We beschrijven een systematische workflow om TGF-β signalering en TGF-β-geïnduceerde EMT te onderzoeken door de eiwit- en genexpressie te bestuderen die betrokken zijn bij deze signaleringsroute. De methoden omvatten western blotting, een luciferase reporter assay, qPCR, en immunofluorescentie vlekken.
Het transformeren van groeifactor-β (TGF-β) is een afgescheiden multifunctionele factor die een sleutelrol speelt in intercellulaire communicatie. Verstoringen van TGF-β signalering kan leiden tot borstkanker. TGF-β lokt de effecten ervan uit op proliferatie en differentiatie via specifiek celoppervlak TGF-β type I- en type II-receptoren (d.w.z. TβRI en TβRII) die een intrinsiek serine/threoninekinasedomein bevatten. Bij TGF-β-geïnduceerde heteromere complexe vorming lokt geactiveerde TβRI intracellulaire signalering uit door fosforylaatende SMAD2 en SMAD3. Deze geactiveerde SMAD’s vormen heteromere complexen met SMAD4 om specifieke doelgenen te reguleren, waaronder plasminogene activeringsremmer 1 (PAI-1, gecodeerd door het SERPINE1-gen). De inductie van epitheel-naar-mesenchymale overgang (EMT) maakt epitheelkankercellen op de primaire locatie of tijdens kolonisatie op verre locaties mogelijk om een invasief fenotype te krijgen en tumorprogressie te stimuleren. TGF-β fungeert als een krachtige inductor van borstkanker invasie door het drijven van EMT. Hier beschrijven we systematische methoden om TGF-β signalering en EMT-reacties te onderzoeken met behulp van premalignant menselijke MCF10A-RAS (M2) cellen en muis NMuMG epitheelcellen als voorbeelden. We beschrijven methoden om TGF-β-geïnduceerde SMAD2-fosforylering te bepalen door westerse blotting, SMAD3/SMAD4-afhankelijke transcriptieactiviteit met behulp van luciferaseverslaggeveractiviteit en SERPINE1-doelgenexpressie door kwantitatieve real-time-polymerasekettingreactie (qRT-PCR). Daarnaast worden methoden beschreven om TGF-β-geïnduceerde EMT te onderzoeken door veranderingen in morfologie, epitheel- en mesenchymale markerexpressie, filamenteuze actinekleuring en immunofluorescentiekleuring van E-cadherine te meten. Twee selectieve kleine molecule TGF-β receptorkinaseremmers, GW788388 en SB431542, werden gebruikt om TGF-β-geïnduceerde SMAD2-fosforylering, doelgenen en veranderingen in EMT-markerexpressie te blokkeren. Bovendien beschrijven we de transdifferentiatie van mesenchymale borst Py2T murine epitheeltumorcellen in adipocyten. Methoden om TGF-β-geïnduceerde signalering en EMT bij borstkanker te onderzoeken, kunnen bijdragen aan nieuwe therapeutische benaderingen voor borstkanker.
Het cytokine transformerende groeifactor-β (TGF-β) is het prototype van een grote groep structureel en functioneel gerelateerde regulerende polypeptiden, waaronder TGF-βs (d.w.z. TGF-β1, -β2 en -β3), botmorfogene eiwitten (BMPs) en activines1,2. Deze cytokinen spelen allemaal een belangrijke rol bij de embryonale ontwikkeling en bij het behoud van weefsel- en orgaanhomeostase3. De verkeerde regelgeving van TGF-β kan leiden tot een grote verscheidenheid aan ziekten, waaronder kanker4,5. TGF-β speelt een complexe, dubbele rol bij de progressie van kanker: in normale en premaligne epitheelcellen gedraagt TGF-β zich als een tumoronderdrukker door proliferatie te remmen en apoptose6,7te induceren; in het late stadium van tumorprogressie, wanneer cytostatische reacties worden geblokkeerd door de activering van oncogenen of verlies van tumoronderdrukkergenen, fungeert TGF-β als een tumorversterker door epitheel-mesenchymale overgang (EMT) in kankercellen te bevorderen, waardoor kankercelinvasie en uitzaaiingen mogelijk worden, inwerken op cellen in het micromilieu van de tumor en angiogenese en immuunontduikingstimuleren 8,9,10.
