Een robuust protocol controleren neurale populaties time-lapse video-microscopie gevolgd door softwarematige nabewerking is beschreven. Deze methode geeft een krachtig hulpmiddel voor het identificeren van biologische gebeurtenissen in een geselecteerde populatie tijdens live imaging experimenten.
Inzicht in de mechanismen die controle van kritieke biologische gebeurtenissen van neurale cel populaties, zoals proliferatie, differentiatie of cel lot besluiten, zal doorslaggevend zijn voor design therapeutische strategieën voor veel ziekten van het zenuwstelsel. Huidige methoden voor het bijhouden van cel populaties vertrouwen op hun uiteindelijke resultaten in stilstaande beelden en ze over het algemeen niet met voldoende temporele resolutie aan het omgaan met gedragsproblemen in afzonderlijke cellen. Bovendien variaties in celdood, gedrags heterogeniteit binnen een celpopulatie, verdunning, verspreiden of het lage rendement van de markers die gebruikt voor het analyseren van de cellen zijn alle belangrijke handicaps die zal leiden tot onvolledige of onjuiste read-outs van deresultaten. Omgekeerd vertegenwoordigt uitvoeren van levende beeldvorming en eencellige bijhouden onder passende omstandigheden een krachtig hulpmiddel voor de monitoring van elk van deze gebeurtenissen. Hier, wordt een time-lapse video-microscopie protocol, gevolgd door post-processing, beschreven om bij te houden van de populaties van de neurale met eencellige resolutie, met specifieke software. De beschreven methoden kunnen onderzoekers te pakken essentiële vragen met betrekking tot de cel biologie en bloedlijn progressie van verschillende neurale populaties.
Om nieuwe en effectievere therapeutische strategieën ontwikkelen om te regenereren neurale populaties, moeten we eerst begrijpen de fundamentele mechanismen die cellen met een regeneratieve neurale potentieel te handhaven. Nastreven van dit doel vereist een uitgebreide kennis van de factoren die het evenwicht tussen de onbeweeglijkheid, proliferatie/differentiatie, de modus en de timing van de divisie, lengte van de celcyclus, trekkende capaciteiten, levensvatbaarheidte regelen. Hoewel het een technische aanpak die heeft gewerkt voor vele jaren1, leven van beeldvorming en rechtstreekse waarneming nog steeds de beste optie om de hierboven genoemde gebeurtenissen te controleren. In tegenstelling tot vele andere benaderingen gecentreerd op eindpunt uitlezingen, live beelden en eencellige bijhouden informeren door de lengte van een experiment2,3,4,5, 6. zo de toevoeging van temporele resolutie kunt celdood, heterogene cel gedrag of cel lot besluiten, evenals zoveel andere kritieke gebeurtenissen kunnen worden geïdentificeerd die misschien anders doorgeven onopgemerkt. Ideaal, deze functies van cellen beste moeten worden gecontroleerd op de eencellige niveau in vivo waar zowel intrinsieke (cel autonome) en extrinsieke (cel niche) signalen in aanmerking worden genomen.
Echter, hoewel de in vitro situatie gebeurtenissen in een omgeving die niet reproduceren van de natuurlijke omgeving plaatsvinden doet, de lage dichtheid kweekomstandigheden meestal gebruikt in deze protocollen zijn geschikter te onthullen van de intrinsieke kenmerken van de cellen. Bovendien kan een meer simplistische controle van het omringende milieu, door eenvoudigweg de aanpassing van het groeimedium, vormen een waardevol instrument om te onderzoeken van de afzonderlijke rol van elke extrinsieke factor waarin de neurale niche, evenals omgevingsfactoren die kunnen in pathologische scenario’s7,–8,9,10,11,12,13worden geïnduceerd. Daarom, wanneer correct geconfigureerd, zoals in het protocol hier voorgesteld, levende imaging biedt een oplossing haalbaar in vitro om aan te pakken van de meeste vragen eerder geïnventariseerd.
Dit protocol beschrijft in het kort, de hardware, software, kweekomstandigheden en de belangrijkste stappen die nodig zijn om met succes uitvoeren van een levende imaging experiment gevolgd door eencellige bijhouden. Deze aanpak biedt waardevolle informatie die helpt om te onthullen van de fundamentele aspecten van de biologie en de progressie van de afkomst, van meerdere neurale populaties.
