Se proporciona en detalle una serie de métodos para determinar la tasa potencial de DNRA basada en 14análisis NH4+/15NH4+. NH4+ se convierte en N2O a través de varios pasos y se analiza utilizando cromatografía de gases cuadrúpedos-espectrometría de masas.
La importancia de entender el destino del nitrato (NO3o),−que es la especie N dominante transferida de los ecosistemas terrestres a los acuáticos, ha ido aumentando porque las cargas mundiales de nitrógeno han aumentado drásticamente tras la industrialización. La reducción disimilizante de nitratos a amonio (DNRA) y la desnitrificación son procesos microbianos que utilizan NO3para la respiración. En comparación con la desnitrificación, las determinaciones cuantitativas de la actividad de la DNRA se han llevado a cabo sólo en una medida limitada. Esto ha llevado a una comprensión insuficiente de la importancia de DNRA enlas transformaciones NO3y los factores reguladores de este proceso. El objetivo de este documento es proporcionar un procedimiento detallado para la medición de la tasa potencial de DNRA en muestras ambientales. En resumen, la tasa potencial de DNRA se puede calcular a partir de la tasa de acumulación de amonio con etiqueta N de 15(15NH4+) en 15NO3– incubación añadida. La determinación de las 14concentraciones NH4+ y 15NH4+ descritas en este documento se compone de los siguientes pasos. En primer lugar, el NH4+ en la muestra se extrae y se atrapa en un filtro de vidrio acidificado como sal de amonio. En segundo lugar, el amonio atrapado se elue y se oxida a NO3a travésde la oxidación del persulfato. En tercer lugar, el NO3se convierte en N2O a través de un denitrificador de deficiencia de N2O reductasa. Finalmente, el N2O convertido se analiza utilizando un sistema de cromatografía de gases de cuadrúpedo-espectrometría de masas previamente desarrollado. Aplicamos este método a los sedimentos de marismas y calculamos sus tasas potenciales de DNRA, demostrando que los procedimientos propuestos permiten una determinación simple y más rápida en comparación con los métodos descritos anteriormente.
La síntesis artificial de fertilizantes nitrogenados y su aplicación generalizada han perturbado enormemente el ciclo global del nitrógeno. Se estima que la transferencia de nitrógeno reactivo de los sistemas terrestres a los costeros se ha duplicado desde tiempos preindustriales1. Una porción significativa de los fertilizantes aplicados a un campo determinado se lava lejos del suelo a los ríos o aguas subterráneas, principalmente como NO3a 2. Esto puede causar problemas ambientales como la contaminación del agua potable, la eutrofización y la formación de hipoxia. NO3en ambientes de agua se elimina o se retiene en el ecosistema a través de la asimilación biológica y varios procesos de disimilación microbiana. Se sabe que la desnitrificación y el anammox son los principales procesos de eliminación microbiana para NO3.− La desnitrificación es la reducción microbiana de NO3a los productos N gaseosos (NO, N2O y N2)junto con la oxidación de un donante de electrones, como las sustancias orgánicas, reduciendo así el riesgo de los problemas antes mencionados. Anammox también produce N2 a partir de NO2o− y NH4+; por lo tanto, elimina N inorgánico de un ecosistema. Por el contrario, DNRA trabaja para retener N en un ecosistema; generalmente se acepta que DNRA se realiza principalmente por bacterias fermentativas o bacterias quimiolitoautotróficas y que reducen el disimilario NO3a BIOdisponible y menos móvil NH4+.
Los estudios sobre DNRA se han realizado principalmente en ecosistemas marinos o estuarinas, como sedimentos oceánicos o estuarinas y agua, tierra de marisma sal o salobre, y suelo de manglar. Los ecosistemas costeros o marinos son importantes como reservorios para eliminar NO3de los ecosistemas terrestres, y en estudios anteriores se ha demostrado que DNRA contribuye en una gama muy amplia deeliminación de NO3(0-99%)3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,,15,16,17,18.14 Además, la existencia de DNRA se ha demostrado en una amplia gama de ambientes, incluyendo ambientes de agua dulce19,suelos de arroz20,y suelos forestales21. Si bien estos estudios han demostrado que DNRA es potencialmente comparable a la desnitrificación para laeliminación de NO3,los estudios que miden la actividad de DNRA son todavía muy limitados en comparación con los que miden la desnitrificación.
