פרוטוקול זה מתאר את ההליכים כדי לגרום לפגיעה בכליות חריפה (AKI) ב זברה-דג מבוגר באמצעות ציספלטין כסוכן נטרוקסי. פירטנו את השלבים כדי להעריך את הרבייה של הטכניקה ושתי טכניקות לניתוח דלקת ומוות תאים ברקמת הכליה, ציטומטריית זרימה ו- TUNEL, בהתאמה.
ציספלטין משמש בדרך כלל ככימותרפיה. למרות שיש לו השפעות חיוביות אצל אנשים שטופלו בסרטן, ציספלטין יכול בקלות לצבור בכליה בשל המשקל המולקולרי הנמוך שלה. הצטברות כזו גורמת למוות של תאים צינוריים ויכולה לגרום להתפתחות של פגיעה בכליות חריפה (AKI), המאופיינת בירידה מהירה בתפקוד הכליות, נזק לרקמות וחדירה לתאי החיסון. אם ניתנת במינונים ספציפיים ציספלטין יכול להיות כלי שימושי כמו AKI inducer במודלים בעלי חיים. דג הזברה הופיע כמודל מעניין לחקר תפקוד הכליות, התחדשות הכליות ופציעה, שכן מבני כליות משמרים קווי דמיון תפקודיים עם יונקים. דג זברה למבוגרים מוזרק עם ציספלטין מראה ירידה בהישרדות, מוות תאי כליות, סמנים דלקת מוגברת לאחר 24 שעות לאחר הזרקה (hpi). במודל זה, חדירת תאים חיסוניים ומוות תאים ניתן להעריך על ידי cytometry זרימה ו- TUNEL assay. פרוטוקול זה מתאר את ההליכים כדי לגרום AKI ב זברה למבוגרים על ידי הזרקת ציספלטין תוך-אישית ולאחר מכן מדגים כיצד לאסוף את רקמת הכליה לעיבוד cytometry זרימה ומוות תאים TUNEL assay. טכניקות אלה יהיה שימושי כדי להבין את ההשפעות של ציספלטין כסוכן nephrotoxic יתרום להרחבת מודלים AKI ב זברה למבוגרים. מודל זה יכול לשמש גם כדי ללמוד התחדשות כליות, בחיפוש אחר תרכובות המטפלות או למנוע נזק לכליות וללמוד דלקת ב- AKI. יתר על כן, השיטות המשמשות בפרוטוקול זה ישפרו את האפיון של נזק לרקמות ודלקת, שהן מטרות טיפוליות בתחלואה הקשורה לכליות.
הכליות אחראיות על מספר פונקציות פיזיולוגיות חשובות השומרות על הומאוסטזיס, כגון סינון דם, הסרת שאריות עודפות ורגולציה של ריכוזי היונים1. נזק של רקמת כליות יכול להוביל למצב הטרוגניים הנקרא פגיעה בכליות חריפה (AKI), אשר קלינית מתוארת כירידה מהירה בתפקוד הכלייתי הנגרמת על ידי הרס ומוות של תאי אפיתל צינורי, פגיעה בתאי אנדותל, וחדירת לויקוציטים 2,3. AKI הוא מצב צפוי לקרות 8-16% של אשפוז בבית החולים4, עם שיעור תמותה גבוה הנע בין 20 ל 50% ביחידה לטיפול נמרץ (ICU)5. מחלות אלה קשורות להגברת השהות בבית החולים ולשימוש ניכר במשאבים כספיים5. גורמים אציולוגיים כוללים התייבשות, הלם, זיהומים, אלח דם, מחלות לב וכלי דם, ותרופות nephrotoxic6. Nephrotoxicity מוגדר כפגיעה בכליות הנגרמת על ידי סמים, גרימת השפעות כמו AKI, tubulopathies, ו גלומרולופתיות7. Nephrotoxicity משפיע על שני שלישים של חולי טיפול נמרץ, כמו כ 20% של תרופות שנקבעו בטיפול נמרץ נחשבים nephrotoxic8,9, זה כולל תרופות נוגדות דלקת לא סטרואידים (NSAIDs), אנטיביוטיקה כגון vancomycin ו aminoglycosides, וסוכנים כימותרפיים כמו מטוטרקסט וציספלטין7. ציספלטין היא אחת התרופות הכימותרפיות החזקות והנפוצות ביותר, המשמשות לטיפול בגידולים מוצקים, כגון ראש וצוואר, אשכים, שחלות ושלפוחית השתן10. בכליה, ציספלטין מופנם בצינור המפותל הפרוקסימלי (PCT) באמצעות טרנספורטר קטיוני אורגני 2 (OCT-2) ובריכוזים גבוהים נקשר ל- DNA המפעיל מסלולי מוות של תאים7,10,11,12. הצטברות של תרופה זו בכליה תורמת nephrotoxicity עם מוות ודלקת13. תופעת לוואי מזיקה זו משפיעה מאוד על החיים ועל הפרוגנוזה של שליש מחולי הסרטן העוברים טיפול ציספלטין, ולכן הוא הכרחי המחקר של טיפולים חדשים שיכולים להוריד את nephrotoxicity מבלי לאבד את ההשפעה הרג על תאים סרטניים10.
