Dit protocol beschrijft het gebruik van één keten MHC klasse I complexen te onderzoeken van de moleculaire interacties in menselijke CD8 + T cel activatie: generatie van gemanipuleerde antigeen presentatie van cellen uiten van één keten bouwt, cultuur van menselijke CD8 + T cel kloon en T-cel activatie experimenten.
Non-stimulerend zelf peptide MHC (pMHC) complexen doen niet het induceren van T-cel activatie en effector functies, maar T cel reacties op agonist pMHC, door middel van een proces genoemd co-agonisme kunnen verbeteren. Dit protocol beschrijft een experimenteel systeem te onderzoeken van co-agonisme tijdens menselijke CD8 + T cel activatie met het uitspreken van menselijke MHC klasse I moleculen presenteren van vooraf bepaalde peptiden als single polypeptiden (één keten MHC) in een XENOGENECELLEN cellijn. Wij hebben één keten MHCs onder omstandigheden waar lage agonist één ketencomplexen p-MHC en hoge niveaus van niet-stimulerend één ketencomplexen p-MHC naar voren zijn gebracht. Gebruik van deze experimenteel systeem toegestaan ons te vergelijken van CD8 + T cel reacties op agonist pMHC in de aanwezigheid of afwezigheid van niet-stimulerend pMHC. Het protocol beschrijft cel lijn transfectie met één keten MHC constructies, generatie van stabiele cel lijnen, cultuur van hepatitis B virus-specifieke menselijke CD8 + T cellen en T-cel activatie experimenten gelijktijdig quantifying cytokine productie en degranulatie. De gepresenteerde methoden kunnen worden gebruikt voor onderzoek op verschillende aspecten van CD8 + T cel activatie in menselijke T cel systemen met bekende peptide MHC specificiteit.
MHC klasse I (MHC-ik) moleculen presenteren korte (8-10 aminozuren) peptiden afgeleid van eiwitten gesynthetiseerd door elke cel. MHC-ik moleculen op gezonde cellen presenteren zelf peptiden afgeleid van endogene eiwitten. Virale infectie leidt tot de presentatie van niet-zelf virus afkomstige peptiden op MHC-ik, maar zelfs geïnfecteerde cellen aanwezig niet-zelf peptiden in de aanwezigheid van grote hoeveelheden zelf peptide-MHC (pMHC). MHC-ik wordt herkend door de T cel receptor (TCR) en de receptor CD8 mede op T cellen. TCR bindende affiniteit met peptide pMHC is sterk afhankelijk van de volgorde van de gepresenteerde peptides, terwijl CD8-bindend peptide-onafhankelijke. TCR binding aan niet-zelf-agonist pMHC complex leidt tot T-cel activatie en effector functies. Non-stimulerend zelf pMHC complexen doen niet het induceren van T-cel activatie en effector functies, maar T cel reacties op agonist pMHC, door middel van een proces genoemd co-agonisme1,2,3kunnen verbeteren. Co-agonisme geconstateerd in muis CD4 + T cellen4,5,6 , alsmede in muizen en menselijke CD8 + T cellen7,8,9,10, 11 , 12 , 13. onder fysiologische omstandigheden, T-cellen moeten erkennen van beperkte hoeveelheden van agonist pMHC op antigeen presentatie van cellen (APCs) mede presentatie van hoge niveaus van niet-stimulerend pMHC complexen, suggereren dat co-agonisme draagt bij aan optimale T cel reacties in vivo. Cel Totaal oppervlakte MHC klasse ik niveaus zijn vaak werden tijdens virale infecties14 en op tumoren15. Deze immuun belastingontduiking strategie vermindert agonist pMHC presentatie, maar ook vermindert de hoeveelheid CO agonist pMHC ik beschikbaar voor T-cel activatie verhoging. Bovendien, hoge cel oppervlakte expressie niveaus van de MHC klasse I molecuul HLA-C is gebleken dat te correleren met verbeterde HIV controle16, suggereert een cruciale rol voor totale MHC klasse I meningsuiting in T-cel activatie. Ondanks de fysiologische betekenis van co-agonisme, is nog steeds onvolledig zijn moleculaire mechanisme begrepen. Dit is grotendeels te wijten aan technische uitdagingen van de hoeveelheid gepresenteerde co agonist pMHC experimenteel te bepalen terwijl agonist pMHC-constante.