TGF-β wordt afgescheiden als een inactief precursormolecuul dat de volwassen carboxy-terminale TGF-β en latentie-geassocieerd peptide (LAP)11bevat. Dit kleine complex kan covalent worden gebonden door latente TGF-β-bindend eiwit (LTBP)12. De afgifte van volwassen TGF-β kan worden bemiddeld door de werking van specifieke proteasen die LAP splijten of door het mechanisch trekken van LAP in een integrin-afhankelijk proces13,14. Naast LTBP worden glycoproteïne A-herhalingen die overheersen (GARP) sterk uitgedrukt op het oppervlak van regulerende T-cellen (Tregs) en speelt het een vergelijkbare rol als LTBP bij het reguleren van de activering van TGF-β15,16. GARP bindt rechtstreeks aan latente TGF-β door disulfidekoppeling en niet-covalente associatie. De activering van TGF-β van het GARP/TGF-β complex vereist integrins17. Volwassen TGF-β bindt aan TGF-β serine/threonine kinase receptoren, d.w.z. TGF-β type I (TβRI) en TGF-β type II (TβRII) receptoren18 om signalering te initiëren. De binding van TGF-β aan TβRII bevordert de aanwerving van TβRI en de vorming van een heteromere complex. Vervolgens wordt TβRI gefosforyleerd door TβRII kinase op serine- en threonineresiduen in een kort glycine- en serinerijk (GS)-motief, wat resulteert in de activeringervan 19,20. Bij activering rekruteert en fosforyleert geactiveerde TβRI zijn substraten: de twee receptorspecifieke SMADs (R-SMADs) die SMAD2 en SMAD3 omvatten (Figuur 1). R-SMADs delen een vergelijkbare algehele structuur met twee zogenaamde Mad homologie domeinen, MH1 en MH2, die worden gescheiden door een proline-rijke linker regio (Figuur 2). Het DNA-bindingsmotief binnen het MH1-domein van SMAD3 is niet geconserveerd tussen SMAD2 en SMAD3, en SMAD2 kan DNA niet rechtstreeks binden vanwege twee invoegingen in zijn MH1-domein (exon 3 en L1). SMAD2 en SMAD3 kunnen worden geactiveerd door de fosforylering van het SSXS-motief in hun C-termini (figuur 2). Gefosforyleerde SMAD2/3 vormt heteromere complexen met een gemeenschappelijke SMAD-bemiddelaar, SMAD4, die transloceert in de kern om de transcriptie van doelgenen te moduleren (figuur 1)7,21. Deze canonieke SMAD-signaleringsroute is nauwkeurig gereguleerd en genereert specifieke cellulaire en weefselreacties zoals de regulatie van cel fate en tumorcelmetastasen en invasie22. Naast TGF-β-SMAD-signalering kunnen niet-SMAD-signaleringsroutes ook direct worden geactiveerd door receptoren om downstream cellulaire reacties te reguleren23.
