Burada, Legionella pneumophila (L. pneumophila) Sıvı kültürlerden dış zar vezikülleri (OMV'ler) saflaştırılmasını anlatmaktadır. Bu arıtılmış, veziküller daha sonra pro-enflamatuar bir potansiyel analiz etmek için makrofajların tedavisi için kullanılmaktadır.
Bacteria are able to secrete a variety of molecules via various secretory systems. Besides the secretion of molecules into the extracellular space or directly into another cell, Gram-negative bacteria can also form outer membrane vesicles (OMVs). These membrane vesicles can deliver their cargo over long distances, and the cargo is protected from degradation by proteases and nucleases.
Legionella pneumophila (L. pneumophila) is an intracellular, Gram-negative pathogen that causes a severe form of pneumonia. In humans, it infects alveolar macrophages, where it blocks lysosomal degradation and forms a specialized replication vacuole. Moreover, L. pneumophila produces OMVs under various growth conditions. To understand the role of OMVs in the infection process of human macrophages, we set up a protocol to purify bacterial membrane vesicles from liquid culture. The method is based on differential ultracentrifugation. The enriched OMVs were subsequently analyzed with regard to their protein and lipopolysaccharide (LPS) amount and were then used for the treatment of a human monocytic cell line or murine bone marrow-derived macrophages. The pro-inflammatory responses of those cells were analyzed by enzyme-linked immunosorbent assay. Furthermore, alterations in a subsequent infection were analyzed. To this end, the bacterial replication of L. pneumophila in macrophages was studied by colony-forming unit assays.
Here, we describe a detailed protocol for the purification of L. pneumophila OMVs from liquid culture by ultracentrifugation and for the downstream analysis of their pro-inflammatory potential on macrophages.
Bakteriler farklı mekanizmalar 1 vasıtasıyla virülans faktörleri salgılar olabilir. iyi bilinen salgılama sistemleri yanı sıra, Gram-negatif bakteriler bilgi alışverişi ve küçük dış zar vezikülleri (OMV'ler), küremsi veziküller 10-300 nm çapında ve iki katmanlı bir membran yapısı ile ile hastalık oluşturma faktörlerini sağlar. Bunlar büyüme ortamlarında (sıvı kültür, bir katı kültür ve biyofilm) çeşitli ve tüm büyüme aşamalarında 2, 3 salgılanır. OMV'ler önemli bir ulaşım aracı (örneğin, OMV yüzeyinde bulunan proteinler, adhesinler, toksinler ve enzimler gibi LPS için) 4. Intraluminal kargo, proteolitik bozulması korunmuş, bu nedenle uzun mesafelerde hareket edebilir, ve veziküller vücut sıvıları ve uzak organlara 5, 6 bulunabilir olduğu"xref"> 7, 8. Bunlar sadece tanınan ve ökaryotik hücrelerde 9, 10 tarafından içine alınır, ama daha yerleşik hücrelerde 4 bakterilerin ve bunların istila bağlanmasını kolaylaştırmak için mümkün olamaz. Legionella pneumophila (L. pneumophila) OMV'leri serbest bir Gram negatif bir bakteridir. Insan akciğerinde, öncelikle doğal konak tatlısu amipler 11 olmasına rağmen, makrofajların bozar. Bir L. pneumophila enfeksiyonu Lejyoner hastalığı, pnömoni 12 şiddetli bir formu neden olabilir. konakçı hücrede bloke fagosom-lizozom füzyon. Bir çoğaltma niş, Legionella içeren yeni vakuol (LCV), 13, 14 oluşturulduğu sayede Ayrıca, ev sahibi organellerini acemi. Lizozomal bozulması sadece efektör protein tra tarafından engellenirTip IV sekresyon sistemi üzerinden değil, aynı zamanda OMV'lerin 15 salınımı ile nslocation.
bakteriyel kültürlerden OMV'lerin saflaştırma alıcı hücrelere üzerindeki etkisini analiz etmek için gereklidir. L. pneumophila OMV'lerden protein içeriği ve alveol epitel hücrelerinin 16, ancak insan akciğer doku nakilleri ile daha sonraki çalışmalar veziküller etkisi üzerinde duruldu önceki çalışmalarda L. pneumophila OMV'ler alveoler makrofajlar 17 tarafından alınır olduğunu göstermiştir.
