Se presenta un protocolo para la síntesis y medición de las propiedades fotoquímicas de compuestos modulares enjaulados con mitades clicables.
Los compuestos enjaulados permiten la manipulación fotomediada de la fisiología celular con alta resolución espaciotemporal. Sin embargo, la limitada diversidad estructural de los grupos de entramado actualmente disponibles y las dificultades en la modificación sintética sin sacrificar sus eficiencias de fotólisis son obstáculos para ampliar el repertorio de compuestos enjaulados para células vivas Aplicaciones. Como la modificación química de los grupos foto-caging tipo cumarina es un enfoque prometedor para la preparación de compuestos enjaulados con diversas propiedades físicas y químicas, informamos de un método para la síntesis de compuestos enjaulados clicables que se pueden modificar fácilmente con varias unidades funcionales a través de la ciclaización Huisgen catalizada por cobre(I). La molécula de plataforma modular contiene un grupo (6-bromo-7-hidroxicoumarin-4-yl)metil (Bhc) como un grupo de foto-caging, que exhibe una alta eficiencia de fotólisis en comparación con las de los 2-nitrobenzyls convencionales. Se presentan procedimientos generales para la preparación de compuestos enjaulados enjaulados en los que se puede hacer clic que contienen aminas, alcoholes y carboxilatos. Propiedades adicionales como la solubilidad del agua y la capacidad de segmentación celular se pueden incorporar fácilmente en compuestos enjaulados enjaulados clicables. Además, se midieron las propiedades físicas y fotoquímicas, incluido el rendimiento cuántico de fotólisis, que fueron superiores a las de los compuestos enjaulados Bhc correspondientes. Por lo tanto, el protocolo descrito podría considerarse una solución potencial para la falta de diversidad estructural en los compuestos enjaulados disponibles.
Los compuestos enjaulados están diseñados moléculas sintéticas cuyas funciones originales están enmascaradas temporalmente por grupos de protección fotoextraíbles conectados covalentemente. Curiosamente, los compuestos enjaulados de moléculas biológicamente relevantes proporcionan un método indispensable para el control espaciotemporal de la fisiología celular1,2,3,4,5 ,6. En 1977, Engels y Schlaeger informaron el éster 2-nitrobenzyl de cAMP como una membrana permeable y derivado fotolabile del cAMP7. Al año siguiente, Kaplan informó el éster de 1-(2-nitrofenilo)etil de ATP (NPE-ATP) y nombró a este compuesto “enjaulado” ATP8. Desde entonces, una gama de grupos de protección fotoquímicamente extraíbles tales como 2-nitrobenzyls, p-hidroxifenazcils9, 2-(2-nitrofenil)etils10,11, 7-nitroindolin-1-yls12, 13,y (coumarin-4-yl)metils14,15,16 se han utilizado para la preparación de compuestos enjaulados.
Se espera que la síntesis de compuestos enjaulados con propiedades adicionales deseables, como la permeabilidad de la membrana, la solubilidad del agua y la capacidad de segmentación celular faciliten las aplicaciones biológicas celulares. Dado que las propiedades físicas y fotoquímicas de estas moléculas dependen principalmente de la estructura química de los grupos de protección fotoquímicamente extraíbles utilizados para prepararlas, se requiere un repertorio diverso de grupos foto-caging. Sin embargo, la diversidad estructural de los grupos de entramado disponibles actualmente que exhiben altas eficiencias de fotólisis es limitada. Esto podría ser un obstáculo para aumentar el uso de compuestos enjaulados.
Para abordar este problema, el repertorio de grupos foto-caging se ha ampliado mediante la modificación química de los grupos de protección fotoextraíbles existentes o el diseño de nuevos cromóforos fotolábilicos con propiedades fotofísicas y fotoquímicas superiores. Algunos ejemplos son nitrodibenzofurano (NDBF)17, [3-(4,5-dimetoxi-2-nitrofenilo)-2-butil] (DMNPB)18,19, una fojaula 2-nitrobenzyl sensible al calcio20, coumarinilmetils sustituidos (DEAC45021 , DEAdcCM22, 7-azetidinyl-4-methylcoumarin23, y cumarinas de estilpílica24), derivados de cianina (CyEt-pan)25, y derivados de BODIPY26,27.
