Back to chapter

10.11:

Комбинаторный генный контроль

JoVE Core
Molekularbiologie
Zum Anzeigen dieser Inhalte ist ein JoVE-Abonnement erforderlich.  Melden Sie sich an oder starten Sie Ihre kostenlose Testversion.
JoVE Core Molekularbiologie
Combinatorial Gene Control

Sprachen

Teilen

Экспрессия большинства генов регулируется более чем одним коэффициентом транскрипции, когда многие гены включаются и выключаются с помощью различных комбинаций протеинов. Этот комбинаторный генный контроль позволяет эукариотам точно контролировать транскрипцию. Комбинаторный ген управления может регулировать, будет ли ген транскрибирован, а также насколько эффективной будет транскрипция.Рассмотрим три фактора транскрипции, A, B, и C, которые влияют на транскрипцию гена X.Если А отсутствует, ген X.не будет транскрибирован. Если C отсутствует, ген X.не будет транскрибирован. И если B отсутствует, эффективность траскрибции уменьшится.Таким образом, комбинация всех трех регуляторов необходима для высоких уровней транскрипции гена X.Транскрипционный регулятора может принять участие в регламенте нескольких генов. A вместе с B и С делает возможной транскрипцию гена X, но А вместе с другой транскрипционным фактором D может стимулировать транскрипцию другого гена, Y Это позволяет нескольким факторам транскрипции регулировать большое количество генов. Факторы транскрипции классифицируются в различные семейства и могут функционировать синергитически, либо с другими белками из этого же семейства, или с иными, из различных семейств.Факторы транскрипции, принадлежащие семейству Pou регулируют гены с различными функциями, от поддержания порядка до дифференциации клетки. Однако, очень мало белков в этом семействе всего 15 из них относится к человеку. Их способности выполнять различные функции зависит от их координации с другими транскрипционными фоакторами из различных семейств.Комбинаторный генный контроль необходим для in vitro перепрограммирования дифференцированных клеток. Выражение транскрипционных факторов Oct-4, Sox-2, KLF-4, и c-Myc в соматических клетках может инициировать преобразование стволовых клеток. Перепрограммирование не происходит в отсутствие каких-либо из первых трех белков.И отсутствие c-Myc приводит к низкой эффективности перепрограммирования. Комбинаторный контроль из всех четырех факторов необходим для формирования индуцированного полипотентного ствола клетки.

10.11:

Комбинаторный генный контроль

Комбинаторный контроль генов – это синергическое действие нескольких транскрипционных факторов, регулирующих экспрессию одного гена. Отсутствие одного или нескольких из этих факторов может привести к значительной разнице в уровне экспрессии гена или его репрессии.

Экспрессия более 30 000 генов контролируется примерно 2000–3000 факторов транскрипции. Это возможно, потому что один фактор транскрипции может распознавать более одной регуляторной последовательности. Специфичность экспрессии генов достигается за счет того, что эти белки взаимодействуют друг с другом в различных комбинациях, чтобы регулировать экспрессию разных генов. 

Комбинаторный контроль генов происходит с помощью нескольких различных механизмов. У дрожжей описаны три различных механизма. В системе «ожидание-активация» все факторы транскрипции, необходимые для регулирования экспрессии гена, связываются с ДНК, но активируют транскрипцию только при получении сигнала. Например, факторы транскрипции, которые регулируют гены, необходимые в поздней G1 фазе клеточного цикла, связываются с регуляторными сайтами своих генов-мишеней в ранней G1. Однако они вызывают транскрипцию только тогда, когда циклинзависимая-протеинкиназа активируется в поздней фазе G1. 

При комбинаторном контроле «объединение по фазам» факторы транскрипции, необходимые в первую очередь для определенной фазы клеточного цикла, остаются прикрепленными к регуляторной последовательности на протяжении всего клеточного цикла и совместно участвуют в регуляции генов во время других фаз. Например, SBF и Fkh2 – это два фактора транскрипции, которые в первую очередь участвуют в регуляции генов, которые должны экспрессироваться в фазах G1 и G2 соответственно. Однако некоторые важные гены, которые должны экспрессироваться в S-фазе, также регулируются комбинированным действием SBF и Fkh2.

Комбинация «объединение процессов» включает использование одного фактора транскрипции, которому помогают различные комбинации других факторов транскрипции для регуляции различных клеточных процессов. Например, факторы транскрипции, которые регулируют экспрессию генов, необходимых в G1 фазе клеточного цикла, также участвуют в регуляции генов, необходимых для процесса спаривания, в сочетании с другим набором регуляторов.

Suggested Reading

  1. Reményi, A., Schöler, H. R., & Wilmanns, M. (2004). Combinatorial control of gene expression. Nature structural & molecular biology, 11(9), 812-815.
  2. Qi, H., & Pei, D. (2007). The magic of four: induction of pluripotent stem cells from somatic cells by Oct4, Sox2, Myc and Klf4. Cell research, 17(7), 578-580.
  3. Godini, R., & Fallahi, H. (2019). Dynamics changes in the transcription factors during early human embryonic development. Journal of cellular physiology, 234(5), 6489–6502. https://doi.org/10.1002/jcp.27386
  4. Kato, M., Hata, N., Banerjee, N., Futcher, B., & Zhang, M. Q. (2004). Identifying combinatorial regulation of transcription factors and binding motifs. Genome biology, 5(8), R56.