巨大な繊毛虫ラッパムシは、創傷治癒と再生を研究する優れたシステムです。単一細胞または細胞断片からラッパムシ細胞培養の確立、切断細胞による再生を誘導する、化学的に membranellar バンドと口腔装置、イメージング、およびセルの分析の再生を誘導するための手順を提案します。再生。
セルは外部摂動から回復するためのパーツを再生することができる必要があります。単細胞の繊毛虫ラッパムシ創傷治癒研究に優秀なモデル生物とそれに続く細胞の再生です。ラッパムシゲノム RNAi などの現代分子生物学方法と共に最近では、利用可能になった。これらのツールは、分子レベルで単一細胞の再生を検討することが可能。プロトコルの最初のセクションは、単一細胞または細胞の断片、ラッパムシ文化を維持するための一般的なガイドラインに沿ってからの培養細胞確立ラッパムシをカバーしています。ラッパムシを大量に養殖生化学、シーケンシング、および質量分析のような貴重なツールを使用することができます。プロトコルの後続のセクションはカバーラッパムシの再生を誘導するさまざまなアプローチです。ガラス針で細胞を手動で切断には、セルの前にある特定の構造の再生を勉強できます蔗糖あるいは尿素とセルを扱う大細胞部品の再生を勉強することができます。イメージング細胞再生の方法は、ステージングおよび再生のダイナミクスを分析するためのルーブリックと共に提供されます。再生の全体のプロセスは 3 つの段階に分かれています。進行の段階を経て細胞の人口の動態を可視化、再生タイミングで不均一性を発揮します。
細胞は、酵素ではなく非常に複雑な機械要素を慎重に適切なサイズにスケールおよび明確に定義された位置に配置がシンプルなバッグではありません。個々 の細胞の形態形成は、細胞・発生生物学の重要なプロセスを表しますが、その分子機構は不明な1,2。いくつかの培養細胞塊に似ている、その単細胞生物に、非常に複雑なのアーキテクチャ、繊毛虫3,4に見られる複雑な皮質パターンに代表される持っていることができます。
おそらく高度な構造セルの最も極端な例は、巨大な heterotrichous の繊毛虫テトラヒメナゾウリムシのの遠縁ラッパムシ、です。ラッパムシ1 mm 長いは、セル全体の長さが実行される微小管リボンの並列スタック主催繊毛の行交互青色色素の以上 100 の縦ストライプで覆われます。セルはトランペット形 (図 1)、membranellar バンドとその前方の端と後部で基板にセルをアタッチ ホールドファスト口腔装置 (OA)。クリア前後極性に加えて、セルは間隔毛様体行徐々 に時計回りの方向に増加するように独特のキラル パターニングも示しています。これは、結果、狭い行が最も幅の広い行およびセル表面のこの地域を満たす不連続に前方構造別セル5、接ぎ木の 2 番目のセットの形成を誘導することができますストライプのコントラストの軌跡として知られ、正式のオーガナイザーと同等となっています。したがって、発生生物学のすべての主要プロセスは、ラッパムシの類似をある: axiation、パターン形成と誘導。胚、ラッパムシは異なる細胞の間、これらのプロセスが運命の違いによって駆動される、彼らは単一のセル内の異なる領域の運命の違いによって駆動される必要があります。ラッパムシの内の領域の違いを定義するものは謎です。
ラッパムシの任意の部分が途中で切れている場合、セルの行方不明の部分は時間の問題で正常な細胞を生成する再生成できます。セルがある場合で、各部分の半分、あるいははるかに小さい部分にカット普通しかし小さい細胞に再編成し、セル部品6、7の間に適切な比例を復元します。小さな断片、1/64th元のセルのサイズが小さいが均整通常細胞として再生して、フル サイズ6にすることができます。ラッパムシは、こうしての通常の組織または個体レベルで適用される手術方法を使用して細胞器官サイズ スケーリングと細胞成長調節機構を研究するユニークな機会を示します。
ラッパムシ手術操作の広い範囲から再生成することができますのプロパティの 1 つは8の全体のゲノムの約 50,000 枚とシングル着生大核 (図 1) が含まれていることです。細胞断片にゾウリムシの少なくとも 1 つのノードが含まれている限り、それは完全に再生成する能力を持ってください。ラッパムシの再生能力の基になる別のプロパティは、その驚異的な創傷治癒能力です。多くの細胞のタイプが9自分の傷の治癒が可能、ラッパムシは物理的な摂動の異常な範囲から回復することができます。以前ラッパムシ10で細胞質流動を可視化する方法とともに、抜本的な摂動からラッパムシ復旧の例は報告されなかった。これらのメソッドによりどのように負傷とそれに続く再生の影響の研究、細胞の物理的な状態。
