF-β איתות בהפעלה של EMT ב carcinogenesis השד, אנו מציגים פרוטוקולים מפורטים עבור סופג המערבי, בדיקת שעתוק לוציפראז, תגובת שרשרת כמותית בזמן אמת פולימראז (qRT-PCR), ו immunofluorescence לחקירה של TGF-β איתות, TGF-β-induced EMT, ואת transdifferentiation של תאי גידול אפיתל השד מורין נגזר EMT לתוך אדיפוציטים. טכניקות אלה הן הכלים האנליטיים הנפוצים ביותר בתחום הביולוגיה של התא. qRT-PCR משמש לזיהוי, אפיון וכימות רמות ביטוי mRNA באופן כמותי. בהשוואה ל- PCR כמותי (qPCR), טכניקה חלופית, ניתן להשתמש בתעתיק ההפוך (RT)-PCR כדי לקבוע ביטוי mRNA באופן חצי כמותי31,32. כתמים מערביים משמשים לבחינת רמות חלבון ספציפיות במדגם ליסנט תא נתון עם יתרונות של רגישות וספציפיות, באופן חצי כמותי. לכן, אנו מציגים זרימת עבודה שיטתית כדי לנתח שינויים מביטוי גנים לביטוי חלבון כדי לעזור לחקור איתות TGF-β שניתן להחיל גם על מסלולי איתות אחרים.
TGF-β/SMAD איתות ממלא תפקיד מרכזי בהתקדמות סרטן השד, כפי שהוא יכול לקדם את פולשניות התא סרטן השד גרורות על ידי גרימת EMT7. כאן, תיארנו זרימת עבודה הגיונית כדי לחקור איתות ביוזמת TGF-β מהפעלת SMAD הנגרמת על ידי קולטן לתגובות שעתוק וביולוגיות בתיווך SMAD. התחלנו בתיאור הניתוח של זרחון SMAD2, המשכנו עם תגובות שעתוק תלויות SMAD3 הנגרמות על ידי TGF β וביטוי סמן EMT הן ברמת הגן והן ברמת החלבון כדי לנתח את תגובת האיתות TGF-β / SMAD, ולבסוף בדקתי את ה- EMT המושרה על ידי TGF-β. השתמשנו כתב שעתוק CAGA12-luciferase המכיל תיבות CAGA נגזר מקדם PAI-1, כדי לפקח על הפעילות של TGF-β / SMAD איתות מסלול35. מבנה כתב זה דורש SMAD3 ו- SMAD4 להפעלה. מחקרים קודמים הראו כי ההפלה של SMAD4 מוחלש TGF-β-induced CAGA12-luciferase פעילות37. בנוסף לבדיקת הכתב, קביעת מצב הזרחן של SMADs אנדוגני, כולל SMAD2 ו SMAD3, היא דרך נוספת לחקור את תגובת איתות TGF-β. ואכן, חברים אחרים במשפחת TGF-β, כגון גורם צמיחה ובידול (GDF)-8/מיוסטטין ו- GDF-9, גם מתמר אותות באמצעות חלבוני SMAD2/3 על ידי עיסוק TβRI42,43,44. בנוסף לכתב CAGA12-luciferase, מספר כתבים דומים שימשו כדי לזהות את ההפעלה של איתות TGF-β. לדוגמה, כתב שעתוק (SBE) 4 -Lux עם רכיביתגובההנגזרים ממקדם JunB יכול להיגרם ביעילות על ידי TGF-β, activins ו BMPs45.