We ontwikkelden een experimenteel systeem te onderzoeken van co-agonisme tijdens menselijke CD8 + T cel activatie met het uitspreken van menselijke MHC klasse I moleculen presenteren van vooraf bepaalde peptide als één polypeptide (enkele keten MHC-I, figuur 1A) in een XENOGENECELLEN cel lijn9,10. Één keten (sc) agonist pMHC was uitgedrukt onder controle van tetracycline-afleidbare promotor in de hamster afkomstige T-REx CHO cellijn uiting van tetracycline onderdrukker; Hierdoor zeer laag “lekke” expressie van sc agonist pMHC in de afwezigheid van tetracycline en hoge sc agonist pMHC expressie na toevoeging van tetracycline (figuur 1BC). De sc agonist uiting van pMHC T-REx CHO cellen werden vervolgens supertransfected met niet-stimulerend, co agonist sc pMHC-ik onder controle van een constitutively actieve promotor (figuur 1BC). Gebruik van deze experimenteel systeem toegestaan ons te vergelijken van CD8 + T cel reacties op agonist pMHC in de aan- of afwezigheid van hoge niveaus van niet-stimulerend pMHC. Kritisch, sinds peptide en MHC-ik zware ketting hangen covalent in de scMHC-ik opmaken, hierdoor introducties van mutaties in MHC moleculen presenteren van vooraf bepaalde peptiden. Gebruik van scMHC-ik technologie dus konden we specifiek moduleren TCR of CD8-bindende eigenschappen van agonist of co agonist pMHC.
Co-agonisme in CD8 + T cel activatie is waargenomen met behulp van gezuiverde MHC-ik complexen presenteren agonist en co agonist peptiden in de vorm van heterodimers11,17 of gepresenteerd op quantum dots12,,13. Vroege werk op het co-agonisme in CD8 + T cel activatie in de context van de agonist pMHC erkenning op APC TAP2-deficiënte cellijnen als APCs gebruikt. TAP is vereist voor transport van de peptide van het cytoplasma naar het endoplasmatisch reticulum en TAP-deficiency ernstig vermindert de pool van beschikbare MHC klasse-bindende peptiden. Bij het ontbreken van peptiden, het ontluikende complex van de MHC klasse I zware ketting en β2– microglobulin is instabiel, wat resulteert in zeer lage MHC-ik cel oppervlakte expressie. Aanvankelijk, deed vergelijking van T cellen gestimuleerd met antigeen geladen TAP-voldoende – deficiënte muis RMA en RMA-S cellijnen, respectievelijk als APCs, niet onthullen enig bewijs voor co-agonisme tijdens muis T-cel activatie18. Gebruik van dit experimenteel systeem heeft echter niet toestaan dat nauwkeurige controle over het bedrag van de agonist pMHC gepresenteerd onafhankelijk van niet-stimulerend zelf pMHC. Bovendien kunnen deze twee cellijnen ook verschillen in expressie of andere moleculen die T-cel activatie, zoals liganden aan T-cel co-stimulatory of remmende receptoren moduleren, celadhesie-moleculen.
