يصف هذا البروتوكول الجيل الجراحي لأورام البنكرياس التقويمية والهضم السريع لأورام البنكرياس المعزولة الطازجة. بعد الهضم ، يمكن استخدام الخلايا المناعية القابلة للاستمرار لمزيد من التحليل المصب ، بما في ذلك تحفيز الجسم الحيوي السابق للخلايا التائية للكشف عن الخلايا الخلوية عن طريق قياس التدفق.
في نماذج الجسم الحيوي لسرطان البنكرياس توفير أدوات لا تقدر بثمن لدراسة ديناميات المرض, تسلل المناعي والاستراتيجيات العلاجية الجديدة. ويمكن اجراء نموذج المريدين العظام علي الأفواج الكبيرة من الفئران المناعية في وقت واحد ، غير مكلفه نسبيا ويحافظ علي البيئة المجهرية الانسجه المتشابهة. ويوفر القياس الكمي لتسلل الخلايا التائية والنشاط السام للخلايا داخل الأورام التقويمية مؤشرا مفيدا للاستجابة المضادة للفم.
يصف هذا البروتوكول منهجيه التوليد الجراحي لأورام البنكرياس التقويمية عن طريق حقن عدد قليل من الخلايا السرطانية المتزامنة التي أعيد تعليقها في غشاء الطابق السفلي 5 μL في البنكرياس مباشره. تاخذ الفئران التي تحمل الأورام التقويمية حوالي 30 يوما للوصول إلى نقطه النهاية ، وعندها يمكن حصاد الأورام ومعالجتها لتوصيف نشاط خلايا T التي تتسلل إلى الورم. الهضم الانزيمي السريع باستخدام كولاجيناز و DNase يسمح للتعليق خليه واحده ليتم استخراجها من الأورام. يتم الحفاظ علي مقومات البقاء وسطح الخلية من الخلايا المناعية المستخرجة من الورم. ولذلك ، فانه من المناسب للتطبيقات المتلقية للمعلومات متعددة ، بما في ذلك الفرز خليه بمساعده التدفق من الخلايا المناعية للثقافة أو استخراج RNA ، تحليل تدفق الخلوي لسكان الخلايا المناعية. هنا ، ونحن وصف التحفيز الجسم السابق من السكان الخلية T للقياس الكمي خلوية داخل الخلايا (Ifnγ و TNFα) والنشاط التحبيب (CD107a) كمقياس للخلايا الكلية. وقد تم تحفيز الأورام الكاملة بالورم مع خلات ميريستات الفطرية و ionomycin لمده 5 ساعات ، في وجود الأجسام المضادة لCD107a من أجل إنتاج اوبريجوليت السايسيسين والتحبيب. تم اجراء أضافه brefeldin A و مونينسين لنهائي 4 ح لمنع النقل خارج الخلية وتعظيم الكشف السايسيسين. ثم تم اجراء تلطيخ خارج وداخل الخلوية من الخلايا لتحليل التدفق الخلوي ، حيث تم تحديد نسبهifnγ +، tnfα + وCD107a + + وCD8 + T الخلايا.
توفر هذه الطريقة قاعده انطلاق لاجراء تحليل شامل لبيئة الورم المجهرية.
