Um método quantitativo foi desenvolvido para identificar e prever a toxicidade aguda de substâncias químicas, analisando automaticamente a caracterização fenotípica de Caenorhabditis elegans. Este protocolo descreve como tratar vermes com produtos químicos em uma placa de 384, capturar vídeos e quantificar toxicológicos fenótipos relacionados.
Aplicação de testes de toxicidade de produtos químicos em organismos superiores de ordem, tais como ratos ou ratos, é demorado e caro, devido a sua longa vida útil e problemas de manutenção. Pelo contrário, o nematódeo Caenorhabditis elegans (c. elegans) tem vantagens para torná-lo uma escolha ideal para o teste de toxicidade: uma vida curta, fácil cultivo e reprodução eficiente. Aqui, descrevemos um protocolo para a perfilação fenotípica automática de c. elegans em uma placa de 384. Os vermes nematoides são cultivados em uma placa de 384 com tratamento líquido médio e química, e vídeos são tomados de cada poço para quantificar a influência química em 33 características de worm. Resultados experimentais demonstram que as características do fenótipo quantificados podem classificar e prever a toxicidade aguda por compostos químicos e estabelecer uma lista de prioridade para mais testes de avaliação de toxicidade química tradicional em um modelo de roedor.
Juntamente com o rápido desenvolvimento de compostos químicos aplicados à produção industrial e o cotidiano das pessoas, é importante estudar a toxicidade testando modelos para os produtos químicos. Em muitos casos, o modelo animal roedor é empregado para avaliar a toxicidade potencial de diferentes substâncias químicas na saúde. Em geral, a determinação da concentração letal (i.e., a analisado 50% dose letal [LD50] de produtos químicos diferentes) é usada como o parâmetro tradicional em um modelo de roedores (rato/mouse) in vivo que é muito caro e demorado. Além disso, devido a reduzir, refinar, ou substituir o princípio (3R) que é central à ética e ao bem-estar dos animal, novos métodos que permitem a substituição de animais superiores são valiosos para a pesquisa científica1,2,3 . C. elegans é um nemátodo de vida livre que foi isolado do solo. Ele foi amplamente utilizado como um organismo de investigação no laboratório por causa de suas características benéficas, tais como um tempo de vida curto, fácil cultivo e reprodução eficiente. Além disso, muitos caminhos biológicos fundamentais, incluindo os processos fisiológicos básicos e respostas de estresse em c. elegans, são conservados no maior mamíferos4,5,6,7 , 8. em algumas comparações que nós e os outros fizeram, há uma boa concordância entre a toxicidade de c. elegans e a toxicidade observada em roedores9. Tudo isso faz c. elegans , um bom modelo para testar os efeitos da toxicidade química in vivo.
Recentemente, alguns estudos quantificar as características fenotípicas de c. elegans. Os recursos podem ser usados para analisar a toxicidade dos produtos químicos,2,3,10 e o envelhecimento dos vermes11. Também desenvolvemos um método que combina um verme líquido cultivo sistema e um sistema de análise de imagem, na qual os vermes são cultivados em uma placa de 384 sob diferentes tratamentos químicos12. Esta técnica quantitativa foi desenvolvida para analisar automaticamente os 33 parâmetros de c. elegans após 12-24h de tratamento químico em uma placa com meio líquido de 384. Numa fase de microscópio automatizado é usada para aquisição de vídeo experimental. Os vídeos são processados por um programa de design personalizado, e 33 características relacionadas ao comportamento em movimento dos vermes são quantificadas. O método é usado para quantificar os fenótipos de worm sob o tratamento de 10 compostos. Os resultados mostram que a toxicidades diferentes podem alterar os fenótipos de c. elegans. Estes fenótipos quantificados podem ser usados para identificar e prever a toxicidade aguda de diferentes compostos químicos. O objectivo geral deste método é para facilitar a observação e quantificação fenotípica de experimentos com c. elegans em uma cultura líquida. Este método é útil para a aplicação do c. elegans em avaliações de toxicidade química e quantificações de fenótipo, que ajudam a prever a toxicidade aguda de diferentes compostos químicos e estabelecer uma lista de prioridade para mais tradicional testes de avaliação da toxicidade química em um modelo de roedor. Além disso, esse método pode ser aplicado à toxicidade de triagem e testes de novos produtos químicos ou o composto, como a poluição de agente aditivo de alimento pharmacautical compostos, compostos exógenos ambiental e assim por diante.
