收购抗生素的耐药性是一个重大的公共医疗问题,目前排名由世界卫生组织对人类生命的最大威胁之一。在这里,我们描述了使用悬臂技术,以量化的抗菌性,发现新颖和强大剂对多药耐药细菌的关键。
悬臂梁传感器,作为在细菌细胞壁的模型的基体固定在其表面上和在溶液中的抗生素药物反应之间的换能器,以前所未有的灵敏度和特异度1-5生化传感应用中表现出相当大的潜力。药物靶相互作用产生的表面应力,使悬臂弯曲,它是通过激光照射时,可以分析的信号的光学。表面应力测量纳米级精度的变化允许中断的生物力学模型细菌细胞壁的目标实时跟踪。尽管提供了相当大的优势,多悬臂梁传感器阵列从未被应用在量化药物靶结合的相互作用。
在这里,我们报告硫醇自组装单分子膜,模仿细菌细胞壁基质定量斯图涂的多个硅悬臂阵列DY抗生素结合的相互作用。为了理解万古霉素对细菌细胞壁的结构1,6,7的力学的影响。我们开发了一种新的模式,可以说是由两个独立的因素提出该悬臂弯曲;我)即一种化学因子,这是一个经典的Langmuir吸附等温,从中我们计算热力学平衡解离常数(K D) ⅱ)几何因素,本质上是一种细菌肽受体的悬臂的表面上分布的措施。肽受体(对)的表面分布是用来研究的几何形状和配位体加载的依赖性。结果表明,传感应用的p〜10%的阈值是至关重要的。下面的,有弯曲的信号是没有可检测到的,而高于此值时,弯曲信号几乎呈线性增加,揭示该应力是一个本地的化学结合因子的商品器和几何因子结合反应区域的机械连接和设计实力的代理商,以打击超级病菌感染提供了新的范式。
分子识别范式的基础大片生物学和医学。药理学,例如,我们的目标是针对如transglycoslyation或催化细菌细胞壁的肽交联转肽的生化过程的主要参与者干扰与病理通路。因此,降低药物的设计来确定一个合适的分子针对特定细菌停靠站点,以诱使完美契合。仿效这种做法成功的一个典型的例子是万古霉素(VAN),它的目标肽聚糖的细胞壁,细菌一个保守的结构特征。在新生的革兰氏阳性菌的肽聚糖的基体由终止序列中的赖氨酸-D-丙氨酸-D-丙氨酸,拴通过C55脂质链接器8-10在这里称为D-丙氨酸的肽。这些暴露的肽肽前体为根本机械保护的细菌细胞对恶劣环境的力量,重要的是,都没有发现人类细胞中,使他们的理想目标抗生素药物。 凡特异性结合的细菌细胞壁肽形成中等强度的范肽的C-末端在图1中所示的复杂。 范和暴露的肽块的动作的transpeptidases和transglycosylases的,能催化交联的细胞壁1,有效地停止从交联,因此nanomechanically的减弱导致其死亡的细菌细胞破裂1,6之间的这种相互作用, 7。
出现耐万古霉素肠球菌 (VRE)是一个日益增加的医疗问题,因为产生细菌耐药性肠球菌由于酰胺林微妙的变化卡格酯键8,这种看似简单的结构变化,在细菌的表面上删除范的现场对接,从一个单一的氢键的结合口袋的后续修改。重要的是,这个过程中改变终端丙氨酸五肽存在于万古霉素敏感肠球菌 (VSE)到一个赖氨酸-D-丙氨酸-D-乳酸10,12,在这里被称为D-Lac的范-D-Lac的结合亲和力,产生了显着的减少因此,三个订单治疗无效的反对肠球菌感染,抗生素耐药性细菌的惊人增长幅度渲染范推动发展,创新的办法来加快和恢复抗菌剂的抗菌活性或发现更强大的药物对多药耐药细菌感染。
<p类=“jove_content”>的灵感来自于我们的实验使用独立的悬臂系统,如利用化学能转化为运动细胞。悬臂式传感器,把化学能转化为机械运动的能力使它们独特的探针实时监测机械干扰细菌细胞壁的目标具有相当的优势,为。悬臂式传感器需要没有记者的标签,并在单步反应快速检测生物分子。他们可以筛选多种药物的生理环境下,如缓冲解决方案和全血清平行。此外,悬臂技术在原位引用使用差分测量,使他们能够特异性地检测药物靶相互作用,凭借其通过标准的半导体工艺路线制造,它们是适合于大批量生产和并行高通量筛选十万的每小时的药物。 particular多个悬臂梁传感器阵列研究对万古霉素的抗生素耐药性是有用的工具-因为耐万古霉素本质上是一个机械问题1,6,7。反应的模型细菌细胞壁的目标和 Van在溶液中可以检测到通过监视药物靶结合的相互作用引起的,在临床相关的应力的变化。体现在以悬臂弯曲信号从表面反应所产生的应力光学分析用激光束照亮传感器。此外,通过剪裁细菌悬臂梁传感器的顶部表面上的目标分子接收涂层,附近的一个未有限数目的分析物(车 ),特定的生化相互作用的生物力学模型细菌细胞壁基质进行实时监控。