هذه الطريقة التفاصيل ، من البداية إلى النهاية ، والعملية الجراحية لتوليد أورام البنكرياس العظام باستخدام كميه الحد الأدنى من المواد الخلوية والتفكك السريع اللاحقة من الأورام الراسخة لتحليل التدفق الخلوي شامله لسكان الخلايا المناعية ، بما في ذلك تحليل ex الجسم الخليوي وظيفة
سرطان الغدة السرطانية في البنكرياس (PDAC) هو سرطاني العدوانية مع 8 ٪ فقط من المرضي الذين يعيشون 5 سنوات1. بما ان اقل من 20 ٪ من المرضي مؤهلون لاستئصال الجراحية2، عينات المريض الطازجة ليست متاحه بسهوله للبحوث ، التالي في نماذج الجسم الحيوي توفير الاداات الاساسيه للتحقيق في هذا المرض. هناك نماذج متعددة murine من PDAC: العظام ، تحت الجلد ، المحورة وراثيا ، الحقن الوريدي والمرضي المشتقة (PDAC) ، وصفت علي نطاق واسع هنا3. يسمح نموذج الهجاء الموصوف هنا بحقن خلايا PDAC المتزامنة في بنكرياس الفئران المناعية. وهذا يمكن ان يؤديها في أفواج كبيره من الفئران من النوع البري أو متحولة ، التالي يوفر نموذج فعاله من حيث التكلفة ومتسقة للمقارنة بين العوامل العلاجية. والاهم من ذلك ، فان نموذج الهجاء يوفر البيئة المجهرية لنمو الخلايا السرطانية وينتشر في ايدينا والآخرين4 إلى المواقع ذات الصلة سريريا (علي سبيل المثال ، الكبد) ، مما يجعلها أكثر ملاءمة سريريا من النماذج تحت الجلد أو المستحثة كيميائيا. تعرض الأورام التقويمية الملامح الرئيسية ل PDAC ، مثل تفاعل قوي من البلاستيك مع وفره من الخلايا الليفية وترسب مصفوفة خارج الخلية5. النماذج المحورة وراثيا من PDAC هي المعيار الذهبي للنموذج murine والأكثر شيوعا هو نموذج الفيلق ، الذي يعبر عن متحولة KrasG12D/+ و Trp53R172H/+ تحت البنكرياس الخاص pdac-1-cre المروج6. وتستعرض المؤسسة الاضافيه لفيلق حماية كوسوفو وغيرها من نماذج pdac هنا7. الفئران الفيلق تطوير تلقائيا أورام البنكرياس مع تطور المرض الذي يحاكي بإخلاص ملامح الإنسان PDAC6. ومع ذلك ، النسبة لجميع النماذج المحورة وراثيا ، وبرنامج تربيه مكلفه ، وتطور الورم هو متغير ، التالي غالبا ما يتطلب أفواج كبيره من الفئران. تستخدم نماذج PDX الخلايا السرطانية المشتقة من المريض أو القطع التي يتم زراعتها بعد ذلك اما بالتنظير أو في كثير من الأحيان جلد في الفئران المناعية. نماذج الطعم الغريب توفر أدوات مفيده لفحص المركبات العلاجية وحساب تغاير المريض. ومع ذلك ، فانها لا توفر بيئة مناعية كامله ، التالي الحد من تطبيقاتها8،9.
مره واحده المنشاة ، والأورام التقويمية عاده ما يستغرق حوالي 1 شهر أو أكثر لتنمو (اعتمادا علي خط الخلية المستخدمة) وتشكل الأورام الكبيرة التي يمكن ان تكون بسهوله التصوير بالموجات فوق الصوتية أو التصوير بالرنين المغناطيسي لتتبع التقدم وتحديد فعاليه العلاج4،5،10. ومع ذلك ، مره واحده في النمو المتسارع ، والمرحلة الاخيره من نمو الورم يمكن ان تكون سريعة ، لذلك بدات معظم نظم العلاج في وقت مبكر نسبيا (علي سبيل المثال ، 14 يوما)11،12. يلعب الجهاز المناعي دورا حاسما في تطوير الورم ، بما في ذلك في PDAC ، والذي يتميز بورم المناعة التسلل مع ندره نسبيه من الخلايا T وكثرة وجود خلايا النخاع13. وجود عال من [ت] خلايا في [بداك] يمنح تكهن جيده14,15. ومع ذلك ، كعوامل واحده ، ومثبطات نقاط التفتيش المناعية التي تخفف من كبت المناعة الخلية T ، مثل مكافحه CTLA-416 ومكافحه PD-L117، لم تظهر الفائدة السريرية في المرضي pdac ، علي الأرجح لان الخلية الكلية t التفاعلية منخفضه جدا. ومع ذلك ، فان العوامل التي الاستجابات الخلية الرئيسية T ، مثل المضادة لCD40 ، يمكن التغلب علي مكافحه PD-L1/ctla-4 المقاومة18،19 والتطعيم مع جنرال موتورز-السائل النخاعي-سيكريتينغ اللقاح pdac (gvax) يمكن ان تزيد من والاستمناع الأورام pdac20، مشيرا إلى ان
الحرجة لاستجابه الخلايا T انتيتورال هو التعرف علي المستضدات المشتقة من الورم عبر مستقبلات الخلايا التائية (TCR) والإنتاج اللاحق من السايتوكينات السامة للخلايا والحبيبات. في حين يمكن تحديد التعرف علي مستضد الخلية T بواسطة تسلسل TCR ، فان هذا النهج مكلف ويستغرق وقتا طويلا. ومع ذلك ، القياس الكمي للورم التسلل الخلايا الفرعية T يوفر مؤشرا جيدا لاستجابه مضاده للتوشف. المزيد من الفحص لنشاط الخلية T ex الجسم الفيفو من حيث التحبيب ، وإنتاج السايتوكين وغيرها من العوامل السامة للخلايا يوفر تحليل وظيفي أعمق. ويمكن اجراء هذه الاختبارات علي عينات الأورام الطازجة والعديد من المعلمات من وظيفة الخلية T يمكن قياسها بسرعة عن طريق تدفق الخلوي.