Además, previamente desarrollamos el (6-bromo-7-hidroxicoumarin-4-yl)metil (Bhc) grupo y sintetizamos con éxito varios compuestos enjaulados de neurotransmisores28, segundomensajeros29,30,y oligonucleótidos31,32,33 que exhiben grandes secciones transversales de excitación de uno y dos fotones. Si las propiedades adicionales se pueden instalar fácilmente en los grupos de encedadiso sin comprometer su fotosensibilidad, entonces el repertorio de compuestos enjaulados se puede ampliar34,35,36, 37,38,39. Por lo tanto, diseñamos compuestos modulares enjaulados que comprenden tres partes, a saber, el grupo Bhc como un núcleo foto-responsivo, mangos químicos para la instalación de funcionalidades adicionales, y las moléculas que se van a enmascarar40, 41.
Por lo tanto, este artículo proporciona un método práctico para la preparación de compuestos enjaulados de moléculas biológicamente relevantes. El presente protocolo describe los métodos para la preparación de una plataforma en la que se puede hacer clic para grupos foto-caging, la introducción de funcionalidades adicionales para ampliar el repertorio de compuestos enjaulados, la medición de sus físicos y fotoquímicos propiedades, y la segmentación selectiva de tipo celular de un compuesto enjaulado enjaulado clicable para su posterior aplicación celular.
Anteriormente desarrollamos compuestos enjaulados Bhc de varias moléculas biológicamente activas que exhiben altas eficiencias fotílíticas28,45,46,47. Con el objetivo de ampliar el repertorio de los grupos de cultivo Bhc, también informamos de plataformas de compuestos modulares enjaulados que se pueden modificar fácilmente por la introducción de varias unidades funcionales32,40,41. Por lo tanto, el presente protocolo representa un método para la síntesis de un precursor clicable de los grupos de encaging Bhc que se puede modificar a través de la ciclación Huisgen catalizada por cobre(I). La síntesis del precursor clickable, paBhcCH2OH (2), se logró a través de una secuencia de reacción de cuatro pasos a partir del 4-bromoresorcinol disponible comercialmente(Figura 1A). La ventaja del presente protocolo es que no se requieren pasos laboriosos de purificación (por ejemplo, separaciones cromatográficas de columna).
Como precursor clicable paBhcCH2OH (2) se puede utilizar para enmascarar varios grupos funcionales, compuestos enjaulados clicables de aminas, alcoholes, y ácidos carboxílicos se sintetizaron utilizando 2 como el precursor(Figura 1B). Las aminas fueron modificadas como sus carbamatos, mientras que los alcoholes fueron modificados como sus carbonatos. En los procedimientos generales 1 y 2, CDI se utilizó para la preparación de carbamatos clicables, mientras que el cloroformato de 4-nitrofenilo se utilizó para la preparación de carbonatos. Como indica el mecanismo de reacción, ambos reactivos se pueden utilizar para la preparación de carbamatos y carbonatos. También debe tenerse en cuenta que el rendimiento del compuesto enjaulado deseado depende de la estructura química de la molécula a enjaular. Otros ejemplos se pueden ver en nuestros informes anteriores28,30,33,48.
A continuación, se realizó una ligera modificación del procedimientonotificado 49. La adición de tris(triazolylmethyl)ligandos a base de amina es necesario para obtener los productos deseados en el bien a altos rendimientos. Dado que una variedad de azidas están fácilmente disponibles tanto de fuentes comerciales como de procedimientos de literatura, podemos preparar varios compuestos modulares enjaulados con propiedades adicionales como la solubilidad del agua y la capacidad de segmentación celular(Figura 2).
El rendimiento cuántico de la fotólisis se midió entonces según un procedimiento reportado28,50. La Figura 3 muestra que el consumo fotolítico de 2o-glc-paBhcmoc-PTX y la liberación de PTX se aproximaron por decaimiento y aumento de un solo exponencial, respectivamente, lo que sugiere que no hay filtrado interno de la radiación o efectos secundarios no deseados. Se observaron rendimientos cuánticos de fotólisis mejorados(o) y eficiencias de fotólisis(o) para los compuestos enjaulados de paBhc en los que se puede hacer clic en comparación con los compuestos enjaulados de Bhc notificados anteriormente(Tabla 1)41, 43. Dado que las eficiencias de fotólisis(o) de los compuestos enjaulados de Bhc son más de cien veces superiores a las de los compuestos enjaulados de tipo nitrocilíico28, la notable mejora debida a la presencia de grupos de enraización de paBhc es claramente una ventaja para este sistema.
