フジツボタテジマフジツボ (Amphibalanus) improvisusは、浸透圧調節や防汚のモデルです。ただし、季節の自然産卵と、cyprid 幼虫の予測不可能な供給が得られます。ここでは、幼虫の生産を含むb. improvisusのオールラウンド年養殖のためのプロトコル、説明します。遺伝子発現研究培養ふじつぼ類の使用を示しています。
フジツボが付着大人海産甲殻類と自由遊泳性、浮遊性の幼生。フジツボタテジマフジツボ (Amphibalanus) improvisus低塩分の極端な耐性のため浸透圧調節機構の研究のためのモデルとして特に関連します。防汚研究に関連して特に生物学のモデルとしても広く使用されます。ただし、自然季節産卵研究 cyprid 幼虫の予測不可能な供給が得られます。B. improvisusのすべての年間養殖は開発され、生産ラインでの手順をすべての詳細な説明のためのプロトコルを説明 (すなわちパネル、コレクションとの飼育アダルト文化の確立フジツボ幼虫と成虫と幼虫の飼料の管理)。説明もトラブルシューティングに関するガイダンスを提供し、重要なパラメーター (例えば汚染の除去、高品質飼料の生産、必要な人材、高品質海水の重要性) を説明します。養殖システムから各バッチは最大限に約 12,000 給餌が得られます、毎週ほぼ 50,000 の幼虫まで作り出すことができるので、1 週間で 4 つのバッチを配信できます。B. improvisusの文化に使用する方法は、おそらく、大部分は無料 swimminglarvae とその他の海産無脊椎動物にも対応。プロトコルは、様々 な組織の郭清の遺伝子発現の研究の質の高い RNA の生産と同様、大人から掲載されています。それはまた記述されているどのように培養大人と飼育 cyprids は外部要因に関連して遺伝子発現を調べるための実験的デザインの広い配列で利用できます。遺伝子発現培養ふじつぼ類の使用、Na+の可能な浸透圧調節の役割の研究で示されて/K+ ATPase とアクアポリン。
フジツボが付着大人海産甲殻類と自由遊泳性、浮遊性の幼生。フジツボの 1,200 の種のほとんど浅い水の多くはしばしば低塩分にさらされています。ほぼ淡水容認することは 1 つの種、タテジマフジツボ (Amphibalanus) 即席に作る(B. improvisus) 湾のフジツボとチャールズ ・ ダーウィンにウルグアイ1リオ ・ デ ・ ラ ・ プラタの河口の小さなストリームからこの種が記載されています。B. improvisus浸透圧調節機構2,3の研究の特に関連するモデルを極端な耐性の時塩分になります。このフジツボは汽水の条件を好むが約 1.6 psu から塩分と水に住んでいることに高い 40 psu4として。バルト海の汽水で生息するフジツボだけです。B. improvisusアメリカ大陸の東海岸に由来すると考えられてが今日は世界の分散のために5を同梱します。それは主要な汚損生物と岩、桟橋、ボートの船体でよく見られる、したがって海洋、塩気のある水6、7の構造の生物付着のメカニズムを理解するための一般的な関心の。
他のほとんどのフジツボと同様、 b. improvisusは受精; と雌雄同体複製は、細長いペニスと体内受精を使用して隣接個体間の交配によって発生します。生殖期間は主に 5 月から 9 月です。B. improvisusは 7 遠洋幼生 (6 給餌 1 つ cyprid ステージ8の順)。ノープリウス幼生は自由遊泳は、非給餌 cyprid 幼虫に脱皮する前に数週間までの水の列のフィードに受精卵が孵化。Cyprid は複数のキューを使用してを解決する適切なサイトを検索して付着少年フジツボ9に変身を経る。種が実験室で培養することができます、海 (実験室文化で 2-3 年) に 1-2 年の寿命。平均では、 B. improvisus (最大 20 mm 程度) が付いている直径で 10 mm に成長し、約 6 mm の高さの最大値に達すると (ただし、それは混雑した条件の下で背が伸びることができます)。種ができるシェル プレートの放射状パターンの石灰質ベースと tergal プレート1,10の形その滑らかな石灰質もシェル (白または灰色がかった) によって識別されます。