CD8 + و الخلايا التائية + T تنتج السايتوكينات مثل Ifnγ و TNFα لتحفيز استجابه مناعية21. IFNɣ يحفز MHCI الحاملة علي الخلايا المستهدفة ، ويدفع التمايز وتجنيد الخلايا المناعية والإيدز موت الخلايا. Ifnγ الإنتاج بواسطة خلاياCD8 + T يتميز جيدا ليكون جزءا من استجابه انتيتورال ويرتبط مع الانحدار الورم22,23. TNFα هو السايسيسين التهابيه الأخرى التي تنتجها كل منCD8 + و الخلاياالتائية . فانه يعزز التنشيط المعتمدة علي TCR وتكاثر الخلايا T ، ومساعده الاستجابة المضادة للتوشف. عند مشاركه TCR ، يمكن للخلاياCD8 + T السامة للخلايا الخضوع لتحبيب ، حيث يتم تحرير الخلايا الشحمية التي تحتوي علي جزيئات سامه للخلايا في المشبك المناعي للتسبب في تدهور الخلايا المستهدفة21. وتشمل هذه الجزيئات تثقيب ، وهو البروتين الذي يربط إلى غشاء الخلية المستهدفة ، وتشكيل المسام التي ثم تعطيل سلامه الغشاء والسماح انتشار21 أو ندره المحببات24 من الجزيئات السامة للخلايا الأخرى ، مثل granzyme ب ، مباشره في سيتوتوبلاسما الخلية المستهدفة. غرانزيم B هو الانزيم البروتيني الذي يسن تحلل البروتينات المتعددة داخل الخلية المستهدفة ، مما يؤدي إلى وفاه الخلية21. ويتطلب الإفراج عن هذه الجزيئات كثرة التنظير الباطني علي سطح الخلية ، حيث يتم دمج علامة التنظير الباطني CD107a (المعروف أيضا باسم مصباح-1) بشكل عابر في غشاء الخلية25.
