Extracellular vesicles present in blood have been suggested as novel biomarkers for various diseases. Here, we present a protocol for the isolation of large plasma membrane-derived microvesicles from peripheral blood samples and their subsequent analysis by conventional flow cytometry and Western Blotting.
küçük endozomal türetilmiş Eksozomlann (Exos, çap <100 nm) ve büyük plazma zarı kaynaklı microvesicles (MVs, çap> 100 nm) dahil dışı veziküller (AGH) serbest bırakılması bütün canlı hücrelerde meydana temel hücresel bir süreçtir. Geldikleri hücre için ve in vitro çalışmalar belirli Bu veziküller taşıyıcı proteinler, lipidler ve nükleik asitler arası iletişimin arabulucu olarak önemlerini sermiştir. EVs başarıyla çeşitli vücut sıvılarından izole edilmiştir ve kan, özellikle EVs kanser veya bulaşıcı hastalıklar için biyolojik sözü olarak tespit edilmiştir. Kandaki MV alt popülasyonlarının çalışma imkan vermek üzere, periferik kan örneklerinden MVs standartlaştırılmış izolasyonu ve karakterizasyonu için bir protokol mevcut. MVs diferansiyel santrifüjleme ile EDTA antikoagüle Plazma örneklerinden topak haline getirildi ve tipik olarak 100 bir çapa sahip olan – 600 nm. Nedeniyle büyük bir boyuta, onlarKolayca flow sitometri, rutin klinik teşhis kullanılan ve en laboratuvarlarda mevcut olan bir teknikle incelenecektir. İzole MVs kalite kontrol testleri için birkaç örnek verilecektir ve kan farklı OG alt toplulukların ayrımı için kullanılabilen işaretleyiciler sunulacaktır.
Son yıllarda in vitro çalışmalar, birçok hücre dışı veziküller (EVS) arası iletişimde önemli bir rol oynadığını göstermiştir. Yaşayan hücreler sürekli boyut, içerik ve biyogenezine farklılık kesecikler döken. En iyi çalışılan AGH onlar multiveziküler organları intraluminal kesecikler olarak depolandığı endozomal sisteminden kaynaklanan eksozomlar vardır. Plazma zarı ile ikinci sigorta kez içeriyordu veziküller Eksozomlann olarak yayımlanan (Exos, çap 30-100 nm 1). Plazma zarı 2 doğrudan kapalı tomurcuk – Son yıllarda artan ilgisini topladı EV ikinci nüfus büyük microvesicles (1000 nm MVs, çapı 100) vardır.
5, ve komşu C transfer proteinlerin bir bolluk – veziküllerinin her iki tipi, örneğin, DNA, mRNA veya miRNA 3, bir lipid iki katmanının ile çevrilidir ve nükleik asitleri içerirlerarşın. Genel olarak veziküllerin protein bileşimi kökenli hücrenin durumunu yansıtırken, bazı proteinler seçici hedef ve AGH 1 zenginleştirilmiş gibi görünüyor. Bir önemli araştırma ilgi roman biyomarkırların olarak AGH kullanımına izin verebilir belirli EV imzaları belirlemek amacıyla anormal ve hastalıklı hücrelerden AGH karakterize etmektir. Özellikle tümörün kendisi kolayca erişilebilir olmadığı kanser, içinde, kanda tümör spesifik AGH hedefleyen sıvı biyopsi tedavi yanıtları izlenmesine olanak veya invaziv işlemler 6 gerek kalmadan primer tümör karakterize yardımcı olabilir.
Gerçekten de EVS başarıyla idrar 7, CSF 8, anne sütü 9 ya da kan 10 de dahil olmak üzere, çeşitli vücut sıvılarından izole edilmiştir. Çeşitli çalışmalarda, farklı insan hastalıklarında EV sayılarında değişiklik ve kompozisyon belirledi. Örneğin, sepsis hastalarında ön pıhtılaştırma MVs sayısıdırönemli ölçüde sağlıklı bireylerin 11 oranla artmıştır. Ayrıca şiddetli serebral sıtma olan hastalarda kandaki toplam MVS bir artış görülebilir ve trombosit kaynaklı MVS sayıları koma derinliği ve trombositopeni 12 ile ilişkilidir. Diğer çalışmalar bu kardiyovasküler olaylar 13,14 daha yüksek bir olasılık ile ilişkilidir, sistemik lupus eritematozus veya kalp yetmezliği olan hastalarda ve ikincisi durumunda endotel kökenli veziküllerin yüksek sayıda rapor.
