Использование бесплатно, открытым исходным кодом программного обеспечения, мы разработали аналитический подход к количественно оценить объем общей и региональной коричневый жировой ткани (BAT) и метаболической активности летучей мыши, с помощью 18F-ФДГ-ПЭТ/КТ.
В эндотермических животных коричневая жировая ткань (BAT) активируется для производства тепла для защиты температуры тела в ответ на холод. BAT в возможность расходовать энергию сделало его потенциальной мишенью для Роман терапии для улучшения ожирение и связанные метаболических расстройств в организме человека. Хотя эта ткань хорошо изучены в мелких животных, BAT термогенный способность людей остается практически неизвестны из-за трудности измерения ее объем, деятельности и распределения. Выявление и количественное определение активного человека BAT обычно выполняется с помощью 18F-Fluorodeoxyglucose (18F-ФДГ) позитронно-эмиссионная томография и компьютерная томография (ПЭТ/КТ) сканирует следующие холодной экспозиции или фармакологических активации. Здесь мы описываем подробный анализ изображений подход к количественной оценке всего тело человека BAT из 18F-ФДГ-ПЭТ/КТ сканирование с помощью программное обеспечение с открытым исходным кодом. Мы демонстрируем рисования определяемый пользователем регионов, представляющих интерес для выявления метаболически активные жировой ткани, избегая общих-BAT тканей, мера BAT объема и активности и для дальнейшей характеризации анатомического распределения. Хотя этот строгий подход является длительным, мы считаем, что он в конечном итоге обеспечит основу для разработки будущих автоматизированных BAT количественной оценки алгоритмов.
Увеличение распространенности ожирения во всем мире1 побудило расследование Роман терапии для предотвращения и улучшения ожирения и его осложнений связанные. Ожирение является отчасти объясняется избыток энергии, хранящейся в белой жировой ткани (Ват) в виде триглицеридов2. Коричневая жировая ткань (BAT) отличается от Ват прежде всего благодаря выше митохондриальной содержание, меньше и многокамерный липидного капель, собственный анатомического распределения, больше симпатической иннервации и тепловой генерации способности. Хотя когда-то считалось, что BAT существуют только в мелких млекопитающих и новорожденных, наличие функциональных Бат был подтвержден в взрослых людей в 20093,4,5. Термогенный способности человека BAT пока не известна, но обширные исследования в мелких животных показали, что не дрожал термогенеза может составлять до 60% их метаболизм во время холодной экспозиции6. В результате человека Бат теперь изучаются как цель для лечения и профилактики ожирения и расстройств, связанных с7. Несколько клинических исследований показали, что бат термогенеза коррелирует с повышенной Глюкоза поглощения и энергии расходы после активации мягкая холодного воздействия8,9,10. Тем не менее, BAT вклад холодной индуцированной термогенеза остается спорным11,12,13,14, с много споров вокруг как количественно оценить человека BAT15. Чтобы лучше понять, если термогенеза BAT могут быть использованы для борьбы с ожирением, важно иметь точное измерение его объем и метаболической активности.
Получение точных измерений BAT является сложной задачей вследствие BAT в уникальный анатомического распределения в организме человека. BAT распространяется внутри белый жировых депо в шеи, грудной клетки и живота в сайтах, которые являются недоступными для неосложненной биопсий14. Вскрытия были использованы для характеристики BAT анатомически16, но являются неосуществимыми для большинства научно-исследовательские лаборатории, делают большие исследования и не может обеспечить продольной или функциональной информации. Так как BAT имеет аналогичные плотность от Ват и может произойти в узких Фасциальных слоев или в маленьких карманов, перемежаются с Ват16, трудно определить с помощью единого, обычных изображений техники. Эта неоднородность также затрудняет автоматическое количественная оценка БИТОЙ чем количественная оценка однородных структур, таких как печень17.
Для преодоления этих проблем, объем BAT и деятельности обычно количественно, связывая компьютерная томография (КТ) и позитронно-эмиссионная томография (ПЭТ). Radiolabeled глюкозы аналоговый 18F-Fluourodeoxyglucose (18F-ФДГ) является наиболее широко используемым трассировщик учиться BAT метаболической активности18. Жировой ткани может быть продифференцированным от других тканей и воздуха, основанные на плотность информации, представленной КТ изображения в единицах Hounsfield (Ху). ПЭТ изображения показывают количество 18F-ФДГ учитывать объем тканей в единицах стандартизированных усвоение ценностей (Внедорожник). Активные BAT могут быть отделены от ткани с незначительными трассирующими поглощения, включая Ват и неактивные BAT, путем совместного регистрации ПЭТ изображения с соответствующим КТ и выбрав соответствующий предел внедорожник.
