マイクロコイルを用いた超高磁場共鳴顕微鏡(MRM)を用いて、高空間分解能で生体組織を研究するプロトコルを紹介する。マイクロコイルの特徴付けについて、ステップバイステップの説明が提供されています。最後に、イメージングの最適化が植物根で実証されます。
このプロトコルは、MR顕微鏡法(MRM)とも呼ばれる、高解像磁気共鳴画像法(MRI)用に設計された生物学的サンプルと組み合わせた、電磁微小コイルのシグナル対雑音比(SNR)較正およびサンプル調製方法を記述する。これは、前臨床MRI分光計で使用することができる,メディカゴトランカトゥーラ根サンプルで実証.マイクロコイルは、RF共振器のサイズを目的のサンプルのサイズに合わせて感度を高め、データ取得時間の高い画像解像度を可能にします。比較的シンプルな設計により、ソレノイダルマイクロコイルは簡単で安価に構築でき、サンプル要件に簡単に適合させることができます。体系的に、参照溶液を用いて、新しいまたは自家製のマイクロコイルを較正する方法を説明する。キャリブレーション手順には、ヌテネーション曲線を使用したパルスパワーの測定が含まれます。RF分野均質性の推定;標準パルスシーケンスを使用して、ボリューム正規化信号対雑音比(SNR)を計算します。小さい生物学的サンプルのサンプル調製における重要なステップと、磁気感受性の違いなどの可能な緩和因子について考察する。最適化されたソレノイドコイルの用途は、ルートサンプルの高解像度(13 x 13 x 13 μm3、2.2 pL)3Dイメージングによって実証されています。
磁気共鳴画像法は、ヒトから単一細胞1、2、3まで、多種多様な生物学的標本を非侵襲的に画像化する汎用性の高いツールである。医療用画像用途用のMRIスキャナは、通常、1.5 T~3 Tの磁場強度を有する磁石を使用するが、単一細胞用途は、より高い磁場強度1、3、4で画像化される。100マイクロメートル以下の解像度での標本の研究は、磁気共鳴顕微鏡(MRM)5と呼ばれています。しかし、MRMは、他の利用可能な顕微鏡またはイメージング技術(例えば、光学顕微鏡またはCT)と比較して、低信号対雑音比(SNR)に苦しんでいます。SNR 6 を最適化するためにいくつかのアプローチを追求することができます。1 つのアプローチは、より高い磁場強度を使用する方法ですが、相補的なアプローチは、個々のサンプルの信号検出器を最適化することです。後者の場合、検出器の寸法は、目的のサンプルの寸法に合わせて調整する必要があります。直径が≈0.5〜2mmの小さいサンプル(例えば、根組織)の場合、マイクロコイルは、SNRがコイル直径6,7に反比例するので有用である。7.8 x 7.8 x 15 μm3の解像度は、専用のマイクロコイル8を使用して動物細胞で達成されています。さまざまなマイクロコイルタイプが存在し、塗布と組織の幾何学的形状に応じて最も一般的に使用される平面コイルとソレノイドコイルが存在する。平面コイルは表面に近い高感度で、薄いスライスでの用途に役立ちます。例えば、パーフューズ組織をイメージング用に特別に設計された方法が、平面マイクロコイル10について説明されている。しかし、平面コイルは感度の高いフォールオフと明確に定義された基準パルスパワーを持っていません。ソレノイドコイルは、円筒形であり、より広い範囲の用途を有し、より厚いサンプルに好まれる。ここでは、ソレノイドコイルの特性、マイクロコイルMRI用のサンプルを調製するプロトコル、ならびにソレノイドマイクロコイルの較正について説明する(図1A)。
ソレノイドコイルは、サンプルを保持するキャピラリーの周りにコルクスクリューのようにコイル状の導線で構成されています(図1B)。マイクロコイルアセンブリは、エナメル銅線、コンデンサの品揃え、およびコンポーネントをはんだ付けするための適切なベースのみを使用して構築することができます(図1B)。主な利点は、シンプルさと低コスト、単位容積あたりのSNRおよびB1フィールド均質性の点で良好な性能特性と組み合わされる。構造の容易さはコイルの設計および幾何学の速い反復を可能にする。ソレノイドマイクロコイル設計およびプローブ特性評価の具体的な要件(すなわち、様々なコイル幾何学に関するエレクトロニクス、ワークベンチ測定、および分光計測定の理論)は、他の地域7、11、12、13、14に広く記載されている。
