Forniamo protocolli semplici e robusti per la trasformazione di materiale bioptico di varie specie, embrioni di organismi del modello biomedico e campioni di altri tessuti organici per consentire la generazione di dati digitali di volume con il metodo di microscopia episcopica ad alta risoluzione.
Forniamo semplici protocolli per la generazione di dati digitali di volume con il metodo di microscopia episcopica ad alta risoluzione (HREM). HREM è in grado di immaginare materiali organici con volumi fino a 5 x 5 x 7 mm 3 in risoluzioni numeriche tipiche tra 1 x 1 x 1 e 5 x 5 x 5 μm 3 . I campioni sono incorporati in resina di metacrilato e sezionati su un microtomo. Dopo ogni sezione un'immagine della superficie del blocco viene catturata con una videocamera digitale che siede sul phototube collegato alla testa del microscopio composto. L'asse ottico passa attraverso un cubo filtrante di proteine fluorescenti (GFP) verde ed è allineato con una posizione in cui il braccio del portabraccio si riposa dopo ogni sezione. In questo modo vengono prodotte una serie di immagini digitali allineate intrinsecamente, che mostrano le successive superfici di blocco. Caricare una simile serie di immagini nel software di visualizzazione tridimensionale (3D) facilita la conversione immediata in dati digitali di volume, che consentono diL'azione in diversi piani ortogonali e obliqui e la creazione di modelli di computer di volume e di superficie. Presentiamo tre semplici protocolli specifici per la lavorazione di diversi gruppi di esemplari organici, tra cui mouse, pulcino, quaglia, rana e zebra, materiale bioptico umano, materiale cartaceo e materiale per la sostituzione della pelle.
L'analisi strutturale dei materiali organici e anorganici è il primo passo nella comprensione delle proprietà fisiche e della loro funzione. La base di tale analisi è spesso informazioni bidimensionali (2D) ottenute con un'accurata osservazione delle sezioni istologiche con una varietà di metodi di imaging semplici e sofisticati che estraggono i dettagli dell'architettura dei tessuti, della morfologia cellulare e della topologia, della composizione molecolare e delle proprietà biomeccaniche 1 , 2 , 3 . Tuttavia, le informazioni 2D non sono adatte per la ricerca di accordi spazialmente complessi. Quindi un numero crescente di metodi in vivo e ex vivo che consentono la generazione di dati digitali di volume sono stati stabiliti negli ultimi decenni 4 e molti altri sono in fase di sviluppo.
Il principio metodico della maggior parte dei metodi di generazione dei dati di volume è la generazione di pile virtualiDi immagini digitali che visualizzano sezioni acquisite tramite la sezione virtuale o fisica di un oggetto. Se le immagini delle sezioni sono allineate correttamente, crea un volume che può essere ripartito in piani di sezione virtuale o utilizzato per creare modelli di superficie e volume resi 3D. Le tecniche popolari per la visualizzazione di esseri umani e di più grandi campioni biologici sono la tomografia a risonanza magnetica (MRT), la tomografia computerizzata (CT), la tomografia a positroni (PET) e la tomografia computerizzata per emissione a singolo fotone (SPECT). I piccoli esemplari sono di solito visualizzati utilizzando l'imaging micro-magnetico (μMRI), la tomografia di proiezione ottica (OPT), la tomografia di coerenza ottica (OCT), la tomografia fotoacoustica (PAT), i metodi basati sulla sezione istologica, la microscopia confocale e la tomografia elettronica 5 , 6 , 7 , 8 , 9 , 10 <sUp>, 11 , 12 , 13 , 14 , 15 , 16 , 17 .
Una tecnica relativamente nuova di generazione dei dati di volume, che produce dati digitali di piccoli esemplari e campioni di tessuti istologici, è il metodo HREM, sviluppato in stretta collaborazione con Tim Mohun 18 , 19 . Si tratta di una semplice tecnica basata su microscopi, che genera dati digitali di volume da materiale incorporato in resina, sezionato su un microtomo. I dati facilitano l'analisi dettagliata dell'architettura dei tessuti e delle distribuzioni delle cellule, nonché l'analisi metrica delle piccole caratteristiche su un livello microscopico a luce intermedia.