Vervolgens, ontwikkelden we een protocol voor het laden van TAP2-deficiënte RMA-S cellen met exogene peptiden presentatie van een vast bedrag van agonist pMHC toestaan in de aanwezigheid of afwezigheid van niet-stimulerend pMHC. Dit werd bereikt door het volgende: incubatie van TAP2-deficiënte RMA-S cellen bij lagere temperaturen (28 ° C, in plaats van de gebruikelijke 37 ° C) te stabiliseren lege MHC klasse I zware ketting/β2 microglobulin complexen19; incubatie bij 28 ° C met exogene agonist peptide; incubatie bij 28 ° C in de aanwezigheid of afwezigheid van exogene niet-stimulerend peptide; en incubatie bij 37 ° C te verminderen cel oppervlakte expressie van de lege MHC klasse I complexen8,9. Gebruik van deze experimentele set-up is gebleken dat de aanwezigheid van niet-stimulerend pMHC activering van muis thymocytes, naïef perifere CD8 + T cellen en CTL’s8verbeterd. Mechanistically, de aanwezigheid van niet-stimulerend pMHC CD8 werving voor de T cel: APC immuun SYNAPS zelfs in de afwezigheid van agonist pMHC kan veroorzaken, en niet-stimulerend pMHC TCR interactie met CD8 co-receptor7,8kunt verbeteren. Echter kan dit experimenteel systeem geen testen van de relatieve bijdragen van TCR en CD8 co-receptor binding aan agonist en co agonist pMHC in het bemiddelen van de verhoging van de activering, als wijzigingen TCR of CD8 binding met de MHC klasse die ik zou veranderen invloed zijn op alle MHC moleculen, ongeacht de gepresenteerde peptide. Daarom gebruikten we de MHC klasse ik enkele keten technologie om dit probleem te verhelpen.
De één keten (sc) MHC klasse die ik formaat is gebruikt voor verbetering van de antigene pMHC presentatie voor therapeutische strategieën, te antwoorden op fundamentele vragen over de mechanismen van de TCR en NK-cel receptor activering en werken van20,21 . scMHC-ik bestaat uit peptide, β2– microglobulin en MHC-ik zware ketting vergezeld door twee flexibele serine/glycine-rijke linkers (figuur 1A), diverse verschillende linker sequenties zijn ontwikkeld en getest van22. scMHC-ik kan onafhankelijk van de kraan complexe vouwen en chaperonnes eiwitten nodig voor conventionele pMHC complexe vergadering20. scMHC-ik heb aangetoond te vouwen correct, zoals bepaald met behulp van bevleesdheid-specifieke antilichaam kleuring22 en door het oplossen van sc structuur met röntgendiffractie23. De elementaire scMHC-ik ontwerp is gewijzigd ter verbetering van de binding van lage affiniteit peptiden24,25.
Dit protocol beschrijft het gebruik van menselijke scMHC-I te onderzoeken van co-agonisme tijdens menselijke CTL kloon activering. Het protocol is geoptimaliseerd voor menselijke CTL kloon specifiek voor een epitoop van Hepatitis B-virus (HBV). HBV is een zware gezondheidszorg last wereldwijd, want er zijn 350 miljoen mensen besmet met HBV en chronische HBV-infectie kan leiden tot ontwikkeling van hepatocellulaire carcinoom (HCC). HCC cellen ten gevolge van HBV-infectie meestal HBV-afgeleide epitopes kunnen presenteren en kunnen worden herkend door specifieke menselijke T-cellen. HBV en HCC goedkeuring is gebaseerd op de menselijke T cel reacties26, maar HCC-patiënten vaak lijden aan T cel uitputting en verminderde T cel reacties27. Binnenbrengen van TCR HBV-specifieke T-cellen van HBV is geprobeerd als een potentiële immunotherapie strategie om te elimineren chronische HBV-infectie28. Echter, het is onbekend of deze methode effect sorteren in een klinische setting, als gevolg van de lage niveaus van oppervlakte MHC zullen-ik in menselijke hepatocyten29. Daarom kan inzicht in het mechanisme van coagonism bepalen alternatieve perspectieven voor de immunotherapie van HBV, eventueel door het verbeteren van de presentatie van endogene pMHC voor het opwekken van co-agonisme-gemedieerde T cel reacties. Het protocol bestrijkt alle nodige stappen voor onderzoek op menselijke co-agonisme: transfectie van T-REx CHO cellen met agonist en co agonist sc pMHC, generatie van stabiele T-REx CHO cellijnen, cultuur van HBV-specifieke menselijke CTL CD8 + T cellijn en CTL activering experimenten cytokine productie en degranulatie in reactie op de T-REx CHO cellen te kwantificeren. Hoewel we ons richten op het gebruik van de sc-MHC klasse I technologie te onderzoeken van co-agonisme tijdens HBV T cel activatie, opgemerkt moet worden dat de gepresenteerde methoden kunnen gemakkelijk worden aangepast voor onderzoek op andere aspecten van T cel activatie in menselijke T cel systemen met bekende pMHC-ik specificiteit.