ويتطلب قياس إفراز السايسيسين بواسطة الخلايا التائية عزلها بواسطة فرز الخلايا بمساعده التدفق أو اختبارات الفصل القائمة علي الخرزة ، والتي لا يمكن تنفيذها بسهوله علي عدد كبير من العينات في وقت واحد. ومع ذلك ، فان قياس السايتوكينات داخل الخلايا لا يتطلب اي خطوات سابقه للعزل ، ويمكن تنفيذها بسهوله علي عينات متعددة في وقت واحد ، مما يسمح باتباع نهج الانتاجيه الأعلى. كما يفرز بسرعة السايتوكينات الخلايا T ، يمكن ان تكون المستويات داخل الخلايا غير قابل للكشف ، التالي فان خليه T يتطلب التحفيز لزيادة إنتاج السايتوكين القاعدية. لتقييم إنتاج السايسيسين التي يحركها مستضد ، يجب ان يتم تقديم مستضد المعترف بها من قبل TCR إلى الخلية T من قبل APC تستعد في المختبر. وفي الحالات التي لا تعرف فيها الخصوصية الخاصة بالمولد ، يلزم اتباع نهج محفز واسع النطاق. يمكن محاكاة التحفيز TCR باستخدام الخرز المضادة لCD3/28 التي توفر كلا من التنشيط TCR والتزاوج ، الذي يحفز إنتاج السايسيسين وانتشار. ومع ذلك ، فان البديل الأكثر فعاليه من حيث التكلفة هو استخدام النقد الذاتي و ionomycin ، الذي ينشط معا علي نطاق واسع مسارات الإشارات التي تؤدي إلى توليف وإطلاق السايتوكينات داخل الخلايا. علي وجه التحديد ، والنقد الخاص ينشط البروتين كيناز C (PKC) و ionomycin يثير الخلايا Ca2 + الأيونات ، مما يؤدي إلى زيادة الخلايا الإشارات. من أجل الحفاظ علي المحتوي داخل الخلايا من السايتوكينات ، يمكن ان يقترن هذا التحفيز بشكل فعال مع مثبطات البروتين والنقل brefeldin A و مونينسين ، والتي تمنع البروتينات في Golgi التالي منع الإفراج خارج الخلية. استخدام نقدا/ionomycin هو وسيله راسخة لتحفيز الخلايا T وهناك علاقة قويه بين الخلوية الصادرة وخلايا السايتوكينات26. التحفيز من الخلايا T مع نقدا و ionomycin أيضا يزيد من الاتجار يحلول إلى غشاء الخلية ، التالي CD107a يصبح بشكل عابر متكاملة علي سطح الخلية قبل أعاده تدويرها في الخلية. بما في ذلك الأجسام المضادة لCD107a اثناء التحفيز ، فمن الممكن استخدامه كعلامة من النشاط التحبيب25.
هذه الطريقة بسرعة بهضم الأورام لتوفير تعليق خليه واحده. عند هذه النقطة ، يمكن ان يكون السكان الفردية ملطخه مباشره لقياس التدفق الخلوي أو تنقيه بواسطة أساليب المصب: تدفق الخلايا بمساعده الفرز أو الفصل المغناطيسي حبه. اعداد تعليق خليه واحده لتحليل التدفق الخلوي يسمح تحليل عاليه الانتاجيه من العديد من الخلايا المناعية وعلامتاتها الظاهرية ، وتوفير كميات دقيقه من رقم الخلية المناعية والنمط الظاهري.
وأخيرا ، فان بروتوكول الهضم الموصوف هنا يمنع فقدان علامات سطح الخلية ويحافظ علي سلامه الخلايا المناعية ، مما يسمح للخلايا المناعية بالخضوع لمزيد من خطوات تنقيه الخلايا والثقافة حسب الحاجة. ومع ذلك ، لم يتم اختبار هذه الطريقة لاشتقاق الخلايا الظهاريه من هذا الهضم.
في نماذج الجسم الفيفو من سرطان البنكرياس توفير أدوات لا تقدر بثمن لفهم تطور المرض وتقييم المداواة الجديدة الأهداف3. نموذج المجسم علي وجه الخصوص هو نموذج فعاله من حيث التكلفة واستنساخه التي يمكن تطبيقها في أفواج كبيره من الفئران في وقت واحد4,27. كما يوفر نموذج المجسم البيئة المجهرية والنظام المناعي السليم لنمو الورم ، مما يجعله أكثر ملاءمة من النماذج تحت الجلد والطراز PDX. ومع ذلك ، وجدنا ان بعض عناصر التسلل المناعي يمكن ان تختلف بين نموذج الجهاز التقويمي والفئران الفيلق ، ونموذج murine الذهب القياسية10. أحد الأسباب لهذا يمكن ان يكون نمو الورم المتسارع ينظر في نموذج الهجاء. وقد تم وصف المزيد من الاختلافات في كثافة الخلايا المناعية الفرعية بين المجسمات والنماذج تحت الجلد3,28. ولذلك ، وعلي الرغم من ان نموذج الفيلق المحور وراثيا أكثر تكلفه ومتغير6، ينبغي التحقق من النتائج الرئيسية في مجموعه صغيره من فئران فيلق حماية كوسوفو حيثما أمكن ذلك.