OMV'ler, bu patojenle ilişkili moleküler modelleri (PAMPS) ve diğer bakteriyel antijenler olarak, ökaryotik hücrelerin enfeksiyonu ile ilgili bir etkisi vardır ve konak immün cevabı 18 modüle olabilir. L. pneumophila OMV'ler hızla dahası, onlar membranöz TLR2 19 etkinleştirmek, konak hücre zarları ile sigorta ve. Bu L pneumoph bilinmektedir zamandaIla OMV'ler, bir pro-enflamatuar bir şekilde 16, 17 makrofajlar ve epitelyal hücreleri uyarır, insan ve murin makrofaj enfeksiyon sürecine OMV'lerin etkilerini analiz ettik.
Burada, biz doğrudan veya bir enfeksiyonu takiben, diferansiyel Ultrasantrifügasyon tarafından salgılanan OMV'ler izole etmek ve ökaryotik konak hücreleri üzerinde veziküller etkisini değerlendirmek için sıvı kültüründe L. pneumophila yetiştiriciliği için bir protokol açıklar.
Bakteriyel etkenler ve hedef hücreler üzerinde bu zar veziküllerinin etkisi OMV'ler anda yoğun çalışmalar yapılmaktadır. Örneğin, Clostridium perfringens OMV'ler makrofajlarda sitokin salgılanmasını teşvik -türevli, B lenfositler, Borrelia burgdorferi OMV'ler ile aktive ve Helicobacter pylori membran vezikülleri, mide epitel hücreleri 21, 22, 23 hareket edebilir -released edilebilir. L. pneumophila, atipik pnömoni şiddetli bir formu uyarabilir bir hücre içi patojen, aynı zamanda akciğer epitel hücreleri ve makrofajlar 16, 19 aktive edebiliyoruz OMV'leri serbest bırakır. Burada, pnömoni OMV'lerden potansiyel rolünü incelemek için sıvı kültürden L. pneumophila OMV'lerden küçük ölçekli izolasyonu için ayrıntılı bir protokol mevcut. Steril iklimlendirme altında çalışmak için önemlidiriyonları ve saf L. pneumophila elde etmek için diğer bakterilerden kirlenmeyi ekarte etmek OMV hazırlık -türevlenmiş. OMV'lerin izolasyonu büyük OMV'ler, bu filtre etme adımı ile kaybolur, çünkü bu OMV verimi azaltır bile, L. pneumophila elde OMV pelet kirlenmesini önlemek amacıyla, 0.22 mikron gözenek ile filtrasyon aşamasını kapsar.
Bundan başka, daha yakından OMV'ler hücre dışı bakteriler x 15 LCV salındığının Legionella pnömoni, durumu yaklaştığı yalıtılmış veziküller ve L. pneumophila ile enfekte edilmiş hücrelere insan ve murin makrofaj tepkisini test edilmiştir. Kullanılan OMV doz 24 saat inkübasyondan sonra, insan makrofajları bir in vitro enfeksiyon serbest OMV miktarına göre tahmin edilmiştir (Referans 20 de tarifedilmiş). Diğer alıcı hücrelerin uyarılması için ve in vivo deneyler,Diğer OMV dozlar gerekli olabilir ve oluşturulması gerekir. L. pneumophila OMV'lerin etkisinin analizi, Jager ve Steinert 24 tarafından tarif edilen protokole bir gelişmeyi temsil etmektedir.
Burada, THP-1 hücreleri nedeniyle birincil insan malzemenin sınırlı sayıda alveoler makrofajlar için bir model olarak hizmet PMA-farklılaşmış. PMA ilave makrofaj benzeri hücre 25 içerisine monositik THP-1 hücreleri ayırır. Ayrıca, L. pneumophila için iyi bilinen bir model hücre hattı 26 çalışmalardır. Bu insan monositik hücre hattı yanı sıra, mBMDM hücreleri kullanılır. mBMDM yaygın L. pneumophila 27, 28, 29 etkilerinin incelenmesi için kabul edilir. Farklı TLR'lerin veya diğer proteinler için genetik Knockouts kullanma imkanı onlara OMV etkilerini araştırmak için değerli bir araç yapmak. ordDeneme başına farelerin miktarını düşürmek için er, mBMDM yerine makrofajlar sınırlamaları nedeniyle alveoler makrofajların kullanılır. Anahtar deneyler doğrulama için makrofajların gerektirebilir.