Dit protocol maakt gebruik van een menselijke CD8 + CTL lijn specifiek voor HBV-afgeleide peptide E183-91 (FLLTRILTI: “E183”)30 gepresenteerd op HLA-A2. SC HLA-moleculen dat bestaat uit een reeks signaal van menselijke β2-microglobulin, een HLA-A2 bindend peptide van belang, een linker glycine/serine, een menselijke β2-microglobulin, een glycine/serine linker en een A2 zware ketting commercieel kan worden gesynthetiseerd (figuur 1A ). Plasmiden codering scA2 constructies met agonist E183 peptide of coagonist HIV GAG (SLYNTVATL)31 peptiden zijn verkrijgbaar bij de auteurs op aanvraag. De volgorde van de peptide kan worden gewijzigd met behulp van plaats-geleide mutagenese. Een tetracycline-afleidbare vector werd pcDNA5/aan gebruikt om uit te drukken van de agonist één keten HLA-A2 met E183 peptide (sc E183-HLA-A2). In aanwezigheid van tetracycline onderdrukker, de pcDNA5/naar plasmide kunt alleen zeer laag, “lekke” uitdrukking van de proteïne van belang; hoge expressie kan worden opgewekt door toevoeging van tetracycline (figuur 1BC). Gebruik van een systeem van tetracycline-afleidbare expressie geeft u controle over het bedrag van de cel oppervlakte agonist pMHC expressie. Een constitutief expressie plasmide pcDNA3.1 gewend was express coagonist scA2 met GAG peptide (sc GAG-HLA-A2). De expressie van tetracycline-gereglementeerde (T-REx) CHO cel (lijn hamster cel, geen endogene menselijke MHC) gewend was express agonist en co agonist sc-HLA-A2-constructies. Dit experimenteel systeem maakt nauwkeurige controle over pMHC presentatie (Figuur 1 c): geen pMHC presentatie (untransfected T-REx), een hoge hoeveelheid CO agonist pMHC presentatie (constitutieve sc GAG-HLA-A2 expressie), een lage hoeveelheid agonist pMHC presentatie (sc E183-HLA-A2 in de afwezigheid van tetracycline), een hoge hoeveelheid agonist pMHC presentatie (sc E183-HLA-A2 in aanwezigheid van tetracycline), een lage hoeveelheid agonist pMHC presentatie en hoge uitdrukking van co agonist pMHC (sc E183-HLA-A2 in de afwezigheid van tetracycline en constitutieve sc GAG-HLA-A2 expressie). Gebruik van deze experimenteel systeem maakt nauwkeurige controle van de oppervlakte bedragen van de cel van agonist en coagonist pMHC.
Het gepresenteerde protocol biedt een robuust instrument voor onderzoek naar de moleculaire interacties tijdens menselijke CD8 + T cel activatie. Een cruciale stap voor onderzoek van co-agonisme tijdens menselijke T-cel activatie is controle over agonist pMHC cel oppervlakte expressie om gelijke agonist pMHC presentatie over de APCs met of zonder co agonist pMHC expressie. In onze experimenteel systeem, dit wordt bereikt met behulp van een enkele cel kloon uiting geven aan lage hoeveelheden agonist pMHC, gevolgd door supertransfection met een co agonist pMHC construct en agonist pMHC kwantificering met behulp van TCR-achtige antilichaam10, 32. als agonist sc pMHC expressie na verloop van tijd veranderen kunt, het is van cruciaal belang te kwantificeren agonist pMHC oppervlakte expressie op APCs gebruikt in elk experiment met TCR-achtige antilichamen. Als beschikbaar, is geen specifiek antilichaam van TCR-achtige agonist scMHC-ik kan worden uitgedrukt als tl proteïne fusion en de cel-oppervlakte expressie kan vervolgens worden gekwantificeerd aan de hand een gevoelige microscopie methode, zoals de totale interne reflectie fluorescentie microscopie 35 , 36. Bovendien cel oppervlakte uitdrukking van co agonist pMHC vermindert na verloop van tijd, als gevolg van methylering-afhankelijke en -onafhankelijke monddood maken van de CMV promotor37, en moet worden gecontroleerd met behulp van antilichaam kleuring en stroom cytometry analyse, met herhaalde FACS-sorteren wanneer nodig. We hebben CHO cellen gekweekt voor maximaal 5 weken met relatief weinig verlies van sc pMHC expressie. Het is raadzaam de CHO-cellen bevriezen kort na selectie/sorteren om een betrouwbare voorraad van cellen met bekende sc MHC expressie.