Tijdens tumorprogressie zijn de activering van TGF-β-geïnduceerde SMAD-afhankelijke en SMAD-onafhankelijke trajecten nodig voor de inductie van EMT. EMT is een omkeerbaar proces waarbij tumorcellen dedifferentiate van een epitheelfenotype, dat wordt geassocieerd met het verlies van celcelcontacten en verminderde apicaal-basale polariteit, tot een mesenchymaal fenotype met verbeterde beweeglijkheid en invasievermogen24. EMT wordt gekenmerkt door een verhoogde expressie van mesenchymale markereiwitten, waaronder N-cadherine, vimentine, Zeb2 en Snail1/2, en de gelijktijdige downregulatie van epitheelmarkers, zoals E-cadherine en β-catenine (figuur 3)25. De overgang van een epitheel naar een mesenchymale toestand is echter vaak onvolledig en cellen krijgen gemengde epitheel- en mesenchymale (E/M) kenmerken. Een recent artikel van de International EMT association stelde voor om het proces van cellen die tussenliggende E/M fenotypische toestanden ondergaan te beschrijven als epitheel-mesenchymale plasticiteit (EMP)26. Deze plasticiteit verwijst naar gedeeltelijke EMT, een hybride E/M-status, een uitzaaibare EMT-toestand, een EMT-continuüm en een EMT-spectrum26. Tijdens EMT krijgen tumorcellen csc-eigenschappen (Cancer Stem Cell) en worden ze resistenter tegen door onthechting veroorzaakte apoptose27. Hoewel EMT verantwoordelijk is voor de verwerving van een invasief fenotype in primaire tumorcellen en de progressie van kanker stimuleert, is daarentegen aangetoond dat mesenchymale-epitheeltransitie (MET) een belangrijke rol speelt in de uitgroei van verspreide tumorcellen op verre gemetastaseerde locaties28,29. Een recente studie toonde aan dat EMT-afgeleide borstkankercellen kunnen worden omgezet in adipocyten, wat een kans zou kunnen bieden om uitzaaiingen te remmen en therapieresistentie in tumorcellen en teruggevallen kanker te overwinnen30. Vanwege de belangrijke rol van TGF-β signalering bij de activering van EMT bij kankerverwekkende borst, we presenteren gedetailleerde protocollen voor western blotting, een luciferase transcriptional reporter assay, kwantitatieve real-time-polymerase kettingreactie (qRT-PCR) en immunofluorescentie voor het onderzoek van TGF-β signalering, TGF-β-geïnduceerde EMT, en de transdifferentiatie van EMT-afgeleide murine borst epitheel tumorcellen in adipocyten. Deze technieken zijn de meest gebruikte analytische tools op het gebied van celbiologie. qRT-PCR wordt gebruikt om mRNA-expressieniveaus kwantitatief te detecteren, karakteriseren en kwantificeren. In vergelijking met kwantitatieve PCR (qPCR), een alternatieve techniek, kan de reverse transcription (RT)-PCR worden gebruikt om mRNA-expressie op semikwantitatieve wijze te bepalen31,32. Western blotting wordt gebruikt om specifieke eiwitniveaus in een bepaald cellysaatmonster te onderzoeken met voordelen van gevoeligheid en specificiteit, op een semi-kwantitatieve manier. Zo presenteren we een systematische workflow om veranderingen van genexpressie naar eiwitexpressie te analyseren om TGF-β-signalering te helpen onderzoeken die ook op andere signaleringsroutes kan worden toegepast.
TGF-β/SMAD-signalering speelt een cruciale rol bij de progressie van borstkanker, omdat het de invasieve en uitzaaiingen van borstkankercellen kan bevorderen door EMT7te induceren. Hier beschreven we een logische workflow om TGF-β geïnitieerde signalering te onderzoeken van receptorgeïnduceerde SMAD-activering naar SMAD-gemedieerde transcriptie- en biologische reacties. We begonnen met het beschrijven van de analyse van SMAD2-fosforylering, gingen verder met TGF-β-geïnduceerde SMAD3-afhankelijke transcriptionele reacties en EMT-markerexpressie op zowel het gen- als eiwitniveau om de TGF-β / SMAD-signaleringsrespons te analyseren en onderzochten uiteindelijk TGF-β-geïnduceerde EMT. We gebruikten de CAGA12-luciferase transcriptional reporter met CAGA-boxen afgeleid van de PAI-1 promotor, om de activiteit van de TGF-β /SMAD signaleringsroute35te volgen. Deze reporter-constructie vereist SMAD3 en SMAD4 voor activering. Eerdere studies hebben aangetoond dat de knockdown van SMAD4 verzwakt tgf-β-geïnduceerde CAGA12-luciferase activiteit37. Naast de reporter-test is het bepalen van de fosforyleringsstatus van endogene SMADs, waaronder SMAD2 en SMAD3, een andere manier om de TGF-β signaleringsreactie te onderzoeken. Andere leden van de TGF-β familie, zoals groei – en differentiatiefactor (GDF)-8/myostatin en GDF-9, transduceren ook signalen via SMAD2/3-eiwitten door TβRI42,43,44in te schakelen . Naast de CAGA12-luciferase reporter zijn verschillende soortgelijke verslaggevers gebruikt om de activering van TGF-β signalering te detecteren. Een transcriptieverslaggever (SBE)4-Lux met responselementen afgeleid van de JunB-promotor kan bijvoorbeeld efficiënt worden geïnduceerd door TGF-β, activins en BMPs45.