除了在分子识别事件,有几个因素会导致画质的悬臂传感器中选择,其中包括 – 温度变化,非特异性结合,或溶液的折射率的变化。为了解释的非特异性信号, 在测量和参考悬臂梁的弯曲持续监控,以分析的特异性相互作用进行原位的差分测量。此外,通过调节表面密度p(其中p占用的捕获分子的整个顶表面面积的悬臂的表面面积的比率被定义为依赖于表面的化学组成和几何形状的悬臂式传感器的检测灵敏度可提高所涵盖的X射线光电子能谱(XPS)所确定的总人口的分子。这个协议的细节如何万古霉素或任何其他抗生素结合细菌细胞壁的前体的类似物(mucopeptides)在临床相关浓度的缓冲溶液中的一个第二血血清中可检测到的通过使用标签悬臂技术。新鲜的金表面自组装单分子膜(SAMs)的使用,因为往往容易形成稳定干净的金层13,14。自组装膜通常由短的硫醇基团的分子的共价键连接在金表面上,而在另一端所需的捕获单元被允许自由互动与被分析物在溶液中的目标。硫醇形成一个灵活的系统,特别是考虑到许多不同化学端基的巯基化合物是市售还是很容易在实验室中合成。但是,应注意,以确保与硫醇基团的分子必须具有正确的末端基团,例如在蛋白质或肽的共轭,氨基应该面对向内拴上的硫醇基团与羧基的反应表面发生。在这里,硫醇从b直接结合的三肽模拟物的细菌的脂质II固相方法合成的目标acterial细胞壁市售预装王-D-Ala和王-D-紫胶树脂和标准FMOC保护基化学15。虽然此说明的重点是对万古霉素,显然可以扩展到其他抗生素确实邀请来自不同的领域,特别是在生物化学,药理学,材料科学,轻松地通过此协议为自己的实验,研究人员进一步研究。
这些结果表明,悬臂阵列传感器的灵敏度进行检测和定量的药物靶结合的相互作用,特别是在删除一个单一的药物的结合口袋的氢键与万古霉素耐药性的变化。我们展现出的纳摩尔检测灵敏度凡在协议与以前的表面等离子体共振(SPR)的研究18,19,揭示悬臂方法可以直接检测和量化药物分子在血液中的浓度临床相关常规应用在临床实践中。我们的数据表明,表面应力差,可以说是由一个产品形式(1)式, 即 (一)化学反应的一个化学术语,描述具体的药物靶结合事件,及(ii)之间的机械连接的几何术语,描述面点,这意味着当地的化学作用,从全球的技工去耦人相互作用的悬臂。虽然经典的Langmuir吸附等温化学名词由下式给出,几何术语揭示了渗流机制的药物靶诱导的表面应力的变化。临界阈值个〜10%( 图5)检测到的差分悬臂弯曲,表示该表面应力集体转导时,一个比较大的表面分数占用的抗生素分子。对于p≥化学转化表面之间的机械连接件,逐步建立,如立体相互作用的纳米机械的网络节点之间的短距离的排斥作用产生增加整个悬臂向下弯曲。据推测,我们的纳米机械的渗流模型可能发挥重要的作用,在真正的细菌糖肽类抗生素的作用方式。这些发现突出的悬臂式技术的高灵敏度为studying抗生素的作用方式和研究的药物,以改善了解抗生素在纳米尺度的操作通知,使强大的药物来控制超级细菌感染的问题,发现代表了一种新的研究工具。要准备悬臂系统,重复性好,灵敏的测量,我们已经解决了一组在协议的目标,尤其是对微细胞样品装载和标准作业程序,让奈米定量检测。
悬臂技术相对于现有方法中的意义
综上所述,我们指出,而这项技术是超过25年前提出的,它没有发现它的方式进入诊所,因为缺乏医疗相关目标的小心和重复测量。在这里,我们演示的程序建立了相关的,使用奈米悬臂调查机械师人抗生素对细菌细胞壁的目标并检测抗菌性的影响。传统的药物筛选方法需要某种类型的荧光或放射性标记的报告分子,测量到它的目标分析物的结合,往往在具有竞争力的或酶的结合分析法和蛋白质检测20。标记生物分子不仅费时且昂贵的,但该标签也可以干扰与阻碍分子间的相互作用的结合位点,从而导致假阴性。此外,荧光化合物往往是疏水性的,这可能会导致背景结合和假阳性。由于这些限制,是新的标签技术,使几乎任何分子复合体进行甄别,以最小的试验开发的兴趣日渐浓厚。目前历史最悠久的无标签的表面处理技术是SPR和石英晶体微天平(QCM)。到SPR相反,测量第ë键介电常数,标签 – 悬臂技术检测到的配体 – 受体相互作用的,它能够直接测量表面的受体特异性结合的配位体所产生的纳米机械力所产生的表面应变。