בגלל אפקט נפורוטוקסי זה, ציספלטין משמש בדרך כלל משרן של AKI במודלים ניסיוניים של בעלי חיים, כמתואר קדימה. במכרסמים, מודל AKI הראשון המושרה על ידי ציספלטין דווח בשנת 197114 אבל כרגע, פרוטוקולים רבים ושונים הופיעו באמצעות ההשפעות תלויות המינון המצטבר של ציספלטין15. ובכך, בהתאם המינון ומספר הבקשות, ציונים שונים של חומרת פגיעה בכליות יכול להיות המושרה16,17,18,19,20,21. השיטה השכיחה ביותר מורכבת זריקה תוך-פיטונית (i.p. ) של מנה אחת של ציספלטין ואחריו המתת חסד בימים הבאים. בפרוטוקול קלאסי זה, מנה נטרוקסית גבוהה אחת של ציספלטין (10-13 מ”ג/ק”ג בעכברים ו/או 3-8 מ”ג/ק”ג בחולדות) גורמת לשינויים היסטולוגיים חמורים, כגון אובדן גבול מברשת ופסולת תא בתוך לומן צינורי, כמה ימים לאחר הזרקת ציספלטין. חומרת השינויים ההיסטולוגיים תלויה במינון, וסימני התחדשות נצפו 7 ימים לאחר הזרקת ציספלטין16,17.
למרות מודלים מכרסמים מבוססים היטב, החלטנו לנצל את המאפיינים של בעלי חוליות אחר, מיקוד המחקרים שלנו על זברה (דניו rerio). דג זה שימש בהרחבה למידול מחלות אנושיות, בשל גודלו הקטן, הפריה חיצונית, שיעורי רבייה גבוהים, התפתחות מהירה, שקיפות העוברים והזחלים, עלות תחזוקה נמוכה, אנטומיה דומה ליונקים (למעט כמה יוצאים מן הכלל), יכולת התחדשות רקמות גבוהה, התנהגות חברתית, 70% מהדמיון הגנטי עם בני אדם ו -84% עם גנים הקשורים למחלות אנושיות22. Streisinger et al.23,24,25 החלו את המחקרים עם זברהפיש שאישרו את הפרקטיקה של ניצול אורגניזם מודל זה לניתוח גנטי של התפתחות בעלי חוליות. במחקר כליות, דג הזברה התפתח לא רק במחקרים התפתחותיים אלא גם ככלי גנטי בחיפוש אחר גנים חדשים הקשורים לתנאי כליות26. יתר על כן, היכולת של התחדשות ללא היווצרות צלקת ואת היכולת ליצור nephrons דרך חייהם, הנקרא neonephrogenesis, להפוך את זברה דג מודל חיה מפתח למחקרהתחדשות 27,28. יתר על כן, הזמינות של מודלים ניסיוניים למחלות כליות שונות, כולל פגיעה בכליות חריפה וכרונית, מדגימה את הרבגוניות של האורגניזם הניסיוני הזה26,29. כמו ביונקים, אבות הכליות של דג הזברה נגזרים מהמזודרם המתווך. אבות כליות כאלה ליצור את נוטה כי מאוחר יותר לפתח mesonephros, אשר יישמרו כמו איבר בוגר עדהבגרות 29,30.