La tasa DNRA se ha evaluado utilizando 15técnicas de etiquetado N junto con el análisis de datos a través de modelos analíticos o numéricos. Una solución analítica para calcular la tasa DNRA se basa en el aumento en el enriquecimiento de 15N de la piscina NH4+ después de la adición de 15NO3como trazador. 15 Se añade N-etiqueta no3− a una muestra e incubada, y la tasa de DNRA se puede calcular a partir de los cambios en la concentración y la relación de isótopos en NH4+ antes y después de un cierto período de tiempo. En este artículo, se describe en detalle un método para cuantificar la concentración NH4+ y la relación de isótopos, que se requieren para calcular la tasa DNRA. Básicamente, el método reportado aquí es una combinación de varias técnicas previamente reportadas22,23,24,25,26 con modificaciones añadidas a algunos procedimientos. El método se compone de una serie de cinco procedimientos componentes: (1) incubación de una muestra ambiental con la modificación de un trazador de isótopos estable, 15NO3o,−(2) extracción y recuperación de NH4+ utilizando un “procedimiento de difusión” con modificaciones, (3) oxidación de persulfato de NH4+ en la muestra, que consiste en los indígenas NH4+ y 15NH4+ derivados de 15NO3a través de la actividad DNRA, en NO3o− y 15NO3o,−(4) transformación microbiana posterior de NO3o− y 15isótopómeros NO3a N2O mediante el método desnitrificador modificado y (5) cuantificación de los isótopómeros N2O utilizando cromatografía de gases-espectrometría de masas (GC/MS). En la siguiente sección, en primer lugar, se describe la preparación para los procedimientos (2) y (4) y, posteriormente, se describen detalladamente los cinco procedimientos de componentes.
La concentración y la relación de isótopos de NH4+ para el análisis DNRA se cuantificaron utilizando varios métodos. Las concentraciones y las relaciones de isótopos de NH4+ generalmente se miden por separado. La concentración de NH4+ se mide típicamente utilizando métodos colorimétricos incluyendo un autoanalyzer4,10,15,16</…
The authors have nothing to disclose.
Agradecemos a Naoto Tanaka por ayudar a la recopilación de datos y el desarrollo del protocolo. La colección de muestras fue compatible con JSPS KAKENHI Grant Number 17K15286.
15N-KNO3 | SHOKO SCIENCE | N15-0197 | |
15N-NH4Cl | SHOKO SCIENCE | N15-0034 | |
20 mL PP bottle | SANPLATEC | 61-3210-18 | Wide-mouth |
Aluminum cap | Maruemu | 1307-13 | No. 20, with hole |
Boric acid | Wako | 021-02195 | |
Centrifuge | HITACHI | Himac CR21G II | |
Deoxygenized Gas Pressure & Replace Injector | SANSIN INDUSTRIAL | IP-12 | |
Disposable cellulose acetate membrane filter | ADVANTEC | 25CS020AS | Pore size 0.22 µm, 25 mm in diameter |
Disposable syringe | Termo | SS-10SZ | 10 mL |
Disposable syringe | Termo | SS-01T | 1 mL |
Dulbecco’s Phosphate Buffered Saline (-) | NISSUI PHARMACEUTICAL | 5913 | |
Gastight syringe | VICI Valco Instruments | 4075-15010 | Series A-2, 100 µL |
GC/MS | shimadzu | GCMS-QP2010ultra | |
GF/D | Whatman | 1823-010 | 10 mm in diameter |
Glass vial | Maruemu | 0501-06 | 20 mL |
Gray butyl rubber stopper | Maruemu | 1306-03 | No.20-S |
H2SO4 | Wako | 192-04696 | Guaranteed Reagent |
K2S2O8 | Wako | 169-11891 | Nitrogen and Phosphorus analysis grade |
KCl | Wako | 163-03545 | Guaranteed Reagent |
KNO3 | Wako | 160-04035 | Guaranteed Reagent |
NaOH | Wako | 191-08625 | Nitrogen compounds analysis grade |
NH4Cl | Wako | 017-02995 | Guaranteed Reagent |
Plastic centrifuge tube | ASONE | 1-3500-22 | 50 mL, VIO-50BN |
Pseudomonas chlororaphis subsp. aureofaciens | American Type Culture Collection (ATCC) | ATCC 13985 | Freeze-dried, the type strain of Pseudomonas aureofaciens |
PTFE sealing tape | Sigma-Aldrich | Z221880 | 25 mm in width |
Reciprocating shaker | TAITEC | 0000207-000 | NR-10 |
Screw-cap test tube | IWAKI | 84-0252 | 11 mL |
PTFE-lined cap for test tube | IWAKI | 84-0262 | |
Tryptic Soy Broth | Difco Laboratories | 211825 |