这些传感器的独特性,其灵敏度不依赖于由于SPR和QCM而是在一个微小的平面应力引起的变化的分析物结合的质量变化引起的介电性能,使该技术特别适合研究药物分子在临床相关的抗生素浓度(3-27微米)17纳米力学。悬臂也特别适合于小的分子(如DNA片段和药物)检测在生理条件下,包括复杂的环境中,这在很大程度上是制药业的基础,因此,作为在药物发现中的补充工具。悬臂式技术已经成功地应用在基因组学领域的3,5,气体传感21 22,蛋白质组学,药物1。此外,低成本的硅技术,由于其兼容性与微细加工流程都采用悬臂,悬臂可以小型化,以提高灵敏度和并行为大型阵列传感器,多种药物的化合物筛选和更高的吞吐量信息丰富的筛选试验。仪器和实验设计的改进将允许在实时帮助推动解决的问题多药耐药感染的新一代superdrugs寻找各种各样的相互作用进行分析。
在协议的关键步骤
强大的测量协议的发展是这项技术的应用。为了达到令人满意的定量的药物靶测量,并确定最低浓度的抗生素吨帽子缓冲区或血液中可检测到血清,在协议的关键步骤解决。第一项任务涉及到调整和优化表面化学捕获提升悬臂检测的特异性和敏感性。不可否认,表面应力传导是一个集体现象,需要一个比较大的部分表面进行覆盖,以建立化学反应区域之间的连通性。我们表明,通过改变下垫面肽的密度,临界阈值,〜P≥10%时,确定规模的肽密度的函数,否则为零( 图5)的表面应力。重要的是,实验旨在探讨沿悬臂应力的均匀性,敏感的测量,以确保最大的信号偏转。此外,高效的表面恢复协议需要的地方,从而使多个周期的测量,并降低成本,为每个测试通过万吨。在设计使用巯基化的疏水性端的受体表面的受体分子和它们之间的间距,方向是至关重要的允许范明镜范德华分子之间的相互作用,由于密实填充自组装,以减少非特异性相互作用。此外,应包含捕获分子的聚乙二醇(PEG)的连接器,以允许传感矩阵的某些部分是亲水性的,以防止插入待测溶液中的分子与未涂覆的金表面直接反应。 PEG连接分子,必须采取行动,作为间隔,以减少空间约束的,因此允许专门与互动解决方案的分析物的表面受体诱导可测量的表面应力变化。的悬臂阵列传感器必须与至少一个在原位参考测量来测定,在实时显示的信号是一个差分偏转,通过以下方式获得从S中减去绝对的参考悬臂偏转悬臂ensing。因此,参考悬臂考虑到的非特异性相互作用,如温度变化,折射率变化或相互作用的悬臂上的非官能化的底面是必不可少的。优化的流动速率(〜30-150微升/分钟)形成于该协议的一个关键步骤,因为它确保高效率地交换液体和溶液的材料有足够的稳定的大量运输。液体电池的设计必须允许最佳体积(5-80微升)采用快的流速,使完美的液体交换,克服大众运输的限制。的流率是特别重要的,同时进行动力学测量23。大容量液体室要求不可控的高流速,导致大样本量的要求,增加不必要的检测价格。此前,我们已经使用了重力流进入测量液体腔注入不同的样品。重力流的优势在于它的母鹿不要求任何机械部件,因此不会引入额外的噪声进入系统。然而,其显着的缺点是,它不仅可以可靠地工作在相对高的流率(约200微升/分钟)。显然,一个较低的流动速率(≤1微升/分钟)将需要的每单位时间的有限体积的样品,但在另一方面,它使反应更慢,因此需要较长的接触时间。此外,重力流有一个大的差别,它的流速,因为它依赖于,从而降低在实验过程中被消耗样品溶液的入口和出口之间的高度差。要避免重力流问题,注射器泵应该被使用。使用注射泵的优点在于,它允许以恒定的流速在很长一段时间,允许以一种更可控的环境中实现的实验。
的协议的限制
获得重现的主要挑战ð特定的生物检测采用悬臂式传感器在于确保受体层的属性生物化学“有效”,对每个测定均匀。实验成功的秘密是一种谨慎的预处理的传感器芯片与连接器定位在其活性构象的受体分子的化学性质,以标准化的清洗和固定化的协议。在我们目前的体制,我们官能悬臂阵列使用小玻璃毛细管,这可能是受到一些缺点,在某些情况下,可能会出现问题的。在这些玻璃毛细管在两端开口,因此样品的溶剂可以很容易蒸发。例如,如果不能准确地控制官能化阶段的温度时,蒸发速度可以显着不同在不同的时间,尤其是在使用挥发性溶剂,如乙醇。有轻微的变化也有可能在孵育时间从一个悬臂到另一个克尔文感测液体必须连续加载到毛细血管。在毛细管官能化的其他限制因素是缺乏的能力,以确保悬臂总是插入到毛细管中完全相同的方式。另外,有时稍微被拉出,以防止交叉污染的液体样品可以流动到芯片上的身体从毛细血管悬臂。我们可以解决这些问题,作为一种替代的表面涂层过程大衣悬臂采用喷墨监视人。虽然这将允许样品涂层的精确控制的可能性扩大的大型阵列中,最常见的缺点是,沉积到悬臂的小滴可以在几秒钟内蒸发的和需要控制的湿度的环境中。因此,温育时间可以容易地调整,这对于某些应用可能是可取的。微妙的相互作用的因素,如样品VOlume明,孵化时间和蒸发速率官能样品曝光的悬臂上,有直接的影响,必须小心,以确保优化的表面化学悬臂试验,因为任何微小的变化将有很大的影响,在悬臂上的受体分子密度的响应。
