हम लक्षित प्राचीन डीएनए अनुक्रम पुनर्प्राप्ति, जो हम पांच Neandertal व्यक्तियों की पूरी mitochondrial जीनोम के पुनर्निर्माण के लिए इस्तेमाल किया की एक विधि प्रस्तुत करते हैं. वर्तमान दिन मनुष्यों के साथ इन दृश्यों की तुलना से पता चलता है कि Neandertals एक लंबी अवधि कम प्रभावी जनसंख्या के आकार का था.
हम जो भारी अपमानित और माइक्रोबियल डीएनए के साथ दूषित कर रहे हैं डीएनए स्रोतों से लक्षित डीएनए अनुक्रम पुनर्प्राप्ति की एक विधि मौजूद है, के रूप में प्राचीन हड्डियों के विशिष्ट है. यह विधि बहुत नमूना विनाश और अनुक्रमण पीसीआर या बन्दूक अनुक्रमण दृष्टिकोण प्रत्यक्ष रिश्तेदार मांगों कम कर देता है. हम इस विधि का इस्तेमाल अपनी भौगोलिक सीमा पार से पूरी तरह mitochondrial डीएनए (mtDNA) पांच Neandertals के जीनोम के पुनर्निर्माण के लिए. देर Neandertals mtDNA आनुवंशिक विविधता समकालीन आधुनिक मानव की है कि तुलना में लगभग तीन गुना कम था. MtDNA प्रोटीन विकास के विश्लेषण के साथ साथ, इन आंकड़ों का सुझाव है कि लंबी अवधि Neandertals प्रभावी जनसंख्या के आकार कि आधुनिक मानव और वर्तमान महान वानर की तुलना में छोटा था.
पीईसी विधि सरल, जल्दी, संवेदनशील और विशिष्ट है. इसलिए हम लेखकों की परिकल्पना की गई है प्राचीन डीएनए के बाहर कई छोटे आरएनए टुकड़े के एक शाही सेना पुस्तकालय से कब्जा जमा नमूना या (या अन्य loci) एक metagenomic नमूना से -16 विविधता का कब्जा में संरचनात्मक परिवर्तन से पूछताछ के रूप में, आवेदन. एक बिंदु पर उल्लेख है कि कब्जा की संवेदनशीलता एक मल्टीप्लेक्स पर कब्जा प्रतिक्रिया में बढ़ पीईसी प्राइमरों की संख्या के रूप में कम हो जाता है. पीईसी इसलिए बहुत बड़ी है (उदाहरण के लिए एक या अधिक megabase) पर कब्जा क्षेत्रों के कब्जा करने के लिए आदर्श अनुकूल नहीं है, लेकिन बहुत अच्छी तरह से छोटे से लक्ष्य या क्षेत्रों के एक तेजी से फैशन में कई व्यक्तियों से भी SNP पदों के पर कब्जा करने के लिए अनुकूल है.
The authors have nothing to disclose.
विज्ञान और कला के क्रोएशियाई अकादमी और बर्लिन-Brandenburg रसद और वैज्ञानिक समर्थन के लिए विज्ञान अकादमी, और वित्तीय समर्थन के लिए मैक्स प्लैंक सोसायटी के राष्ट्रपति अभिनव कोष हम सलाह के लिए एम. मेयेर धन्यवाद. JMG एक NSF अंतरराष्ट्रीय postdoctoral फैलोशिप (Oise 0,754,461) द्वारा समर्थित किया गया. 1 Neandertal (1 Feldhofer) FM865407, Neandertal 2 (2 Feldhofer) FM865408, Sidron FM865409 1253, Vindija FM865410 33.25, 1 Mezmaiskaya FM865411: दृश्यों परिग्रहण संख्या के साथ EBI nucleotide डेटाबेस में जमा कर रहे हैं
Material Name | Typ | Company | Catalogue Number | Comment |
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AmpliTaq Gold polymerase with GeneAmp PCR buffer II and MgCl2 | Applied Biosystems | N8080241 | ||
QIAGEN MinElute PCR purification kit | Qiagen | 28004 | ||
M-270 streptavidin beads | Invitrogen | 653.05 | ||
Tween-20 | Sigma-Aldrich | P2287 | ||
DynaMag-2 magnetic particle separator | Invitrogen | 120.02D |