在这里, 我们提出了一个培养人类肠体或类团类单层具有完整的屏障功能的方案, 以研究宿主上皮微生物在细胞和生化水平上的相互作用。
从隐基干细胞中提取的人三维 (3D) 肠内酯或类殖民细胞培养物是目前肠道上皮最先进的体外模型。由于其封闭的结构和显著的支持细胞外基质, 3D 培养物不是理想的宿主病原体研究。肠内或菌落可以作为上皮单层生长在可渗透组织培养膜上, 以允许操作腔内和亚外侧细胞表面及伴随的液体。这种增强的腔表面可及性有助于模拟细菌-宿主上皮的相互作用, 如结肠上皮肠出血性大肠杆菌(ehec) 的粘液降解能力。介绍了一种三维培养碎裂、单层播种和超相电阻 (TER) 测量的方法, 以监测融合和分化的进展。结肠样单层分化产生分泌粘液, 可通过免疫荧光或免疫印迹技术进行研究。更广泛地说, 肠内或结肠样单层使生理相关的平台能够评估可能成为致病性或同源微生物群目标的特定细胞群。
肠道有机体、肠体和菌落在了解干细胞行为、肠道发育、屏障运输功能和细胞分化方面取得了许多进展。1然而, 3d 培养限制了宿主上皮病原体相互作用的研究, 因为细菌或毒力因素不能直接接触到腔内, 除非封闭结构受到微注射。2,3此外, 分泌的材料, 如小分子、蛋白质或粘液, 不能很容易地从3d 培养中取样, 以便进行下游分析。在3D 培养中, 使用荧光染料和延时显微镜对病原体对上皮屏障功能4和离子转运5的影响进行了评价, 但在透水组织培养支架上生长的单层菌是可以接受的其他技术, 如 TER 测量和使用室电压夹记录。6,7.
许多出版物描述了肠结肠炎/结肠炎的2D 或单层培养协议。被发现促进上皮细胞附着的材料包括胶原蛋白水凝胶,8,9 0.1% 明胶,10薄层小鼠肉瘤衍生基底膜基质 (bmm),11,12, 13和人胶原蛋白 iv。6,7.,14,15,16,17种入途径包括通过移液6、14、15 和使用胰蛋白酶、10、11 的细胞粘附因子分离进行机械碎裂消除,13或 edta。9一些协议使用无孔组织培养塑料制品进行播种, 但这限制了基外侧访问, 因此大多数应用依赖于渗透组织培养插入物。不同出版物之间有稳定的融合单层形成和维护的文献。此外, 不同群体的人类文化增长和差异化媒体成分不同, 并随着更多的研究人员采用和调整方法以适应其应用和现有资源而不断演变。
为了解决在宿主-病原体相互作用研究中3D 肠道上皮培养的局限性, 我们提出了一种改进的协议, 用于将3D 人类肠体或菌落转换为单层。在隐状样未成熟状态下实现融合后, 生长因子 WNT3A、RSPO1 和抑制剂 a-83-01 和 SB 202190 的退出可导致小肠绒毛或表面结肠上皮的分化代表。我们描述理想的基质, 人胶原蛋白类型 iv, 以覆盖插入物, 并获得均匀的肠内或结肠样碎片电镀。我们证明, 该协议产生了一个融合单层具有较高的 ter. 结肠样单层分泌一个厚的顶端粘液层, 允许通过免疫印迹或免疫染色对病理-粘液相互作用进行体外研究。还介绍了一种改进的固定程序, 以保持结肠粘液层的免疫染色。该方法旨在为研究感染后肠道宿主-病原体相互作用提供一个可追溯的模型。
成功形成肠内样单层的关键参数包括 1) 健康、增殖的3D 文化作为起始材料;2) 在单层播种前, 用人胶原蛋白 iv 涂覆细胞培养表面;3) 机械或酶上的3D 培养体的碎片化, 但不分散到单个细胞级别。
在三维肠内结石的分离过程中, 最佳的晃动速度可能会根据给定振动台模型的旋转直径而变化。这样做的目的不仅是为了高效混合而搅拌板材, 而且也是为了避免将细胞悬浮液溅到板盖上或相邻的井中。< 30分钟的潜伏期可能会产生残留的 BMM 粘附在细胞上, 这可能会阻碍在插入物上镀片时附着和形成均匀的细胞单层。广泛的孵育 (≥1小时) 将导致细胞活力显著降低。
分离三维肠溶特类化合物所需的三位一体程度可能随活塞刚度和使用者的灵活性而变化。建议在相对比光显微镜上定期检查井内含量, 以确定片段在三化过程中的均匀性, 目标是每个片段大约30个细胞。作为代替, 或除了三化, 悬浮液可以用胰蛋白酶短暂消化, 以获得较小的均匀碎片。如果单层在一个单一的上皮层中含有很大比例的3d 样结构, 则可能需要使用胰蛋白酶消化。然而, 与单细胞的离解是不可取的, 因为这显著降低细胞的活力。在 35Μl BMM 液滴中培养的肠系膜/类原体的一口通常足以填充2-3 个插入物, 但这一因素可能因肠类/结肠滴的数量和平均大小而异。