フジツボB. improvisus分子生理機構と同様、生態学的相互作用と進化の結果の焦点との浸透圧の研究のためのモデルとして有利な機能があります。防汚メカニズム関係7,11,12,13研究に関連して特に生物学の調査のためのモデルとしても広く使用されます。ただし、自然季節産卵研究 cyprid 幼虫の予測不可能な供給が得られます。したがって、そのライフ サイクル全体を通じてこのフジツボを一年中文化能力です分子および作用機構研究の様々 なタイプを有効にする主要な資産であります。また、海洋/汽水域の世界でのプレゼンスは、フィールドと実験的研究の組み合わせにできます。制御された繁殖は長期培養14について知られている家系の家族を作成することも、数ヶ月の生成時間は長期的な戦略の実験的進化できます。またドラフト ゲノムとトランスクリプトームのいくつか、ありこれらのリソースは、いくつかの遺伝子 (例えば、浸透圧に重要な遺伝子)2,3のクローニングのために使用されています。
このプロトコルの目的は、確立し、大人やこの生物の幼虫について遺伝子発現研究を行うために一年中フジツボB. improvisusの文化を維持する方法について説明することです。Rittschofら15種タテジマフジツボの cyprids の集落への給餌のリリースからフジツボを培養するための方法について説明します。プロトコルは Tjärnö 海洋研究所 (スウェーデン)、 b. improvisusのすべて年間を通して養殖に適応されているし、生産を含むとフジツボの飼育、生産ラインのすべてのステップの詳細な説明が記載されて幼虫と成虫と幼虫のフィードの管理。完全な手順の概要については、図 1を参照してください。養殖システムの使用はいくつかの一般的な実験のセットアップを例示、Na+の機能ゲノミクス研究で示されている/K+ ATPase とアクアポリン、浸透圧調節2、その機能の解明 3。それは特定の臓器における遺伝子発現を調べることが不可欠でありフジツボ解剖の基礎の一部を支給します。質の高い海水の良い供給、フジツボB. improvisus、および他の可能性のある多くの種の培養できるはず世界中の海洋研究室です。
Tjärnö 海洋研究所 (スウェーデン) にフジツボ文化は 20 年以上されていると、多くの異なる分野で研究に使用されています。30 以上の科学論文が発行されている研究を含む防汚13,22, 流体力学23, 化学生態学24年間養殖システムを利用して、気候変動16、進化生物学5、および分子生物学2。
研究室環境 (野生の母集団を代表できない場合があります個人) により適応している特定の個人の選択を避けるためには、毎年フィールドから新しい親魚を収集するためにそれをお勧めします。さらに、通常の年の間にほぼ成人の死亡率の 50-80% があるので毎年、文化を活性化させることをお勧めではまた。しかし、目的は自殖系統実験進化の研究を設定するか、飼育の家族だけは使用されるが。
Tjärnö 海洋研究所パネルB. improvisusを収集する良い時間を当時の海で cyprid 幼虫の十分な供給があるため 6-8 月です。他を手動で削除して起動時にフジツボ決済毎週パネル解決b. improvisus (例えば、ムール貝、アステラス製薬、コケムシ、ヒドロ、nemerteans/隊、他のフジツボ種) より種をチェック、パネル (例えば歯ブラシで)。Tjärnö、周り 3 浅瀬のフジツボの種 (B. improvisus Semibalanus balanoides、タテジマフジツボ crenatus) があります。7 月-8 月に支配的な滑らかなハード面の行うことはB. improvisus です。S. balanoidesその決済期間は早いばねの間に、主に天然物 (例えば石) を好みます。B. crenatusは、夏の間にパネルの低い数字で発生します。
また、培養の cyprids、特定の特徴を持つ特定の linages が確立されている場合に必須になる、または実験進化学大人のフジツボの新しい世代を開始することが可能です。大人の新世代を開始する最も便利な方法は、研究室では、熱可塑性樹脂パネル cyprids を解決することです。新規入植 cyprids でこれらのパネルは、実験的治療またはフィールドの露出のためにも使えます。緊急の場合、1 つは、近隣のサイト (例えばTjärnö の海洋研究所の場合 Idefjorden) B. improvisusは共通から岩に大人も使用できます。これらの既に確立された大人はこのようにトレイに置かれているパネルの大人と同じように扱われを介してフローを介してシステムを供給します。フローセルは、フジツボ25パネルを確立するも使用できます。これらは、フロースルー プランクトン ネットを cyprids 我慢しないでください、幼虫の唯一の解決の表面板と側面が付いている部屋です。