يعد اعداد الخلايا السرطانية للجراحة التقويمية خطوه حاسمه في البروتوكول. يجب ان تكون الخلايا دائما في مرحله السجل من النمو والميكوبلازما-وخاليه من العدوى. يجب تاجيل الجراحة التقويمية إذا كان هناك اي مخاوف بشان نمو الخلايا السرطانية. استخدام غشاء الطابق السفلي يحسن معدل حدوث الورم علي الخلايا بالحقن دون ذلك29 ويقلل من تسرب الخلايا التالي انتشار البريتوني27. ومع ذلك ، مره واحده معلقه في غشاء الطابق السفلي ، يجب حقن الخلايا السرطانية بسرعة (في غضون 2 ساعة) لتجنب اي فقدان الخلايا. من المرجح ان يكون عدد الخلايا السرطانية المطلوبة لتوليد الأورام معتمدا علي الخلايا ، وينبغي اختبار مجموعه من أرقام الخلايا (علي سبيل المثال ، من 100 – 100,000) والتي قد تحدد أيضا الوقت اللازم للوصول إلى نقطه النهاية. فمن المرجح ان يكون هناك هامش خطا عند اعداد 1,000 خلايا لكل ماوس للحقن. لذلك ، إذا كانت هناك حاجه لعده أيام من الجراحة ، يجب ان ينتشر علاج المجموعات علي قدم المساواة عبر الأيام للسيطرة علي الآثار الدفعيه. يمكن تعديل معظم الخطوات الجراحية اعتمادا علي تفضيلات; ومع ذلك ، يجب الحرص علي عدم إزعاج غشاء الطابق السفلي عند استبدال البنكرياس في تجويف البطن أو إغلاق الجدار الصفاقي. يمكن ان يسبب تسرب غشاء القبو نمو الخلايا السرطانية علي الجدار الصفاقي ، والتي تشكل بسرعة ويمكن ان يؤدي إلى الاضطرار إلى التضحية الحيوانية في وقت سابق.
ومن الناحية المثالية ، ينبغي هضم أورام البنكرياس بسرعة بعد الحصاد واعدادها لتحفيز الجسم السابق علي الفور. ومع ذلك ، قد لا يكون هذا ممكنا إذا كان هناك دفعه كبيره من الأورام للحصاد ، في هذه الحالة يجب ان تبقي الأورام علي الجليد وهضمها علي دفعات. وقد تبين ان نوع وتركيز وطول التعرض لانزيمات الجهاز الهضمي تؤثر علي عدد كبير من جزيئات السطح علي الخلايا المناعية30،31،32. ال [هضم تيم] أيضا عمدا قصيرة ان يحد خليه موت33. يمكن تجميد الخلايا المهضومة في وسط التجميد للتخزين علي المدى الطويل. ومع ذلك ، فان بعض فقدان الخلايا تحدث عند الذوبان. عمليه الهضم يمكن ان تكون اقل من الأمثل إذا قطع الورم ليست مكعبات بما فيه الكفاية قبل حضانة كولاجيناز وهذا سيكون واضحا كما ستبقي قطع الورم الثابت في تصفيه بعد الهضم. يمكن خفض تركيز كولاجيناز إذا كان يعمل مع البنكرياس الصحي أو الأورام في مرحله مبكرة. تقارير عن استخراج خلايا الاقنيه البنكرياس صحية استخدام تركيزات اقل بكثير34. وهناك درجه عاليه من الموت الخلايا الظهاريه المتوقع خلال الهضم; ومع ذلك ، يجب ان تتسامح الخلايا المناعية العملية جيدا. توجد طرق بديله لعزل الخلايا الظهاريه القابلة للحياة للنمو العضوي35 أو للحفاظ علي الانسجه المعمارية36.