Een van de meest belangrijke waarden voor levende imaging is de mogelijkheid voor het uitvoeren van nauwkeurige lineage opsporing, ophelderen van kritieke aspecten van lineage progressie in een neuraal bevolking. Lineage tracering wordt gedefinieerd als de identificatie en controle van alle van de nakomelingen van een enkel voorlopercellen, van de oprichter van de kloon naar de volgende kloon21gevormd. Opmerkelijk, alternatieve testmethoden voor lineage traceren (bv, virale transductie of multicolor verslaggever constructies21) hebben een essentieel nadeel, waarbij het eindresultaat is gebaseerd op stilstaande beelden en het doet niet noodzakelijkerwijs de hele reeks vormen. Dit betekent dat celdood, heterogeniteit in het gedrag van de bevolking van de cel, verdunning, verspreiden of slecht efficiëntie van de markers, samen met andere belangrijke handicaps, leiden tot onvolledige of onjuiste read-outs van de resultaten2. Levende imaging maakt bovendien de onderzoeker voor het analyseren van de belangrijke kenmerken van de biologie van neurale bevolkingen, zoals de modus en de timing van de celdeling celgroei, migratie, proliferatie versus differentiatie, lengte van de celcyclus, neurite vorming, complexiteit en lengte, cel lot selectie (differentiatie), of conversie (herprogrammering).
Bovendien, levende imaging gemakkelijk kan worden aangevuld met andere analyse die bedoeld zijn om gegevens van afzonderlijke cellen zoals, bijvoorbeeld, RNA sequencing. Echter, om gecombineerde profiteren zowel live beeldvorming en andere technieken vereist dat deze cellen eerder gecontroleerd in de films zijn later opnieuw geïdentificeerd en afzonderlijk verzameld voor de secundaire analyse. Dit kan worden bereikt met behulp van microscopen die positioneel coördinaten, door het toepassen van fluorescerende verslaggevers voor specifieke cellen of analyseren van de verdeling van de groepen van cellen als verwijzingen bevatten. Inderdaad, de combinatie van het transcriptoom profiel en het gedrag van afzonderlijke cellen kunnen vertegenwoordigen een krachtige route ophelderen van nieuwe moleculaire signalen die betrokken zijn bij de biologie van cellen.
Een van de belangrijkste problemen die een levende imaging experiment in gevaar kunnen brengen is een onvoldoende celdichtheid cultuur. Zoals eerder aangegeven, bij hoge dichtheid de overdaad aan puin of slechte dissociatie (klomp vorming) invloed kan zijn op de kwaliteit en de ruimtelijke resolutie van de beelden, het maken van eencellige bijhouden onhaalbaar. Daarom moeten de voorwaarden van de bevolkingen van de afzonderlijke cel onder studie worden aangepast aan het laagste aantal cellen mogelijk zonder afbreuk te doen aan de levensvatbaarheid van de cultuur van de cel.
De frequentie van Beeldacquisitie is ook van cruciaal belang en moet worden zorgvuldig aangepast, met name wanneer fluorescentie verlichting wordt gebruikt. Overmatige blootstelling aan verzonden en vooral fluorescentie licht levensvatbaarheid van de cellen in gevaar kan brengen. Als alternatief, een bovenmatige vertraging tussen het vastleggen van de beelden kan interfereren met de temporele resolutie van de analyse.
Een andere belangrijke stap tijdens het levende imaging experiment is de periodieke aanpassing van zich te concentreren. Storing in de juiste instelling/re-setting van de scherpstelafstand kan belemmeren eencellige bijhouden. Bovendien is het noodzakelijk om zorgvuldig controleren dat de kamer van de incubatie bewaart het voldoende temperatuur, vochtigheid en CO2 niveaus, tot wijziging van de ongewenste variaties die leiden celdood tot kunnen.
Ten slotte, zodra de PICC is verricht, is het belangrijk goed de xyz nul-positie voorafgaand aan de laatste ronde van Beeldacquisitie ophalen. Onjuiste opnieuw instellen van de xyz nulpositie zal bemoeilijken overeenkomen met de fase contrast en immunofluorescentie beelden, belemmeren de identificatie van de nakomelingen van de cel.