De verschillende stappen van de gepresenteerde protocollen kunnen worden gewijzigd, afhankelijk van de beschikbaarheid van apparatuur of afhankelijk van de doelstellingen van het specifieke onderzoek. Bijvoorbeeld PBMC proliferatie potentiële kunt geremde (stap 3.2.1) met behulp van alternatieve methoden die vereisen geen een gamma (of X-) irradiator, zoals behandeling met mitomycine C38. Een niet-enzymatische cel dissociatie buffers met metalen chelaatvormers39 kunnen worden gebruikt in plaats van cel schrapen in stap 3.3.1. Bovendien, het antigeen presentatie systeem kan worden gewijzigd zodat het geschikter voor menselijke CTL klonen uiting van verschillende CHO TCRs. cellen uitdrukkelijke hamster MHC klasse I moleculen, en hoewel dit zijn irrelevant voor de lijn van de CTL studeerde hier (figuur 2A en Figuur 3A, we waargenomen geen T cel reacties op untransfected CHO cellen), bestaat de mogelijkheid dat andere menselijke TCRs sommige xenoreactivity kunnen weergeven. In dat geval, hamster MHC klasse I expressie kan worden verminderd door het uitsparen van hamster β2-microglubulin of tik op met behulp van CRISPR/Cas9; of een menselijke APC-lijn kan worden gebruikt nadat β2-microglubulin CRISPR/Cas9-gemedieerde of TAP knock-out.
Het experimentele systeem hier gepresenteerde maakt nauwkeurige controle van TCR en CD8-interacties met MHC moleculen presenteren van vooraf gedefinieerde peptiden. Bijvoorbeeld, hebben we eerder getoond dat mutaties afschaffing van CD8 bindende40 tot en met pMHC van de coagonist geëlimineerd de verhoging van de coagonist-gemedieerde activering in lymfkliertest en menselijke CD8 + T cellen9,10, overwegende dat de intrekking van de TCR interactie met mede agonist pMHC had geen effect op coagonist-gemedieerde activering toebehoren10. Het gebruik van één keten MHC constructies heeft echter verschillende beperkingen. Bijvoorbeeld, het is tijd en arbeid-verbruiken voor het testen van meerdere co agonist peptide sequenties met behulp van deze experimenteel systeem, als dit gaat om generatie van meerdere plasmiden codering sc MHC met verschillende peptides, en de daaropvolgende transfections en de cel sorteren. Eerder, we de lymfkliertest TAP-deficiënte cellijn RMA-S gebruikt voor het testen van meerdere co agonist peptiden in muis T-cel activatie8,9, maar deze aanpak was niet succesvol met de TAP-deficiënte menselijke T2 cel lijn10, waarschijnlijk Als gevolg van de presentatie van de kraan onafhankelijk peptiden41. Een andere beperking van onze experimenteel systeem is dat het voorziet niet in een snelle methode voor het wijzigen van de hoeveelheid CO agonist pMHC moleculen met het oog op de bepaling van de kritische hoeveelheid CO agonist pMHC nodig om te activeren van T cel activatie. Bovendien, het tetracycline-afleidbare systeem gebruikt staat geen titratie van agonist pMHC hoeveelheid op de eencellige niveau door het veranderen van de concentratie van tetracycline, zoals verschillende tetracycline concentratie het aandeel van HLA-A2 positieve cellen verandert, in plaats van HLA-A2 niveau op basis van per cel. Een alternatieve benadering die wij momenteel onderzoeken is het gebruik van ondersteunde lipide bilayers42, vroeger co-agonisme onderzoeken tijdens lymfkliertest CD4 + T cel activatie4 of kralen voorstellende vaste hoeveelheid agonist pMHC in de aanwezigheid van wisselende hoeveelheden mede agonist pMHC. Wanneer gebruikt in combinatie met UV-cleavable peptide technologie-4,43, mag deze alternatieve experimentele systemen snel testen van meerdere co agonist peptide reeksen evenals verschillende hoeveelheden mede agonist pMHC .