ويمكن اجراء تعديلات علي بروتوكول التحفيز بسهوله ، اعتمادا علي القراءة المطلوبة والخلية المناعية تحليلها (علي سبيل المثال ، الضامة أو الخلايا B). استخدام الكواشف عموم التحفيز نقدا/ionomycin لا يميز لتحديد TCR-antigen ، مما يجعلها مفيده عندما لا يعرف مستضد. ومع ذلك ، يرتبط إنتاج ifnɣ بشكل وثيق مع المشاركة TCR37 وكل ifnɣ وإنتاج tnfα حاسمه في الاستجابات روبوطيه pdac38. يعكس التحفيز الكهربي الكهربي/ionomycin القدرة القصوى للخلايا التائية لإنتاج السايتوكينات ، والتي قد تنتجها خلايا T داخل البيئة المجهرية للورم. ويمكن قياس الإنتاج الذاتي دون الحاجة إلى التحفيز ؛ ومع ذلك ، قد تكون مستويات اقل بكثير أو غير قابل للكشف. هناك طرق بديله لتحفيز الخلايا T: المضادة لCD3/28-الخرز المغلفة ، والتي لا تتطلب أيضا مستضد أو في الواقع غيرها من الخلايا المناعية السكان. والفائدة من هذه الطريقة هي السماح بالقياس الكمي لإنتاج السايسيسين بواسطة مجموعات فرعيه معينه من خلايا T دون الحاجة إلى أساليب الفصل. علامات أخرى من السمية الخلوية (granzyme ب و تثقيب A) ، والنشاط (IL-2) أو كبت المناعة (آيل-10) يمكن أيضا ان تضاف21. ومع ذلك ، لا تتوفر الأجسام المضادة عاليه الجودة لقياس التدفق الخلوي للكشف عن جميع السايتوكينات والعوامل ذات الاهميه. ولذلك ، إذا كانت هناك تطبيقات أخرى مثل اليسا المطلوبة التحفيز يمكن ان يؤديها دون ادراج brefeldin A/مونينسين ، مما يسمح بإطلاق السايسيسين في supernatant. ومع ذلك ، من الجدير بالذكر ان هذا سيسمح بالإفراج عن الخلية الكلية ولن يكون من الممكن تحديد اي من الخلايا المساهمة.
Ifnγ الإنتاج هو السمة المهيمنة لاستجابه الخلية T انتيتورال ، وغالبا ما تستخدم كبديل للاعتراف الاعتراف مستضد37،38. الأخرى في الكائنات المجرية التي تحدد بدقه أكثر الاستجابات الخاصة antigen استخدام الخلايا السرطانية التعبير عن مستضد معروفه ، مثل اوفالبومين أو SV40. يمكن بعد ذلك استخدام مستضد العالمية السابقة المجرية لاختبار التعرف علي الخلايا T أو في تركيبه مع الماوس المضيف المقيدة TCR. بدلا من ذلك ، حيث مستضد غير معروف ، يمكن اجراء القياس الكمي من التوسع الخلوية T بواسطة التسلسل tcr السائبة ، أو أكثر مؤخرا أحاديه الخلية التسلسل tcr39،40. لفهم تماما حاله استجابه الخلية T داخل الفم, علامات تدل علي الإرهاق أو مستقبلات المثبطة وينبغي أيضا ان تقاس بما في ذلك: CTLA-4, PD-1, تاخر-3, TIM3, 2B4. فضلا عن علامات الخلايا T المستجيب (CD44hi, CD62lo) والنشاط التكاثري, Ki67 + أو csfe التخفيف41,42,43,44. وعموما ، فان نموذج الهجاء يوفر منصة مفيده لاختبار الاستراتيجيات العلاجية بسرعة ، ولا سيما التي قد تعدل استجابه الخلايا التائية المضادة للفم ، والتي يمكن التحقق منها بعد ذلك علي مجموعه أصغر من المعدلة وراثيا ، الفيلق ، الفئران.
The authors have nothing to disclose.
ونود ان نشكر دائره الفنيين الحيوانيين والدكتور الزبيتا تالاروفيتشي (معهد بارتس للسرطان ، جامعه الملكة ماري في لندن ، لندن ، المملكة المتحدة) علي مساعدتهم خلال جراحه العظام. ونود أيضا ان نشكر الدكتورة جنيفر مورتون (معهد بيرسون لبحوث السرطان ، غلاسكو ، المملكة المتحدة) لتوجيهها في التقنية الجراحية ، الدكتورة كريستينا غيللي (معهد بارتس للسرطان ، جامعه الملكة ماري في لندن ، لندن ، المملكة المتحدة) لنصيحها بشان هضم الأورام والدكتور فأبيان ماككلاهان (معهد بارتس للسرطان ، جامعه الملكة ماري في لندن ، لندن ، المملكة ونود أيضا ان نشكر مجلس البحوث الطبية ، وصندوق بحوث سرطان البنكرياس (PCFR) والعمل سرطان المبيض الذين مولوا هذا البحث.