כתמים מערביים ו qPCR שימשו לניתוח TGF-β-induced EMT, שהן שיטות קלאסיות לחקור את הביטוי של סמני אפיתל (כלומר, E-cadherin) וסמנים mesenchymal (כלומר, N-cadherin, חילזון, שבלול ו Zeb2). ביצענו גם כתמי כשל חיסוני עקיף של E-cadherin וכתם פלואורסצנטי ישיר של F-actin. מבחנים אלה עוד יותר אימת את פנוטיפ mesenchymal של תאים לאחר טיפול TGF-β. המגבלה של כתמי כשל חיסוני היא שיש לתקן תאים לפני הדגירה עם נוגדנים והדמיה, וקשה לחקור שינויים בביטוי סמן EMT בתאים חיים. לאחרונה, העיצוב של קווי תא כתב EMT, כגון A549 ריאות אדנוקרצינומה-vimentin-RFP, אפשר לפקח על הטרנספורמציה של תאי אפיתל לתאים mesenchymal בזמן אמת באמצעות הביטוי של חלבון פלואורסצנטי אדום (RFP)מתויג vimentin. פלטפורמה זו יכולה להיות מנוצלת עבור הקרנת סמים ופיתוח תרופות חדשות46. צבע LifeAct, פפטיד 17-חומצת אמינו, שיכול להכתים מבני F-actin בתאים חיים, הופך לכלי רב ערך כדי לדמיין את ציטוסקלטון actin בזמן אמת מבלי להפריע לתהליכים הסלולר47. במחקר זה, השתמשנו בשני מעכבי מולקולה קטנה, SB431542 ו- GW788388, כדי לאמת את ההשפעה המעכבת שלהם על איתות TGF-β ו- EMT הנגרמת על ידי TGF-β. יש לציין כי GW788388 מעכב בעוצמה את פעילות TβRI ו- TβRII, בעוד של- SB431542 יש השפעה מעכבת רק על TβRI (ו- ALK4 ו- ALK7). מחקרים קודמים גילו כי GW788388 הוא חזק יותר vivo מאשר SB43154240. בנוסף לעיכוב של EMT, GW788388 הפחית את הביטוי של סמני פיברוזיס בכליה, ואת הממשל אוראלי של GW788388 בעכברים סוכרתיים ירד במידה ניכרת גלומרולופתיה25,48.
EMT ממלא תפקיד חיוני בקידום פלסטיות תא סרטן ותוצאות עמידות לתרופות גרורות 49. לכן, מיקוד תאים נגזרי EMT עם תרופות ציטוטוקסיות ספציפיות50 או גרימת חלוקה מחדש באמצעות מעבר mesenchymal-to-אפיתל (MET)51 הוצע כגישה להתגבר על גרורות תאים סרטניים והתנגדות לטיפול. עם זאת, MET תורם לשגשוג של תאים סרטניים מופצים באיברים רחוקים52, אשר עשוי להיות מועיל בעת שימוש בהיפוך הטיפולי של EMT. לאחרונה, מחקר חדש דיווח על גישה טיפולית transdifferentiation על ידי מיקוד ישיר EMT נגזר תאים סרטניים השד עבור בידול לתוך adipocytes30. מחקרו של ישי-רונן ואח’ Al.30 השתמשו בתאי סרטן אפיתל מורין Py2T שעברו מעבר לתאים mesenchymal בתגובה לטיפול ארוך טווח עם TGF-β. הם הראו כי rosiglitazone בשילוב עם מעכבי MEK משופרת בידול אפיתל ו adipogenesis. עם זאת, מצאנו כי rosiglitazone לבד היה מספיק כדי לגרום transdifferentiation של תאים מורין Py2T mesenchymal לתוך adipocytes.