Через этот документ мы стремимся обеспечить поэтапный подход с учебное видео, которое может использоваться клинических исследователей для количественного определения человека бат с использованием 18F-ФДГ-ПЭТ/КТ сканирование. Этот метод анализа изображения идеально использоваться после того, как предмета (ов) были на холоде или лечение с фармакологическими BAT стимуляторов. В частности мы продемонстрировать пользователям о том, как построить регионы интереса (ROI) при минимальном количестве ложных срабатываний, используя программное обеспечение обработки изображений бесплатно, с открытым исходным (ImageJ) с конкретного плагина (petctviewer.org). В результате этого подхода может использоваться для изучения BAT тома (поглощение глюкозы) и активность анатомического распределения индивидуальных предметов.
После подтверждения функциональной BAT на взрослых людей был большой интерес в понимании роли BAT в физиологии человека. Однако потому что это термогенный ткани часто встречается в узких фасциальных плоскостями, interspersed в пределах белого жира и вокруг других органов, это сложно определить количественно. В 2016 году на основе консенсуса документ был опубликован группой экспертов Международный BAT с рекомендациями для представления соответствующих участников характеристики, критерии для вопроса подготовки и протокол для получения изображения PET/CT21. Группа также указала на необходимость большей последовательности в обработке PET/CT BAT количественной оценки, отметив, что методы для выявления BAT менялись широко и, в большинстве случаев предоставляется только ограниченные детали процедуры количественного определения BAT. Следовательно, хотя доклады в рамках исследования воспроизводимость являются высокие22,23,24, заметно разные BAT объем и деятельности было сообщено групп с использованием методов количественной оценки различных, даже при Участники имеют аналогичного возраста, пола и ИМТ25,26. Эти несоответствия затрудняют сравнение результатов и привели к полемике над суммой BAT в взрослого человека15.
Ограничение, свойственное обработки изображений ПЭТ/КТ является включение вокселей, ПЭТ и КТ критериям, но находятся в анатомических местах, которые соответствуют структурам помимо BAT. Идеальный ко-регистрация ПЭТ и КТ изображений практически невозможно из-за различий в резолюции и тема движения во время сканирования. Как следствие структуры, граничащих с воздуха или кости и регионах высоких трассирующими поглощения часто неправильно определены как активные BAT. Чтобы ограничить включение ложных положительных вокселей, один следует применять ПЭТ и КТ критерии только в пределах трансформирования, которые пользователям построить. Однако нынешние подходы к количественной оценке бат с пользователем ROIs или автоматизированного анализа отличаются размере участие пользователей и знания, которые они требуют. Мы показали, что с помощью одного, двумерные определяемые пользователем корональный ROI применяется к весь стек изображений могут быть более склонны к включая ложных положительных районы19. Несколько групп разработали автоматизированные методы для количественного определения BAT, которые способны быстро обрабатывать большие наборы данных без много ввода пользователя. Однако эти методы либо не включать всех потенциальных BAT-содержащих регионов, особенно в нижней тела27, или нести относительно высокий уровень ложных срабатываний28 и ложь негативы26. Поскольку объем человеческой BAT в целом низок (< 600 мл, или < 2% от общего числа массы тела), небольшие абсолютной ошибки в количественной оценки может привести к большим относительные различия.
Более строгий подход, описанный в этом исследовании рисования ROIs на каждый ломтик осевой ПЭТ-КТ позволяет обнаруживать BAT в узких Фасциальных слоев обеспечивая больше уверенности, что были исключены ложных срабатываний. Это дает подробную количественную оценку в каждом individial, вместо того, чтобы бинарные оценки BAT присутствие или отсутствие29. Таким образом она может быть более подходящим для контролируемых экспериментов в небольшой выборки, намеревается изучить последствия от вмешательства и/или BAT физиологии. Кроме того возможность определения конкретного региона BAT складов может обеспечить более глубокое BAT в функциональной значимости и развития происхождения. Мы считаем, что эти количественные показатели важны не только для сравнения по всему полю, но и лучше оценки BAT вклад энергии метаболизма и терморегуляции у взрослых людей.