Özellikle kanser, kandaki AGH halen tanısal ve prognostik değeri olan yeni biyomarkerların olarak tartışılmaktadır. Bu MUC1, EGFR veya FAK tümör-ilişkili proteinler eksprese MVs seviyeleri meme kanserli hastaların 15,16 kanında yükselmiş olarak görülmektedir. Ayrıca EXOS için son zamanlarda yapılan çalışmalar gibi glipikan-1 erken hastalık DE izin göğüs kanseri için pankreas kanseri veya del-1 için olduğu gibi, tümör spesifik antijenler taşıyan kan türevi EXOS göstermiştiryüksek özgüllük ve duyarlılık 17,18 ile koruması. Buna ek olarak, serum kaynaklı tümör Exos gibi Kras ve tedavi tahmini 19 için kullanımlarını göstermektedir p53 gibi mutasyonların saptanması için kullanılabilir DNA içerebilir. Son gelişmeler, belirli bir mikroakışkan çip ile glioblastoma hastaların kanında EXOS bu analiz tedavisi 20 izlenmesine olanak sağlar göstermiştir. Birlikte ele alındığında, bu bulgular veziküllerin hastalığa özgü alt popülasyonlar analizi tanı, prognoz yanı sıra tedavi seçenekleri ve başarı hakkında değerli bilgiler verir ima.
Bununla birlikte, kan EXOS izolasyonu ve analizi, zaman alıcıdır, özel laboratuar ekipmanları gerektirir ve bu nedenle henüz rutin klinik teşhis için uygun değildir. Bunun aksine, MVs bu EXOS 18 için gerekli olan sitometri lateks boncuk çift bunları gerek kalmadan kolayca akış sitometrisi ile analiz edilebilir nedeniyle büyük bir boyuta, çok daha hızlı biçimde izole edilebilir ve21. Bu nedenle, burada kan örneklerinden MVs standartlaştırılmış izolasyonu ve akış sitometrisi ile OG altgrupları müteakip özellik tayini için kullanılabilecek bir protokol mevcut. Bu protokol, daha fazla çalışma ve günlük klinik teşhis için MVS kullanmak için gerekli olacak büyük hasta gruplarında OG profilleri derinliği karakterizasyonu sağlayacaktır.
Kandaki EVs üzerinde son çalışmalar, EV kompozisyon ve sayımlar çeşitli hastalıkların nedeni sırasında değişiklik olduğunu göstermiştir. Bu nedenle, bu AGH analizi ve ileri karakterizasyon daha fazla teşhis ve prognoz için hastalık biyobelirteçlerinin olarak potansiyel kullanımını değerlendirmek ya da tedavi yanıtları değerlendirmek için yüksek ilgi görmektedir. Burada mevcut protokol herhangi bir hücre organellerini içermeyen 600 nm çapında veziküllerin izolasyonu sağlar. Bu gözlemler MVS güncel bir tanımlama ile uyumlu ve apoptotik cisimlerin 2 varlığını dışlamak. genellikle Ekzo belirteç olarak kullanılan tetraspanins CD9 ve CD81 sadece biraz ifade edildi Western Blot kullanarak, izole edilmiş MVs tubulin yüksek ifade gösterdiği göstermek mümkün oldu. Bu MVs Exos farklı olduğunu teyit ve proteomik 25 tarafından son derinlemesine karakterizasyonu ve hem EV popülasyonlarının karşılaştırmak için uyuyor.