הכליה הבוגרת של דג הזברה ממוקמת על דופן הגב של הגוף, בין שלפוחית השחייה לעמוד השדרה29. מנקודת מבט גחונית, ניתן לחלק את דג הזברה לשלושה אזורים (איור 1A):ראש (H), תא מטען (Tr) וזנב (Ta)29. בדומה ליונקים, דג הזברה כולל את הנפרונים כיחידות פונקציונליות של הכליה, המחולקות למקטעי צינורית(איור 1A):קורפוסקל כליות (RC), צינורית מפותלת פרוקסימלית (PCT), טובולה ישרה פרוקסימלית (PST), דיסטל מוקדם (DE), דיסטל מאוחר (DL) ואיסוף צינורית (CD)29. זברה-פיש חולקת שימור גנטי ודמיון מבני עם נפרונים אנושיים (איור 1B), אך חסרה להם קונפורמציות מסוימות כגון צינורית הביניים, הידועה גם בשם הלולאה של הנל (LH)29,31. דגי מים מתוקים כמו דגי זברה מוקפים בדרך כלל במדיום עם אוסמולריות נמוכה מאוד, בגלל זה, הם נוטים להיות hyperosmotic ותלויים הזימים, העור בשלבים מוקדמים, ואת הכליה כדי לווסת את osmolarity ואת הפרשת מים32. סינון הדם מאב העורקים הגבי על ידי נוטה מתחיל סביב 48 שעות לאחר ההפריה (hpf)33,34. הכליה של דג הזברה היא לא רק איבר הפרשת פסולת מטבולית, אלא גם פועלת כאיבר hematopoietic מ 4 ימים לאחר ההפריה (dpf) לבגרות וזה שווה למח העצם ביונקים35. במהלך הפיתוח, תאי גזע hematopoietic (HSCs) יהיה לזרוע את הכליה, לשפץ את עצמו, וליצור שושלת מיאלואידית, אריתרואיד, תאי הלימפה, שמירה על גורמי שעתוק, מולקולות איתות, ותוכניות גנטיות שמורות מאוד עם יונקים36,37. מחקרים גילו כי רוב תאי אריתרואיד, תרומבוציטיקה, מיאלואידים ולימפואידים של מערכת החיסון האנושית נמצאים בזברה פיש37,38. המאפיינים הייחודיים של בעל חיים זה והתכונות השמורות עם הכליה האנושית הפכו את המודל הזה לאורגניזם יתרון במחקר של תפקוד הכליות, פציעה והתחדשות.
למרות שהכליה של דג הזברה נחקרת היטב וכמה דגמים של AKI כבר זמינים בזחלים ובזברפיש בוגר28, בזמן הקמת פרוטוקול זה לא היו ראיות למודל AKI שאינו אנטיביוטי המושרה כימית בזברה דג מבוגר. חוץ מזה, המעבדה שלנו מתמקדת בבדיקת חיידקים פרוביוטיים ותרכובות שמקורן במיקרוביוטה כדי לחקור התחדשות ונזק לכליות, ובכך ריכזנו את מאמצינו ביצירת מודל AKI חדש המושרה על ידי ציספלטין בדגים בוגרים. מאמר הווידאו המוצג בכתב יד זה מדגים את ההליכים לדגם חדש של אינדוקציה AKI באמצעות הזרקת i.p. של 120 UG ציספלטין לכל גרם של בעלי חיים (120 מיקרוגרם / גרם)(איור 2A). מינון זה התבסס בתחילה על מחקרים של AKI המושרה על ידי ציספלטין במודלים מורין כי הלך סביב 10 מ”ג / קילוגרם (שווה ערך 10 מיקרוגרם / גרם)14,15,16,17, עם זאת, מינון זה לא היה מספיק כדי לגרום נזק לכליות הקשורות nephrotoxicity (נתונים לא הראו). לכן, הגדלנו את המינון לאלה המשמשים במחקר זה (איור 2B). העבודה