We describe a method to establish human enteroids from small intestinal crypts and colonoids from colon crypts collected from both surgical tissue and biopsies. In this methodological article, we present the culture modalities that are essential for the successful growth and maintenance of human enteroids and colonoids.
The epithelium of the gastrointestinal tract is constantly renewed as it turns over. This process is triggered by the proliferation of intestinal stem cells (ISCs) and progeny that progressively migrate and differentiate toward the tip of the villi. These processes, essential for gastrointestinal homeostasis, have been extensively studied using multiple approaches. Ex vivo technologies, especially primary cell cultures have proven to be promising for understanding intestinal epithelial functions. A long-term primary culture system for mouse intestinal crypts has been established to generate 3-dimensional epithelial organoids. These epithelial structures contain crypt- and villus-like domains reminiscent of normal gut epithelium. Commonly, termed “enteroids” when derived from small intestine and “colonoids” when derived from colon, they are different from organoids that also contain mesenchyme tissue. Additionally, these enteroids/colonoids continuously produce all cell types found normally within the intestinal epithelium. This in vitro organ-like culture system is rapidly becoming the new gold standard for investigation of intestinal stem cell biology and epithelial cell physiology. This technology has been recently transferred to the study of human gut. The establishment of human derived epithelial enteroids and colonoids from small intestine and colon has been possible through the utilization of specific culture media that allow their growth and maintenance over time. Here, we describe a method to establish a small intestinal and colon crypt-derived system from human whole tissue or biopsies. We emphasize the culture modalities that are essential for the successful growth and maintenance of human enteroids and colonoids.
De voering epitheel van het maagdarmkanaal in constante vernieuwing. Dit proces wordt veroorzaakt door proliferatie van intestinale stamcellen (ISC) die continu produceren nakomelingen snel vervangen darmepitheel als het omdraait. De proliferatieve compartiment dat de ISCs beperkt tot de bodem van de crypten. De ISC leiden tot nakomelingen die uiteindelijk differentiëren in absorptieve of secretoire lijnen. Verhuizen van de crypte en op de villus of oppervlakte-epitheel, cellen differentiëren naarmate ze migreren naar boven voordat afschilfering in het lumen 1. ISC's aanleiding geven tot alle intestinale epitheliale celtypen met inbegrip van enterocyten, microfold cellen, entero-endocriene cellen, bekercellen, tuft cellen en Paneth cellen. De dikke darm wordt gekenmerkt door langgerekte crypten voornamelijk samengesteld uit colonocyten en bekercellen, met verspreide enteroendocrine en tuft cellen 2.
Ex vivo cultuur systemen vormen veelbelovend instrument voor het bestuderen van ISC onderhoud en darmweefsel homeostase. Het is echter moeilijk te vertrouwen op weefselkweek technieken fysiologische omstandigheden niet volledig gereproduceerd en de epitheliale micro vaak veranderd 3,4. Een grote vooruitgang in ISC gebied was de oprichting van weefselkweek technieken te onderhouden en uit te breiden individuele muizen ISC's met behulp van gedefinieerde groeifactoren aan de normale intestinale niche signalen vervangen. Langdurig kweekomstandigheden werden door Sato et al., Waarin één crypten of geïsoleerde stamcellen van het darmepitheel wel 3-dimensionale epitheelstructuren waaronder multiple crypte-achtige domeinen 5-7 vormen. Deze driedimensionale structuren ondergaan kernsplijting gebeurtenissen om continu uit te breiden. Interessant alle intestinale celtypes specifiek aan het weefsel van oorsprong worden geproduceerd en ook geëxtrudeerd in een lumen 8. Met modificaties van dit systeem epithelialeorganoids kunnen uit de maag, dunne darm en colon. Meer specifiek epitheliale organoids van de dunne darm enteroids 9 en die van de dikke darm colonoids 9,10. Deze epitheelcellen organoïde kweeksystemen werden gebruikt om het vermogen van geïsoleerde enkele cellen gefunctioneerd als stamcellen in vitro, waardoor het testen van de "stemness" van geïsoleerde cellen 5,6,10-15 testen. Andere onderzoekers hebben zowel enteroids en colonoids gebruikt om de functie van afzonderlijke epitheelcellen 16-21 bestuderen. Aldus kunnen enteroid en colonoid culturen worden gebruikt om zowel stam als niet-stamcellen functies uitwerken en geven nieuw inzicht in fundamentele cellulaire interacties in de darmen.
In 2011, Sato en collega's gegenereerd op lange termijn de cultuur van epitheliale organoids afkomstig van menselijke dunne darm en dikke darm 22,23. Naast verschillen in media samenstelling, de menselijke epitheliale enteroidsen colonoids vertonen dezelfde kenmerken als hun muizen tegenhanger. Bovendien kunnen ze worden gegenereerd uit zieke weefsels zoals Barrett-slokdarm, adenoom of adenocarcinoom en cystische fibrose 22,24. Human enteroids vormen een waardevolle systeem om intestinale stamcellen en epitheliale mucosale biologie studeren en dienen als een nieuw experimenteel systeem om zowel normale en abnormale gastro-intestinale fysiologie 3 bestuderen.