Ultrasantrifüj arasında tarifnamede tarif edilen protokol OMV'leri saflaştırmak için Bunun yanı sıra, Chutkan ark protokolüne dahil olan bir yoğunluk gradyan santrifüjleme, gerçekleştirmek mümkündür. 30. Bu elde edilen OMV hazırlık saflığını iyileştirmek ve ortak saflaştırılmış protein agrega, flagellin ve LPS miktarını azaltabilir. Elde edilen OMV preparatın saflığı transmisyon elektron mikroskobu ya da kalite kontrol ek bir adım olarak nanopartikül izleme analizi ile analiz edilebilir. Bu Burada sunulan protein ölçüm prosedürü ötesinde, miktarının ek bir araç sağlayabilir. İsteğe bağlı olarak, LPS konsantrasyonu Limulus amebocyte lizat testi ile analiz edilebilir. OMV verimi düşük ise, birsantrifüj filtre üzerinden ek konsantrasyon adımı burada bitmiş değil, hangi yapılabildi. verim beklenenden düşük ise, OMV'ler atıldı.
OMV'lerden arkasındaki biyolojik mekanizmaları ve işlevleri aydınlatmak için çabalarımızın bir parçası olarak, OMV üretimi üzerine farklı stres koşullarının etkisi test edilebilir. Besin yoksunluk, zararlı maddelere inkübasyon sıcaklığı, ya da maruz değişiklikler OMV salgısı 31 üzerinde bir etkiye sahip olabilir. Olası stres koşulları Klimentova ve Stulik 32 protokol tartışılmıştır. Ayrıca, hiper veya hypovesiculating L. pneumophila mutantlar oluşturulabilir. Farklı OMV preparasyonlar daha sonra, (Referans 17'de tarif edilmiştir), insan akciğer dokusu, eksplantlar ya da in vivo modellerde makrofajlar enfeksiyonu deneylerde analiz edilebilir. Bakteriyel iletişimde onların etkisi doğuştan gelen bağışıklık sinyalizasyon OMV'lerden rolü yanındadeneysel ele alınabilir. Bundan başka, çeşitli doğal bağışıklık sinyal kaskadlar etkisi murin nakavt hücreler kullanılarak ya da insan hücre çizgilerinde CRISPR / Cas9 tırnakları üretilmesi ile analiz edilebilir. OMV'lerden Bu temel araştırma zaten Neisseria meningitidis 33 tarafından iletilen menenjit B ana kadar yeni aşı stratejilerinin geliştirilmesine yardımcı olacaktır.
OMV izolasyonu ve karakterizasyonu protokol başlayarak bir başka Gram-negatif bakteri ve diğer konakçı hücreleri, bu uygulayabilir; sadece, sıvı kültür içinde bakterilerin büyümesine ayarlanması gerekmektedir. Chutkan et at tarafından yayınlanmıştır protokol. Escherichia coli ve Pseudomonas aeruginosa 30 OMV'lerden nesil hakkında ayrıntılı bilgi sağlar. Kültür lize bakterilerde artışları ve kirletici proteinler ve mem önlemek için geç bir sabit faz ulaşmamalıdırbrane'ler. Buna ek olarak, konakçı hücrelerin uyarılması için kullanılan OMV doz hala sitotoksisite oranı düşük sağlarken, in vivo enfeksiyon sırasında OMV'ler miktarına göre tespit edilmesi gerekmektedir. Bu şekilde, OMV'lerin patolojik bir rolü, türler arası iletişim, konukçu-patojen etkileşimlerine etkileri incelenebilir.
Ayrıca pnömoni L. pneumophila OMV'lerden rolünü araştırmak için, yeterli verim ve karşılaştırılabilir enfeksiyon deneyleri ile standardize OMV hazırlıkları gereklidir. Bu protokol, izolasyon prosedürleri standartlaştırmak ve diğer Gram-negatif bakterilere karşı ve diğer konakçı hücrelerde OMV çalışmaları uzatmak için yardımcı olacaktır. Ayrıca, araştırma in vivo ayarlara deneyler genişletmek için kullanılabilecek in vitro bilgi, ayrıntılı yararlanacaktır. Gelecekte, bu protokol, serum veya bronkoalveoler Lav primer biyolojik maddeden OMV'lerin, izolasyonu için uzun olabiliryaş sıvı, fizyolojik koşullar altında yayınlanan OMV'lerden bileşimi hakkında fikir edinmek için. Bu OMV kompozisyonun kilit parametrelerini belirlemek ve in vitro -generated OMV'lerden özelliklerini anlamanıza yardımcı olacaktır.