实验设计修改( 即替代技术或材料)
为了克服获得重现涂层过程的悬臂技术的未来发展面临的主要挑战,需要不同的策略,将使用集成在微流体通道的悬臂。这个想法是,特殊的悬臂芯片的设计应使每个悬臂被放置到自己的渠道,让在线渠道单独解决原位功能化程序。这些实验的设计修改将使涂装工艺执行在一个控制和封闭的环境中,暴露到溶剂的精确自动化悬臂芯片上固定化的捕获分子的培养时间和流量监测。然后,相同的信道可以被用于所有悬臂可能会暴露在相同的分析物溶液的实际的结合实验。除了的悬臂官能程序,悬臂读出机制还需要改进。的光束偏转方法是高度敏感的,它已被成功地用于原子力显微镜(AFM)技术多年。然而,为的自由站立悬臂式传感器的应用程序的光学读出有一些缺点,例如它并没有允许不透明的液体,如血液中的测量,激光器阵列的对应的时间,费时和乏味的,将当前配置不能区分倾斜和垂直偏转之间。因此,未来的发展cantilev呃将不得不考虑技术方面的一般传感器的设计( 如悬臂几何)和悬臂读出强大的测量协议的领域和实验室环境。 Manalis和他的同事22发达的小说类型,其中有一个嵌入式的微流体通道内的梁悬臂空心悬臂传感器,允许在真空中进行操作的设备提供高品质的因素。在这种模式下,悬臂作为微量天平22,因此,它不再需要有一个相对于官能化的双方之间的不对称,因此,捕获分子可以被物理吸附或共价键直接连接在硅,通常使用的自组装膜或硅烷24。的悬臂也可以修改,用薄的聚合物层,然后共轭生化检测抗体25。
故障排除
一个常见的亲事态进一步恶化的悬臂测量与气泡引入到微流体的流动池。必须小心,以确保没有气泡被引入到液晶单元而安装的芯片。信号的漂移也是样品的温度的差异所造成的另一个常见问题。悬臂必须是平衡稳定后再进行测量。所有的缓冲区,分析物溶液和再生溶液必须被存储在同一房间内的悬臂仪器,以允许所有的解决方案,具有相同的温度。虽然注射泵能提供非常精确的和非常低的流速,它一般是与机械噪声的悬臂测量。因此重要的是设计出一种简单而有效的降噪器,以避免不必要的偏转信号中的噪声。降噪器由注射泵和液体的细胞,其吸收吨之间的小储液器他从泵的机械噪声。由于光检测器的敏感性质,悬臂式测量系统最好在一个封闭的设置,以阻止任何杂散光干扰的光学读出系统操作。此外,感测层的质量显着降低,如果大量的洗涤步骤的传感器芯片的寿命限制的悬臂上执行。
掌握这一技术后的替代或未来的应用
与终止在氨基或羧基的自组装膜涂覆的悬臂可以用作pH传感器。质子化或去质子化的官能端基取决于溶液的pH值,可以产生表面电荷,导致悬臂弯曲24。由于悬臂式传感器,可以跟踪与生命细菌的细胞壁1,6,7不稳定的药物靶相互作用,因此,它们将帮助搜索,并为开发新一代抗生素,以打击耐药菌感染。在未来的悬臂将用作微量天平测量的质量和单细胞的生长率26。的的悬臂技术将细胞反应,不同的生长因子或药物的研究证明是有益的。它也将快速检测多种生物标志物,里面有直接相关的医疗和护理点的应用提供了一种新的工具。由于悬臂式传感器的通用性,体积小,和鲁棒性,它们将形成一个敏感的监视器的有害环境的影响。他们已证明自己的灵敏度,检测有毒有害气体,可以逃离的实验室和工业生产单元到环境中,如氢氟酸27或氰化氢28。
The authors have nothing to disclose.
由工程和物理科学研究理事会(EPRSC),在纳米技术的跨学科研究中心(IRC),英国皇家学会(RS)和Biano顾问(BNC),约瑟夫·Ndieyira支持。我们感谢,亚历杭德拉·多诺索巴雷拉,周德舰,曼努埃尔Vögtli,巴彻勒马修,马修A.库珀,托尔斯滕·施特龙茨,特雷弗·雷门和Gabriel Aeppli的,有益的讨论。
Items | Catalog Number | Company | Comments |