Hier beschrijven we methoden enteroids en colonoids stellen van menselijke dunne darm en colon crypten (figuur 1). In deze methodologische beoordeling, benadrukken we de crypte collectie van hele weefsel en biopten. We herhalen de cultuur modaliteiten die essentieel zijn voor de succesvolle groei en het onderhoud van de menselijke enteroids en colonoids en de mogelijke experimentele strategieën door dit model uitgevoerd zijn.
Deze methode levert een compleet systeem reproduceren darmepitheel geslachten en epitheliale dynamiek die een nuttig instrument om darmepitheel biologie studeren vormen. De werkwijze die hierin gepresenteerd werd aangepast van de oorspronkelijke muizen studie van Sato en Clevers 22 die efficiënt resulteert in menselijke enteroids en colonoids. Hier hebben we handmatig pakte de crypten door microdissection elke cellulaire verontreinigingen te voorkomen. Deze methode laat een directe visualisatie van de crypten en leidt tot consistentie overuren vergeleken met het oorspronkelijke crypte collectie van "schudden". Andere groepen ontwikkelde vergelijkbare techniek met behulp van iets andere aanpak vooral het vervangen van de chelatietherapie door EDTA met collagenase 25. Behalve de verschillen in crypte verzameling, die technieken gebruiken een gedefinieerde media die vereist is om de menselijke enteroids groeien in kweek 22. Om de groei van efficiëntie op crypte zaaien verhogen, voegen we een GSK3 remmer (CHIR99021)de eerste twee dagen 12.
De behandeling van het weefsel of biopsies is belangrijk en het crypte isolatie moet zodra het weefsel komt in het laboratorium uitgevoerd. Kan echter vertraagd crypt het kweken worden uitgevoerd tot 24 uur na weefselverzameltoestel (gegevens niet getoond) zoals eerder beschreven voor muizen weefsel 26. Het darmweefsel wordt in een conische buis geheel gevuld met DPBS om weefselverstoring voorkomen en moet bij 4 ° C gehandhaafd worden geplaatst. De vertraagde voorbereiding zorgt voor weefsel verschepen maar temperatuurvariatie dient tijdens het transport te vermijden. De totale tijd voor het oorspronkelijke crypte plating ongeveer 2 uur bij 15 tot 30 minuten aan het weefsel en 1 tot 2 uur te isoleren en plaat de crypte verwerken. De microdissection van het weefsel is een kritische factor en gezegde van een schone crypte voorbereiding. De crypt afgifte hand schudden zoals beschreven in verschillende protocollen mogelijk 22,23.
Ondanks de overeenkomsten met de muizen enteroid (enteroids) systeem, het menselijk enteroids vereisen specifieke moleculen behouden en te versterken hun groei in de tijd. De groeifactoren worden EFG Noggin, R-spondin eveneens gebruikt om de muizen epitheliale organoids. Het gebruik van Wnt-3A kritisch. We merkten dat de vorming en de groei rendement groter met een Wnt-3A geconditioneerd medium dan de menselijke recombinant eiwit. Gelijktijdig hebben we aangetoond verbeterde kweekomstandigheden met een remmer van glycogeen synthase kinase 3 (CHIR99021) 12. Recombinant groeifactoren kunnen worden vervangen door Wnt-3A, R-spondin en Noggin geconditioneerd medium. Een Wnt-3A uiten L-cellijn is commercieel verkrijgbaar (ATCC). Andere groepen hebben R-spondin 1- 23,27, Noggin- 19 ontwikkeld, en Wnt-3A / R-spondin3 / Noggin- 28 uiten cellijnen. Twee kleine molecule inhibitoren worden gebruikt in de kweek menoodzakelijk dia en zijn voor het onderhoud van de cultuur 29. A-83-01 is een selectieve remmer van transformerende groeifactor β en activine / Nodal receptoren (activine-achtige kinase 4, 5, 7) en SB202190 is een p38 mitogen-activated protein kinase inhibitor (MAPK). Beide remmers werden respectievelijk gebruikt om humane geïnduceerde pluripotente stamcellen zelf-vernieuwing te ondersteunen en om de menselijke naïeve pluripotente stamcellen 30-32 stand. Bovendien, nicotinamide, een voorloper van nicotinamide adenine dinucleotide, moet enteroids en colonoids expansie handhaven langdurige wijze 22,29.
De EDTA chelatie is een belangrijke stap als het bepaalt de opbrengst van de crypt bereiding. We hebben succesvol met 2 mM EDTA behandeling. Echter, EDTA concentratie worden gewijzigd van 2 mM tot 15 mM betreffende het type weefsel. In dat geval incubatietijd moet empirisch worden bepaald. Na de eerste plating, zal de crypte rond-up en uiteindelijk vormen enteroids. De enteroids of colonoids tonen vaak "stem" fenotype door het vormen van gebieden met weinig tot geen gedifferentieerde cellen. In dat geval kan differentiatie worden geïnitieerd door intrekking Wnt-3A, nicotinamide en de p38 MAPK remmer. Het gebruik van Notch-remmer, zoals DAPT of DBZ helpt het verbeteren van de differentiatie binnen de enteroids 22.