Western blotting en qPCR werden gebruikt om TGF-β-geïnduceerde EMT te analyseren, wat klassieke methoden zijn om de expressie van epitheelmarkers (d.w.z. E-cadherine) en mesenchymal markers (d.w.z. N-cadherine, Snail, Slug en Zeb2) te onderzoeken. We hebben ook indirecte immunofluorescentiekleuring van E-cadherine en directe fluorescentiekleuring van F-actine uitgevoerd. Deze tests verder gevalideerd het mesenchymale fenotype van cellen na TGF-β behandeling. De beperking van immunofluorescentiekleuring is dat cellen vóór incubatie moeten worden gerepareerd met antilichamen en beeldvorming, en het is moeilijk om veranderingen in emt-markerexpressie in levende cellen te onderzoeken. Onlangs heeft het ontwerp van EMT reporter cell lines, zoals A549 lung adenocarcinoma-vimentin-RFP, het mogelijk gemaakt om de transformatie van epitheelcellen naar mesenchymale cellen in realtime te monitoren via de expressie van rood fluorescerend eiwit (RFP)-tagged vimentine. Dit platform kan worden gebruikt voor drugsscreening en nieuwe drugsontwikkeling46. LifeAct-kleurstof, een 17-aminozuurpeptide, dat F-actinestructuren in levende cellen kan bevlekken, wordt een waardevol hulpmiddel om het actinecytoskelet in realtime te visualiseren zonder de cellulaire processen te verstoren47. In deze studie gebruikten we twee kleine-molecuulremmers, SB431542 en GW788388, om hun remmende effect op TGF-β signalering en TGF-β-geïnduceerde EMT te valideren. Met name de GW788388 remt de TβRI- en TβRII-activiteit krachtig, terwijl SB431542 alleen een remmend effect heeft op TβRI (en ALK4 en ALK7). Eerdere studies toonden aan dat GW788388 krachtiger is in vivo dan SB43154240. Naast de remming van EMT verminderde GW788388 de expressie van fibrosemarkers in de nier en verminderde de orale toediening van GW788388 bij diabetische muizen de glomerulopathieaanzienlijk 25,48.
EMT speelt een essentiële rol bij het bevorderen van de plasticiteit van kankercellen en resulteert in geneesmiddelresistentie en uitzaaiingen 49. Daarom is het richten van EMT-afgeleide cellen met specifieke cytotoxische geneesmiddelen50 of het induceren van redifferentiatie via mesenchymal-to-epithelial transition (MET)51 voorgesteld als een aanpak om kankercelmetastasen en therapieresistentie te overwinnen. BMO draagt echter bij tot de proliferatie van verspreide kankercellen in verre organen52, wat contraproductief kan zijn bij het gebruik van de therapeutische omkering van EMT. Onlangs rapporteerde een nieuwe studie een therapeutische transdifferentiatiebenadering door emt-afgeleide borstkankercellen rechtstreeks te richten op differentiatie in adipocyten30. De studie van Ishay-Ronen et. al.30 gebruikt py2T murine epitheelkankercellen die een overgang naar mesenchymale cellen hadden ondergaan als reactie op langdurige behandeling met TGF-β. Ze toonden aan dat rosiglitazon in combinatie met MEK-remmers de epitheeldifferentiatie en adipogenese verbeterde. We ontdekten echter dat rosiglitazon alleen voldoende was om de transdifferentiatie van mesenchymale Py2T murinecellen in adipocyten te induceren.