ソレノイドコイルは、他の15,16に記載されているガイドラインに従って、所望の寸法の設計規則を念頭に置いて構築することができます。この特定のケースでは、直径1.5mmのキャピラリーを中心にループした直径1.5mmのエナメル銅線から作られたコイルを使用しました。このソレノイドは、回路が作られたベースプレート上に保持され、調整コンデンサ(2.5pF)、可変一致コンデンサ(1.5-6 pF)、銅接続線(図1A、1C)で構成されています。チューニングコンデンサは950 MHzの望ましい共振周波数を達成するために選択され、マッチングコンデンサは50オームのインピーダンスで最大の信号伝送を達成するために選択されます。大きいコンデンサはより細かい調節を可能にする可変である。通常の操作では、プローブベースのコンデンサを使用してチューニングとマッチングが行われます。組み立てられたマイクロコイルは、磁石に挿入できるようにプローブに取り付ける必要があります。システムによっては、追加のホルダーが必要な場合があります。ここでは、Micro5プローブと組み合わせて、ブルカーコンソールAvance III HDと22.3 T磁石の組み合わせを使用します。この場合、プローブの1Hチャンネルに接続するために必要な接続を備えた修正されたサポート挿入物を使用しました(図1A)。
コイルの感受性に一致した設計には、サンプル17に近接している銅コイルから生じる感受性の不一致を減らすために、パーフルオロ化された液体を備えたリザーバが含まれる。プラスチック製のシリンジから作られた貯水池がコイルを囲み、フォーブリンで満たされました。パーフルオロ化された液体はコイルを囲む必要があるので、サンプルに対して利用可能な直径は1mmの外径に減少する。サンプル交換を容易にするために、サンプルは外径1mm、内径700μmのキャピラリーで調製した。サンプル調製に必要なツールを図 2Aに示します。
基本的な実験MRパラメータは、勾配システム、フィールド強度、およびコンソールを含む、使用されるシステムのハードウェアに大きく依存しています。システムの性能を説明するためにいくつかのパラメータを使用することができ、その中で90°パルス長と電力 、B1-均質性および単位体積当たりのSNR(SNR /mm3)が最も実用的に関連しています。SNR/mm3 は、同じシステム18上の異なるコイルの性能を比較するのに便利です。システム間でハードウェアの違いが存在する場合がありますが、ベンチマーク・プロトコルの均一な適用により、システム・パフォーマンスの比較も容易になります。
このプロトコルは、キャリブレーションとサンプル調製に焦点を当てています。ソレノイドマイクロコイルの性能の段階的な特性を示しています: 90°パルス長または電力を較正;RF-フィールドの同質性を評価する;単位体積あたりの SNR の計算 (SNR/mm3) を計算します。ファントムを用いた標準化されたスピンエコー測定は、コイル設計の比較を容易にするため、個別のアプリケーションの最適化を可能にする。マイクロコイルに特異的な幻影および生物学的試料試料調製物について説明する。このプロトコルは、市販のマイクロイメージングシステムを備えた任意の適切な狭孔(≤60mm)垂直磁石に実装することができる。他のシステムでは、ガイドラインとして機能し、いくつかの調整で使用することができます。
MRI測定のための生物学的標本調製は、通常、検体が可能な限りそのままの画像化されているため、あまり広範囲ではない。しかし、生体組織の空気空間は、磁気感受性の違いのために画像のアーティファクトを引き起こす可能性があります 19.磁界強度が20に増加すると効果が高まる。したがって、空気空間は高いフィールド強度で避けるべきであり、これは組織の周りの空気と組織構造内の空気空間の除去を避けるために流体中のサンプルの浸漬を必要とする可能性があります。具体的には、マイクロコイルが採用される場合、所望のサンプル組織の切除が必要であり、続いて適切な流体に浸す必要があります。その後、サンプルを切り取り前の毛細血管に挿入し、最後に毛細管を毛細血管ワックスで密封します。接着剤の代わりにシール剤としてワックスを使用すると、封止または代替物、試料が容易に抽出され得る。この手順は、 メディカゴトランカトゥーラ、 小さな豆類植物の根に実証されています。このプロトコルの利点は、MRI測定中にサンプルが破壊されないので、光学顕微鏡でMRIデータの後続の共登録の可能性です。
提示されたプロトコルは、その場での測定における高い空間分解能に適しており、より精巧な設計により、生命維持システムに関連する課題に対処する必要がある生体内サンプルのイメージングが可能になる可能性があります。
このプロトコルは、多くの材料および地質学的サンプルがT2緩和時間を大幅に短くし、ここで使用される配列では画像化できないため、生物学的サンプルに最も適しています。高サンプルの磁気感受性不均一性を示す一部の生体組織でさえ、その効果が磁場強度24と相関するため、超高磁場での画像化が困難な場合がある。このプロトコルは、新しいコイルに役立つだけでなく、潜在的な問題のトラブルシューティングや診断にも役立ちます。新しいサンプルまたは未知のサンプルをテストする場合、このプロトコルは、実験のセットアップが仕様に従って機能していることを確認するために、参照ソリューションに事前に実行することができます。分光計は、アーティファクトや誤動作の原因として除外できるため、トラブルシューティングに役立ちます。さらに、プローブの調整およびマッチングコンデンサをマイクロコイルに典型的な値に設定します。