Scentris | Scentris, Veeco Instruments, Inc | Not in production | |
Six-way valve | MVP, Hamilton, Reno, NV | Enables multiple concentration injection | |
EB Evaporator | BOC Edwards Auto 500, UK | Electron beam is preferable because of deformation of cantilevers caused by thermal heating problems | |
Storage vessel | Agar Scientific, UK | Keeps gold coated films fresh | |
Glass capillary | King Precision Glass, Claremont, CA, USA | For capillary functionalization of the cantilever arrays | |
Pump | Model Genie Plus, Kent Scientific, Torrington, CT, USA | Good for controlled flow rate of liquid samples in microfluidic channels | |
0.2-4.5 μm Filters | 1511940001 | Merck Millipore | For sample filtering |
Cantilever chips | London Centre for Nanotechnology (LCN) | Highly sensitive | |
Sodium phosphate monobasic | 10049-21-5 | Sigma-Aldrich, UK | For making buffer solutions |
Sodium phosphate dibasic | 7558-79-4 | Sigma-Aldrich, UK | For making buffer solutions |
Polysorbate 80 (PS80) or Tween 80 | 9005-65-6 | Sigma-Aldrich, UK | Used in buffer solutions to prevent nonspecific interactions on glassware |
DI water | Millipore Co., Billerica, MA, USA | Used for making solutions | |
Whole serum | GEM-700-110-H | Sera Laboratories International Ltd, UK | Used in measurements that mimic physiological conditions |
Vancomycin (Van) | 1404-93-9 | Sigma-Aldrich, UK | Drug used |
Sulfuric acid | 7664-93-9 | Sigma-Aldrich, UK | Used for glassware cleaning procedures |
Hydrogen peroxide | 7722-84-1 | Sigma-Aldrich, UK | Used for glassware cleaning procedures |
D-Ala and D-Lac | London Centre for Nanotechnology (LCN) | Surface receptors coated on the cantilever for detecting drug-target interactions | |
LabView | National Instruments Co., Austin, TX, USA | Software used for instrumental interface to allow controlled measurements | |