과학자들은 동물보통은 쥐에서 유전자를 비활성화 시켜서그 유전자의 기능을 더 연구하는데보통 그 유전자를 조작된 DNA 조각인표적 벡터로 대체한다표적 벡터는 해당 유전자의 전후의 서열과동일한 상동 서열을 갖고 있다보통 긍정적인 선발 표지 유전자를 갖는데이를테면 네오마이신 저항 유전자와중앙에 NeoR 및 부정적인 선발 표지 유전자를티미딘키나아제(TK) 유전자를 한 끝에 둔다배아 줄기 세포에 도입될 때동종 재결합을 통하여 그 유전자를 대체하는데그 과정은 유사한 서열을 가진 DNA 가닥 사이에서자연스럽게 일어난다유전자가 제대로 대체된 세포는 긍정적인 표지를갖고, 부정적인 표지는 없어서배양액에서 파악을 할 수가 있다이런 세포를 다시 생쥐 배아에 삽입하고암컷의 자궁에 이식한다그 결과 생쥐는 보통 세포와 한 염색체에서그 유전자가 비활성화된 세포가 결합된 것이다이 생쥐를 배양하여소위 녹아웃 생쥐를 생성하게 되는데모든 세포에서 특정 유전자가 제거된 동종이다