结肠样单层可以吸收大量的顶端介质, 因为他们区分。这可以通过在上插入室 (150-200μl) 上应用额外的 DM 来规避, 尽管上腔的部分干燥似乎不会对单层的生存能力或下游检测中的功能产生不利影响。经过大约4-5 的分化, 结肠这种单层细胞外粘液在仔细抽吸 DM 后, 可能会在细胞表面显示为厚胶状物质。
对于 EHEC 与外部粘液层的相互作用, 我们通常使用协议中规定的细菌滴度和潜伏期。然而, 独特的菌株最初应检测在多个浓度和潜伏期, 以确定适当的参数所需的效果。
在粘液固定过程中, 吸气顶端介质可能会去除大部分细胞外未附着的粘液层。因此, 仔细倒出介质是很重要的。如果介质被表面张力保留在刀片中, 请使用折叠的实验室组织的角, 以打破表面张力, 并将大部分介质擦掉。固定和染色后, 在插入滤镜上安装覆盖玻璃时, 粘液层可能会被无意中移开或扁平。为了保持粘液高度, 请将滤清器放在安装介质的一滴上, 并小心地将覆盖玻璃放在过滤器上。不要点击或按下覆盖玻璃, 因为这可能会显著压平粘液层。
为了在三维培养中从细胞中形成偏振单层, 有必要重现肠上皮细胞的亚外侧膜整合与细胞外基质 (ECM) 蛋白之间的相互作用。层压板、胶原蛋白 IV、纤维连接蛋白和一系列蛋白聚糖构成肠道上皮 ECM。21,22我们比较了人类细胞衍生的层压蛋白、纤维连接蛋白、胶原蛋白 iv 和穆林衍生的 bmm 作为插入涂层。只有胶原蛋白 IV 支持形成稳定的、长期的 (长达 4周) 的融合肠样单层 (图 1-2)。在其他测试矩阵上获得了少量的单层样生长, 但这些区域未能进展到融合。使用人胶原蛋白 iv 作为 ECM 替代品有许多优点。来自恩格尔布雷斯-霍尔姆-群 (EHS) 小鼠肉瘤细胞的 BMM 不是人类的起源, 而人类胶原蛋白 IV 是商业上可用的, 通常更具成本效益。此外, BMM 是一种具有固有变异性的蛋白质的复杂混合物, 可能包含由影响基因表达的肉瘤分泌的生长因子。23
肠道上皮细胞与肠道上皮恢复中的潜在 ECM 之间的相互作用仍未完全了解。胶原蛋白 IV, 但不是层压蛋白的意义, 作为一个粘附配体对人殖民地细胞 24 和肠道隐窝上皮细胞恢复25的增强剂已建议使用抗体对胶原蛋白 iv, 防止附着.作为Β-1-整合素的抗体, 在菌落细胞对 IV 型胶原蛋白的粘附中表现出明显的阻断抗体, 上皮表达的β1-整合素似乎对 ECM 相互作用很重要。虽然胶原蛋白 iv 为插入物上的肠样单层形成提供了可靠的 ecm, 但随着时间的推移, ecm 的上皮重塑尚未在该模型中得到评估, 也没有更复杂和定义的 ecm 混合物的影响。胶原蛋白 IV、层压蛋白和纤维连接蛋白。
人类肠杆菌/单层形式的结肠炎 (图 1-4) 使操作和采样成为可能, 使用三维矩阵嵌入的培养物将是繁琐或不可能实现的。三维肠杆菌/菌落在大小、结构复杂性和管腔体积上各不相同, 因此微生物或小分子的微注射很难准确定量。此外, 与单层 (表 1) 不同的是, 3d 培养物阻止直接进入腔内和基底外侧表面, 以测量与生理或病理生理过程相关的离子、营养物质、细胞因子或分泌因素.融合 (图 1-2) 是肠内样单层的主要特性之一, 不仅需要建立营养物质、离子和其他大分子的生理梯度,而且要创造适当的屏障在腔内微生物群和无菌间充质/免疫细胞居住的浆膜环境之间。这些方面是重要的考虑, 未来的研究, 纳入肠内样单层与间充质, 免疫, 或神经元细胞类型, 以建立更复杂的生理模型。
这里描述的细胞培养插入模型的局限性包括缺乏物理力, 如流体剪切应力和机械拉伸压缩 (蠕动), 以及缺乏通常经历肠道的厌氧顶端环境体内上皮。这些元素有可能通过更复杂的微生理平台26来解决,但它们也需要额外的费用、设备和专门知识来实施。3D 和单层培养物也没有与肠道微生物群、基质细胞群和免疫系统的相互作用或贡献, 除非有目的地添加这些成分。
肠内样单层在胶原蛋白 iv 包膜细胞培养插入物中的未来应用可能包括其他关于致病性或同源微生物相互作用、药物或营养吸收、毒性、代谢、屏障功能和功能的研究由与其他肠道细胞类型共同培养的增强。评估不仅可以在健康捐献者的上皮内进行, 还可以从有基因突变或肠道疾病的个体进行评估, 前提是体内表型被确定为保存在体外肠内/结肠组培养中。
The authors have nothing to disclose.