6/0 gauge coated vicryl absorbable sutures | Ethicon | W9500T | |
70 μm pore-size cell strainer | Fisher Scientific | 11597522 | |
9 mm Clay Adams clips | VetTech Solutions | IN015A | |
anti-CD107a PE (clone 1D4B) | Biolegend | 121612 | 1:100 to culture media |
anti-CD16/CD32 | BD Biosciences | 553142 | Use at final dilution 1:200 |
anti-CD3 PerCP eFluor710 (clone 17A2) | Biolegend | 46-0032 | Use at final dilution 1:50 |
anti-CD4 FITC (clone GK1.5) | eBioscience | 11-0041 | Use at final dilution 1:100 |
anti-CD45 Brilliant Violet 605 (clone 30-F11) | Biolegend | 103140 | Use at final dilution 1:200 |
anti-CD8 Brilliant Violet 421 (clone 53-6.7) | Biolegend | 100738 | Use at final dilution 1:100 |
anti-IFN-gamma PE/Cy7 (clone XMG1.2) | Biolegend | 505826 | Use at final dilution 1:50 |
anti-TNF-alpha Alexa Fluor 647 (clone MP6-X) | Biolegend | 506314 | Use at final dilution 1:50 |
BD Matrigel Basement Membrane Matrix High Concentration | BD Biosciences | 354248 | Aliquot on ice and store in -20 °C |
Bovine Serum Albumin (BSA) | Sigma-Aldrich | A4503 | |
Cell Stimulation Cocktail (500x) (phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) and ionomycin) | eBioscience | 00-4970-03 | 1x Final concentration PMA 0.081 μM, ionomycin 1.34 μM |
Clay Adams Autoclip Applier | VetTech Solutions | IN015B | |
Clay Adams Autoclip remover | VetTech Solutions | IN015B | |
Collagenase Type V from Clostridium histolyticum | Sigma-Aldrich | C9263 | 2 mg/mL in media |
Dimethyl sulphoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D2650-100mL | |
DMEM High glucose (4.5 g/L) with L-Glutamine | PAA | E15-810 | |
DNase (Deoxyribonuclease I from bovine pancreas Type II-S) stock 10 mg/mL in 0.15 M NaCl | Sigma-Aldrich | D4513 | Final concentration in digestion media 0.025 mg/mL |
Fixable Viability Dye 506 (FVD506) | eBioscience | 65-0866 | Use at 1:200 in PBS |
Foetal calf-serum (FCS) | GE Healthcare | A15-104 | 10% in RPMI |
Hamilton syringe 700 series, 25 μL volume, 22s gauge needle bevel tip | Fisher Scientific | 10100332 | |
Intracellular Fixation buffer and Intracellular Permeabilisation Buffer | eBioscience | 88-8824-00 | Dilute permeabilisation buffer to 1x in H2O |
Penicillin/streptomycin | PAA | 15140122 | 100 units/mL Penicillin, 100 μg/mL Streptomycin |
Protein transport inhibitor cocktail (500x) (brefeldin A and monesin) | eBioscience | 00-4980-03 | 1x Final concentration Brefeldin A 10.6 μM, monensin 2 μM |
RPMI-1640 (containing 0.3 g/L Glutamine) | Sigma-Aldrich | R8758 | |
Surgical Scalpel Blade No.10 | Swann-Morton | 0501 | |
Trypsin-EDTA Solution 10x | Sigma-Aldrich | 594-18C | Trypsin (0.1%) EDTA (0.4%) final concentration |
U-bottomed 96 microwell plate | VWR | 734-2080 | |
Universal Cotton Tipped Applicators – 6 inch x 100 | Medisave | UN982 | |
V-bottomed 96 microwell plate | VWR | 735-0184 |