שלנו חשפה השפעה תלוית מינון של ציספלטין בשיעור ההישרדות לאחר הזרקה עם אינדוקציה של נזק לרקמת הכליה 24 hpi כפי שמוצג על ידי אובדן מבנה צינורי, הסתננות דלקתית מוגברת, ושיעור גבוה של מוות תאי. כאן, אנו מתארים שתי טכניקות לניתוח ההתפתחות של AKI הנגרמת על ידי ציספלטין: ציטומטריית זרימה, כדי לנתח חדירת תאים, ו TUNEL, כדי למדוד מוות של תאים. ציטומטריית זרימה היא טכנולוגיה המודדת את המאפיינים הפיזיים (גודל וצפיפות) וכימיקלים (תרכובות פלואורסצנטיות) של התאים. בתוך הסייטומטר התא עובר דרך נוזל נדן שמארגן את התאים בשורה אחת, ומאפשר להם לעבור דרך קרן לייזר תא אחד בכל פעם(איור 3A). גלאי מול קרן האור ימדד את הפיזור הקדמי (FSC), אשר מתואם עם גודל התא, וגלאים בצד ימדדו את פיזור הצד (SSC) המתאם לצפיפות התאים. גלאים אחרים ימדדו את הפלואורסצנטיות מחלקיקים, חלבונים פלואורסצנטיים או תאים המסומנים בנוגדנים39,40. כמו נוגדנים מסחריים עבור דגי זברה הם נדירים כיום, השימוש כתבים בעלי חיים סמנים ביולוגיים פלואורסצנטיים מאפשר לשפר את הניתוח הזה ולזהות אוכלוסיות תאים מגוונות41,42,43. כלי נוסף ששימש בפרוטוקול זה היה מסוף deoxynucleotidyl transferase (TdT) dUTP ניק סוף תיוג (TUNEL) assay. בדיקת TUNEL היא שיטה לגילוי אפופטוזיס בשלב מאוחר המסתמכת על היכולת של ה- TdT לזהות דנ”א מקוטע ולתייג אותו עם deoxynucleotides מתויג עם סמן פלואורסצנטי שמאוחר יותר ניתן לדמיין ולכמת על ידי מיקרוסקופיה44 (איור 3B). בהתחשב בכך שאחת התכונות הבולטות ביותר של AKI היא אינדוקציה של אפופטוזיס בתאי כליות שחפת3, טכניקה זו היא יתרון מאוד שכן ניתן לנתח אותה על ידי cytometry זרימה ו / או מיקרוסקופיה.
הגישות המוצגות במאמר זה מאפשרות תצפית על מצב AKI ומציעות מודל אקוטי חדש ללמוד הפרעות AKI שיכולות להיות שימושיות למחקר של מטרות טיפוליות חדשות ב- AKI הקשורות לציספלטין.
השכיחות של מחלת כליות המשיכה לגדול ברחבי העולם, והפכה לבעיה עולמית בבריאות הציבור המשפיעה על מיליוני אנשים63. מציאת דרך לטפל אנשים פגועים בכליות היא בעלת חשיבות עליונה, כמו גם להבין יותר על האטיולוגיה שלהם ואת ההתקדמות. מספר מחקרים השתמשו במודלים של בעלי חיים כדי להבין את נזקי הכליות. הכליה של דג הזברה(איור 1)נחקרה במשך שנים במחקר ביולוגי התפתחותי ופציעות בשל יכולות ההתחדשות העצמית שלה והדמיון הגנטי29,64. כאן, אנו מציגים דגם AKI חדש בדג זברה למבוגרים תוך שימוש בתכונות של ציספלטין כסוכן נפרוטוקס, המפרט את השלבים להשגת תגובה מהירה וחמורה עם נזק גלוי ברגע 24 hpi(איור 2). יתר על כן, כאן אנו מסבירים שתי טכניקות שיסייעו להערכת נזקי הרקמה לאחר הזרקת ציספלטין, ציטומטריית זרימה ו- TUNEL (איור 3).