The authors have nothing to disclose.
Biz TLR2 bize sağlamak için Dr. Markus Schnare teşekkür – / – ve TLR2 / 4 – / – fareler ve TRIF / MyD88 Prof. Dr. Carsten Kirschning – / – fareler. Bu çalışmanın parçaları Bundesministerium für Bildung und Forschung tarafından finanse edildi (e: biyo miRSys – FKZ 0316175B, e: Med CAPSYS – FKZ 01X1304E; http://www.bmbf.de/), Deutsche Forschungsgemeinschaft (SFB / TR-84; http://www.sfb-tr84.de/) ve Hessisches Ministerium für Wissenschaft und Kunst (LOEWE Tıbbi RNomics – FKZ 519/03 / 00.001- (0003); http://www.proloewe.de/medicalrnomics), tüm BS.
10 cm petridish | Sarstedt AG & Co KG (Nuembrecht, Germany) | 82.1473 | |
70 Ti rotor | Beckman Coulter Incorporation (California, USA) | 337922 | |
ACES | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | 9138.2 | |
activated charcoal | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | X865.2 | |
agar-agar, Kobe I | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | 5210.2 | |
Columbia agar with 5 % sheep blood | Becton Dickinson GmbH (Heidelberg, Germany) | 254005 | |
cuvettes | Sarstedt AG & Co KG (Nuembrecht, Germany) | 67.742 | |
ELISA (human) | BD OptEIA™; Becton Dickinson GmbH (Heidelberg, Germany) | IL-8: 555244 IL-6: 550799 | |
ELISA (murine) | DuoSet, R&D (Minneapolis, USA) | CXCL1: DY453-05 | |
Fe(NO3)3x9H2O | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | 5632.1 | |
Fetal calf serum (FCS) | Life Technologies GmbH (Darmstadt, Germany) | 10270-106 | |
Heracell 240i CO2 incubator | Thermo Fisher Scientific Germany BV & Co KG (Braunschweig, Germany) | 40830469 | |
Heraeus Multifuge X3R | Thermo Fisher Scientific Germany BV & Co KG (Braunschweig, Germany) | 75004515 | |
Inoculation loop | Sarstedt AG & Co KG (Nuembrecht, Germany) | 86.1567.010 | |
KOH | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | 6751.1 | |
L. pneumophila Corby | — | — | kindly provided by Prof Dr Antje Flieger (RKI, Berlin, Germany) |
L. pneumophila Corby ΔflaA | — | — | kindly provided by Prof Dr Klaus Heuner (RKI, Berlin, Germany) |
L-cystein | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | ||
mBMDM | — | — | kindly provided by Prof Dr Markus Schnare (Philipps Univeristy Marburg, Marburg, Germany) and Prof Dr Carsten Kirschning (University Duisburg Essen, Essen, Germany) |
PBS | Biochrom GmbH (Berlin, Germany) | L 1825 | |
phorbol 12-myristate 13-acetate | Sigma-Aldrich Chemie GmbH (Taufkirchen, Germany) | P8139-1MG | |
rotating shaker (MaxQ 6000) | Thermo Fisher Scientific Germany BV & Co KG (Braunschweig, Germany) | SHKE6000 | |
RPMI 1640 high glucose | Life Technologies GmbH (Darmstadt, Germany) | 11875-093 | |
saponin | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | 9622.1 | |
Ultrospec 10 | Biochrom Ltd (Cambridge, England) | 80-2116-30 | |
sterile filter (pore size: 0.22 µm) | Corning Incorporated (new York, USA) | 431096 | |
THP-1 | Sigma-Aldrich Chemie GmbH (Taufkirchen, Germany) | 88081201-1VL | |
Sorvall Discovery 100 SE | Thermo Fisher Scientific Germany BV & Co KG (Braunschweig, Germany) | ||
yeast extract | Carl Roth GmbH & Co KG (Karlsruhe, Germany) | 2363.2 | |
Pierce BCA protein assay kit | Thermo Fisher Scientific Germany BV & Co KG (Braunschweig, Germany) | 23225 |