すべてのライフ ステージを含む長期的な機能しているフジツボ文化を設定するために重要ないくつかの手順があります。B. improvisusの文化に使用するメソッドは、おそらく、大部分は、自由遊泳、planktotrophic 幼虫とその他の海産無脊椎動物にも対応します。養殖のいくつかの種は、すでによく手順 (例えばムール貝、カキの種)26、他の海産無脊椎動物のために彼らの一生にわたる長期的な文化の例がありますサイクル。文化フジツボ (B. アンフィトリテ) 最初の成功した試みの一つが Rittschofらによって行われていた15. 長期的な財政および個人的なリソースは、フジツボの養殖施設の設定を検討する前に場所でする必要があります。年のこの種のメンテナンス-フジツボ周り文化は少なくとも 1 人作業半分時間を必要とします。主に微細藻類27の養殖、生産ラインでいくつかの手順の将来の自動化のいくつかの可能性があります。さらに、成功するために質の高い海水の大量にアクセスを持つことが不可欠です。フジツボ、アルテミア、微細藻類の培養は、特定の安全手順を含まない。ただし、いくつかの防汚物質や有害化学物質のテストは、特別な予防策を必要があります。
パネルは、汚染のため週に数回をチェックされました。文化で使用される海水は、コスター フィヨルド Tjärnö 海洋研究所の外に 40 m の深さから汲み上げは、ラボの水システムに入る前に 2 つの砂フィルターを通して渡されました。水のフィルター処理が行われてない場合文化ではるかに多くの汚染があります。定期的にデトリタスやフィールドから海水の供給を介してシステムに入力 (例えば、匐枝建物ヒドロと捕食 nemerteans) その他の無脊椎動物からの文化でパネルをきれいにすることが欠かせません。たとえば、にもかかわらず、幼虫が生成されない文化が十分に供給しそれ以外をされているという事実は、良好な状態にするよう交尾を阻害するために表示される nemerteans の存在の問題かもしれない。当然、Tjärnö 海洋研究所文化における汚染の生物の多くは、スウェーデンの西海岸の特定、他の種類の生物を汚染が流行して他の地域での挑戦の多くであります。スウェーデンの西海岸、珍しくパネルに他のフジツボの生物に汚染を見つけること。時折、 S. balanoidesの確立が発見されているが、これは非常に限界の問題 (せいぜい、1 S の balanoides汚染 10,000 b. improvisusサンプルのため)。種を汚染することの欠如が最も可能性の高い優占 larvaefrom B. improvisusの頃、夏の間に新しい文化を確立する体制に依存していた。さらに、またあったパネルB. improvisusの明確な濃縮この種は滑らかな表面の13の選択なので。
死んでいる大人のフジツボを必ずしも削除する必要は。空のシェルは、パネルに残っている、彼らは避難所アルテミアノープリウスおよび様々 な混入種の両方になります。さらに、死亡個体隣接する分解中に有毒な化合物のリリースでおそらく個人の幸福に影響を与えることが注目されています。成人の死亡率の追加結果はいくつかの個人が (にもかかわらず、フジツボは、そのサイズに関連して動物の世界最長の陰茎を持っている) 交配を許可する他の大人から一人で、あまりにも遠くで残される、28。これらの個人は存続するが、幼虫のための生産的です。しかし、これらの孤独な大人個人ベース プレートを傷つけることがなく優しく削除できます、交尾を有効にする他の人の近くに水平方向に配置します。フジツボもそれぞれ大人 1 人とパネルを配置することで合致することができますが、受精が発生することが、十分に近い。このように、遺伝子のラインは作り出された14をすることができます。
高品質のフィードを作成してほぼ毎日文化を養うために重要です。食べ物がなくてもあっても数日は、幼虫のリリースが減少で起因できます。飼料組成の前のテストは、珪藻成長と給餌フジツボの生存に不可欠であることを示しています。いくつかの珪藻種見えるとして適切なフィード、小規模または孤独な細胞 (直径未満 10 μ m) 給餌の摂取の必要がありますが。S. marinoi c. 単信、 t. pseudonanaの種すべては適切なフィードB. improvisus給餌のためだけでなく、栽培が簡単に証明しています。さらに、飼料の品質は指数関数的に成長している藻類のため一般的に高いです。また、珪藻がB. アンフィトリテ15の生産的な文化を確立するために不可欠であることが報告されています。珪藻の重要性の理論は彼らがユニークな脂肪酸プロファイルを持っている、20:5 の高度不飽和脂肪酸29で特に豊富。それが示されてきた特定の脂肪酸がオイスター幼虫30の開発に成功のために重要です。