מודלים נוכחיים AKI ב זברה למבוגרים כוללים i.p. הזרקה של gentamicin אשר גורם נזק נרחב בהרס nephron ו tubule, אירועי ניאונפרוגנסיס להתחיל מהיום 5, והתחדשות הושלמה על ידי 21 ימים לאחר הזרקה65. מצד שני, מודל של פגיעה בכליות חריפה הקשורות אלח דם (S-AKI) הוקמה על ידי זיהום עם Edwardsiella tarda, שכן גדל באופן משמעותי את הביטוי של סמני AKI, כגון פקטורי גדילה דמויי אינסולין מחייב חלבון-7 (IGFBP7), מעכבי רקמה של metalloproteinases 2 (TIMP-2), מולקולה פגיעה בכליות-1 (KIM-1), בזחלים וזברה למבוגרים66. דג הזברה ידוע בהיותו בעל תפוקה גבוהה לחיפוש סוכנים טיפוליים וזה כולל שימוש בפרוביוטיקה ובמטבוליטים שמקורם במיקרוביוטה כדי ללמוד תפקוד כליות והתחדשות67. עם זאת, הדגמים הזמינים יכולים להשפיע ישירות על התוצאה של טיפולים אלה. לכן, הקמנו שיטה אחרת כדי לגרום AKI ב זברה למבוגרים (איור 4), באמצעות ציספלטין כסוכן nephrotoxic ידוע כי לא היו השפעות ידועות ישירות על microbiota דגים, כמו גם מודל gentamicin להיות אנטיביוטיקה, או זיהום עם E. tarda, על היותו מודל אלח דם. עם זאת, באותו זמן שאנחנו מפתחים פרוטוקול ציספלטין שלנו, קבוצה אחרת חקרה גם את ההשפעות nephrotoxic של ציספלטין ב זברה למבוגרים, פישוט המינון ל 10-20-30 מיקרוגרם לכל חיה68. למרות שהם הראו גם אפקט תלוי מינון ציספלטין בהישרדות, אנו ממליצים להיזהר באמצעות כמות אחת של ציספלטין עבור כל הדגים, כמו דגי זברה מאותו גיל יכול להיות בגדלים ומשקל שונים מאוד וזה יכול לגרום וריאציות בתוצאות69,70. אנו חושבים שחשוב להתאים את המינון למשקל המתאים של החיה, כפי שנעשה בעכברים ובמחקר זה.
בניסויים שלנו עם דג זברה בוגר, ציספלטין הראה אפקט תגובה מינון. זה היה דמיין על ידי ניטור שיעור ההישרדות של בעלי החיים לאחר הזרקת ציספלטין (איור 5). השתמשנו בהישרדות כדרך להעריך את עוצמת המינון של ציספלטין ולא כמדד לנפרוטוקסיות, שכן שום סימן פיזי אחר אינו נראה בזמן הניטור. זה יכול להיות דומה עם מכרסמים, שבו חומרת הפגיעה בכליות ניתן לווסת על ידי המינון והתדירות של הזרקת ציספלטין15, השגת מינונים קטלניים עם ריכוזים גבוהים יותר של ציספלטין71. מת נראה גם בימים הבאים במודל הזחל של ציספלטין72. מאז המטרה שלנו הייתה לגרום לפציעה חריפה בעוד כמה ימים, בחרנו את המינון 120 מיקרוגרם / גרם של ציספלטין כפי שניתן לראות נזק לכליות 24 שעות לאחר ההזרקה, עם זאת, זה יכול להיות מותאם בהתאם למטרות המחקר.
בבני אדם, AKI מאובחנת קלינית על ידי ירידה בשיעור הסינון הגלומרולרי (GFR), קריאטינין סרום גבוה, וחנקן אוריאהבדם 3. ב זברה, הרפרטואר של מודלים AKI כולל כמה מודלים מותניםגנטיים 73,74 וכמה מודלים הקשורים לתרופות65,72, אבל כמו כמה פרמטרים תפקודיים AKI לא ניתן למדוד על זברהפיש בגלל קשיים טכניים(למשל, איסוף דם), רוב המחקר מאמץ טכניקות מורפולוגיות ויזואליות כדי לבחון את התכונות של AKI1,75 כגון המחקר שלנו.