De sc MHC technologie kan gelden ook onderzoek naar co-agonisme in menselijke of lymfkliertest CD4 T-cellen, zoals één keten MHC klasse II moleculen presenteren vooraf bepaalde peptiden zijn geuit op zoogdiercellen oppervlakken44. Bovendien, het gebruik van sc MHC technologie kan worden uitgebreid tot onderzoek van niet-klassieke MHC moleculen zoals HLA-E. SC HLA-E is beschreven vóór, en haar expressie is gebleken voor de remming van menselijke T-cel activatie45. Een andere niet-klassieke MHC molecule van belang is CD1, waarin lipiden in plaats van peptiden46. SC constructies bestaande uit zware ketting CD1 en β2-microglobulin is aangetoond te worden uitgedrukt op het celoppervlak en binden van relevante lipide liganden47. Één keten MHC technologie heeft een groot potentieel als een onderzoeksinstrument voor het onderzoeken van moleculaire interacties tijdens de activering van T en NK-cel.
The authors have nothing to disclose.
Dit onderzoek werd gesteund door de Singapore ministerie van volksgezondheid nationale Medical Research Council onder haar CBRG/0064/2014 te N.R.J.G., door maken onder haar R571-002-012-592 P.A.M., nationale onderzoek Stichting Investigatorship R571-000-272-281 aan P.A.M ., en door een Singapore translationeel onderzoek (ster)-Detective Award (NMRC/ster/013/2012) naar A.B. We zijn dankbaar Dr Paul Hutchinson en Mr. Teo Guo Hui van NUS immunologie programma Flow Core faciliteit voor de deskundige cel sorteren. Wij zijn dankbaar aan Elijah Chen voor kritische lezing van het manuscript.
Aim-V (serum free media) | Gibco | 12055091 | |
blasticidin | Gibco | R21001 | |
Cytofix/Cytoperm (fixation/permealibisation kit) | BD | 554714 | |
F12 | Gibco | 10565-018 | |
Fetal bovine serum (FBS) | HyClone | SH3007103 | |
geneticin | Gibco | 10131035 | |
GolgiPlug (Brefeldin A) | BD | 555029 | |
Human serum | Sigma-Aldrich | H4522 | |
hygromycin | Gibco | 10687010 | |
Lectin from Phaseolus vulgaris (PHA) | Sigma-Aldrich | L4144 | |
Opti-MEM (low serum media) | Bibco | 31985070 | |
10 X PBS | Vivantis | PB0344 – 1L | |
Penicillin/Streptomycin | HyClone | SV30010 | |
polyethylenimine (PEI) | Sigma-Aldrich | 408727 | |
recombinant human IL2 | R&D Systems | 202-IL | |
recombinant human IL7 | R&D Systems | 207-IL | |
recombinant human IL15 | R&D Systems | 247-ILB | |
tetracycline | Sigma-Aldrich | T7660 | |
T-REx CHO cell line | Thermo Fisher Scientific | R71807 | |
10 x Trypsin/EDTA | Gibco | 15400054 | |
Antibodies | |||
CD3 | BD | 347347 | Clone SK7, RRID:AB_400287 |
CD8α | BD | 563795 | Clone RPA-T8, RRID:AB_2722501 |
CD107a | BD | 566261 | Clone H4A3, RRID:AB_2739639 |
HLA-A2 | eBioscience | 17-9876-41 | Clone BB7.2, RRID:AB_11151522 |
IFN-γ | eBioscience | 12-7319-41 | Clone 4S.B3, RRID:AB_1311250 |