ラッパムシの巨大なサイズ、異常な再生能力と、それが多細胞の胚 (主催者、axiation、パターニングなど) に見られる発達現象の多くをマニフェスト実際集めて中に多く発達生物学者トーマス ・ ハント ・ モーガンの7を含む最後の世紀の変わり目。50 年代、60 年代の間には、顕微鏡下の方法は、この単一 celled の有機体11の再生・形成過程の驚くべき配列を紹介されて。ただし、ラッパムシ最近開発された分子生物学モデル システムとしてのみ。過去数年、ラッパムシのゲノムは配列された、8を組み立て、餌で RNAi を用いた遺伝子発現を摂動する術が開発した12。
ラッパムシは現代分子生物学のみのモデル生物にした理由の一つは最近成長の長い細胞周期 (3 ~ 5 日) による大規模な文化の難しさがあった。ただし、現代の genomic および proteomic 方法ラッパムシ単細胞のボリュームは単一の分析のために開発された超高感度の方法に頼ることがなく、これらのメソッドは、十分な彼らには使用より少ない材料が必要ラッパムシよりはるかに小さいされているセル。プロトコルのセクション 1 は、単一のラッパムシセルから大規模な文化を確立するための手順を詳しく説明します。セルを切断して得られる細胞片から大規模な文化を確立する同じ方法を使用することができます。セクション 1 は、時間の長い期間にわたって健康ラッパムシ文化を維持するためのガイドラインを提供します。プロトコルのセクション 2 は、ガラス針で細胞を手動で切断することによって細胞の再生を誘導するための方法論を提供します。プロトコルのセクション 3 は特定のセル構造体 (membranellar バンドと口腔装置) の再生を誘導する 2 つの方法に捧げられて: 続いて、これらの構造の脱落につながる蔗糖あるいは尿素とセルを扱う、再生。プロトコルのセクション 4 では、時間の長い期間にわたって個々 の再生細胞のイメージング法を詳しく説明します。セクション 4 は、再生と再生のダイナミクスの解析のヒントの段階の説明で終わります。
ラッパムシを養殖の課題の数を示します。多数のセルを必要とする実験を実行するまず、ラッパムシ濃度 20 セル/mL を超えると不健康になる文化としてラッパムシ文化の多数を維持するためにであります。第二に、しばしばラッパムシ文化を汚染できる生物はラッパムシより分割し、(一般的な汚染物質はワムシ) 文化を圧倒します。したがって、顕微鏡下で培養を定期的に検査し、汚染物質を除去する必要は。時折、新しい文化は、汚染された文化から手動で救出された細胞の数が少ないから開始する必要があります。これは健康ラッパムシ文化を維持するために必要な時間が増加します。第三に、単一のセルを 400 mL 文化に進出と、ラッパムシ細胞周期は 3-5 日ために、少なくとも 1 ヶ月を必要です。第四に、他のモデルとは異なりと嚢胞フォームに繊毛虫ラッパムシ稀に凍結することはできません。
ラッパムシを養殖の重要な側面は、適切な食品の有機体の選択です。ラッパムシを培養するためのさまざまな方法が説明しました。それらの 1 つは、ラッパムシを供給するバクテリアを培養するスキムミルクを使用するように提案します。このような手法は養殖ラッパムシ; 効果的です。しかし、ゲノム技術のアプリケーションでは、未定義の餌生物からゲノムの読み取りによる混乱を避けるために純粋なサンプルが必要です。現在のプロトコルを使用して、ラッパムシを大量に育てることができる、彼らの食糧、クラミドモナスが配列されているので食品有機体からの遺伝子汚染の存在することができます検出および制御します。未知の理由のため歯石を前にラッパムシを見つけた彼に戻って彼の在庫を補充するために持っていた。現在のプロトコルでは、長年ラッパムシを維持できました。
ラッパムシ再生実験は一般に簡単ですが、留意すべきいくつかの重要な詳細があります。ラッパムシを切断に関してセクション 2 分で半分のセルを習得できます。ラッパムシのより高度な手術の手順をマスターすると、1 週間練習が必要があります。一方、スクロース処理が次に実行されるときの 10-30 s インキュベーション時間を増やす蔗糖あるいは尿素治療 (セクション 3)、イメージングの初めにほとんどの細胞はまだ自分たちの membranellar のバンドがある場合を実行します。それは細胞死になりますので 3 分インキュベーションを超えてスクロース処理の時間を増やさないでください。
ラッパムシの画像再生時間の長い期間にわたって大型細胞をイメージする方法が必要です。セクション 4 で詳細なイメージング法は、正立型顕微鏡でのみ使用できます。倒立顕微鏡が利用できる代わりに、スライドまたは小型チャンバーの coverslip のセルが配置できます。1 つの方法は、蒸発を防ぐために別の coverslip でワセリンとカバーの商工会議所を作成します。1 × 1 cm2のシリコン スペーサーの正方形で希望のサイズの穴を開けると穴を作るで、個々 のセルの商工会議所または、可能 (材料表)、観察にスペーサーを配置すること、商工会議所のセルを置くこと、と別の coverslip の商工会議所をカバーします。ラッパムシは、再生の各段階の特徴を観察する向きが正しいされていない場合、イメージング、携帯契約させるしっかりとプレートをタップします。細胞の再生の段階を識別するために拡張を見る (完全な拡張は約 45 秒)。間違った方向のセルでは、タップを繰り返します。図 1と図 6に示すように画像が撮影されたステレオ ズーム顕微鏡;ただし、詳細すべての実験は、実体顕微鏡を切り裂く X 5 を使用して実行できます。