HREM produce pile di immagini digitali intrinsecamente allineate che appaiono come se sono state catturate da eFrammenti istologici parzialmente colorati. Il contrasto del tessuto e la risoluzione dei dati rispetto al campo visivo superano quello dei dati prodotti con μCT, μMRI e OPT, ma sono inferiori a quelli raggiungibili con la microscopia confocale, di foglio leggero e di elettroni 20 . Tuttavia, contrariamente a quest'ultimo, HREM è in grado di visualizzare gli esemplari con volumi relativamente grandi fino a 5 x 5 x 7 mm 3 in qualità istologica. Alcuni recenti studi forniscono dettagliati caratterizzazioni e confronti di vantaggi e svantaggi delle singole tecniche di imaging e, per ragioni di obiettività, si riferiscono a quelle per ulteriori informazioni sulle loro limitazioni e potenziali campi di applicazione 4 , 21 , 22 , 23 , 24 .
Questo studio si concentra sul metodo di imaging HREM e mira a fornireProtocolli molto semplici per generare dati HREM di un ampio spettro di materiali organici, nonché esempi di applicazione. Il flusso di lavoro per la creazione di dati HREM è semplice e si applica a tutti i materiali che possono essere incorporati in resina di metacrilato ( Figura 1 ). Tuttavia ci sono differenze specifiche del tessuto nella preparazione del campione, che devono essere considerate. Di conseguenza, forniamo tre protocolli standard per la preparazione di vari campioni. I passaggi del protocollo di incorporamento e di generazione dati sono identici per tutti.
HREM è un metodo microscopico altamente robusto ideale per la visualizzazione di un ampio spettro di materiali organici impiegati in biomedicina e nell'industria 18 , 21 , 26 , 27 , 28 , 29 , 30 , 31 , 32 , 33 , 34 , 35 , 36 , 37 , 38 , 39 , 40 . Può essere impiegato come modalità di imaging esclusiva, attualmente utilizzata dal programma dei meccanismi di disturbi dello sviluppo (DMDD) 41 , 42 <suP>, 43 , 44 o come parte integrante delle tubazioni di imaging multimodale 45 .
Un apparecchio generatore di dati HREM completamente funzionante può essere assemblato da componenti convenzionali di laboratorio e comprende un microtomo motorizzato, un microscopio, una tavola incrociata motorizzata e un computer con un software appropriato 25 . È fondamentale l'uso di un microtomo dotato di un blocco di bloccaggio che riproducibilmente si ferma dopo ogni sezione in una posizione definita e cubi del filtro GFP all'interno del percorso ottico. Tuttavia, le soluzioni complete a pieno titolo possono essere acquistate da aziende come Indigo Scientific.
HREM affronta le stesse limitazioni di tutte le tecniche istologiche, tranne che non vengono introdotti manufatti durante il montaggio a sezione o sezione. Tuttavia, esistono limitazioni, che derivano dalla necessità di macchiare campioni prima della sezionamento eDalle caratteristiche del materiale incorporante. La penetrazione di eosina attraverso l'intero campione è necessaria per ottenere contatti tissutali sufficienti; Materiali molto denso, tessuti adiposi e sostanze anorganiche impediscono efficacemente la penetrazione di eosina e ciò provoca i tessuti non sottoposti al centro degli oggetti. Utilizzando speciali fissaggi aiuta a macchiare i campioni della pelle, ma non esiste ancora un metodo adeguato per superare completamente il problema. Un'altra limitazione è che le resine che bloccano più di 2 cm tendono a rompere durante la sezione. Ciò può essere parzialmente evitato tagliando separatamente i campioni e le parti di lavorazione.
Il posizionamento corretto di piccoli campioni o campioni con superfici irregolari negli stampi durante l'inserimento è spesso problematico. La copertura dei campioni con agarosio e la lavorazione dei blocchi di agarosio come descritto nel protocollo solitamente risolve questo problema 19 . Un approccio alternativo, che aiuta anche se i blocchi si rompono durante le sectiÈ quello di rimuovere il blocco già indurito dal suo supporto e riagganciare nuovamente, seguendo la procedura di incorporazione descritta.