年間で、フジツボ文化の有害な病気の発生率がされてないです。カキとムール貝のような多くの商業無脊椎動物漁場に病気はなく一般的で、非常に有害な場合があります。ウイルスの有害な影響は、野生の個体群からも報告されています。フランスでネイティブのオイスターは、1925 年に、ポルトガル オイスターマガキ angulataと取替えられたが、この種は 1970年31周りイリドによって一掃されました。最近では、太平洋のカキ、世界中の文化で ostreid ヘルペス ウイルス 132に関連する表示されるマガキで大規模な死亡イベントがあった。フジツボにウイルスや細菌、病原体の報告は今のところ発表されていません。しかし、 b. improvisusの継続的なゲノム プロジェクト、ウイルスの配列が見つかりました (Alm Rosenbladら、未発表データ) が病気の症状に明らかなリンクがないです。抗生物質の混合物は、細菌感染症のリスクを最小化する文化に以前適用されています。ただし、この手順が放棄され現在、これまでのところ、これが汚染問題を生じない。
(前述) に海水を加熱すると、過熱と文化生産ラインで最も深刻なリスクがあるかもしれない。もちろん、センサーと適切な警報システムが使用される (例えば、責任者に電子メールまたはテキスト メッセージを送信) ありますが、過熱を防ぐためには困難です。過去にこの種の事件は文化で大人の実質的殺害しました。もちろん、壊滅するし、時間とお金の長期的な投資を台無しにするこのできます。特に、これは近交系の遺伝子のラインが確立されている場合は致命的となります。そのようなラインの寿命を確保し、彼らは偶発的な損失から保護、フジツボの凍結保存方法を開発することが望ましいこと。それは太平洋のカキから幼虫のダウン凍結および部分的な成功33で復活できることを報告されています。Cryobanking はまた、幅広い種34の遺伝資源を維持するために貴重なツールをされています。B. アンフィトリテからも給餌は凍結35、生き残るために報告され、凍結ダウン個人の 20% が正常に cyprids36に変成することがわかった。しかし、文化の長期的な持続可能性のための凍結を適用することは今のところ採用されていないが、これは確かに選択した線の維持のため必要これは強力な海洋 modelsystem にB. improvisusをしっかりと確立するための重要なステップになります。
ここでは、プロトコルは、 B. improvisus (すなわち前後、相馬、マントルピース) の大人から様々 な組織の郭清に対して贈られました。ただし、他の組織が抽出もできますそれ強調する必要があります。例えば、軟膜ベース種クロフジツボ スギついての外装と内部マントル間慎重に分離され RNA の抽出および遺伝子表現37の RNA シーケンス解析に使用します。ここで説明した最適化されたアウトラインの抽出プロトコルは、開始材料の最小量からシーケンスの高品質 RNA の十分な量を提供します。まず、均質化管に直接個々 の幼虫のコレクションは、1 つの管から別の転送中に任意の損失を最小化します。さらに、テストのさまざまな方法の中で、RNA の点で最も効率の良いをもたらすことを証明したセラミック ビーズと超音波または杵の均質化と比較して整合性が均質化。遺伝子発現やゲノム解析実験を計画するとき心に留めて、フジツボの高い遺伝的変異の挑戦、少なくともB. improvisusのあること。フジツボは、コード領域 (Alm Rosenbladら、未発表データ) でも、3-5% の範囲、遺伝的多様性。これはもちろん、qPCR 解析のためのプライマーの設計に特定の要求を置きます、領域の識別し一貫性のある表現の結果 betweenbatches を得るためにプライマーのためのテンプレートとして使用する必要があります保存より。標的遺伝子の節約された地域アクアポリンと Na のような + K + Atpase, cyprids を含む個人の何百もの集団から得られた RNA シーケンス データのこれらの遺伝子の順序の変動を研究することによって識別できます。ゲノム解析のため DNA がサンプリングされます。ただし、 B. improvisusから高品質の DNA を取得することができます挑戦する21。