最初の実験で信号が記録されていない場合、ローカライザースキャンの視野を拡大して、サンプルが見られるかどうかを確認することができます。次に、コイルが正しく調整されているかどうかを再確認し、別のローカライザースキャンを試みます。コイルは、意図しない共振モードを追加する可能性があり、その場合、正しいものを決定する必要があります。まだ画像が得られない場合は、マイクロコイルアセンブリ内の位置を確認するためにサンプルを取り外し、サンプルが無傷であることを確認します(すなわち、シール内の気泡や漏れは存在しません)。最後に、試料はPFDの代わりに水で調製することができる。ローカライザースキャンでサンプルが検出可能な信号をほとんど与えなかった場合、キャピラリー内の周囲の水はまだ検出することができます。
マイクロコイルはサンプルに近いのが理想的なため、 図7Bに示すように、空気とワイヤの磁気感受性の差により、さらなる信号損失が生じる可能性があります。潜在的なアーティファクトには、空間的な誤マッピングや異常な信号強度の変動が含まれます。特に、グラディエントエコー型パルスシーケンスは、この不均一な信号損失の影響を受けます。このため、フッ素液(FomblinまたはFC-43)にワイヤを沈め、感受性に一致したコイルを提示した。このプロトコルに含まれる B1 推定法は 、B1 感受性の違いがコイルアセンブリの設計に感受性マッチング戦略を含めることを保証するかどうかを判断するのに役立ちます。感受性一致コイルを構築するための別のアプローチは、感受性一致電線25を使用することです。さらに、コイルによる感受性の問題だけがこのアプローチで対処されます。サンプル内の感受性の不一致(例えば、空気空間による)は依然として困難である。
エアポケットまたは気泡は、空気と流体または試料19 の界面での感受性の違いによって引き起こされる広範な信号損失を引き起こす実験的課題を提起する(図5A)。サンプル調製に成功する上で重要な点は、サンプルと毛細血管の両方の沈み込みである。ただし、小さな気泡でも、特にグラデーションエコータイプのシーケンスでは信号損失を引き起こす可能性があります。移動式気泡は、サンプルに接触するまで毛細血管を通って移動することができます。これらの効果のいくつかは、一方の端が他方よりも高くなるように毛細管をわずかに傾けることによって緩和することができます。傾斜により、サンプルを邪魔することなく、潜在的な気泡が上端に保持されます。脱水は大きな気泡を形成する可能性がありますので、毛細血管ワックスが良好なシールを形成することを確認することも重要です。
サンプル内部の空気空間については、PFDを用い、細胞膜26を貫通しない一方で細胞間空気空間を満杯にした。しかし、このアプローチでも、すべての空域を取り外す方法はできませんでした。さらに、このアプローチは、可能な限り非侵襲的にシステムを研究したいという願望のために通常好ましくない追加の薬剤が必要であることを意味します。
毛細血管の円筒形は、特に生検や生きている根材料の研究プロセスなど、腐敗に対して脆弱な組織に対して、灌流のセットアップが実行可能であるべきであることを意味します。2つのステップは、灌流のセットアップを実現することができます。まず、毛細管の両側に媒体供給管とドレインチューブを接続するだけで、チェモスタットを作り出すのに十分であろう。第二に、サンプル毛細血管へのインデントの付加は、流れの方向に対してサンプルを所定の位置に保持することができる。これは、平面マイクロコイル10に対して公開されたプロトコルに似ています。
MRイメージングの非侵襲的性質と、本プロトコルで使用される不活性液体(PFDまたはFomblin)と組み合わせることは、実験終了後、さらなる研究のためにそれらの毛細血管からサンプルを除去してもよい。組み合わせには、光学顕微鏡または電子顕微鏡およびその他の破壊的なイメージング技術が含まれます。我々は最近、 メディカゴトルンカチュラ 根結節27の光学顕微鏡との組み合わせを実証した。
超高磁場NMR分光計で専用マイクロコイルを用いた植物材料のイメージング方法を実証しました。比較的大きなサンプル量は、良好なRF均質性を有する高解像度で研究することができる。さらに、分光イメージングは、それ以外の場合よりも高い解像度で行うことができる。マイクロコイル設計をサンプルに適合させることは、コイル性能特性を決定する効率的な方法によって促進される。ソレノイドコイルアプローチは、動物組織を含む植物以外の他のサンプルにも容易に適用され得る。
The authors have nothing to disclose.