Un set di dati HREM tipico comprende 500-3000 singole immagini. La sua risoluzione numerica è determinata dalla distanza tra le immagini successive (dallo spessore della sezione), dalla caratteristica del target della fotocamera e dalle proprietà delle ottiche utilizzate. Abbiamo utilizzato spessori di sezione compresi tra 1 μm e 5 μm e hanno ottenuto buoni risultati, anche se i protocolli presentati non eliminano completamente l'illuminazione dagli artefatti 20 , 46 . Questi artefatti sono causati da tessuti intensamente macchiati situati profondamente all'interno del blocco, con conseguente sfocatura delle informazioni sui tessuti sulle superfici del blocco.
Le telecamere hanno dimensioni target di 2,560 x 1,920 pixel 2 , 2,048 x 2,048 pixel 2 e 4,096 x 4,096 pixel 2 e sono stati combiCon obiettivi obiettivo 1.25X, 2.5X, 5X, 10X e 20X. Ciò ha portato a dimensione numerica di pixel tra 0,18 x 0,18 μm 2 e 5,92 x 5,92 μm 2 , che si è rivelato sufficiente per l'analisi 3D dell'architettura dei tessuti e delle forme cellulari e anche per la visualizzazione dei nuclei. Data l'elevata risoluzione numerica, altri organelli cellulari dovrebbero essere visibili pure. Contrasti insufficienti dovuti alla semplice colorazione di eosina e le proprietà ottiche degli obiettivi riducono drasticamente la possibilità di discriminare le strutture. La massima risoluzione spaziale massima dei dati HREM, che tiene conto dell'apertura numerica, è di circa 1 x 1 x 1 μm 3 e quindi consente solo una discriminazione effettiva di strutture superiori a circa 3 x 3 x 3 μm 3 .
Un problema comune a tutte le tecniche di digital imaging è il compromesso tra le dimensioni del campo di vista, che definisce la parte del campione che può essere visualizzataD sull'obiettivo della fotocamera e la risoluzione numerica dell'immagine. Maggiore è il campo visivo, minore è la risoluzione numerica massima possibile 46 . L'impostazione HREM qui utilizzata consente di generare dati HREM con un campo visivo compreso tra 0,74 x 0,74 mm 2 (obiettivo 20X) visualizzato in una risoluzione numerica di 0,18 x 0,18 μm 2 e 12,12 x 12,12 mm 2 (obiettivo di 1,25 X) visualizzata in Una risoluzione numerica di 2.96 x 2.96 μm 2 . I set-up alternativi e commercializzati possono fornire campi di vista più grandi, ma a costo della vera risoluzione. Tuttavia, essi forniscono risultati eccellenti, come evidente dai dati visualizzati sulla homepage del programma DMDD 47 .
The authors have nothing to disclose.
Gli autori ringraziano Tim Mohun per i suoi contributi invalute nello sviluppo di HREM e Petra Heffeter per la fornitura di campioni.
JB-4 Plus Embedding Kit | Polysciences Europe GmbH | 18570-1 | includes Benzoyl Peroxide, Plasticized (Catalyst) and Solution A+B |
Polyethylene Molding Cup Trays, 6x8x5mm hexagon (9 cavities) | Polysciences Europe GmbH | 17177A-3 | |
Polyethylene Molding Cup Trays, 13x19x5mm (9 cavities) | Polysciences Europe GmbH | 17177C-3 | |
JB-4 Plastic Block Holders | Polysciences Europe GmbH | 15899-50 | |
Eosin | Waldeck GmbH & Co. KG, Division Chroma | 1A-196 | |
Microtec CUT 4060E | rotary microtome | ||
Leica DM LM, fluorescence compound microscope | Leica Mikrosysteme Handelges.m.b.H | ||
GFP filter set | Leica Mikrosysteme Handelges.m.b.H | 11090937180000 | |
Motorised cross table | Walter Uhl, technische Mikroskopie GmbH & CO. KG | KT5-LSMA | |
Digital video camera SPOT-FLEX | Visitron Systems GmbH. | ||
precisExcite High-Power LED | Visitron Systems GmbH. | light source | |
VisiView 2.1.4 | Visitron Systems GmbH. | Image capturing software | |
Hard metal knife (tungsten carbide), profile D | Leica Mikrosysteme Handelges.m.b.H | ||
KL 2500 LCD | Schott AG | light source |