結論としては、確立されたフジツボ文化は、さまざまな種類の実験的研究に尽力する証明されています。特に、すべての年周り幼虫生産は、天然の産卵期間に制限されることがなく実験を実施する私たちをことができます ( B. improvisus、これは、夏の間に)。得られた幼虫は、幅広い決済アッセイ、動作の試金、特定の遺伝子の表現研究ゲノム ・ トランスクリプトーム研究などの実験的研究を実行する使用できます。
The authors have nothing to disclose.
この研究は、アンダース ブロームベルクにスウェーデン研究評議会 (VR) および EU のサポートされているプロジェクト海岸から 2017-04559 助成金によって支えられました。特に、養殖施設の設置、年間で、支えられている補助金 r. ジョンソンあたりに次の資金調達機関から: SSF (スウェーデン戦略研究財団) プログラム海洋科学と技術と船舶用塗料・ プログラムを通じてミストラ。ケント ・ ベルントソン、culturingfacility のセットアップの初期段階に尽力しました。さらに養殖施設は海洋の進化生物学 (www.cemeb.science.gu.se) の中心部から来ている確立のための資金であるスウェーデン研究協議会 FORMAS と VR からリンネ助成します。
Plexiglas (poly-methyl methacrylate) panels | Plastic produkter, Bromma, Sweden | transparent glas | |
1.5-L PET bottle | |||
Artemia | INVE Aquaculture, Belgium | We have tested different companies; this is really the best one | |
Skeletonema marinoi (CCAP strain 1077/5) | CCAP (Culture Collection of Algae and Protozoa); Scotland | strain 1077/5 | |
Chaetoceros simplex var. gracilis (CCAP strain 1085/3) | CCAP (Culture Collection of Algae and Protozoa); Scotland | strain 1085/3 | |
Millipore cartridge filter system | Millipore | ||
cartridge with a nominal pore size of 0.2 µm | Millipore | cartridge CWSS01S03 | High capacity for large volumes |
polycarbonate bottle | Nalgene | autoclavable | |
RNA later | Qiagen | 76106 | Fixation solution to preserve RNA |
TURBO DNA-free Kit | Invitrogen/Thermofisher Scientific | AM1907 | DNAse kit to remove DNA from prepared RNA |
iScript cDNA Synthesis Kit | Biorad | 1708890 | cDNA synthesis kit |
SYBR Green supermix | Biorad | 1708880 | Dye for QPCR |
RNeasy minikit | Qiagen | 74104 | RNA extraction of adults or many cyprids |
Soft tissue homogenising CK 14, 2 ml tubes | Precellys | KT03961-1-003.2 | Ceramic beads for homogenisation |
RNeasy micro kit | Qiagen | 74004 | RNA extraction of few cyprids |