Kan örneklerinin elde edilmesi sırasında içeriği ">, MV bozunmasını önlemek için, kısa sürede damar delinerek ve plazma hazırlama arasındaki zaman kalması açısından çok önemlidir. Ayrıca, kan örneklerinin uzun süreli depolama geliştirilmiş MV neden kan hücrelerinin aktivasyonuna yol açabilir sonuçta apoptotik cisimlerin salınımına neden apoptoz dökülme ve. OG izolasyonu için bir başka önemli husus nedenle, aşağı iplik sonra mümkün olduğunca süpernatant kadar çok kaldırmak için kritik öneme sahiptir. plazma proteinlerine veya daha küçük Exos MV hazırlıkları kirletmesini önlemek için topak, normal olarak görünür ve sıkı bir şekilde borunun duvara bağlı olduğu 14,000 x g'de MVs., süpernatan kolay bir pipet ucu ile temizlenebilir. EXOS aksine yüksek hızlı ultra-santrifüj tarafından hazırlanması sırasında agregatlar oluşturması için eğilimi olan genellikle tekrar süspansiyon zor bu sorun MVs oluşmaz.Çalışmamız bu Possi olduğunu gösterirflow sitometri ile kanda bulunan OG subpopülasyonunun karakterize etmek için ble. En akış sitometrelerinde tespit limiti yaklaşık 200 olmasına rağmen – 300 nm, MVs tekrarlanabilir açıkça arka plan sinyallerinden kendi ayrım izin Aynı analiz parametreleri ve kapıları ile donör yanı sıra hücre kültürü örneklerinde ölçüldü. PBS akış sitometrisi (Şekil 3) sırasında yüksek bir arka plan neden olabilecek herhangi bir kirletici partiküller ihtiva etmez analizler için kullanılan ölçümlerinden önce kontrol edilmesi önemlidir. Bazı küçük MVs bir akış sitometri yaklaşımla ele olmayabilir rağmen, tüm büyük kan hücre popülasyonlarının (örneğin, trombositler, kırmızı kan hücreleri, lökositler, endotel hücreleri) MVS tespit edildi. 29 – Bizim analizlerde daha önce MVS 26 bulunmuştur farklı kan hücreleri için standart belirteçler kullanılır. Belirtilmelidir ki t akış sitometrisi ile mümkün olan en iyi sonuçları elde etmek içinO miktar ve antikor konsantrasyonu, söz konusu antijeni ifade eden bir MV numune üzerinde titre edilmelidir. Kanda spesifik MV alt popülasyonlar daha yüksek özgüllük ile tespit edilir ise, ilgili MVS iki farklı antijenlerin karşı çifte boyama gerçekleştirmek ve sonraki 23 analizleri için yalnızca tüm çift pozitif MVS dikkate almak mümkündür. Şu anda, sağlıklı bireylerin 23,30 kanında MV alt popülasyonlar standart bir dizi tanımlamak için çabalar vardır. Bu çalışmalar, daha önce trombosit türevli MVs gözlemlerimiz ile uyumlu olarak bir kan MVs büyük nüfus oluşturmaktadır göstermiştir.
OG örnekleri karakterize etmek flow sitometri bir avantajı, bu yöntem zaten iyi günlük klinik teşhis biyomarkırların olarak MVs olası kullanımını sağlayacak birçok klinik merkezlerinde tanı amaçlı kurulmuş olmasıdır. çoğunlukla odak kandaki EVs önceki çalışmalarküçük Exos üzerinde ed, seçici istenen Exo hedef nüfusu 31,32 analiz özel sıralama prosedürleri ya güvenmek ya da analiz 18 öncesinde boncuk Latexe Exos birleştirilmesi ile zaman alıcı (2 gün) izolasyon süreci gerektirir. Kendi yayınlanmamış gözlemler tam kan hazırlıkları MVS akım sitometri analizi bile böyle böyle bir seçim süreçleri olmadan tümör kaynaklı MVS olarak MVS algılanmasını sağlar düşündürmektedir.
Burada sunulan protokol standardı laboratuar ekipmanları ile periferik kan örneklerinden MVs hızlı izolasyonuna izin verir ve onların sonraki karakterizasyonu akım sitometri ve Western Blot kullanarak, birlikte ele alındığında. Bütün bu süreç hastalık biyobelirteçlerinin olarak MVs potansiyelini değerlendirmek için gerekli olan hastaların kanındaki OG profilleri gelecek çalışmalara kolaylaştıracaktır yaklaşık 2 saat içinde yapılabilir.
The authors have nothing to disclose.