לסיכום, השיטות המשמשות במחקר זה סיפקו זרימת עבודה הגיונית כדי לחקור איתות TGF-β ו- EMT הנגרמת על ידי TGF-β. שני המעכבים, SB431542 ו- GW788388, יכולים לחסום תגובות הנגרמות על ידי TGF-β ו- EMT. בנוסף, הדגמנו גם rosiglitazone לבד גורם adipogenesis מסוימים TGF-β-induced תאים סרטן השד mesenchymal. למרות שהשתמשנו רק בכמה קווי תאים סרטניים בשד כדי לחקור תגובות TGF-β, השיטות המתוארות כאן יכול להיות extrapolated לתאים אחרים (סרטן). כאן, השתמשנו בריכוזים שונים של β TGF כדי לגרום לתגובות סלולריות. ברוב סוגי התאים, TGF-β מפעילה את פעילותה הביולוגית בטווח הריכוז של 0.01-10 ng/mL53 וגורם לאיתות בתבנית תגובת מינון. בתאי אנדותל ראשוניים, כולל תאי אנדותל אבי העורקים שור, TGF-β המושרה הביטוי המשמעותי של SMAD2 phosphorylated ב 0.025 ng/mL, הגיע למקסימום ב 0.25 ng/mL, ונשאר ברמה זו בתגובה ריכוזים גבוהים יותר53. במחקר שלנו, השתמשנו בריכוז גבוה של TGF-β (5 ng/mL) בתאי MCF10A-ראס לבדיקת הכתב שעתוק כדי לקבל תגובות חזקות. SMAD2 זרחון וביטוי גנים היעד יכול להיגרם על ידי TGF-β במינון נמוך; לכן, השתמשנו 2.5 ng/mL TGF-β לטיפול בתאים. עם זאת, ריכוז העבודה המתאים ביותר תלוי בסוג התא ובאפקטים המשוערים. כדי לקבוע את הריכוז הטוב ביותר של TGF-β, מומלץ לטפל בתאים במינונים שונים (מנמוך לגבוה).
The authors have nothing to disclose.
אנו מכירים בתמיכת מועצת המלגות הסינית (CSC) ל- J.Z. ולמרכז הגנומיקה לסרטן בהולנד (CGC). NL) לפ.ט.ד.
Reagent | |||
18 mm-side square glass coverslips | Menzel Gläser | 631-1331 | |
4′,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) | Vector Laboratories | H-1200 | |
Alexa Fluor 488 Phalloidin | Thermo Fisher Scientific | A12379 | |
Alexa Fluor 555 secondary antibody | Thermo Fisher Scientific | A-21422 | |
Anti-E-cadherin antibody | BD Biosciences | 610181 | |
anti-glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase(GAPDH) antibody | Merck Millipore | MAB374 | |
Anti-N-cadherin antibody | BD Biosciences | 610920 | |
Anti-Slug antibody | Cell Signaling Technology | 9585 | |
anti-SMAD2/3 antibody | Becton Dickinson | 610842 | |
Anti-Snail antibody | Cell Signaling Technology | 3879 | |
Anti-Tubulin antibody | Cell Signaling Technology | 2148 | |
Bovine Serum Albumin | Sigma-Aldrich | A2058 | |
Cholera enterotoxin | Sigma-Aldrich | C8052 | |
Clarity Western ECL Substrate | Bio-Rad | 1705060 | |
DC protein assay kit | Bio-Rad | 5000111 | |
DMEM-high glucose | Thermo Fisher Scientific | 11965092 | |
DMEM-high glucose medium | Thermo Fisher Scientific | 11965092 | |
Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM)/F12 | Thermo Fisher Scientific | 11039047 | |
epidermal growth factor (EGF) | Merck Millipore | 01-107 | |
Fetal bovine serum (FBS) | BioWest | S1860-500 | |
GoTaq qPCR Master Mix | PROMEGA | A600X | |
Horse serum | Thermo Fisher Scientific | 26050088 | |
Hydrocortisone | Sigma-Aldrich | H0135 | |
Insulin | Sigma-Aldrich | 91077C | |
Mini Protease Inhibitor Cocktail | Roche | 11836153001 | |
NucleoSpin RNA II kit | BIOKE´ | 740955 | |
Penicillin-streptomycin (Pen-Strep) | Thermo Fisher Scientific | 15140148 | |
Polyethylenimine (PEI) | Polyscience | 23966 | |
Polyvinylidene difluoride (PVDF) membrane | Merck Millipore | IPVH00010 | |
Ponceau S solution | Sigma-Aldrich | P7170 | |
RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit | Thermo Fisher Scientific | K1621 | |
Skimmed milk | Campina: Elk | ||
Equipment | |||
ChemiDoc Imaging System | Bio-Rad | 17001402 | |
CFX Connect Detection System | Bio-Rad | 1855201 | |
Luminometer | Perkin Elmer | 2030-0050 | |
NanoDrop 2000/2000c Spectrophotometers | Thermo Fisher Scientific | ND-2000 |