这项工作得到了国家卫生研究院的支持, 该项目提供了 P01 AI125181、K01 DK106323 (JGI) 和 K01 DK113043 (JFA)。我们感谢詹姆斯·卡普 (马里兰州立大学、巴尔的摩、医学博士、美国) 提供大肠杆菌株 HS 和 ehec。我们还感谢霍普金斯霍普金斯·霍特消化系统基础和转化研究核心中心 (P30 DK089502) 和约翰霍普金斯质谱和蛋白质组学核心的综合生理和成像核心。
2-Amino-2-(hydroxymethyl)-1,3-propanediol | Sigma | T4661 | Tris base, Component of lysis buffer |
A-83-01 | Tocris | 2939 | ALK4/5/7 inhibitor |
Acetic acid, glacial | Fisher Scientific | A38 | |
Advanced DMEM/F12 | Life Technologies | 12634-010 | Component of growth medium |
Alexa Fluor 488 phalloidin | Life Technologies | A12379 | Fluorescent probe for F-actin |
Antibiotic/antimycotic cocktail | Invivogen | ant-pm-2 | Primocin (100x) |
B27, 50x | Life Technologies | 17504-044 | Component of growth medium |
Cell culture inserts | Corning | 3470 | Transwell, PET membrane, 0.4 μm pore, 24-well plate |
CHIR 99021 | Tocris | 4423 | GSK3β inhibitor |
Click-iT Plus EdU Alexa Fluor 594 Imaging Kit | Life Technologies | C10639 | |
Collagen IV, from human placenta | Sigma | C5533 | |
Cultrex Organoid Harvesting Solution | Trevigen | 3700-100-01 | Depolymerizes basement membrane matrix |
Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) | Kaper lab, University of Maryland | ||
Epithelial voltohmmeter | World Precision Instruments | EVOM2 | |
Epithelial voltohmmeter electrode | World Precision Instruments | STX3 | |
Escherichia coli strain HS | Kaper lab, University of Maryland | ||
Ethanol, absolute | Pharmco | 111000200 | |
FluorSave mounting medium | Millipore | 345789 | For mounting insert membrane on microscope slide |
GlutaMAX | Life Technologies | 35050-061 | L-alanyl-L-glutamine dipeptide, 200 mM |
HEK293T/Noggin-Fc cell line | van den Brink lab, Tytgat Institute for Liver and Intestinal Research | For production of Noggin conditioned medium | |
HEK293T/RSPO1-Fc-HA cell line | Trevigen | 3710-001-K | For production of Rspondin-1 conditioned medium |
HEPES, 1 M | Life Technologies | 15630-080 | Component of growth medium |
Heraeus Multifuge X1R Centrifuge | Thermo Fisher Scientific | 75004250 | |
Hoechst 33342 | Life Technologies | H3570 | Fluorescent nuclear dye |
Human epidermal growth factor (EGF) | R&D Systems | 236-EG-01M | Component of growth medium |
IGEPAL CA-630 | Sigma | I8896 | Component of lysis buffer |
Inverted cell culture light microscope | Olympus | CKX51 | |
LB broth | EMD Millipore | 1.10285.0500 | |
L-WNT3A cell line | ATCC | CRL-2647 | For production of Wnt3a conditioned medium |
Matrigel, growth factor reduced | Corning | 356231 | Basement membrane matrix for 3D culture |
Mini cell scraper | United BioSystems | MCS-200 | |
MUC2 antibody, mouse monoclonal | Abcam | ab11197 | Use at 1:100 for immunostaining, 1:500 for immunoblotting |
MUC2 shRNA lentiviral particles | GE Dharmacon | RHS4531 | GIPZ lentiviral shRNA, ID: 4583 |
Orbital shaker | Grant Instruments | PSU-10i | |
Penicillin-streptomycin, 100x | Life Technologies | 15140-122 | Component of growth medium |
Phosphate buffered saline | Corning | 21-031 | |
Probe sonicator with microtip | Branson Ultrasonics | 450 | |
Protease inhibitor cocktail for mammalian cells | Sigma | P8340 | Component of lysis buffer |
SB 202190 | Tocris | 1264 | p38 MAPK inhibitor |
Sodium chloride | Sigma | S3014 | Component of lysis buffer |
Sodium dexoycholate | Sigma | D6750 | Component of lysis buffer |
Sodium dodecyl sulfate | Sigma | L3771 | Component of lysis buffer |
TrypLE Express, 1x | Life Technologies | 12605-010 | Trypsin, for digesting enteroid/colonoid fragments |
Vinculin antibody, rabbit monoclonal | Abcam | ab129002 | Use at 1:1000 for immunoblotting |
Water, tissue culture grade, sterile filtered | Corning | 25-055 | |
Y-27632 | Tocris | 1254 | RhoA/ROCK inhibitor |