Некоторые анатомические особенности BAT поможет пользователям нашего метода предел включение ложных положительных вокселей. BAT обычно встречается в непрерывной и симметричного Фасциальных слоев. Таким образом во время рисования и переработки ROI, изучение высших и низших осевые срезы для преемственности и симметрии выбранного жировой ткани может помочь пользователям максимизировать включение жировой ткани при сведении к минимуму включение скелетных мышц, костей и других Очевидно-BAT структуры. Активные BAT присутствует также редко в подкожных жировых депо, поэтому мы советуем пользователям избежать этих областях при построении ROIs. Как отмечено в протоколе, BAT распространяется в нескольких различных анатомических регионах, включая шейки матки, dorsocervical, надключичных, подмышечных, средостения, paraspinal и брюшной депо. Эти склады распределяются таким образом, чтобы осевые один ломтик мая содержат больше, чем BAT из нескольких складов. К примеру осевой срез в регионе грудной могут содержать BAT от средостения депо (проксимальный и передней), paraspinal депо (проксимальный и задняя, вдоль позвоночника) и подмышечный депо (боковые и вблизи середины Антеро задней линии). Знание этих складов может помочь пользователям создавать ROI в различных регионах тела, поскольку они происходят в предварительно описанных мест во многом смежными, как описано в наших протокол. Однако потому что мы рекомендуем пользователям рисовать только один ROI за кусочек во избежание дублирования ROI, дополнительные шаги генерации маски BAT и рисование сагиттальной ROIs требуется отделить вокселей BAT ранее выявленных в отдельных региональных складов, если требуемой информации BAT распределения, т.е., отделяя средостения, paraspinal и подмышечных BAT, обнаруженных в же осевой ROI в депо основанный на месте сагиттальной (рис. 3).
ПЭТ/КТ просмотра программное обеспечение может также использоваться для количественного определения активности тканей помимо BAT, например дрожал скелетных мышц, который также крупные играет роль холодной индуцированной термогенеза19, или различных областях мозга или печени, которые были предложено в качестве ссылки тканей для анализа PET/CT21. Однако эти ткани будет иметь плотность и анатомические дистрибутивов, которые отличаются от BAT и за пределами фокус нашего нынешнего протокола. Мы направлять читателей на консенсусный документ для более подробно на этих субъектов21. Наконец мы рекомендуем всем пользователям постоянно обновлять ImageJ и посетить petctviewer.org плагин обновления и программного обеспечения помощи.
Хотя мы считаем, что этот строгий метод является более точным, чем автоматизированных методов26,28 и методы, которые используют упрощенные, единый ROI для оценки всего BAT объем9,30, это не без ограничений. Существует не идеальный метод поддается неинвазивно BAT в организме человека, и 18F-ФДГ представляет только поглощение глюкозы, это не то же самое, как метаболизм глюкозы11. Однако даже несмотря на то, что другие радиоактивные Трейсеры были используется31,3332,, 18F-ФДГ является наиболее известных трассирующими, используется для изучения человеческого BAT. Таким образом разработка стандартизированных методов для анализа 18F-ФДГ-ПЭТ/КТ изображения будет продолжать быть впечатляющие в исследовании физиологии человека BAT в обозримом будущем.
Метод, который мы предлагаем, создание ROI на каждый ломтик осевой BAT-содержащих избегая общих проблемных областей, является трудоемким и требует от пользователя иметь некоторые знания о базовой анатомии. Это также возможно, что строгий отбор ROI может ввести ложных негативов, так как некоторые BAT-содержащих складов может избежаться. Рисование ROIs на каждый осевой кусочек плавленого ПЭТ/КТ изображения позволяет тщательно дискриминации между жировой ткани и соседних метаболически активных тканях и/или регионами воздействие разлива над и частичный объем эффекты34. Однако время, необходимое для завершения анализа одного сканирования может варьироваться от трех до восьми часов, с возможность сокращения сроков с практикой и опытом. Подходы различных машинного обучения могут быть в состоянии сократить труда и знаний, необходимых для выполнения этой задачи. Однако создавая более автоматизированный метод, который может точно обнаружить BAT и надежными для ложных срабатываний, созданных изображений ограничений потребует большого набора данных с лицами состава различных тела и BAT распределения. Мы надеемся, что этот метод может использоваться для производят подробный атлас BAT, который может служить в качестве шаблона для более сложных подходов больших объемов данных.
В заключение мы продемонстрировали анализа подход шаг за шагом изображения количественно оценить объем коричневых жировых тканях человека, деятельности и распределения с использованием холодной индуцированной ФДГ-ПЭТ/КТ сканирование. Важнейшие шаги включают 1) непрерывно и последовательно анализ осевой трансформирования и 2) оценки соответствующих Бат складов, их анатомического расположения избегая других метаболически активных тканях. Этот строгий количественной оценки подход может использоваться исследователями в области изучения физиологии BAT и служить справочным материалом для разработки автоматизированных человека BAT количественный подходов в будущем.
The authors have nothing to disclose.
Мы хотели бы поблагодарить всех добровольцев исследования, медсестер и клинического персонала и диетологи NIH клинический центр за их участие в наших исследований воздействия холодной и оказываемых в ходе стационарного остается. Мы также хотели бы поблагодарить д-р Билл Dieckmann для всех его помощи, приобретение и распространение изображений ПЭТ-КТ для нашего исследования. Эта работа была поддержана очной программы исследований Национального института диабета и пищеварительной и почечных заболеваний грантов Z01 DK071014 (для K.Y.C.) и DK075116-02 (до Мехико.).
ImageJ/Fiji Software | ImageJ | https://imagej.net/Fiji/Downloads | Open Source Software |