במכרסמים, ציספלטין נכנס לתאי האפיתל בצינורות הפרוקסימליים והדיסטליים, בתוך התא עובר הפעלה מטבולית והופך לפעולה תגובתית מאוד על אברונים של תאים וגרימת שינויים במבנה התא. שינויים אלה יכולים לגרום אפופטוזיס אוטופגיה ואפילו נמק, במינונים גבוהים מאוד. בתגובה לנזק זה, ציטוקינים רבים משתחררים לויקוציטים מגויסים המוביל דלקת המשפיעים על הפונקציונליות של האיבר15. זה מדגיש את החשיבות של הערכת איזה סוג של תאים ניתן למצוא בכליה הפגועה, כתושבים או תאים חיסוניים הסתננו. כאן הראינו כיצד להעריך זאת על ידי cytometry זרימה, באמצעות קווי כתב חיסוני מהונדס זמין כיום (טבלה 1). ציספלטין העלה את אחוז הנויטרופילים(mpo:GFP תאים חיוביים) בכליה 24 שעות לאחר ההזרקה (איור 6). במקרה של דג הזברה, הכליה היא הנישה של HSCs כי להוליד סוגים שונים של תאי דם. עם זאת, גרנולוציטים ומקפאגים רבים מסתובבים בדרך כלל בדם. בדוגמה שלנו, השתמשנו mpo:GFP קו מהונדס המבטאים GFP תחת האמרגן של myeloperoxidase של נויטרופילים52. מחקרים מקוריים של mpo:GFP קו מהונדס הראה ביטוי של myeloperoxidase במצבים שונים של התבגרות נויטרופילים76 אבל אסטרטגיית השער שלנו התמקדה שבר גרנולוציטים הכולל תאים בוגרים המגיעים מהדם52, בדרך זו הניתוח שלנו כולל תאים הסתננו ולא תאים תושב. זה חשוב לשקול בעת בידוד אוכלוסיית התאים הרצויה.
כפי שהוסבר לעיל, אפופטוזיס הוא הסמן הקלאסי ביותר של AKI הקשורות ציספלטין. כאן, הדגמנו פרוטוקול פשוט ללוקליזציה של תאים מתים על ידי מבחני TUNEL. הזרקת ציספלטין הגדילה את מספר התאים האפוטוטיים 24 כ”ס (איור 7). זה יכול להיות לכמת בקלות על ידי ספירת ישירות את התאים המתים מן הרקמה. עם זאת, לזיהוי מוות ספציפי לתאים ניתן להשתמש בנוגדנים נגד התא הרצוי(למשל, תאים צינוריים), או להשתמש בקו כתב מהונדס יחד עם טכניקה זו. בהשוואה לדגם הנגרמת על ידי גנטמיצין של AKI, ציספלטין נראה מודל חמור יותר, שכן אפופטוזיס gentamicin היה גבוה יותר ביום השלישי לאחר הזרקה65.
למרות שיש מגוון רחב של תופעות לוואי, ציספלטין הוא עדיין בשימוש נרחב בטיפול בסרטן, בגלל האפקטיביות שלה נגד סוגים שונים של סרטן, כולל קרצינומות, גידולים בתא הנבט, לימפומות, סרקומות77. Nephrotoxicity מתרחשת בשליש מהחולים בטיפול עם ציספלטין10, ובכך החיפוש אחר אסטרטגיות שיכולות להקטין את האפקט הזה ולהגדיל את הרפופרוטציה הוא הכרחי. אנו מאמינים כי השיטות והטכניקות המוצגות בכתב יד זה יסייעו להבהיר מנגנונים של פגיעה בכליות ולמצוא מטרות טיפוליות שיכולות להיות חיוניות כדי לשפר את איכות החיים של אנשים הסובלים מסיבוכי כליות, בעיקר אלה הקשורים לשימוש בציספלטין.
The authors have nothing to disclose.
מחקר זה נתמך על ידי Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo – FAPESP (2015/21644-9; 2017/05264-7; 2017/05687-5; 2018/20722-4), קונסלהו נאסיונאל דה דזנובולבימנטו סינטיפיקו אי טקנולוג’יקו (CNPq) וקורדנאצואו דה אפרפייסומנטו דה פסואל דה ניבאל סופריור (CAPES), קוד פיננסי 001. אנו מודים למשתפי הפעולה שלנו במעבדה של מריה ריטה דוס סנטוס e Passos-Bueno’s ומתקן זברה-פיש של המחלקה לגנטיקה וביולוגיה אבולוציונית, במכון הביולוגי של אוניברסיטת סאו פאולו. אנו מודים בחביבות לכריסטיאן נאפה דה סוזה ברדה ותרזה ראקל דה אוליביירה רמאלהו על ההערות וההצעות על כתב היד. אנו מעריכים מאוד ומודים למרציו וילאר מרטינס, מצוות המולטימדיה של המכון למדעים ביו-רפואיים, על ההקלטה, המהדורה וההפקה של וידאו זה.