Dit model recapituleert de intestinale fysiologie met continue-crypt ontluikende gebeurtenissen die voortvloeien uit een stamcel compartiment evenals villus-achtige epitheliale domeinen die zowel absorberend en secretoire onderscheiden geslachten. Interessant dit systeem geen mesenchymale cellen bevat en gebruikt specifieke media omstandigheden de niche signaal voldoen.
Zoals het muizenmodel kunnen humane enteroids worden gegenereerd uit geïsoleerde intestinale epitheliale cellen met het vermogen van deze cellen om als een stamcel testen. Several studies hebben gebruikt cluster van differentiatie merkers (CD44, CD24 en CD166) en EPHB2 positieve cellen te verrijken voor cellen met stamcellen eigenschappen 12,23,33. Samen vormen deze studies tonen het nut van de menselijke enteroids culturen voor het testen van de stemness. Andere onderzoekers gebruiken dit model om intestinale ziekten zoals besmettelijke diarree, cystic fibrosis, of colorectale kanker 22,34-37 onderzoeken. Deze studies tonen aan dat de menselijke enteroids vormen een betrouwbare menselijke ziekte model met een mogelijkheid om te komen tot een persoonlijke screening. Menselijke enteroids kunnen genetisch worden gemodificeerd met behulp van DNA transfectie of infectie met virale deeltjes 38. Dit zorgt voor een krachtig hulpmiddel om gen-specifieke functies te bestuderen binnen het menselijke epitheliale organoids of juist genetische mutaties. Onlangs Schwank en collega's toonden de mogelijkheid het genoom de mutatie van het CFTR-gen dat ac bewerken met de CRISPR / Cas9 systeem en corrigerenystic fibrose 24. Menselijke enteroids een waardevolle systeem intestinale stamcellen en epitheliale mucosale biologie bestuderen en als een nieuw experimenteel systeem voor zowel normale als abnormale maag fysiologie studie.
The authors have nothing to disclose.
We gratefully acknowledge Dr. Hans Clevers (Hubrecht Institute for Developmental Biology and Stem Cell Research, Netherlands) for the kind gift of TOPflash cells.
This project was supported in part by NIH-R01DK083325 (MAH); NIH P30 DK078392 (Digestive Health Center); NIH UL1RR026314 (CTSA).
Name of Reagent | Company | Catalog Number |
Dulbecco’s Phosphate buffered saline Ca2+, Mg2+ free (DPBS) | Life technologies; Gibco | 14190-144 |
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) | Sigma-Aldrich | 431788 |
Sorbitol | Fischer Scientific | BP439-500 |
Sucrose | Fischer Scientific | BP220-1 |
Bovine serum albumin (BSA) Fraction V | Fischer Scientific | BP1600-100 |
Gzntamycin/Amphotericin B solution | Life technologies; Gibco | R-015-10 |
Wnt-3A conditionned medium | in house | – |
Advanced DMEM/F12 | Life technologies; Gibco | 12634-028 |
HEPES 1M | Life technologies; Gibco | 15630-080 |
GlutaMAX (glutamine) | Life technologies; Gibco | 35050-061 |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Life technologies; Gibco | 15140-148 |
N2 Supplement | Life technologies; Gibco | 17502-048 |
B27 Supplement | Life technologies; Gibco | 17504-044 |
N-Acetylcysteine | Sigma-Aldrich | A9165-5G |
Nicotidamide | Sigma-Aldrich | N0636 |
Matrigel, GFR, Phenol free (basement membrane matrix) | Corning | 356231 |
human recombinant Noggin | R&D | 6057-NG/CF |
human recombinant R-Spondin | Preprotech | 120-38 |
human recombinant EGF | Sigma-Aldrich | E9644-.2MG |
Y-27632 | Sigma-Aldrich | Y0503-1MG |
A-83-01 | Tocris | 2939 |
SB202190 | Sigma-Aldrich | S7067-5MG |
human [Leu]15-Gastrin 1 | Sigma-Aldrich | G9145-.1MG |
CHIR99021 | Stemgent | 04-0004 |
Thiazovivin | Stemgent | 04-0017 |
TrypLE Express Enzyme (1X), phenol red (cell dissociation enzyme) | Life technologies; Gibco | 12605-010 |
Fetal Bovine Serum | Life technologies; Gibco | 10082-147 |
CTS Synth-a-Freeze Medium (freezing medium) | Life technologies; Gibco | A13713-01 |
L Wnt-3A cell line | ATCC | CRL-2647 |
Renilla luciferase assay | Promega | E2710 |
human recombinant Wnt-3A | R&D | 5036-WN/CF |
HEK293 TOPflash cell line | – | – |