Como un experimento de prueba de concepto, se introdujo una mitad hidrófila en 2o-paBhcmoc-PTX (4) y un ligando de orientación celular se introdujo en el compuesto 3 (Figura 2). La solubilidad del agua de 2o-glc-paBhcmoc-PTX fue 650 veces mayor que la del PTX principal(Tabla 1). La focalización celular selectiva se logró utilizando un sistema de sonda de etiquetas, y el paBhcmoc-hex-FITC/Halo(8) que llevaba el ligando HaloTag fue dirigido con éxito a la membrana celular de las células de mamíferos cultivadas que expresaban la proteína de fusión HaloTag/EGFR ( Figura 4). También se logró la modulación fotomediada de la localización subcelular de una quinasa utilizando un compuesto enjaulado enjaulado 5 (Figura 5).
En conclusión, demostramos con éxito un método para la preparación de plataformas clicables para compuestos foto-enjaulados de moléculas biológicamente interesantes que se pueden modificar fácilmente con propiedades adicionales, como la solubilidad del agua y un capacidad de orientación. Dado que el grupo de apiase paBhc se puede utilizar para preparar cualquier molécula con grupos funcionales modificables, la aplicación del protocolo actual no se limita a las moléculas descritas en este documento. Utilizando una plataforma modular, a saber, el grupo de perforación paBhc, los compuestos enjaulados deseados se pueden preparar fácilmente, y sus propiedades físicas y químicas se pueden modular mediante la modificación de clics.
The authors have nothing to disclose.
Este trabajo fue apoyado por el número de subvención JSPS KAKENHI JP16H01282 (TF), una subvención para la investigación científica sobre áreas innovadoras “Dinamismo de la memoria”, y JP19H05778 (TF), “MolMovies”.
acetonitrile, EP | Nacalai | 00404-75 | |
acetonitrile, super dehydrated | FUJIFILM Wako | 010-22905 | |
Antibiotic-Antimycotic, 100X | Thermo Fisher | 15240062 | |
4-bromoresorcinol | TCI Chemicals | B0654 | |
N,N’-carbonyldiimidazole | FUJIFILM Wako | 034-10491 | |
chloroform | Kanto | 07278-71 | |
Copper (II) Sulfate Pentahydrate, 99.9% | FUJIFILM Wako | 032-12511 | |
dichloromethane, dehydrated | Kanto | 11338-05 | |
N,N'-Diisopropylcarbodiimide (DIPC) | TCI Chemicals | D0254 | |
4-dimethylaminopyridine | TCI Chemicals | D1450 | |
dimethylsulfoxide, dehydrated -super- | Kanto | 10380-05 | |
DMEM – Dulbecco's Modified Eagle Medium | Sigma | D6046-500ML | |
dual light source fluorescence illuminator, IX2-RFAW | Olympus | ||
Ethanol (99.5) | FUJIFILM Wako | 054-07225 | |
Ethyl 4-Chloroacetoacetate | TCI Chemicals | C0911 | |
Ham's F-12 with L-Glutamine and Phenol Red | FUJIFILM Wako | 087-08335 | |
hydrochloric acid | FUJIFILM Wako | 087-01076 | |
inverted fluorescent microscope IX-71 | Olympus | ||
ISOLUTE Phase Separator, 15 mL | Biotage | 120-1906-D | |
L-(+)-Ascorbic Acid Sodium Salt | FUJIFILM Wako | 196-01252 | |
laser scanning fluorescence confocal microscopy, FLUOVIEW FV1200/IX-81 | Olympus | ||
Lipofectamine 2000 Transfection Reagent | Thermo Fisher | 11668027 | lipofection reagent |
3-(N-morpholino)propanesulfonic acid | Dojindo | 345-01804 | MOPS |
4-nitrophenylchloroformate (4-NPC) | TCI Chemicals | C1400 | |
Opti-MEM I Reduced Serum Medium, no phenol red | Thermo Fisher | 11058021 | reduced serum medium contains no phenol red |
1,10‐Phenanthroline Monohydrate | Nacalai | 26707-02 | |
Photochemical reactor with RPR 350 nm lamps | Rayonet | ||
Potassium Trioxalatoferrate (III) trihydrate | FUJIFILM Wako | W01SRM19-5000 | |
Sodium Acetate Trihydrate | Nacalai | 31115-05 | |
Sodium Bicarbonate | FUJIFILM Wako | 199-05985 | |
Sulfuric Acid, 96-98% | FUJIFILM Wako | 190-04675 | |
Tris(3-hydroxypropyltriazolylmethyl)amine (THPTA) | ALDRICH | 762342-100MG | |
tri‐Sodium Citrate Dihydrate | Nacalai | 31404-15 | |
Xenon light source, MAX-303 | Asahi Spectra |