Samengevat boden de methoden die in deze studie werden gebruikt een logische workflow om TGF-β signalering en TGF-β-geïnduceerde EMT te onderzoeken. De twee remmers, SB431542 en GW788388, kunnen TGF-β-geïnduceerde reacties en EMT blokkeren. Daarnaast hebben we ook aangetoond dat rosiglitazon alleen adipogenese induceert in bepaalde TGF-β geïnduceerde mesenchymale borstkankercellen. Hoewel we slechts verschillende borstkankercellijnen gebruikten om TGF-β reacties te onderzoeken, konden de hier beschreven methoden worden geëxtrapoleerd naar andere (kanker)cellen. Hier gebruikten we verschillende TGF-β concentraties om cellulaire reacties op te wekken. In de meeste celtypen oefent TGF-β zijn biologische activiteit uit in het concentratiebereik van 0,01-10 ng/ml53 en induceert signalering in een dosisresponspatroon. In primaire endotheelcellen, met inbegrip van boviene aorta-endotheelcellen, veroorzaakte TGF-β de substantiële expressie van gefosforyleerde SMAD2 bij 0,025 ng/ml, bereikte een maximum van 0,25 ng/ml en bleef op dit niveau in reactie op hogere concentraties53. In onze studie gebruikten we een hoge concentratie TGF-β (5 ng/ml) in MCF10A-Ras-cellen voor de transcriptionele reportertest om sterke reacties te verkrijgen. SMAD2-fosforylering en doelgenexpressie kunnen worden geïnduceerd door TGF-β in een lage dosis; zo gebruikten we 2,5 ng/ml TGF-β om cellen te behandelen. De meest geschikte werkconcentratie hangt echter af van het celtype en de geschatte effecten. Om de beste concentratie TGF-β te bepalen, wordt aanbevolen om de cellen met verschillende doses (van laag tot hoog) te behandelen.
The authors have nothing to disclose.
Wij erkennen de steun van de Chinese Scholarship Council (CSC) aan J.Z. en Cancer Genomics Centre Netherlands (CGC. NL) naar P.t.D.
Reagent | |||
18 mm-side square glass coverslips | Menzel Gläser | 631-1331 | |
4′,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) | Vector Laboratories | H-1200 | |
Alexa Fluor 488 Phalloidin | Thermo Fisher Scientific | A12379 | |
Alexa Fluor 555 secondary antibody | Thermo Fisher Scientific | A-21422 | |
Anti-E-cadherin antibody | BD Biosciences | 610181 | |
anti-glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase(GAPDH) antibody | Merck Millipore | MAB374 | |
Anti-N-cadherin antibody | BD Biosciences | 610920 | |
Anti-Slug antibody | Cell Signaling Technology | 9585 | |
anti-SMAD2/3 antibody | Becton Dickinson | 610842 | |
Anti-Snail antibody | Cell Signaling Technology | 3879 | |
Anti-Tubulin antibody | Cell Signaling Technology | 2148 | |
Bovine Serum Albumin | Sigma-Aldrich | A2058 | |
Cholera enterotoxin | Sigma-Aldrich | C8052 | |
Clarity Western ECL Substrate | Bio-Rad | 1705060 | |
DC protein assay kit | Bio-Rad | 5000111 | |
DMEM-high glucose | Thermo Fisher Scientific | 11965092 | |
DMEM-high glucose medium | Thermo Fisher Scientific | 11965092 | |
Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM)/F12 | Thermo Fisher Scientific | 11039047 | |
epidermal growth factor (EGF) | Merck Millipore | 01-107 | |
Fetal bovine serum (FBS) | BioWest | S1860-500 | |
GoTaq qPCR Master Mix | PROMEGA | A600X | |
Horse serum | Thermo Fisher Scientific | 26050088 | |
Hydrocortisone | Sigma-Aldrich | H0135 | |
Insulin | Sigma-Aldrich | 91077C | |
Mini Protease Inhibitor Cocktail | Roche | 11836153001 | |
NucleoSpin RNA II kit | BIOKE´ | 740955 | |
Penicillin-streptomycin (Pen-Strep) | Thermo Fisher Scientific | 15140148 | |
Polyethylenimine (PEI) | Polyscience | 23966 | |
Polyvinylidene difluoride (PVDF) membrane | Merck Millipore | IPVH00010 | |
Ponceau S solution | Sigma-Aldrich | P7170 | |
RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit | Thermo Fisher Scientific | K1621 | |
Skimmed milk | Campina: Elk | ||
Equipment | |||
ChemiDoc Imaging System | Bio-Rad | 17001402 | |
CFX Connect Detection System | Bio-Rad | 1855201 | |
Luminometer | Perkin Elmer | 2030-0050 | |
NanoDrop 2000/2000c Spectrophotometers | Thermo Fisher Scientific | ND-2000 |