The authors acknowledge Meike Schaffrinski for excellent technical assistance. We would like to thank the following people for their help in the collection of peripheral blood samples (all from University Medical Center Göttingen): Henrietta Vida (Dept. of Transfusion Medicine), Kia Homayounfar, Lena-Christin Conradi (Dept. of General, Visceral and Pediatric Surgery), Leila Siam, Bawarjan Schatlo (Dept. of Neurosurgery), Hendrik A. Wolff, Martin Canis (Dept. of Otorhinolaryngology, Head and Neck Surgery) as well as all employees of the interdisciplinary short-term oncology. We acknowledge Dirk Wenzel (Max Planck Institute for Biophysical Chemistry, Göttingen) for his help with the electron microscopy of MVs.
The study was funded by the German Ministry of Education and Research (BMBF) project MetastaSys (grant no. 0316173) as well as the German Cancer Aid (grant no. 109615).
butterfly needle (21 gauge) | Hospira Deutschland GmbH | 490P29201 | |
Bovine serum albumin Fraction V | Roth | 8076.3 | For 10x TBS weigh 24.2 g Tris base and 80 g NaCl, ad 1 L H2O and adjust pH to 7.6 |
For 1x TBS-T mix 100 mL 10x TBS with 900 mL H2O and add 1 mL Tween-20 | |||
CD235a-PE | Beckman Coulter | A07792 | use 5µl for staining |
CD45-FITC | Beckman Coulter | 7782 | use 5µl for staining |
CD62E-PE | Biolegend | 336008 | use 0.8µg for staining |
CD62P-PE | Biolegend | 304905 | use 0.1µg for staining |
CD81 antibody | Biolegend | 349501 | 1:2000 in 5%BSA in TBS-T; use non-reducing conditions for Western Blotting |
CD9 antibody | Immunotools | 21270091 | 1:1000 in 5%BSA in TBS-T; use non-reducing conditions for Western Blotting |
Chemiluminescence imager ImageQuant LAS-4000 | Fujitsu Life Sciences | ||
DC protein assay kit II | Bio-Rad | 5000112 | |
ECL detection reagent | GE Healthcare | RPN2232 | |
EDTA vacutainers for blood collection | Sarstedt | 01.1605.001 | |
FACSCanto II | BD Biosciences | ||
fetal calf serum (FCS) | Invitrogen | 10091148 | heat-inactivated (30 min, 56°C) |
filter 0.22µm | Sarstedt | 83.1826.001 | |
HRP-coupled anti-mouse secondary antibody | santa cruz | sc-2005 | use 1:10,000 in 5% milk powder in TBS-T |
HRP-coupled anti-rabbit secondary antibody | santa cruz | sc-2004 | use 1:10,000 in 5% milk powder in TBS-T |
4x Laemmli loading buffer, Roti-Load 1 | Roth | K929.1 | |
microfuge SIGMA 1-15K | Sigma Laborzentrifugen | ||
milk powder (Blotting-Grade Blocker, nonfat dry milk) | BioRad | 170-6404 | |
multifuge 3 L-R | Heraeus | ||
NanoSight LM10 | NanoSight Ltd. | ||
PBS, w/o Ca and Mg | Pan biotech | P04-36500 | |
perfusor syringe 50 mL | Braun | 8728844F | |
Ponceau-S staining solution | PanReac AppliChem | A2935,0500 | |
rotor Sw32.1 Ti for ultracentrifugation (6x 17 mL) | Beckman Coulter | ||
rotor TLA-120.2 for ultracentrifugation (10x 1.5 mL) | Beckman Coulter | ||
tubes for flow cytometry (5 mL, round-bottom) | BD Biosciences | 352054 | |
tubes for ultracentrifugation (15 mL) | Beckman Coulter | 344061 | |
tubes for ultracentrifugation (11* 34 mm) | Beckman Coulter | 343778 | |
Tubulin antibody | Millipore | 05-829 | 1:5000 in 5%BSA in TBST |
ultracentrifuge Optima L-80 XP | Beckman Coulter | ||
ultracentrifuge TL-100 | Beckman Coulter | ||
valve filter Seraplas V15 | Sarstedt | 53,428 |