1x PBS | Made by diluting 10 X PBS (prepared in lab) in distilled water | ||
31 G 1.0 cc insulin syringe | BD Plastipak | 990256 | Needle: BD Precision Glide 300110 |
3.5 L Fish tank | Tecniplast | Part of the aquactic system | |
6 well plate | Corning | 351146 | |
10 mM Tris/HCl | Prepared from solid Tris Base (Promega, H5135), adjusted to pH 7.4-8 with HCl (Merck, 1003171000) | ||
50 ml Falcon tube | Corning | 352070 | |
2-3% Agarose | Invitrogen | 16500-500 | Dissolve 2 or 3% agarose (w/v) in 1x PBS, warm until dissolve. |
2% FBS | Gibco | 12657-09 | Dilute 2% (w/v) directly in 1x PBS |
4% Paraformaldehyde | Sigma-Aldrich | P6148-500G | Dissolve 4% PFA (w/v) in warm 1x PBS, mix until dissolve in a hot plate in a fume hood. Aliquot and store at -20 °C |
50% Ethanol | Made by diluting 100% ethanol in distilled water | ||
70% Ethanol | Made by diluting 100% ethanol in distilled water | ||
90% Ethanol | Made by diluting 100% ethanol in distilled water | ||
100% Ethanol | Synth | 00A1115.01.BJ | |
100% Xylene | Synth | 00X1001.11.BJ | |
Cell strainer 40 µm | Corning | 431750 | |
Cisplatin | Blau Farmacêutica | 16020227 | C-PLATIN 1 mg/mL. Store at room temperature. |
Cork board sheet | Obtained from local stationary store | ||
DAPI | Sigma-Aldrich | D9542 | Stock solution 20 mg/ml dissolved in water |
Fine forceps | Fine Science Tools | 11254-20 | |
Flow cytometry tubes | Corning | 352052 | |
Glass slide | Thermo-Fisher | 4445 | |
Histology cassette | Ciencor | 2921 | |
Immuno stain chamber | Ciencor | EP-51-05022 | |
Incubator | NAPCO | 5400 | Set to 37 °C |
Insect pins | Papillon | Model micro15x20 | |
In Situ Cell Death Detection Kit | Roche Diagnostics | 12156792910 | |
Metal mold | Leica Biosystems | 3803081 | |
Micropipette 200-1000 µL | Eppendorf | Use 1 mL tips | |
MS-222 (Tricaine) | Fluka Analytical | A5040-25G | |
NaCl 0.9% | Synth | C1060.01.AG | Dissolve 0.9% NaCl (w/v) in distilled water |
Nail polish | Prefer transparent | ||
Neubauer chamber | Precicolor HGB | ||
Pasteur plastic pipet | United Scientific Supplies | P31201 | |
Paraplast | Sigma-Aldrich | P3558 | |
Petri dish | J.ProLab | 0307-1/6 | 60 and 100 mm |
Plastic spoon | Obtained from local store | ||
Proteinase K | New England BioLabs | P8102 | Diluite from stock 20 mg/ml |
Scissors | Fine Science Tools | 14060-09 | |
Scalpel blade | Solidor | ||
Sponge | Obtained from local store | ||
Trypan Blue | Cromoline | 10621/07 | |
Vannas Spring Scissors | Fine Science Tools | 15000-00 | |
Vectashield Antifade Mounting Medium | Vector Laboratories | H-1000-10 | |
Centrifuge | Eppendorf | 5810R | |
Cytometer | BD Biosciences | FACSCanto II | |
Fluorescence Stereoscope | Zeiss | Axio Zoom.V16 | |
Fluorescence Microscope | Zeiss | AxioVert.A1 | |
Microtome | Leica | Jung Supercut | |
Scale | Ohaus Corporation | AR2140 |