As vantagens de c. elegans levaram-se a sua crescente utilização em toxicologia9, tanto para estudos mecanicistas e abordagens de seleção da elevado-produção. Um papel acrescido para c. elegans em complementando outros sistemas modelo na pesquisa toxicológica tem sido notável nos últimos anos, especialmente para a avaliação da toxicidade rápida de novas substâncias químicas. Este artigo fornece um novo ensaio de triagem elevado-throughput, quantitativo de worm fenó…
The authors have nothing to disclose.
Os autores agradecer CGC gentilmente enviar o c. elegans. Este trabalho foi apoiado pela nacional chave de pesquisa e desenvolvimento programa de China (#2018YFC1603102, #2018YFC1602705); Fundação Nacional de ciências naturais da China Grant (#31401025, #81273108, #81641184), a Capital de saúde pesquisa e desenvolvimento de projeto especial em Pequim (#2011-1013-03), o fundo da abertura do Beijing chave laboratório de toxicologia ambiental (# 2015HJDL03) e a Fundação de ciências naturais da província de Shandong, China (ZR2017BF041).
2-Propanol | Sigma-Aldrich | 59300 | |
384-well plates | Throme | 142761 | |
Agar | Bacto | 214010 | |
Atropine sulfate | Sigma-Aldrich | PHL80892 | |
Bleach buffer | 0.5 mL of 10 M NaOH, 0.5 mL of5% NaClO, 9 mL ofultrapure water | ||
Cadmium chloride | Sigma-Aldrich | 202908 | |
Calcium chloride | Sigma-Aldrich | 21074 | |
CCD camera | Zeiss | AxioCam HRm | Zeiss microscopy GmbH |
Cholesterol | Sigma-Aldrich | C8667 | |
Copper(II) sulfate | Sigma-Aldrich | 451657 | |
Ethanol | Sigma-Aldrich | 24105 | |
Ethylene glycol | Sigma-Aldrich | 324558 | |
Glycerol | Sigma-Aldrich | G5516 | |
K-Medium | 3.04 g of NaCl and 2.39 g of KCl in 1 L ultrapure water | ||
LB Broth | 10 g/L Tryptone, 5 g/L Yeast Extract, 5 g/L NaCl | ||
Magnesium sulfate heptahydrate | Sigma-Aldrich | 63140 | |
NGM Plate | 3 g ofNaCl, 17 g ofagar, 2.5 g ofpeptone in 1 L of ultrapure water, after autoclave add 1 mL of cholesterol (5 mg/mL in ethanol), 1 mL of MgSO4 (1 M), 1 mL of CaCl2 (1 M), 25 mL of PPB buffer | ||
Peptone | Bacto | 211677 | |
Potassium chloride | Sigma-Aldrich | 60130 | |
Potassium phosphate dibasic | Sigma-Aldrich | 795496 | |
Potassium phosphate monobasic | Sigma-Aldrich | 795488 | |
PPB buffer | 35.6 g of K2HPO4, 108.3 g of KH2PO4 in 1 L ultrapure water | ||
shaker | ZHICHENG | ZWY-200D | |
Sodium chloride | Sigma-Aldrich | 71382 | |
Sodium fluoride | Sigma-Aldrich | s7920 | |
Sodium hydroxide | Sigma-Aldrich | 71690 | |
Sodium hypochlorite solution | Sigma-Aldrich | 239305 | |
The link of program | https://github.com/weiyangc/ImageProcessForWellPlate | ||
Tryptone | Sigma-Aldrich | T7293 | |
Yeast extract | Sigma-Aldrich | Y1625 | |
Zeiss automatic microscope | Zeiss | AXIO Observer.Z1 | Zeiss automatic microsco with peproprietary software Zen2012 and charge coupled device(CCD) camera |