950 MHzの機器での実験は、オランダのNWO出資の国家ロードマップ大規模施設であるuNMR-NL(プロジェクト184.032.207)によって支えられました。R.S.はバイオソーラーセルズコンソーシアムプロジェクトU2.3によってサポートされました。J.R.K.はオランダ磁気共鳴研究学校(NMARRS)大学院[022.005.029]の支援を受けた。デフェン・シェンとトン・ビッセリングが メディカゴ・トランカトゥーラ のサンプルを提供してくれたことに感謝します。さらに、クラルチェ・フーベン、マリー・ルノー、ヨハン・ファン・デル・ズワンのuNMR-NL施設での技術サポートに感謝します。また、フォルカー・レーマン、ヘニー・ヤンセン、ピーター・デ・ワールドの技術支援に感謝します。フランク・ヴェルゲット、ジョン・フィリッピ、カルシック・B・サイ・サンカル・グプタの助言に感謝します。最後に、ビデオにナレーションを提供してくれたジェシカ・デ・ルイターに感謝します。
Reference solution preparation | |||
CuSO4 | Sigma-aldrich | 469130 | Crystalline powder for creating reference solution |
D2O | Sigma-aldrich | 151882 | Liquid used to prepare reference sample |
Weigh Scale | Sartorius | PRACTUM513-1S | Scale for weighing compounds |
Sample preparation | |||
Capillary 1000 μm (Outer diameter) | Hilbenberg GmbH | 1408410 | Sample capillaries |
Capillary wax | Hampton Research | HR4-328 | Solid wax used to seal samples |
Disposable Scalpel | Swann-Morton | No. 11 | Used to excise samples |
Perfluorodecalin | Sigma-aldrich | P9900 | Liquid used for submerging sample |
Stereo Microscope | Olympus | SZ40 | Tabletop binocular microscope |
Syringe | Generic | – | Used to apply PFD and manipulate the sample |
Vacuum Pump | Vacuubrand | MZ2C | Two-stage membrane vacuumpump used for removing air pockets from samples. |
Wax pen | Hampton Research | HR4-342 | Handheld wax pen used to melt and apply capillary wax to samples |
Imaging Hardware | |||
22.3 T Magnet | Bruker GmbH | 950 US2 | Narrowbore superconducting magnet |
Air cooler | Bruker GmbH | – | Used to regulate probe temperature |
Console | Bruker GmbH | Avance III HD | Controls operation of the spectrometer |
Micro5 gradient coils | Bruker GmbH | Mic5 | Removable gradient coils mount on the Micro5 probe body |
Micro5 Probe body | Bruker GmbH | Mic5 | Holds microcoils and gradient coils |
RF microcoil | Home-built | – | contains Fomblin |
Vector Network Analyzer | Copper Mountain Technologies | TR1300/1 | Used to perform S11 reflectance test, frequency range 300kHz to 1.3 GHz |
Water cooler | Bruker GmbH | BCU-20 | Open loop watercooling to dissipate heat from gradient coil operation. |