Hoewel deze benadering vele positieve facetten heeft, blijven enkele beperkingen aan de levende imaging van neurale bevolking. Bijvoorbeeld, maakt de lage celdichtheid vereist voor het uitvoeren van succesvolle eencellige tracking van aNSCs het onmogelijk om biochemische tests, zoals Western blotting14in dienst. Bovendien controle snel verdelen populaties zoals cerebellaire astrocyten of N2a cellen is stoffelijk beperkt aangezien het vaak ook moeilijk om bij te houden van de cellen als de culturen in de buurt van samenloop. Bovendien, vele cultuur-methoden, evenals de inherente biologische beperkingen die verbonden zijn met de isolatie van cellen, vaak levensvatbaarheid cel over lange periodes, beperking van de duur van de levende imaging experimenten. Tot slot, isoleren van cellen uit hun natuurlijke omgeving heeft zowel positieve als negatieve effecten. Cellen geïsoleerd van hun fysiologische niche kunnen mislukken om te ontvangen van belangrijke signalen die moduleren van hun gedrag, terwijl op hetzelfde moment, het vertegenwoordigt een krachtig instrument voor het testen van het effect van deze signalen individueel in de progressie van de bloedlijn van specifieke neurale populaties.
Gezien de beperkingen hierboven beschreven, is het duidelijk dat het perfecte methodologische scenario zijn zou om uit te voeren levende imaging en één cel bijhouden experimenten onder normale fysiologische omstandigheden in vivo. Huidige technieken zijn echter niet kon volgen van afzonderlijke cellen voor langere tijd in diepe delen van de hersenen-2. Dus moet de toekomst voor levende imaging richten op het overwinnen van deze beperking, gericht op de celbiologie van afzonderlijke cellen in vivo met de kleinste mogelijke interferentie van de fysiologische omgeving3volledig te analyseren.
The authors have nothing to disclose.
Wij bedanken Beatriz Gascon voor haar hulp en kunst werk in Figuur 1. Wij danken ook Dr. C. Norris voor zijn hulp. Het werk hier gepresenteerd werd gesteund door onderzoekssubsidies, “Red de excelencia Consolider-Ingenio Spaans ionkanaal initiatief” (BFU2015-70067REDC), MEC (BFU2014-53654-P), BRADE-CM (S2013/ICE-2958), UCM-Santander (PR26/16-18B-3) en Fundación Ramon Areces Grant programma (PR2018/16-02). Felipe Ortega erkent de Ramon y Cajal programma van het Spaanse ministerie van economie en concurrentievermogen (MEC: RYC-2013-13290).
Poly-D-lysine | Sigma | P0899 | Working solution 0.02 mg mL-1 |
24 wells plate | Falcon | 352047 | |
Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM): F12 Nutrient Mixture medium (-L Glutamine) | Invitrogen | 21331-020 | |
DMEM High Glucose medium | Sigma | D6546 | |
Bovine Serum Albumin | Sigma | A6003 | |
Triton X-100 | Merck | 11869 | non-ionic surfactant |
Mouse anti-β III Tubulin | Sigma | T8660 | |
Rabbit anti-GFAP | DakoCytomation | Z0334 | |
Mouse anti-α Tubulin | Sigma | T5168 | |
Anti-Mouse FITC | Jackson Laboratories | 715-095-150 | |
Anti-Rabbit Cy3 | Jackson Laboratories | 711-165-152 | |
Brightfield/Phase contrast/fluoresence microscope | Nikon | TE-2000-E | |
CFI PLAN FLUOR DLLL 10X objetives | Nikon | Ref 280MRH10101 | |
CFI SUPER PLAN FLUOR ELWD AMD 20X objetives | Nikon | Ref 280MRH48230 | |
pE-300 LED fluorescence | Cool LED | Ref Number 1981 | |
310M-201 Incubation system (temperature) | OKO-Lab | Serial Nº VOF007307 | |
Pro-ScanII Motorized stage system | Prior | Serial Nº 60018 | |
High precision microscope camera version 4.2 | ANDOR Zyla | VSC-03650 | |
Specifc software for live imaging with timelapse module: NIS-Elements AR4.5 | Nikon | NIS-Elements AR4.5 -Hasp ID: 13CE819E | |
OKO touch Incubation system (CO2) | OKO-lab | Serial number 1716 | |
Murine Neuro-2a Neuroblastoma Cell line | ATCC | ATCCCCL131 | |
HEPES buffer solution 1 M | Invitrogen | 15630-056 |