養殖やラッパムシをイメージング以外の別の挑戦再生、特に段階を識別するために必要な時間の量の追跡であります。再生細胞がはっきりと見える口腔原基の領域と完全に指向の場合、ステージの同定は数秒をかかります。場合によっては、ただし、ラッパムシセルがので識別するより多くの時間を割いて、再生段階の明確な割り当てを防止する方向で。再生細胞が待機するオブザーバーを必要とするステージングの時間精度の減少、すべての再生細胞の定量を遅れる可能性がありますステージとイメージを再作成後にセルに移動に必要な時間のかなりの量新しい向き。したがって、この実験は時間と労力がかかりました。これらの理由から、ラッパムシ細胞を検出し、ビデオ顕微鏡検査データの再生の段階を割り当てるのための自動方法を開発する非常に望ましいでしょう。これらはまたより多くの再現実験に、サンプル サイズ、および人間バイアスの除去で増加します。
高感度の genomic および proteomic 方法の出現は、リーチに単一細胞の研究を入れてし始めています。このような単一細胞解析のラッパムシセルの巨大なサイズ概念実証実験のため、望ましいテストの対象になります。可能にするそのような実験のためラッパムシの養殖が、基本で、ここで説明する方法より高度な単一セル技術の更なる発展に役割を果たすべきので。
The authors have nothing to disclose.
この作品は、NIH グラント R01 GM113602 (WFM) と NSF 1144247 (AL) によって支持されました。我々 は、有益な議論では、これらのプロトコルのいくつかの初期のバージョンを開発するため、マーク Slabodnick とナタリー カークランドを認めます。原稿の批判的な読み、カリーナ Perlaza とグレイソン ・ ルイスに感謝します。
Stentor coeruleus live culture | Carolina Biological Supply | 131598 | |
Chlamydomonas reinhardtii on agar | Carolina Biological Supply | 152040 | |
Pasteurized springwater, 1-quart bottle | Carolina Biological Supply | 132458 | |
Methyl cellulose, 1500 cP | Millipore Sigma | M0387 | |
Pyrex glass spot plate | Fisher Scientific | 13748B | |
Wide-mouth glass jar with screw cap, 60 mL | Carolina Biological Supply | 715740 | |
2-cup glass container with glass lid | Pyrex | 1095600 | |
CultureWell silicone sheet material | Grace Bio Labs | 664475 | |
Kimwipes | Kimberly Clark | 34155 | |
Posi-Click 1.7 mL microcentrifuge tube | Denville | C2170 | |
Cover Glass | Fisher finest | 12-548-B | |
TAP Growth Media, optimized for Chlamydomonas culture | ThermoFisher | A1379801 | |
Silicone spacer, CultureWell Silicone Sheet, 0.25mm Thick/13 cm x 18 cm | Grace Bio Labs | 664475 | |
Petrolatum, Petroleum Jelly, White | Spectrum | P1037 | |
Borosilicate glass capillary tubes. OD: 1.2 mm, ID: 0.9 mm, length: 10 cm. |
Sutter Instrument | B120-90-10 | |
Needle puller P-87 | Sutter Instrument | ||
Stemi 2000 stereo microscope | Zeiss | ||
Axiozoom V16, stereo zoom microscope | Zeiss |